MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000 chromosome

Total Repeats: 125962

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
123001	NC_004578	AGT	2	6	6246323	6246328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123002	NC_004578	GAC	2	6	6246385	6246390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123003	NC_004578	GCC	2	6	6246416	6246421	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
123004	NC_004578	CG	4	8	6246568	6246575	0 %	0 %	50 %	50 %	28872587
123005	NC_004578	GCA	2	6	6246669	6246674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872587
123006	NC_004578	CAC	2	6	6246779	6246784	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28872587
123007	NC_004578	CTGACC	2	12	6246851	6246862	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	28872587
123008	NC_004578	CTG	2	6	6246889	6246894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872587
123009	NC_004578	GCA	2	6	6246930	6246935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872587
123010	NC_004578	ACC	2	6	6246948	6246953	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28872587
123011	NC_004578	GCC	2	6	6246962	6246967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28872587
123012	NC_004578	GCG	2	6	6246994	6246999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28872587
123013	NC_004578	GC	3	6	6247007	6247012	0 %	0 %	50 %	50 %	28872587
123014	NC_004578	ACG	2	6	6247140	6247145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872587
123015	NC_004578	ATG	2	6	6247173	6247178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28872587
123016	NC_004578	AACGG	2	10	6247179	6247188	40 %	0 %	40 %	20 %	28872587
123017	NC_004578	CAA	2	6	6247223	6247228	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28872587
123018	NC_004578	AAT	2	6	6247348	6247353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28872587
123019	NC_004578	CCA	3	9	6247399	6247407	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28872587
123020	NC_004578	ATTG	2	8	6247526	6247533	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
123021	NC_004578	CGC	2	6	6247538	6247543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
123022	NC_004578	CTTA	2	8	6247628	6247635	25 %	50 %	0 %	25 %	28872588
123023	NC_004578	CTT	2	6	6247685	6247690	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28872588
123024	NC_004578	AGAT	2	8	6247738	6247745	50 %	25 %	25 %	0 %	28872588
123025	NC_004578	TGCG	2	8	6247763	6247770	0 %	25 %	50 %	25 %	28872588
123026	NC_004578	AGCG	2	8	6247789	6247796	25 %	0 %	50 %	25 %	28872588
123027	NC_004578	CAT	2	6	6247845	6247850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28872588
123028	NC_004578	GAT	2	6	6247893	6247898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28872588
123029	NC_004578	CGAC	2	8	6247913	6247920	25 %	0 %	25 %	50 %	28872588
123030	NC_004578	GC	3	6	6247941	6247946	0 %	0 %	50 %	50 %	28872588
123031	NC_004578	CG	3	6	6248015	6248020	0 %	0 %	50 %	50 %	28872588
123032	NC_004578	CGG	2	6	6248053	6248058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28872588
123033	NC_004578	TGG	2	6	6248066	6248071	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28872588
123034	NC_004578	TCA	2	6	6248074	6248079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28872588
123035	NC_004578	TGA	2	6	6248117	6248122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28872588
123036	NC_004578	CGC	2	6	6248139	6248144	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28872588
123037	NC_004578	GAC	2	6	6248150	6248155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872588
123038	NC_004578	TTC	2	6	6248175	6248180	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28872588
123039	NC_004578	TGC	2	6	6248186	6248191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872588
123040	NC_004578	TGAT	2	8	6248200	6248207	25 %	50 %	25 %	0 %	28872588
123041	NC_004578	GTC	2	6	6248211	6248216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872588
123042	NC_004578	GGT	2	6	6248434	6248439	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
123043	NC_004578	T	6	6	6248498	6248503	0 %	100 %	0 %	0 %	28872589
123044	NC_004578	AAC	2	6	6248516	6248521	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28872589
123045	NC_004578	CGA	2	6	6248541	6248546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872589
123046	NC_004578	GCC	2	6	6248588	6248593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28872589
123047	NC_004578	TGC	2	6	6248594	6248599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872589
123048	NC_004578	TGT	2	6	6248601	6248606	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28872589
123049	NC_004578	TTC	2	6	6248653	6248658	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28872589
123050	NC_004578	TCG	2	6	6248699	6248704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872589
123051	NC_004578	AGC	2	6	6248705	6248710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872589
123052	NC_004578	ACC	2	6	6248764	6248769	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28872589
123053	NC_004578	T	6	6	6248866	6248871	0 %	100 %	0 %	0 %	28872589
123054	NC_004578	TGT	2	6	6249000	6249005	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28872589
123055	NC_004578	GCA	2	6	6249075	6249080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872589
123056	NC_004578	CGGA	2	8	6249099	6249106	25 %	0 %	50 %	25 %	28872589
123057	NC_004578	AAC	2	6	6249155	6249160	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28872589
123058	NC_004578	TGC	2	6	6249287	6249292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872589
123059	NC_004578	CGT	2	6	6249350	6249355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123060	NC_004578	CCG	2	6	6249411	6249416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28872590
123061	NC_004578	ACCAGC	2	12	6249437	6249448	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	28872590
123062	NC_004578	GCC	2	6	6249479	6249484	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28872590
123063	NC_004578	CGT	2	6	6249510	6249515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872590
123064	NC_004578	CACC	2	8	6249606	6249613	25 %	0 %	0 %	75 %	28872590
123065	NC_004578	TCA	2	6	6249669	6249674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28872590
123066	NC_004578	GCA	2	6	6249693	6249698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872590
123067	NC_004578	TGG	2	6	6249723	6249728	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28872590
123068	NC_004578	GC	3	6	6249769	6249774	0 %	0 %	50 %	50 %	28872590
123069	NC_004578	CAC	2	6	6249799	6249804	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28872590
123070	NC_004578	CAG	2	6	6249814	6249819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872590
123071	NC_004578	CAGGC	2	10	6249844	6249853	20 %	0 %	40 %	40 %	28872590
123072	NC_004578	GCC	2	6	6249907	6249912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28872590
123073	NC_004578	CG	3	6	6250019	6250024	0 %	0 %	50 %	50 %	28872590
123074	NC_004578	CCG	2	6	6250041	6250046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28872590
123075	NC_004578	TCA	3	9	6250089	6250097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28872590
123076	NC_004578	GTC	2	6	6250150	6250155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872590
123077	NC_004578	CAC	2	6	6250234	6250239	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28872590
123078	NC_004578	GC	3	6	6250348	6250353	0 %	0 %	50 %	50 %	28872590
123079	NC_004578	GCC	2	6	6250373	6250378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28872590
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123082	NC_004578	TCTT	2	8	6250475	6250482	0 %	75 %	0 %	25 %	28872590
123083	NC_004578	AGCG	2	8	6250504	6250511	25 %	0 %	50 %	25 %	28872590
123084	NC_004578	GCC	2	6	6250550	6250555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28872590
123085	NC_004578	CCTT	2	8	6250580	6250587	0 %	50 %	0 %	50 %	28872590
123086	NC_004578	TCA	2	6	6250638	6250643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28872590
123087	NC_004578	GCT	2	6	6250654	6250659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872590
123088	NC_004578	GC	3	6	6250792	6250797	0 %	0 %	50 %	50 %	28872590
123089	NC_004578	CCTGCT	2	12	6250806	6250817	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	28872590
123090	NC_004578	ACC	2	6	6250874	6250879	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28872590
123091	NC_004578	CAG	2	6	6250884	6250889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872590
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123093	NC_004578	GC	3	6	6250989	6250994	0 %	0 %	50 %	50 %	28872590
123094	NC_004578	TGAG	2	8	6251013	6251020	25 %	25 %	50 %	0 %	28872590
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123097	NC_004578	TCA	2	6	6251102	6251107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28872591
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123100	NC_004578	CACC	2	8	6251285	6251292	25 %	0 %	0 %	75 %	28872591
123101	NC_004578	ATC	2	6	6251308	6251313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28872591
123102	NC_004578	A	6	6	6251321	6251326	100 %	0 %	0 %	0 %	28872591
123103	NC_004578	GAC	2	6	6251349	6251354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872591
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123106	NC_004578	CGAAT	2	10	6251665	6251674	40 %	20 %	20 %	20 %	28872591
123107	NC_004578	CAG	2	6	6251703	6251708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872591
123108	NC_004578	AGC	2	6	6251725	6251730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872591
123109	NC_004578	AAG	2	6	6251791	6251796	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28872591
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123112	NC_004578	GCG	2	6	6251906	6251911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28872591
123113	NC_004578	CAG	2	6	6251916	6251921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872591
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123116	NC_004578	CAA	2	6	6252108	6252113	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28872591
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123148	NC_004578	TCAG	2	8	6253500	6253507	25 %	25 %	25 %	25 %	28872592
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123225	NC_004578	TCAG	2	8	6257339	6257346	25 %	25 %	25 %	25 %	28872595
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123229	NC_004578	AC	3	6	6257501	6257506	50 %	0 %	0 %	50 %	28872595
123230	NC_004578	CAT	2	6	6257520	6257525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28872595
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123233	NC_004578	CCA	3	9	6257791	6257799	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28872596
123234	NC_004578	GT	3	6	6257890	6257895	0 %	50 %	50 %	0 %	28872596
123235	NC_004578	GTC	2	6	6257900	6257905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872596
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123241	NC_004578	ACAGA	2	10	6258367	6258376	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
123242	NC_004578	CAG	2	6	6258424	6258429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872597
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123247	NC_004578	TTC	2	6	6258761	6258766	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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123346	NC_004578	AATG	2	8	6263326	6263333	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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