MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000 chromosome

Total Repeats: 125962

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
121501	NC_004578	GAT	2	6	6164682	6164687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28872530
121502	NC_004578	CGC	2	6	6164717	6164722	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28872530
121503	NC_004578	ATG	3	9	6164800	6164808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28872530
121504	NC_004578	CGC	2	6	6164905	6164910	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28872531
121505	NC_004578	ACA	2	6	6164919	6164924	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28872531
121506	NC_004578	AGC	2	6	6165096	6165101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872532
121507	NC_004578	CG	3	6	6165126	6165131	0 %	0 %	50 %	50 %	28872532
121508	NC_004578	CGT	2	6	6165148	6165153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872532
121509	NC_004578	GCT	2	6	6165218	6165223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872532
121510	NC_004578	AG	3	6	6165249	6165254	50 %	0 %	50 %	0 %	28872532
121511	NC_004578	CGA	2	6	6165418	6165423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872532
121512	NC_004578	GCAGG	2	10	6165463	6165472	20 %	0 %	60 %	20 %	28872532
121513	NC_004578	TGC	2	6	6165560	6165565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872532
121514	NC_004578	GCA	2	6	6165628	6165633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872532
121515	NC_004578	GCA	2	6	6165637	6165642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872532
121516	NC_004578	GCTTG	2	10	6165643	6165652	0 %	40 %	40 %	20 %	28872532
121517	NC_004578	TCG	2	6	6165678	6165683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872532
121518	NC_004578	GCC	2	6	6165695	6165700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28872532
121519	NC_004578	CTT	2	6	6165871	6165876	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28872532
121520	NC_004578	TC	3	6	6165889	6165894	0 %	50 %	0 %	50 %	28872532
121521	NC_004578	GCA	2	6	6165898	6165903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872532
121522	NC_004578	GCA	2	6	6165922	6165927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872532
121523	NC_004578	ATC	2	6	6165936	6165941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28872532
121524	NC_004578	GCA	2	6	6166051	6166056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872532
121525	NC_004578	GTTGA	2	10	6166058	6166067	20 %	40 %	40 %	0 %	28872532
121526	NC_004578	GA	3	6	6166094	6166099	50 %	0 %	50 %	0 %	28872532
121527	NC_004578	CAA	3	9	6166142	6166150	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28872532
121528	NC_004578	GAC	2	6	6166175	6166180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872532
121529	NC_004578	AGC	2	6	6166191	6166196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872532
121530	NC_004578	CAG	2	6	6166406	6166411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872532
121531	NC_004578	CCGC	2	8	6166489	6166496	0 %	0 %	25 %	75 %	28872532
121532	NC_004578	CAA	2	6	6166517	6166522	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28872532
121533	NC_004578	CAG	2	6	6166698	6166703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872533
121534	NC_004578	GAC	2	6	6166793	6166798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872533
121535	NC_004578	GTA	2	6	6166869	6166874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28872533
121536	NC_004578	CCGG	2	8	6166928	6166935	0 %	0 %	50 %	50 %	28872533
121537	NC_004578	CGG	2	6	6166955	6166960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28872533
121538	NC_004578	CG	3	6	6166966	6166971	0 %	0 %	50 %	50 %	28872533
121539	NC_004578	TCA	2	6	6167018	6167023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28872533
121540	NC_004578	CGT	2	6	6167063	6167068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872533
121541	NC_004578	TCA	2	6	6167134	6167139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28872533
121542	NC_004578	AGC	2	6	6167140	6167145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872533
121543	NC_004578	GCC	2	6	6167187	6167192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28872533
121544	NC_004578	GGC	2	6	6167215	6167220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28872533
121545	NC_004578	TGG	2	6	6167273	6167278	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28872533
121546	NC_004578	ACA	2	6	6167300	6167305	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28872533
121547	NC_004578	AGCG	2	8	6167310	6167317	25 %	0 %	50 %	25 %	28872533
121548	NC_004578	CGC	2	6	6167342	6167347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28872533
121549	NC_004578	GC	3	6	6167410	6167415	0 %	0 %	50 %	50 %	28872533
121550	NC_004578	GCT	2	6	6167641	6167646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872533
121551	NC_004578	TCG	2	6	6167704	6167709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872533
121552	NC_004578	CAG	2	6	6167895	6167900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872533
121553	NC_004578	ACC	2	6	6167940	6167945	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28872533
121554	NC_004578	CAGC	2	8	6167948	6167955	25 %	0 %	25 %	50 %	28872533
121555	NC_004578	ACGC	2	8	6168003	6168010	25 %	0 %	25 %	50 %	28872533
121556	NC_004578	GC	4	8	6168009	6168016	0 %	0 %	50 %	50 %	28872533
121557	NC_004578	GGC	2	6	6168056	6168061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28872533
121558	NC_004578	CGG	2	6	6168086	6168091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28872533
121559	NC_004578	CGT	2	6	6168104	6168109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872533
121560	NC_004578	CGGT	2	8	6168182	6168189	0 %	25 %	50 %	25 %	28872533
121561	NC_004578	CTT	2	6	6168246	6168251	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28872533
121562	NC_004578	CGT	2	6	6168264	6168269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872533
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121564	NC_004578	ACC	2	6	6168333	6168338	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28872533
121565	NC_004578	GCC	2	6	6168345	6168350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28872533
121566	NC_004578	TCG	2	6	6168415	6168420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872533
121567	NC_004578	GCA	2	6	6168473	6168478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872533
121568	NC_004578	CAG	2	6	6168495	6168500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872533
121569	NC_004578	GCA	2	6	6168535	6168540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872533
121570	NC_004578	GCG	2	6	6168615	6168620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28872533
121571	NC_004578	CTG	2	6	6168696	6168701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872533
121572	NC_004578	AGC	2	6	6168744	6168749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872533
121573	NC_004578	GCT	2	6	6168767	6168772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872533
121574	NC_004578	CTTG	2	8	6168773	6168780	0 %	50 %	25 %	25 %	28872533
121575	NC_004578	AGT	2	6	6168868	6168873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28872533
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121578	NC_004578	CG	3	6	6169060	6169065	0 %	0 %	50 %	50 %	28872533
121579	NC_004578	CAG	2	6	6169086	6169091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872533
121580	NC_004578	ACG	2	6	6169167	6169172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872533
121581	NC_004578	GTT	2	6	6169199	6169204	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28872533
121582	NC_004578	TCA	2	6	6169220	6169225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28872533
121583	NC_004578	TGC	2	6	6169248	6169253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872534
121584	NC_004578	CAC	2	6	6169261	6169266	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28872534
121585	NC_004578	TTC	2	6	6169348	6169353	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28872534
121586	NC_004578	CA	3	6	6169416	6169421	50 %	0 %	0 %	50 %	28872534
121587	NC_004578	CACG	2	8	6169512	6169519	25 %	0 %	25 %	50 %	28872534
121588	NC_004578	TCG	2	6	6169583	6169588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872534
121589	NC_004578	TAA	2	6	6169646	6169651	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28872534
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121592	NC_004578	CAGTT	2	10	6169727	6169736	20 %	40 %	20 %	20 %	28872534
121593	NC_004578	GC	3	6	6169806	6169811	0 %	0 %	50 %	50 %	28872534
121594	NC_004578	TTC	2	6	6169841	6169846	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28872534
121595	NC_004578	GGT	2	6	6169875	6169880	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28872534
121596	NC_004578	GC	5	10	6170002	6170011	0 %	0 %	50 %	50 %	28872534
121597	NC_004578	A	6	6	6170029	6170034	100 %	0 %	0 %	0 %	28872534
121598	NC_004578	CAG	2	6	6170155	6170160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872534
121599	NC_004578	GTG	2	6	6170234	6170239	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28872534
121600	NC_004578	TG	3	6	6170260	6170265	0 %	50 %	50 %	0 %	28872535
121601	NC_004578	GTA	2	6	6170502	6170507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28872535
121602	NC_004578	AGTTTG	2	12	6170707	6170718	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	28872535
121603	NC_004578	TCGA	2	8	6170749	6170756	25 %	25 %	25 %	25 %	28872535
121604	NC_004578	AGA	2	6	6170826	6170831	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28872535
121605	NC_004578	AC	3	6	6170966	6170971	50 %	0 %	0 %	50 %	28872535
121606	NC_004578	CGG	2	6	6170993	6170998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28872535
121607	NC_004578	GCA	3	9	6170999	6171007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872535
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121609	NC_004578	TCT	2	6	6171178	6171183	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28872535
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121612	NC_004578	GC	3	6	6171365	6171370	0 %	0 %	50 %	50 %	28872535
121613	NC_004578	GCAG	2	8	6171440	6171447	25 %	0 %	50 %	25 %	28872535
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