MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000 chromosome

Total Repeats: 125962

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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125502	NC_004578	GAT	2	6	6373263	6373268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28872693
125503	NC_004578	TCT	2	6	6373310	6373315	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28872693
125504	NC_004578	CTT	2	6	6373324	6373329	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28872693
125505	NC_004578	TTCGT	2	10	6373418	6373427	0 %	60 %	20 %	20 %	28872693
125506	NC_004578	CGA	2	6	6373468	6373473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872693
125507	NC_004578	GAA	2	6	6373587	6373592	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28872693
125508	NC_004578	CA	3	6	6373650	6373655	50 %	0 %	0 %	50 %	28872693
125509	NC_004578	CG	3	6	6373725	6373730	0 %	0 %	50 %	50 %	28872693
125510	NC_004578	TTA	2	6	6373754	6373759	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28872693
125511	NC_004578	GTC	2	6	6373780	6373785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872693
125512	NC_004578	GTC	2	6	6373793	6373798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872693
125513	NC_004578	GC	3	6	6373838	6373843	0 %	0 %	50 %	50 %	28872693
125514	NC_004578	TGG	2	6	6373961	6373966	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28872693
125515	NC_004578	GGCA	2	8	6374031	6374038	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
125516	NC_004578	CGG	2	6	6374049	6374054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
125517	NC_004578	ACG	2	6	6374136	6374141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125518	NC_004578	CAG	2	6	6374152	6374157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125519	NC_004578	CGG	2	6	6374253	6374258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
125520	NC_004578	CAG	2	6	6374261	6374266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125521	NC_004578	AG	3	6	6374265	6374270	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
125522	NC_004578	GCA	2	6	6374293	6374298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125523	NC_004578	GTT	2	6	6374346	6374351	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125524	NC_004578	CTGG	2	8	6374380	6374387	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
125525	NC_004578	GAA	2	6	6374425	6374430	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125526	NC_004578	GGC	2	6	6374433	6374438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
125527	NC_004578	TCAA	2	8	6374445	6374452	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
125528	NC_004578	GC	3	6	6374562	6374567	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
125529	NC_004578	GCC	2	6	6374673	6374678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
125530	NC_004578	CTC	2	6	6374680	6374685	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
125531	NC_004578	TAG	2	6	6374724	6374729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125532	NC_004578	AGG	2	6	6374734	6374739	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
125533	NC_004578	TGA	2	6	6374769	6374774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125534	NC_004578	CG	3	6	6374818	6374823	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
125535	NC_004578	CGA	2	6	6374909	6374914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125536	NC_004578	TCGA	2	8	6374990	6374997	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
125537	NC_004578	C	6	6	6375083	6375088	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
125538	NC_004578	GCA	2	6	6375114	6375119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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125540	NC_004578	GTT	2	6	6375148	6375153	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125541	NC_004578	TCG	2	6	6375215	6375220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125542	NC_004578	TCA	2	6	6375222	6375227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125543	NC_004578	TGAG	2	8	6375233	6375240	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
125544	NC_004578	AC	3	6	6375278	6375283	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
125545	NC_004578	CG	3	6	6375360	6375365	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
125546	NC_004578	ACCGA	2	10	6375415	6375424	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
125547	NC_004578	GGA	2	6	6375458	6375463	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
125548	NC_004578	CTG	2	6	6375504	6375509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125549	NC_004578	GATGT	2	10	6375541	6375550	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
125550	NC_004578	GC	3	6	6375600	6375605	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
125551	NC_004578	ATC	2	6	6375695	6375700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125552	NC_004578	CCA	2	6	6375714	6375719	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
125553	NC_004578	AGAT	2	8	6375773	6375780	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
125554	NC_004578	TCG	2	6	6375789	6375794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125555	NC_004578	GAC	2	6	6375855	6375860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125556	NC_004578	AAT	2	6	6375933	6375938	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125557	NC_004578	CCT	2	6	6376027	6376032	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
125558	NC_004578	T	6	6	6376073	6376078	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
125559	NC_004578	TCA	2	6	6376127	6376132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125560	NC_004578	A	6	6	6376201	6376206	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
125561	NC_004578	TAT	2	6	6376345	6376350	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125562	NC_004578	CAA	2	6	6376378	6376383	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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125569	NC_004578	CAG	2	6	6376653	6376658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872694
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125572	NC_004578	GC	3	6	6376808	6376813	0 %	0 %	50 %	50 %	28872694
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125589	NC_004578	GCGG	2	8	6377715	6377722	0 %	0 %	75 %	25 %	28872694
125590	NC_004578	CAG	2	6	6377724	6377729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872694
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125599	NC_004578	CG	3	6	6378299	6378304	0 %	0 %	50 %	50 %	28872695
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125608	NC_004578	TGC	2	6	6378713	6378718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872695
125609	NC_004578	CGA	2	6	6378725	6378730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872695
125610	NC_004578	GCGA	2	8	6378768	6378775	25 %	0 %	50 %	25 %	28872695
125611	NC_004578	CAC	2	6	6378842	6378847	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28872695
125612	NC_004578	GCG	2	6	6378852	6378857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28872695
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125618	NC_004578	GTTTC	2	10	6379028	6379037	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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125958	NC_004578	GC	3	6	6396954	6396959	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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125961	NC_004578	T	6	6	6397088	6397093	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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