MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000 chromosome

Total Repeats: 125962

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
121001	NC_004578	GCG	2	6	6139173	6139178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28872515
121002	NC_004578	CGTG	2	8	6139196	6139203	0 %	25 %	50 %	25 %	28872515
121003	NC_004578	CAA	2	6	6139214	6139219	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28872515
121004	NC_004578	GCG	2	6	6139255	6139260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28872515
121005	NC_004578	ACCA	2	8	6139359	6139366	50 %	0 %	0 %	50 %	28872515
121006	NC_004578	GC	3	6	6139408	6139413	0 %	0 %	50 %	50 %	28872515
121007	NC_004578	GGT	2	6	6139415	6139420	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28872515
121008	NC_004578	GCG	2	6	6139540	6139545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28872515
121009	NC_004578	CTG	2	6	6139578	6139583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872515
121010	NC_004578	AC	3	6	6139649	6139654	50 %	0 %	0 %	50 %	28872515
121011	NC_004578	GGC	2	6	6139676	6139681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28872515
121012	NC_004578	TGA	2	6	6139685	6139690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28872515
121013	NC_004578	GC	3	6	6139752	6139757	0 %	0 %	50 %	50 %	28872515
121014	NC_004578	TCA	2	6	6139780	6139785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28872515
121015	NC_004578	TGC	3	9	6139855	6139863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872515
121016	NC_004578	TTC	2	6	6139965	6139970	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28872515
121017	NC_004578	CG	3	6	6140008	6140013	0 %	0 %	50 %	50 %	28872515
121018	NC_004578	CCG	2	6	6140125	6140130	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28872515
121019	NC_004578	CGACAT	2	12	6140237	6140248	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	28872515
121020	NC_004578	TGGCTG	2	12	6140406	6140417	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	28872515
121021	NC_004578	GGC	2	6	6140502	6140507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28872515
121022	NC_004578	ACA	2	6	6140671	6140676	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28872515
121023	NC_004578	CCA	2	6	6140677	6140682	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28872515
121024	NC_004578	GAC	2	6	6140694	6140699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872515
121025	NC_004578	ACGTG	2	10	6140723	6140732	20 %	20 %	40 %	20 %	28872515
121026	NC_004578	CAT	2	6	6140753	6140758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28872515
121027	NC_004578	CCAG	2	8	6140771	6140778	25 %	0 %	25 %	50 %	28872515
121028	NC_004578	GCGTC	2	10	6140822	6140831	0 %	20 %	40 %	40 %	28872515
121029	NC_004578	CGG	2	6	6140863	6140868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28872515
121030	NC_004578	TAC	2	6	6140883	6140888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28872515
121031	NC_004578	GCA	3	9	6140932	6140940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872515
121032	NC_004578	A	6	6	6141012	6141017	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
121033	NC_004578	A	7	7	6141025	6141031	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
121034	NC_004578	TC	4	8	6141038	6141045	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
121035	NC_004578	TCG	2	6	6141143	6141148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121036	NC_004578	TTC	2	6	6141165	6141170	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121037	NC_004578	TGT	3	9	6141234	6141242	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28872516
121038	NC_004578	GCG	2	6	6141258	6141263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28872516
121039	NC_004578	GGCA	2	8	6141271	6141278	25 %	0 %	50 %	25 %	28872516
121040	NC_004578	TGGG	2	8	6141306	6141313	0 %	25 %	75 %	0 %	28872516
121041	NC_004578	CTCGG	2	10	6141317	6141326	0 %	20 %	40 %	40 %	28872516
121042	NC_004578	TCG	2	6	6141327	6141332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872516
121043	NC_004578	CGG	2	6	6141343	6141348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28872516
121044	NC_004578	CGG	2	6	6141391	6141396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28872516
121045	NC_004578	CGGT	2	8	6141399	6141406	0 %	25 %	50 %	25 %	28872516
121046	NC_004578	TCG	2	6	6141412	6141417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872516
121047	NC_004578	GCGG	2	8	6141458	6141465	0 %	0 %	75 %	25 %	28872516
121048	NC_004578	GGC	2	6	6141488	6141493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28872516
121049	NC_004578	CAG	2	6	6141516	6141521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872516
121050	NC_004578	GGC	3	9	6141527	6141535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28872516
121051	NC_004578	TGC	2	6	6141538	6141543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872516
121052	NC_004578	TGA	2	6	6141577	6141582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28872516
121053	NC_004578	TCG	2	6	6141583	6141588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872516
121054	NC_004578	TGA	2	6	6141604	6141609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28872516
121055	NC_004578	CAA	2	6	6141640	6141645	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28872516
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121058	NC_004578	A	6	6	6141856	6141861	100 %	0 %	0 %	0 %	28872517
121059	NC_004578	TGGC	2	8	6141885	6141892	0 %	25 %	50 %	25 %	28872517
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121061	NC_004578	CAGG	2	8	6141977	6141984	25 %	0 %	50 %	25 %	28872517
121062	NC_004578	GC	3	6	6142053	6142058	0 %	0 %	50 %	50 %	28872517
121063	NC_004578	GC	3	6	6142113	6142118	0 %	0 %	50 %	50 %	28872517
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121065	NC_004578	GCA	2	6	6142193	6142198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872517
121066	NC_004578	GTC	2	6	6142213	6142218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872517
121067	NC_004578	TGCT	2	8	6142219	6142226	0 %	50 %	25 %	25 %	28872517
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121070	NC_004578	CGT	2	6	6142571	6142576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872517
121071	NC_004578	GC	4	8	6142578	6142585	0 %	0 %	50 %	50 %	28872517
121072	NC_004578	CG	3	6	6142604	6142609	0 %	0 %	50 %	50 %	28872517
121073	NC_004578	CAC	2	6	6142770	6142775	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28872517
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121083	NC_004578	CAG	3	9	6143163	6143171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872517
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121085	NC_004578	GC	3	6	6143367	6143372	0 %	0 %	50 %	50 %	28872517
121086	NC_004578	CAT	2	6	6143393	6143398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28872517
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121089	NC_004578	ACC	2	6	6143491	6143496	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28872517
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121091	NC_004578	CCGG	2	8	6143618	6143625	0 %	0 %	50 %	50 %	28872517
121092	NC_004578	ATAC	2	8	6143722	6143729	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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121101	NC_004578	TGG	2	6	6144019	6144024	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28872518
121102	NC_004578	GCCGC	2	10	6144048	6144057	0 %	0 %	40 %	60 %	28872518
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121107	NC_004578	CAGA	2	8	6144294	6144301	50 %	0 %	25 %	25 %	28872518
121108	NC_004578	GC	3	6	6144357	6144362	0 %	0 %	50 %	50 %	28872518
121109	NC_004578	CG	3	6	6144438	6144443	0 %	0 %	50 %	50 %	28872518
121110	NC_004578	TCGC	2	8	6144503	6144510	0 %	25 %	25 %	50 %	28872518
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121113	NC_004578	CGA	2	6	6144596	6144601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872518
121114	NC_004578	AG	3	6	6144602	6144607	50 %	0 %	50 %	0 %	28872518
121115	NC_004578	AGC	2	6	6144619	6144624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872518
121116	NC_004578	CA	3	6	6144747	6144752	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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121118	NC_004578	CGG	2	6	6144931	6144936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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121241	NC_004578	ACC	2	6	6151870	6151875	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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121472	NC_004578	CAGC	2	8	6163560	6163567	25 %	0 %	25 %	50 %	28872529
121473	NC_004578	AAAG	2	8	6163573	6163580	75 %	0 %	25 %	0 %	28872529
121474	NC_004578	GCG	2	6	6163588	6163593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28872529
121475	NC_004578	CAT	2	6	6163603	6163608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28872530
121476	NC_004578	TGG	2	6	6163612	6163617	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28872530
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121494	NC_004578	CGT	2	6	6164414	6164419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872530
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121499	NC_004578	TGC	2	6	6164597	6164602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872530
121500	NC_004578	TGA	2	6	6164650	6164655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28872530

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