MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000 chromosome

Total Repeats: 125962

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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123502	NC_004578	GCA	2	6	6270590	6270595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872609
123503	NC_004578	CGT	2	6	6270719	6270724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872609
123504	NC_004578	CGA	2	6	6270734	6270739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872609
123505	NC_004578	CCAG	2	8	6270916	6270923	25 %	0 %	25 %	50 %	28872609
123506	NC_004578	CG	3	6	6270942	6270947	0 %	0 %	50 %	50 %	28872609
123507	NC_004578	CAG	2	6	6270990	6270995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872609
123508	NC_004578	TGC	2	6	6271018	6271023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872609
123509	NC_004578	GC	3	6	6271022	6271027	0 %	0 %	50 %	50 %	28872609
123510	NC_004578	CAG	2	6	6271049	6271054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872609
123511	NC_004578	CAGCC	2	10	6271057	6271066	20 %	0 %	20 %	60 %	28872609
123512	NC_004578	GAG	2	6	6271072	6271077	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28872609
123513	NC_004578	CGC	2	6	6271086	6271091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28872609
123514	NC_004578	GCC	2	6	6271106	6271111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28872609
123515	NC_004578	CGC	2	6	6271119	6271124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28872609
123516	NC_004578	GGT	2	6	6271265	6271270	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28872609
123517	NC_004578	CAG	2	6	6271314	6271319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872609
123518	NC_004578	TG	3	6	6271368	6271373	0 %	50 %	50 %	0 %	28872609
123519	NC_004578	TGG	2	6	6271391	6271396	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28872609
123520	NC_004578	GC	3	6	6271513	6271518	0 %	0 %	50 %	50 %	28872609
123521	NC_004578	GGCA	2	8	6271566	6271573	25 %	0 %	50 %	25 %	28872609
123522	NC_004578	GCT	2	6	6271584	6271589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872609
123523	NC_004578	CGTC	2	8	6271594	6271601	0 %	25 %	25 %	50 %	28872609
123524	NC_004578	GCT	2	6	6271631	6271636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872609
123525	NC_004578	GTGG	2	8	6271678	6271685	0 %	25 %	75 %	0 %	28872609
123526	NC_004578	AACGC	2	10	6271687	6271696	40 %	0 %	20 %	40 %	28872609
123527	NC_004578	ACA	2	6	6271747	6271752	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123528	NC_004578	TCA	2	6	6271778	6271783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123529	NC_004578	AC	3	6	6271833	6271838	50 %	0 %	0 %	50 %	28872610
123530	NC_004578	GAC	2	6	6271893	6271898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872610
123531	NC_004578	GCT	2	6	6271922	6271927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872610
123532	NC_004578	GGCCAA	2	12	6271973	6271984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872610
123533	NC_004578	GCA	2	6	6271994	6271999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872610
123534	NC_004578	CGT	2	6	6272059	6272064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872610
123535	NC_004578	CAA	2	6	6272397	6272402	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28872610
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123538	NC_004578	CGA	2	6	6272467	6272472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872611
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123540	NC_004578	CTGGC	2	10	6272597	6272606	0 %	20 %	40 %	40 %	28872611
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123544	NC_004578	CGG	2	6	6272848	6272853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28872611
123545	NC_004578	CAT	2	6	6272905	6272910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28872612
123546	NC_004578	GCCG	2	8	6272954	6272961	0 %	0 %	50 %	50 %	28872612
123547	NC_004578	TCACG	2	10	6272990	6272999	20 %	20 %	20 %	40 %	28872612
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123552	NC_004578	CTG	2	6	6273287	6273292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872612
123553	NC_004578	TGGAA	2	10	6273327	6273336	40 %	20 %	40 %	0 %	28872612
123554	NC_004578	CAA	2	6	6273346	6273351	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28872612
123555	NC_004578	TGG	2	6	6273417	6273422	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28872612
123556	NC_004578	CTGG	2	8	6273502	6273509	0 %	25 %	50 %	25 %	28872612
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123559	NC_004578	CGT	2	6	6273771	6273776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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123561	NC_004578	CGT	2	6	6273928	6273933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872613
123562	NC_004578	CCAG	2	8	6273975	6273982	25 %	0 %	25 %	50 %	28872613
123563	NC_004578	TCGA	2	8	6273986	6273993	25 %	25 %	25 %	25 %	28872613
123564	NC_004578	CA	3	6	6274040	6274045	50 %	0 %	0 %	50 %	28872613
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123570	NC_004578	A	6	6	6274357	6274362	100 %	0 %	0 %	0 %	28872613
123571	NC_004578	AGC	2	6	6274380	6274385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872613
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123574	NC_004578	GC	3	6	6274471	6274476	0 %	0 %	50 %	50 %	28872614
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123582	NC_004578	GA	3	6	6274642	6274647	50 %	0 %	50 %	0 %	28872614
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123585	NC_004578	TC	3	6	6274824	6274829	0 %	50 %	0 %	50 %	28872614
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123588	NC_004578	AAGCA	2	10	6275026	6275035	60 %	0 %	20 %	20 %	28872614
123589	NC_004578	T	6	6	6275080	6275085	0 %	100 %	0 %	0 %	28872614
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123596	NC_004578	G	6	6	6275277	6275282	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
123597	NC_004578	CGT	2	6	6275361	6275366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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123599	NC_004578	A	7	7	6275501	6275507	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
123600	NC_004578	ATG	2	6	6275545	6275550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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123602	NC_004578	CCTT	2	8	6275720	6275727	0 %	50 %	0 %	50 %	28872615
123603	NC_004578	CGA	2	6	6275739	6275744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872615
123604	NC_004578	TGG	2	6	6275757	6275762	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28872615
123605	NC_004578	GC	3	6	6275778	6275783	0 %	0 %	50 %	50 %	28872615
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123615	NC_004578	CG	3	6	6276390	6276395	0 %	0 %	50 %	50 %	28872615
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123617	NC_004578	ATC	2	6	6276467	6276472	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28872615
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123991	NC_004578	GC	3	6	6295313	6295318	0 %	0 %	50 %	50 %	28872634
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