MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000 chromosome

Total Repeats: 125962

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
124501	NC_004578	ACCGC	2	10	6319202	6319211	20 %	0 %	20 %	60 %	28872652
124502	NC_004578	CGT	2	6	6319352	6319357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872652
124503	NC_004578	GGC	2	6	6319476	6319481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28872652
124504	NC_004578	CGG	2	6	6319484	6319489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28872652
124505	NC_004578	CTG	2	6	6319567	6319572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872652
124506	NC_004578	CGT	2	6	6319614	6319619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872652
124507	NC_004578	CCA	2	6	6319712	6319717	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
124508	NC_004578	CGAA	2	8	6319776	6319783	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
124509	NC_004578	GC	3	6	6319785	6319790	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
124510	NC_004578	CAGC	2	8	6319839	6319846	25 %	0 %	25 %	50 %	28872653
124511	NC_004578	TCAC	2	8	6319901	6319908	25 %	25 %	0 %	50 %	28872653
124512	NC_004578	TTG	2	6	6319931	6319936	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28872653
124513	NC_004578	GAC	2	6	6319948	6319953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872653
124514	NC_004578	CTG	2	6	6319966	6319971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872653
124515	NC_004578	TGGCG	2	10	6319989	6319998	0 %	20 %	60 %	20 %	28872653
124516	NC_004578	CAG	2	6	6320074	6320079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872653
124517	NC_004578	CGCC	2	8	6320118	6320125	0 %	0 %	25 %	75 %	28872653
124518	NC_004578	TGA	2	6	6320166	6320171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28872653
124519	NC_004578	AAC	2	6	6320312	6320317	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28872653
124520	NC_004578	GAA	2	6	6320357	6320362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28872653
124521	NC_004578	GTC	3	9	6320374	6320382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872653
124522	NC_004578	GAT	2	6	6320392	6320397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28872653
124523	NC_004578	GCA	2	6	6320417	6320422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872653
124524	NC_004578	GT	3	6	6320427	6320432	0 %	50 %	50 %	0 %	28872653
124525	NC_004578	TCA	2	6	6320433	6320438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28872653
124526	NC_004578	GTGAA	2	10	6320464	6320473	40 %	20 %	40 %	0 %	28872654
124527	NC_004578	CGAT	2	8	6320483	6320490	25 %	25 %	25 %	25 %	28872654
124528	NC_004578	CCG	2	6	6320515	6320520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28872654
124529	NC_004578	GATC	2	8	6320532	6320539	25 %	25 %	25 %	25 %	28872654
124530	NC_004578	ATCCCC	2	12	6320557	6320568	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	28872654
124531	NC_004578	CTTG	2	8	6320570	6320577	0 %	50 %	25 %	25 %	28872654
124532	NC_004578	CGGT	2	8	6320602	6320609	0 %	25 %	50 %	25 %	28872654
124533	NC_004578	CGC	2	6	6320660	6320665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28872654
124534	NC_004578	AGC	2	6	6320752	6320757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872654
124535	NC_004578	GCG	2	6	6320789	6320794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28872654
124536	NC_004578	GCGCCA	2	12	6320852	6320863	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	28872654
124537	NC_004578	CGA	2	6	6320910	6320915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872654
124538	NC_004578	GCAC	2	8	6320929	6320936	25 %	0 %	25 %	50 %	28872654
124539	NC_004578	GAT	2	6	6320943	6320948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28872654
124540	NC_004578	CTGC	2	8	6320987	6320994	0 %	25 %	25 %	50 %	28872654
124541	NC_004578	CGG	2	6	6321020	6321025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28872654
124542	NC_004578	CCAG	2	8	6321026	6321033	25 %	0 %	25 %	50 %	28872654
124543	NC_004578	TGA	2	6	6321053	6321058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28872654
124544	NC_004578	GCA	2	6	6321100	6321105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872654
124545	NC_004578	GCCA	2	8	6321193	6321200	25 %	0 %	25 %	50 %	28872654
124546	NC_004578	GGT	2	6	6321201	6321206	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28872654
124547	NC_004578	CCA	2	6	6321218	6321223	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28872654
124548	NC_004578	TGA	2	6	6321227	6321232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28872654
124549	NC_004578	GGT	2	6	6321270	6321275	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28872654
124550	NC_004578	ACC	2	6	6321289	6321294	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28872654
124551	NC_004578	ACC	2	6	6321364	6321369	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28872654
124552	NC_004578	CAGCAA	2	12	6321438	6321449	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	28872654
124553	NC_004578	AAC	2	6	6321602	6321607	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28872655
124554	NC_004578	CGC	2	6	6321695	6321700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28872655
124555	NC_004578	ATC	2	6	6321724	6321729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28872655
124556	NC_004578	CCG	2	6	6321736	6321741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28872655
124557	NC_004578	CAG	2	6	6321769	6321774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872655
124558	NC_004578	GCT	2	6	6321789	6321794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872655
124559	NC_004578	GCA	2	6	6321837	6321842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872655
124560	NC_004578	C	6	6	6321854	6321859	0 %	0 %	0 %	100 %	28872655
124561	NC_004578	GCA	2	6	6321876	6321881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872655
124562	NC_004578	TCG	2	6	6321911	6321916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872655
124563	NC_004578	GGC	2	6	6321971	6321976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28872655
124564	NC_004578	TGG	2	6	6322011	6322016	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28872655
124565	NC_004578	TCA	2	6	6322095	6322100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28872655
124566	NC_004578	CCA	2	6	6322116	6322121	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28872655
124567	NC_004578	GGA	2	6	6322201	6322206	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28872655
124568	NC_004578	CAG	2	6	6322210	6322215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872655
124569	NC_004578	TGT	2	6	6322248	6322253	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28872655
124570	NC_004578	CAG	2	6	6322306	6322311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872655
124571	NC_004578	CGG	2	6	6322329	6322334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28872655
124572	NC_004578	GCC	2	6	6322426	6322431	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28872655
124573	NC_004578	GCC	2	6	6322487	6322492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28872655
124574	NC_004578	GC	4	8	6322494	6322501	0 %	0 %	50 %	50 %	28872655
124575	NC_004578	GCA	2	6	6322514	6322519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872655
124576	NC_004578	CGCC	2	8	6322615	6322622	0 %	0 %	25 %	75 %	28872655
124577	NC_004578	ACG	2	6	6322630	6322635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872655
124578	NC_004578	TCGG	2	8	6322655	6322662	0 %	25 %	50 %	25 %	28872655
124579	NC_004578	CAC	2	6	6322663	6322668	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28872655
124580	NC_004578	AGA	2	6	6322721	6322726	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28872655
124581	NC_004578	CGA	2	6	6322728	6322733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872655
124582	NC_004578	TGC	2	6	6322785	6322790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872655
124583	NC_004578	CAT	3	9	6322849	6322857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28872655
124584	NC_004578	CCCT	2	8	6322862	6322869	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
124585	NC_004578	CA	3	6	6322880	6322885	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
124586	NC_004578	GAC	2	6	6322973	6322978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872656
124587	NC_004578	GCC	2	6	6323046	6323051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28872656
124588	NC_004578	CGA	2	6	6323086	6323091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872656
124589	NC_004578	GC	3	6	6323125	6323130	0 %	0 %	50 %	50 %	28872656
124590	NC_004578	GTA	2	6	6323138	6323143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28872656
124591	NC_004578	ACG	2	6	6323168	6323173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872656
124592	NC_004578	CCA	2	6	6323174	6323179	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28872656
124593	NC_004578	CGA	2	6	6323329	6323334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872656
124594	NC_004578	CA	3	6	6323436	6323441	50 %	0 %	0 %	50 %	28872656
124595	NC_004578	GCA	2	6	6323491	6323496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872656
124596	NC_004578	GCC	2	6	6323712	6323717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28872656
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124598	NC_004578	GC	3	6	6323722	6323727	0 %	0 %	50 %	50 %	28872656
124599	NC_004578	CAG	2	6	6323756	6323761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872656
124600	NC_004578	GCCAGC	2	12	6323928	6323939	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	28872656
124601	NC_004578	GGT	2	6	6323966	6323971	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28872656
124602	NC_004578	CCGA	2	8	6323976	6323983	25 %	0 %	25 %	50 %	28872656
124603	NC_004578	CCA	2	6	6323998	6324003	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28872656
124604	NC_004578	A	6	6	6324005	6324010	100 %	0 %	0 %	0 %	28872656
124605	NC_004578	GCC	2	6	6324014	6324019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28872656
124606	NC_004578	GACATC	2	12	6324021	6324032	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	28872656
124607	NC_004578	GGC	2	6	6324112	6324117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28872656
124608	NC_004578	GGC	2	6	6324209	6324214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28872656
124609	NC_004578	GAA	2	6	6324254	6324259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28872656
124610	NC_004578	GAA	2	6	6324301	6324306	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28872656
124611	NC_004578	ATG	2	6	6324321	6324326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28872656
124612	NC_004578	GCC	2	6	6324351	6324356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28872656
124613	NC_004578	ACG	2	6	6324385	6324390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872656
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124615	NC_004578	GCA	2	6	6324493	6324498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872656
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124964	NC_004578	ACC	2	6	6342135	6342140	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
124965	NC_004578	T	6	6	6342141	6342146	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
124966	NC_004578	AAC	2	6	6342249	6342254	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124967	NC_004578	GAAC	2	8	6342303	6342310	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
124968	NC_004578	CAA	2	6	6342495	6342500	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124969	NC_004578	C	6	6	6342532	6342537	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
124970	NC_004578	CAT	2	6	6342556	6342561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124971	NC_004578	TGA	2	6	6342562	6342567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124972	NC_004578	TAA	2	6	6342634	6342639	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124973	NC_004578	GCTT	2	8	6342662	6342669	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
124974	NC_004578	TTC	2	6	6342732	6342737	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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124995	NC_004578	CGG	2	6	6344144	6344149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28872671
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124997	NC_004578	GTG	2	6	6344240	6344245	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28872671
124998	NC_004578	TCG	2	6	6344261	6344266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872671
124999	NC_004578	GCCGA	2	10	6344345	6344354	20 %	0 %	40 %	40 %	28872671
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