MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000 chromosome

Total Repeats: 125962

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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122002	NC_004578	TGA	2	6	6191205	6191210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28872547
122003	NC_004578	TCC	2	6	6191342	6191347	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	28872547
122004	NC_004578	AACCA	2	10	6191364	6191373	60 %	0 %	0 %	40 %	28872547
122005	NC_004578	GCA	2	6	6191394	6191399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872547
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122009	NC_004578	A	7	7	6191761	6191767	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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122011	NC_004578	A	6	6	6191909	6191914	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
122012	NC_004578	ATA	2	6	6191944	6191949	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122013	NC_004578	GAT	2	6	6191980	6191985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122014	NC_004578	GAT	2	6	6191989	6191994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122015	NC_004578	ATTT	2	8	6192037	6192044	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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122346	NC_004578	TGT	2	6	6209821	6209826	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28872563
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122352	NC_004578	GCAC	2	8	6210212	6210219	25 %	0 %	25 %	50 %	28872563
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122354	NC_004578	CTC	2	6	6210277	6210282	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	28872563
122355	NC_004578	GCG	2	6	6210349	6210354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28872563
122356	NC_004578	CAG	2	6	6210396	6210401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872563
122357	NC_004578	GTG	2	6	6210501	6210506	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28872563
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122366	NC_004578	CAG	2	6	6211019	6211024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872563
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122382	NC_004578	TGA	2	6	6212150	6212155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28872563
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122412	NC_004578	GGTG	2	8	6213576	6213583	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
122413	NC_004578	TG	3	6	6213590	6213595	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
122414	NC_004578	CTG	2	6	6213752	6213757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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122420	NC_004578	GGT	2	6	6213998	6214003	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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122424	NC_004578	AC	3	6	6214240	6214245	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
122425	NC_004578	CGT	2	6	6214258	6214263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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122432	NC_004578	GC	3	6	6214747	6214752	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
122433	NC_004578	CTC	2	6	6214807	6214812	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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122442	NC_004578	ACC	2	6	6215462	6215467	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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122448	NC_004578	CGACT	2	10	6215973	6215982	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
122449	NC_004578	CTTT	2	8	6215997	6216004	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
122450	NC_004578	GCT	2	6	6216013	6216018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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122452	NC_004578	GTT	2	6	6216103	6216108	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122453	NC_004578	ACG	2	6	6216118	6216123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122454	NC_004578	GT	3	6	6216140	6216145	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
122455	NC_004578	GAG	2	6	6216271	6216276	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
122456	NC_004578	TCGGT	2	10	6216349	6216358	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
122457	NC_004578	CAA	2	6	6216537	6216542	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122458	NC_004578	GTCA	2	8	6216644	6216651	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
122459	NC_004578	GTA	2	6	6216652	6216657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122460	NC_004578	GGA	2	6	6216667	6216672	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
122461	NC_004578	C	6	6	6216677	6216682	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
122462	NC_004578	GCC	2	6	6216767	6216772	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
122463	NC_004578	TCGC	2	8	6216824	6216831	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
122464	NC_004578	ACT	2	6	6216833	6216838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122465	NC_004578	ATG	2	6	6216940	6216945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122466	NC_004578	CTT	2	6	6217064	6217069	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122467	NC_004578	GAC	2	6	6217112	6217117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122468	NC_004578	TTTC	2	8	6217194	6217201	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
122469	NC_004578	TC	3	6	6217272	6217277	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
122470	NC_004578	GTG	2	6	6217321	6217326	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
122471	NC_004578	CCT	2	6	6217352	6217357	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
122472	NC_004578	AGGC	2	8	6217365	6217372	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
122473	NC_004578	TGG	2	6	6217442	6217447	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
122474	NC_004578	GCAAA	2	10	6217531	6217540	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
122475	NC_004578	GCT	2	6	6217542	6217547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122476	NC_004578	TCT	2	6	6217556	6217561	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122477	NC_004578	GTC	2	6	6217606	6217611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122478	NC_004578	AGG	2	6	6217617	6217622	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
122479	NC_004578	C	6	6	6217699	6217704	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
122480	NC_004578	GT	3	6	6217758	6217763	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
122481	NC_004578	GT	3	6	6217927	6217932	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
122482	NC_004578	ATG	2	6	6217952	6217957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122483	NC_004578	TCC	2	6	6217978	6217983	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
122484	NC_004578	CACGA	2	10	6218079	6218088	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
122485	NC_004578	GAC	2	6	6218092	6218097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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122487	NC_004578	CTC	2	6	6218134	6218139	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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122491	NC_004578	CCA	2	6	6218484	6218489	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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