MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000 chromosome

Total Repeats: 125962

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_004578	GCC	2	6	635853	635858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28867808
12502	NC_004578	GGC	2	6	635895	635900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28867808
12503	NC_004578	GCG	2	6	635901	635906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28867808
12504	NC_004578	TCA	2	6	636040	636045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28867808
12505	NC_004578	CCACGG	2	12	636190	636201	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	28867808
12506	NC_004578	GCA	2	6	636250	636255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28867808
12507	NC_004578	CTGC	2	8	636261	636268	0 %	25 %	25 %	50 %	28867808
12508	NC_004578	GAT	2	6	636299	636304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28867808
12509	NC_004578	CGC	2	6	636314	636319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28867808
12510	NC_004578	GGC	2	6	636323	636328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28867808
12511	NC_004578	GTG	2	6	636354	636359	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28867808
12512	NC_004578	CTGGCG	2	12	636474	636485	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	28867808
12513	NC_004578	CTG	2	6	636492	636497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867808
12514	NC_004578	GGCC	2	8	636556	636563	0 %	0 %	50 %	50 %	28867808
12515	NC_004578	T	6	6	636648	636653	0 %	100 %	0 %	0 %	28867808
12516	NC_004578	GCG	2	6	636654	636659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28867808
12517	NC_004578	CGC	2	6	636727	636732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28867808
12518	NC_004578	ATG	2	6	636834	636839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28867808
12519	NC_004578	CGC	2	6	636850	636855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28867808
12520	NC_004578	GGC	2	6	636954	636959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28867808
12521	NC_004578	ACGCA	2	10	637028	637037	40 %	0 %	20 %	40 %	28867808
12522	NC_004578	TGG	2	6	637043	637048	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28867808
12523	NC_004578	TCGC	2	8	637091	637098	0 %	25 %	25 %	50 %	28867808
12524	NC_004578	CAG	3	9	637101	637109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28867808
12525	NC_004578	GCC	2	6	637130	637135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28867808
12526	NC_004578	TGC	2	6	637186	637191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867808
12527	NC_004578	TGC	2	6	637199	637204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867808
12528	NC_004578	GC	3	6	637213	637218	0 %	0 %	50 %	50 %	28867808
12529	NC_004578	CTG	2	6	637376	637381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867809
12530	NC_004578	GTG	2	6	637395	637400	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28867809
12531	NC_004578	T	6	6	637405	637410	0 %	100 %	0 %	0 %	28867809
12532	NC_004578	CGT	2	6	637423	637428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867809
12533	NC_004578	CGA	2	6	637471	637476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28867809
12534	NC_004578	GTCG	2	8	637535	637542	0 %	25 %	50 %	25 %	28867809
12535	NC_004578	GCAGT	2	10	637645	637654	20 %	20 %	40 %	20 %	28867809
12536	NC_004578	CGG	2	6	637751	637756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28867809
12537	NC_004578	CTG	2	6	637781	637786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867809
12538	NC_004578	CGT	2	6	637822	637827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867809
12539	NC_004578	CACTG	2	10	637933	637942	20 %	20 %	20 %	40 %	28867809
12540	NC_004578	GTT	2	6	637981	637986	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28867809
12541	NC_004578	CAC	2	6	637987	637992	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28867809
12542	NC_004578	GCA	3	9	638043	638051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28867809
12543	NC_004578	GCG	2	6	638058	638063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28867809
12544	NC_004578	CAC	2	6	638068	638073	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28867809
12545	NC_004578	TCGG	2	8	638090	638097	0 %	25 %	50 %	25 %	28867809
12546	NC_004578	CGG	3	9	638095	638103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28867809
12547	NC_004578	GCA	3	9	638145	638153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28867809
12548	NC_004578	GCA	2	6	638181	638186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28867809
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12550	NC_004578	AG	3	6	638486	638491	50 %	0 %	50 %	0 %	28867809
12551	NC_004578	ATC	2	6	638500	638505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28867809
12552	NC_004578	TCGCTT	2	12	638559	638570	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	28867809
12553	NC_004578	GT	3	6	638596	638601	0 %	50 %	50 %	0 %	28867809
12554	NC_004578	GGT	2	6	638619	638624	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28867809
12555	NC_004578	GAG	2	6	638633	638638	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28867809
12556	NC_004578	AGT	2	6	638639	638644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28867809
12557	NC_004578	C	7	7	638751	638757	0 %	0 %	0 %	100 %	28867809
12558	NC_004578	GGA	2	6	638773	638778	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28867809
12559	NC_004578	GCCGC	2	10	638801	638810	0 %	0 %	40 %	60 %	28867809
12560	NC_004578	TTC	2	6	638865	638870	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28867809
12561	NC_004578	CTC	2	6	638904	638909	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	28867809
12562	NC_004578	GC	3	6	638987	638992	0 %	0 %	50 %	50 %	28867809
12563	NC_004578	ACTT	2	8	639025	639032	25 %	50 %	0 %	25 %	28867809
12564	NC_004578	AGGT	2	8	639037	639044	25 %	25 %	50 %	0 %	28867809
12565	NC_004578	GGGAGG	2	12	639051	639062	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	28867809
12566	NC_004578	GGTGC	2	10	639074	639083	0 %	20 %	60 %	20 %	28867809
12567	NC_004578	TCAA	2	8	639141	639148	50 %	25 %	0 %	25 %	28867809
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12569	NC_004578	TGTT	2	8	639168	639175	0 %	75 %	25 %	0 %	28867809
12570	NC_004578	GAT	2	6	639205	639210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12571	NC_004578	TTG	2	6	639248	639253	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12572	NC_004578	ATGA	2	8	639269	639276	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
12573	NC_004578	CTCTG	2	10	639343	639352	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
12574	NC_004578	TTC	2	6	639365	639370	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12575	NC_004578	CAG	2	6	639388	639393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12576	NC_004578	GTA	2	6	639456	639461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28867810
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12578	NC_004578	AGC	2	6	639583	639588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28867810
12579	NC_004578	AATC	2	8	639676	639683	50 %	25 %	0 %	25 %	28867810
12580	NC_004578	GAT	2	6	639889	639894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28867810
12581	NC_004578	CGA	2	6	639964	639969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28867810
12582	NC_004578	GAT	2	6	640010	640015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28867810
12583	NC_004578	CTGC	2	8	640044	640051	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
12584	NC_004578	AAGTGT	2	12	640060	640071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12585	NC_004578	AGC	2	6	640145	640150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12586	NC_004578	CAT	2	6	640200	640205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12587	NC_004578	TTC	2	6	640320	640325	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28867811
12588	NC_004578	CAT	2	6	640355	640360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28867811
12589	NC_004578	T	7	7	640508	640514	0 %	100 %	0 %	0 %	28867811
12590	NC_004578	TAT	2	6	640604	640609	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28867811
12591	NC_004578	CTG	2	6	640619	640624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867811
12592	NC_004578	CAGAC	2	10	640637	640646	40 %	0 %	20 %	40 %	28867811
12593	NC_004578	TTCC	2	8	640656	640663	0 %	50 %	0 %	50 %	28867811
12594	NC_004578	TCA	2	6	640735	640740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28867811
12595	NC_004578	TCG	2	6	640744	640749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867811
12596	NC_004578	T	6	6	640770	640775	0 %	100 %	0 %	0 %	28867811
12597	NC_004578	CG	3	6	640909	640914	0 %	0 %	50 %	50 %	28867811
12598	NC_004578	TGC	2	6	640956	640961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867811
12599	NC_004578	ATCG	2	8	640972	640979	25 %	25 %	25 %	25 %	28867811
12600	NC_004578	ACG	2	6	641010	641015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12601	NC_004578	GCA	2	6	641016	641021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12602	NC_004578	CCT	3	9	641028	641036	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12603	NC_004578	CAGC	2	8	641046	641053	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
12604	NC_004578	CTC	2	6	641063	641068	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12605	NC_004578	AGGG	2	8	641116	641123	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
12606	NC_004578	CG	3	6	641132	641137	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12607	NC_004578	GTC	2	6	641192	641197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12608	NC_004578	CCGT	2	8	641247	641254	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
12609	NC_004578	TCA	2	6	641270	641275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12610	NC_004578	A	6	6	641347	641352	100 %	0 %	0 %	0 %	28867812
12611	NC_004578	GA	3	6	641363	641368	50 %	0 %	50 %	0 %	28867812
12612	NC_004578	CTT	2	6	641657	641662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28867812
12613	NC_004578	TTTGG	2	10	641716	641725	0 %	60 %	40 %	0 %	28867812
12614	NC_004578	CT	3	6	641765	641770	0 %	50 %	0 %	50 %	28867812
12615	NC_004578	ATC	2	6	641778	641783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28867812
12616	NC_004578	TGA	2	6	641795	641800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28867812
12617	NC_004578	TGT	2	6	641875	641880	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28867812
12618	NC_004578	AGCT	2	8	642072	642079	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12619	NC_004578	TCAG	2	8	642085	642092	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12620	NC_004578	TG	3	6	642128	642133	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12621	NC_004578	CGA	2	6	642205	642210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28867813
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12995	NC_004578	GCC	3	9	662499	662507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28867834
12996	NC_004578	CAG	2	6	662580	662585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28867834
12997	NC_004578	GGT	3	9	662630	662638	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28867834
12998	NC_004578	CCCAG	2	10	662642	662651	20 %	0 %	20 %	60 %	28867834
12999	NC_004578	CCGG	2	8	662664	662671	0 %	0 %	50 %	50 %	28867834
13000	NC_004578	T	6	6	662715	662720	0 %	100 %	0 %	0 %	28867834

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