MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000 chromosome

Total Repeats: 125962

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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15002	NC_004578	ACA	2	6	765863	765868	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28867942
15003	NC_004578	GATCT	2	10	765970	765979	20 %	40 %	20 %	20 %	28867942
15004	NC_004578	CAA	2	6	765993	765998	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28867942
15005	NC_004578	GGT	2	6	766015	766020	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28867942
15006	NC_004578	GAA	2	6	766021	766026	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28867942
15007	NC_004578	GGC	2	6	766048	766053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28867942
15008	NC_004578	TGAT	2	8	766085	766092	25 %	50 %	25 %	0 %	28867942
15009	NC_004578	CGA	2	6	766127	766132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28867942
15010	NC_004578	GCA	2	6	766157	766162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28867942
15011	NC_004578	CACGGG	2	12	766170	766181	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	28867942
15012	NC_004578	TA	3	6	766231	766236	50 %	50 %	0 %	0 %	28867942
15013	NC_004578	GCT	2	6	766267	766272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867942
15014	NC_004578	TAC	2	6	766284	766289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28867942
15015	NC_004578	ACA	2	6	766349	766354	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28867942
15016	NC_004578	ACCG	2	8	766403	766410	25 %	0 %	25 %	50 %	28867942
15017	NC_004578	GCG	2	6	766547	766552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28867942
15018	NC_004578	GGC	2	6	766564	766569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28867942
15019	NC_004578	CAG	2	6	766575	766580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28867942
15020	NC_004578	CTG	2	6	766691	766696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867942
15021	NC_004578	ACT	2	6	766714	766719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28867942
15022	NC_004578	GC	3	6	766733	766738	0 %	0 %	50 %	50 %	28867942
15023	NC_004578	GGC	2	6	766749	766754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28867942
15024	NC_004578	GAC	2	6	766762	766767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28867942
15025	NC_004578	GTG	2	6	766924	766929	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28867942
15026	NC_004578	CGG	2	6	766983	766988	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28867942
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15028	NC_004578	TTG	2	6	767077	767082	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28867942
15029	NC_004578	GCC	2	6	767155	767160	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28867942
15030	NC_004578	ACC	2	6	767161	767166	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28867942
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15032	NC_004578	CAA	2	6	767427	767432	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28867942
15033	NC_004578	CGG	2	6	767466	767471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28867942
15034	NC_004578	GCA	2	6	767540	767545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28867942
15035	NC_004578	CTG	2	6	767584	767589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867942
15036	NC_004578	TGG	2	6	767600	767605	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28867942
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15038	NC_004578	TTC	2	6	767703	767708	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28867942
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15040	NC_004578	TGGC	2	8	767771	767778	0 %	25 %	50 %	25 %	28867942
15041	NC_004578	CGC	2	6	767841	767846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28867942
15042	NC_004578	CGA	2	6	767847	767852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28867942
15043	NC_004578	GCA	2	6	767882	767887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28867942
15044	NC_004578	AAC	2	6	768076	768081	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15045	NC_004578	GCT	2	6	768113	768118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867943
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15050	NC_004578	CCCAG	2	10	768313	768322	20 %	0 %	20 %	60 %	28867943
15051	NC_004578	TCA	2	6	768412	768417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28867943
15052	NC_004578	TC	3	6	768460	768465	0 %	50 %	0 %	50 %	28867943
15053	NC_004578	GTC	2	6	768471	768476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867943
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15056	NC_004578	CGC	2	6	768664	768669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28867943
15057	NC_004578	CAGC	2	8	768809	768816	25 %	0 %	25 %	50 %	28867943
15058	NC_004578	A	6	6	768917	768922	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15059	NC_004578	TCAT	2	8	768924	768931	25 %	50 %	0 %	25 %	28867944
15060	NC_004578	CG	3	6	769155	769160	0 %	0 %	50 %	50 %	28867944
15061	NC_004578	TTGCT	2	10	769182	769191	0 %	60 %	20 %	20 %	28867944
15062	NC_004578	ATCA	2	8	769219	769226	50 %	25 %	0 %	25 %	28867945
15063	NC_004578	GC	3	6	769407	769412	0 %	0 %	50 %	50 %	28867945
15064	NC_004578	AGC	2	6	769429	769434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28867945
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15066	NC_004578	ATGG	2	8	769452	769459	25 %	25 %	50 %	0 %	28867945
15067	NC_004578	GC	3	6	769471	769476	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15068	NC_004578	TAAA	2	8	769498	769505	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15069	NC_004578	GCAC	2	8	769562	769569	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
15070	NC_004578	AGG	2	6	769577	769582	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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15072	NC_004578	CCAA	2	8	769698	769705	50 %	0 %	0 %	50 %	28867946
15073	NC_004578	AGCG	2	8	769774	769781	25 %	0 %	50 %	25 %	28867946
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15081	NC_004578	CG	3	6	770203	770208	0 %	0 %	50 %	50 %	28867948
15082	NC_004578	GCT	2	6	770231	770236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867948
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15087	NC_004578	CTAT	2	8	770517	770524	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15088	NC_004578	ACA	2	6	770580	770585	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15089	NC_004578	CAC	2	6	770671	770676	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15090	NC_004578	CAA	2	6	770712	770717	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28867949
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15099	NC_004578	T	6	6	771074	771079	0 %	100 %	0 %	0 %	28867949
15100	NC_004578	G	6	6	771119	771124	0 %	0 %	100 %	0 %	28867949
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15107	NC_004578	AGTC	2	8	771377	771384	25 %	25 %	25 %	25 %	28867949
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15109	NC_004578	AG	3	6	771508	771513	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15110	NC_004578	TGG	2	6	771514	771519	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15111	NC_004578	GAAT	2	8	771538	771545	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15112	NC_004578	TAA	2	6	771565	771570	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15113	NC_004578	ACG	2	6	771586	771591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15114	NC_004578	GT	3	6	771699	771704	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15115	NC_004578	GCGCA	2	10	771728	771737	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
15116	NC_004578	GAT	2	6	771794	771799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28867950
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15119	NC_004578	AGC	2	6	771932	771937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28867950
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15121	NC_004578	CGT	2	6	772029	772034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867950
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15123	NC_004578	CGT	2	6	772128	772133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867950
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