MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000 chromosome

Total Repeats: 125962

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
122501	NC_004578	CCG	2	6	6219050	6219055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
122502	NC_004578	CCA	2	6	6219060	6219065	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
122503	NC_004578	TGC	2	6	6219080	6219085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122504	NC_004578	GCC	2	6	6219111	6219116	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
122505	NC_004578	CTG	2	6	6219251	6219256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122506	NC_004578	GTT	2	6	6219302	6219307	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122507	NC_004578	GGT	2	6	6219316	6219321	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
122508	NC_004578	GC	3	6	6219345	6219350	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
122509	NC_004578	TCA	2	6	6219453	6219458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122510	NC_004578	T	6	6	6219502	6219507	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
122511	NC_004578	CTT	2	6	6219538	6219543	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122512	NC_004578	A	6	6	6219667	6219672	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
122513	NC_004578	AG	3	6	6219703	6219708	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
122514	NC_004578	TA	3	6	6219731	6219736	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122515	NC_004578	TCA	2	6	6219772	6219777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28872566
122516	NC_004578	CTC	2	6	6219795	6219800	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	28872566
122517	NC_004578	GGC	2	6	6219832	6219837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28872566
122518	NC_004578	CCAC	2	8	6220019	6220026	25 %	0 %	0 %	75 %	28872566
122519	NC_004578	ATC	2	6	6220119	6220124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28872566
122520	NC_004578	ACTG	2	8	6220166	6220173	25 %	25 %	25 %	25 %	28872566
122521	NC_004578	CAGG	2	8	6220305	6220312	25 %	0 %	50 %	25 %	28872566
122522	NC_004578	TGC	2	6	6220345	6220350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872566
122523	NC_004578	C	6	6	6220468	6220473	0 %	0 %	0 %	100 %	28872566
122524	NC_004578	TCA	2	6	6220490	6220495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28872566
122525	NC_004578	GCC	2	6	6220630	6220635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28872566
122526	NC_004578	CCA	2	6	6220639	6220644	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28872566
122527	NC_004578	CGC	2	6	6220677	6220682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28872566
122528	NC_004578	TAA	2	6	6220762	6220767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28872566
122529	NC_004578	GCC	2	6	6220768	6220773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28872566
122530	NC_004578	TGA	2	6	6220859	6220864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28872566
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122532	NC_004578	CAC	2	6	6221049	6221054	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28872567
122533	NC_004578	GC	3	6	6221073	6221078	0 %	0 %	50 %	50 %	28872567
122534	NC_004578	TCG	2	6	6221089	6221094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872567
122535	NC_004578	GC	3	6	6221130	6221135	0 %	0 %	50 %	50 %	28872567
122536	NC_004578	CTG	2	6	6221316	6221321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872567
122537	NC_004578	CAG	2	6	6221353	6221358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872567
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122539	NC_004578	CG	3	6	6221505	6221510	0 %	0 %	50 %	50 %	28872567
122540	NC_004578	ATGA	2	8	6221526	6221533	50 %	25 %	25 %	0 %	28872567
122541	NC_004578	CGT	2	6	6221591	6221596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872567
122542	NC_004578	CAC	2	6	6221607	6221612	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28872567
122543	NC_004578	TGC	2	6	6221651	6221656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872567
122544	NC_004578	ATC	2	6	6221698	6221703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28872567
122545	NC_004578	AGC	2	6	6221744	6221749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872567
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122547	NC_004578	GCC	2	6	6221928	6221933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28872567
122548	NC_004578	CAG	2	6	6221958	6221963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872567
122549	NC_004578	CTT	2	6	6222086	6222091	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28872567
122550	NC_004578	CAA	2	6	6222111	6222116	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28872567
122551	NC_004578	CAA	2	6	6222279	6222284	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122552	NC_004578	GAA	2	6	6222297	6222302	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122553	NC_004578	CG	3	6	6222358	6222363	0 %	0 %	50 %	50 %	28872568
122554	NC_004578	GCC	2	6	6222516	6222521	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28872568
122555	NC_004578	CAG	2	6	6222530	6222535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872568
122556	NC_004578	GC	3	6	6222582	6222587	0 %	0 %	50 %	50 %	28872568
122557	NC_004578	GCC	2	6	6222734	6222739	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28872568
122558	NC_004578	CA	3	6	6222777	6222782	50 %	0 %	0 %	50 %	28872568
122559	NC_004578	GGGC	2	8	6222829	6222836	0 %	0 %	75 %	25 %	28872568
122560	NC_004578	GCT	2	6	6222874	6222879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872568
122561	NC_004578	ACC	2	6	6222887	6222892	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28872568
122562	NC_004578	GCAG	2	8	6222988	6222995	25 %	0 %	50 %	25 %	28872568
122563	NC_004578	CAA	2	6	6223096	6223101	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28872568
122564	NC_004578	TGA	2	6	6223113	6223118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28872568
122565	NC_004578	CTGG	2	8	6223165	6223172	0 %	25 %	50 %	25 %	28872568
122566	NC_004578	AT	3	6	6223256	6223261	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122567	NC_004578	A	6	6	6223291	6223296	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
122568	NC_004578	A	6	6	6223373	6223378	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
122569	NC_004578	AT	3	6	6223501	6223506	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122570	NC_004578	TTGA	2	8	6223561	6223568	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
122571	NC_004578	CCAG	2	8	6223583	6223590	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
122572	NC_004578	CCTA	2	8	6223614	6223621	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
122573	NC_004578	A	6	6	6223630	6223635	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
122574	NC_004578	GCT	2	6	6223702	6223707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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122577	NC_004578	GTC	2	6	6223867	6223872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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122582	NC_004578	TGA	2	6	6224117	6224122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122583	NC_004578	GTG	2	6	6224218	6224223	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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122585	NC_004578	CAT	2	6	6224415	6224420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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122587	NC_004578	TGC	2	6	6224459	6224464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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122589	NC_004578	GGC	2	6	6224530	6224535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
122590	NC_004578	GTC	2	6	6224566	6224571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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122592	NC_004578	CTG	2	6	6224653	6224658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122593	NC_004578	GCT	2	6	6224670	6224675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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122596	NC_004578	AC	3	6	6224778	6224783	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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122600	NC_004578	GCTG	2	8	6225004	6225011	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
122601	NC_004578	GCT	2	6	6225126	6225131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872569
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122604	NC_004578	CAC	2	6	6225243	6225248	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28872569
122605	NC_004578	CTG	2	6	6225328	6225333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872569
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122610	NC_004578	GCA	2	6	6225645	6225650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872569
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122853	NC_004578	CGG	2	6	6237398	6237403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28872582
122854	NC_004578	TGC	2	6	6237406	6237411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872582
122855	NC_004578	CTG	2	6	6237480	6237485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872582
122856	NC_004578	GC	3	6	6237509	6237514	0 %	0 %	50 %	50 %	28872582
122857	NC_004578	AC	3	6	6237517	6237522	50 %	0 %	0 %	50 %	28872582
122858	NC_004578	GCT	2	6	6237530	6237535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872582
122859	NC_004578	GGC	2	6	6237549	6237554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28872582
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122862	NC_004578	TGC	2	6	6237784	6237789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872583
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122890	NC_004578	TGC	2	6	6238948	6238953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872583
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122898	NC_004578	CTGGG	2	10	6239421	6239430	0 %	20 %	60 %	20 %	28872584
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