MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000 chromosome

Total Repeats: 125962

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
125001	NC_004578	CCT	2	6	6344659	6344664	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
125002	NC_004578	ATG	2	6	6344667	6344672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125003	NC_004578	CGAA	2	8	6344765	6344772	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
125004	NC_004578	TTGA	2	8	6344797	6344804	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
125005	NC_004578	GCAG	2	8	6344817	6344824	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
125006	NC_004578	AGA	2	6	6344835	6344840	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125007	NC_004578	GCCA	2	8	6344878	6344885	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
125008	NC_004578	ACG	2	6	6344913	6344918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125009	NC_004578	GAC	2	6	6345257	6345262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125010	NC_004578	TGG	2	6	6345297	6345302	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
125011	NC_004578	TTGA	2	8	6345350	6345357	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
125012	NC_004578	GCG	2	6	6345364	6345369	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
125013	NC_004578	T	7	7	6345397	6345403	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
125014	NC_004578	ACAT	2	8	6345427	6345434	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
125015	NC_004578	ACCT	2	8	6345460	6345467	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
125016	NC_004578	TTG	2	6	6345586	6345591	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28872672
125017	NC_004578	CCA	2	6	6345719	6345724	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28872672
125018	NC_004578	CTG	2	6	6345728	6345733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872672
125019	NC_004578	CAC	2	6	6345735	6345740	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28872672
125020	NC_004578	T	6	6	6345821	6345826	0 %	100 %	0 %	0 %	28872672
125021	NC_004578	TGA	2	6	6345954	6345959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28872672
125022	NC_004578	G	6	6	6345978	6345983	0 %	0 %	100 %	0 %	28872672
125023	NC_004578	CTT	2	6	6345988	6345993	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28872672
125024	NC_004578	ACA	2	6	6346033	6346038	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28872672
125025	NC_004578	TCT	2	6	6346045	6346050	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28872672
125026	NC_004578	AGG	2	6	6346134	6346139	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28872672
125027	NC_004578	AGA	2	6	6346225	6346230	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28872672
125028	NC_004578	TGA	2	6	6346261	6346266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28872672
125029	NC_004578	CGG	2	6	6346282	6346287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
125030	NC_004578	TAG	2	6	6346411	6346416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28872673
125031	NC_004578	CT	3	6	6346419	6346424	0 %	50 %	0 %	50 %	28872673
125032	NC_004578	TGC	2	6	6346499	6346504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872673
125033	NC_004578	GA	3	6	6346546	6346551	50 %	0 %	50 %	0 %	28872673
125034	NC_004578	TGT	2	6	6346583	6346588	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125035	NC_004578	A	6	6	6346614	6346619	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
125036	NC_004578	GATT	2	8	6346630	6346637	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
125037	NC_004578	GCT	2	6	6346720	6346725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125038	NC_004578	TCCA	2	8	6346735	6346742	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
125039	NC_004578	CTT	2	6	6346753	6346758	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125040	NC_004578	TGA	2	6	6346788	6346793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125041	NC_004578	CG	3	6	6346807	6346812	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
125042	NC_004578	TCA	2	6	6346857	6346862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125043	NC_004578	CCG	2	6	6346899	6346904	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
125044	NC_004578	A	7	7	6346910	6346916	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
125045	NC_004578	CA	3	6	6346918	6346923	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
125046	NC_004578	CTG	2	6	6347000	6347005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125047	NC_004578	CCAT	2	8	6347022	6347029	25 %	25 %	0 %	50 %	28872674
125048	NC_004578	GGT	2	6	6347106	6347111	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28872674
125049	NC_004578	GC	3	6	6347138	6347143	0 %	0 %	50 %	50 %	28872674
125050	NC_004578	TGA	2	6	6347192	6347197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28872674
125051	NC_004578	CTT	2	6	6347211	6347216	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28872674
125052	NC_004578	A	7	7	6347335	6347341	100 %	0 %	0 %	0 %	28872674
125053	NC_004578	GAC	2	6	6347516	6347521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872674
125054	NC_004578	CAG	2	6	6347550	6347555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872674
125055	NC_004578	TGT	2	6	6347609	6347614	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28872674
125056	NC_004578	GCA	2	6	6347662	6347667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872674
125057	NC_004578	GAG	2	6	6347804	6347809	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28872674
125058	NC_004578	CATC	2	8	6347869	6347876	25 %	25 %	0 %	50 %	28872674
125059	NC_004578	GCA	2	6	6347900	6347905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872674
125060	NC_004578	CCG	2	6	6347935	6347940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28872674
125061	NC_004578	AGC	2	6	6347999	6348004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872674
125062	NC_004578	CAG	2	6	6348022	6348027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872674
125063	NC_004578	TCA	2	6	6348096	6348101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28872674
125064	NC_004578	CAGGC	2	10	6348121	6348130	20 %	0 %	40 %	40 %	28872674
125065	NC_004578	CGC	2	6	6348200	6348205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28872674
125066	NC_004578	GTT	2	6	6348249	6348254	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28872674
125067	NC_004578	GC	3	6	6348266	6348271	0 %	0 %	50 %	50 %	28872674
125068	NC_004578	CA	3	6	6348284	6348289	50 %	0 %	0 %	50 %	28872674
125069	NC_004578	GAT	2	6	6348314	6348319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28872674
125070	NC_004578	CAGG	2	8	6348330	6348337	25 %	0 %	50 %	25 %	28872674
125071	NC_004578	A	6	6	6348364	6348369	100 %	0 %	0 %	0 %	28872674
125072	NC_004578	AGA	2	6	6348404	6348409	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28872674
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125074	NC_004578	AAC	2	6	6348490	6348495	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28872674
125075	NC_004578	GC	3	6	6348507	6348512	0 %	0 %	50 %	50 %	28872674
125076	NC_004578	GCA	2	6	6348663	6348668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125077	NC_004578	GCT	2	6	6348745	6348750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125078	NC_004578	GCAT	2	8	6348781	6348788	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
125079	NC_004578	TCT	2	6	6348872	6348877	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125080	NC_004578	ACCC	2	8	6348881	6348888	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
125081	NC_004578	A	6	6	6348911	6348916	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
125082	NC_004578	TCA	2	6	6349001	6349006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125083	NC_004578	GTG	2	6	6349058	6349063	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
125084	NC_004578	CTGC	2	8	6349072	6349079	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
125085	NC_004578	TAA	2	6	6349123	6349128	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125086	NC_004578	GAC	2	6	6349202	6349207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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125088	NC_004578	CAC	2	6	6349461	6349466	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
125089	NC_004578	CGA	2	6	6349508	6349513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125090	NC_004578	TC	3	6	6349598	6349603	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
125091	NC_004578	GAG	2	6	6349611	6349616	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
125092	NC_004578	ATG	2	6	6349688	6349693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28872675
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125094	NC_004578	CAATCG	2	12	6349725	6349736	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	28872675
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125100	NC_004578	T	6	6	6350052	6350057	0 %	100 %	0 %	0 %	28872675
125101	NC_004578	TTGCC	2	10	6350072	6350081	0 %	40 %	20 %	40 %	28872675
125102	NC_004578	CCA	2	6	6350084	6350089	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28872675
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125109	NC_004578	TGA	3	9	6350681	6350689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125110	NC_004578	AGC	2	6	6350731	6350736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125111	NC_004578	GGC	2	6	6350770	6350775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
125112	NC_004578	TCA	2	6	6350782	6350787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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125114	NC_004578	GCG	2	6	6350899	6350904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
125115	NC_004578	TGT	2	6	6350981	6350986	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125116	NC_004578	ACGG	2	8	6350999	6351006	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
125117	NC_004578	TCA	2	6	6351020	6351025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125118	NC_004578	GCA	2	6	6351029	6351034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125119	NC_004578	GCT	2	6	6351147	6351152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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125456	NC_004578	ATG	2	6	6370444	6370449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28872691
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125461	NC_004578	GAATT	2	10	6370723	6370732	40 %	40 %	20 %	0 %	28872691
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125470	NC_004578	GCAAGC	2	12	6371116	6371127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872692
125471	NC_004578	GTC	2	6	6371214	6371219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872692
125472	NC_004578	TTGA	2	8	6371346	6371353	25 %	50 %	25 %	0 %	28872692
125473	NC_004578	TGC	2	6	6371386	6371391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872692
125474	NC_004578	ACC	2	6	6371394	6371399	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28872692
125475	NC_004578	GCG	2	6	6371500	6371505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28872692
125476	NC_004578	CG	3	6	6371694	6371699	0 %	0 %	50 %	50 %	28872692
125477	NC_004578	GCT	2	6	6371717	6371722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872692
125478	NC_004578	TGA	2	6	6371743	6371748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28872692
125479	NC_004578	TGA	2	6	6371750	6371755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28872692
125480	NC_004578	GCG	2	6	6371822	6371827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28872692
125481	NC_004578	GAT	2	6	6371894	6371899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28872692
125482	NC_004578	CGA	2	6	6371942	6371947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872692
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125484	NC_004578	CGC	2	6	6372034	6372039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28872692
125485	NC_004578	ACA	2	6	6372127	6372132	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28872692
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125487	NC_004578	TGC	2	6	6372337	6372342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872692
125488	NC_004578	TGGT	2	8	6372401	6372408	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
125489	NC_004578	TCA	2	6	6372530	6372535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125490	NC_004578	CTGA	2	8	6372574	6372581	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
125491	NC_004578	GCC	2	6	6372625	6372630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
125492	NC_004578	TGCCT	2	10	6372636	6372645	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
125493	NC_004578	CTTT	2	8	6372653	6372660	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
125494	NC_004578	AGT	2	6	6372681	6372686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125495	NC_004578	CTT	2	6	6372758	6372763	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125496	NC_004578	GGT	2	6	6372822	6372827	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
125497	NC_004578	A	6	6	6372965	6372970	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
125498	NC_004578	ATCGC	2	10	6372983	6372992	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
125499	NC_004578	TGCCT	2	10	6373130	6373139	0 %	40 %	20 %	40 %	28872693
125500	NC_004578	GCTTG	2	10	6373167	6373176	0 %	40 %	40 %	20 %	28872693

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