MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000 chromosome

Total Repeats: 125962

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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118002	NC_004578	A	6	6	5983468	5983473	100 %	0 %	0 %	0 %	28872375
118003	NC_004578	T	6	6	5983586	5983591	0 %	100 %	0 %	0 %	28872375
118004	NC_004578	TGG	2	6	5983726	5983731	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28872375
118005	NC_004578	CAA	2	6	5983733	5983738	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28872375
118006	NC_004578	TCT	2	6	5983747	5983752	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28872375
118007	NC_004578	GGC	2	6	5983827	5983832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28872375
118008	NC_004578	CA	3	6	5983882	5983887	50 %	0 %	0 %	50 %	28872375
118009	NC_004578	CG	3	6	5983911	5983916	0 %	0 %	50 %	50 %	28872375
118010	NC_004578	CCG	2	6	5984087	5984092	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28872375
118011	NC_004578	TTCGAC	2	12	5984178	5984189	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	28872375
118012	NC_004578	ATC	2	6	5984208	5984213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28872375
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118014	NC_004578	ACT	2	6	5984275	5984280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28872375
118015	NC_004578	GCT	2	6	5984351	5984356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872375
118016	NC_004578	TGG	2	6	5984402	5984407	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28872375
118017	NC_004578	AAC	3	9	5984451	5984459	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28872375
118018	NC_004578	GCACC	2	10	5984477	5984486	20 %	0 %	20 %	60 %	28872375
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118020	NC_004578	GAAA	2	8	5984543	5984550	75 %	0 %	25 %	0 %	28872375
118021	NC_004578	CTG	3	9	5984554	5984562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872375
118022	NC_004578	CGG	2	6	5984570	5984575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28872375
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118039	NC_004578	CACG	2	8	5985514	5985521	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
118040	NC_004578	CTGG	2	8	5985591	5985598	0 %	25 %	50 %	25 %	28872376
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118051	NC_004578	GC	3	6	5986228	5986233	0 %	0 %	50 %	50 %	28872376
118052	NC_004578	AGC	2	6	5986269	5986274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872376
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118232	NC_004578	GTG	2	6	5995195	5995200	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28872384
118233	NC_004578	GCTGAT	2	12	5995201	5995212	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	28872384
118234	NC_004578	TCG	2	6	5995215	5995220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872384
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118238	NC_004578	TCG	2	6	5995269	5995274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872384
118239	NC_004578	CTG	2	6	5995277	5995282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872384
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118241	NC_004578	GC	3	6	5995394	5995399	0 %	0 %	50 %	50 %	28872384
118242	NC_004578	GCT	2	6	5995429	5995434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872384
118243	NC_004578	CAT	2	6	5995438	5995443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28872384
118244	NC_004578	GCCGC	2	10	5995535	5995544	0 %	0 %	40 %	60 %	28872384
118245	NC_004578	CTGA	2	8	5995556	5995563	25 %	25 %	25 %	25 %	28872384
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118247	NC_004578	CAT	2	6	5995672	5995677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28872384
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118252	NC_004578	GTC	2	6	5995835	5995840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872384
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118261	NC_004578	GCG	2	6	5996147	5996152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28872385
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118302	NC_004578	GCTG	2	8	5998172	5998179	0 %	25 %	50 %	25 %	28872386
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118334	NC_004578	GCC	2	6	5999509	5999514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28872387
118335	NC_004578	GCT	2	6	5999611	5999616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872387
118336	NC_004578	CTGC	2	8	5999678	5999685	0 %	25 %	25 %	50 %	28872387
118337	NC_004578	GCA	2	6	5999753	5999758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872387
118338	NC_004578	T	6	6	5999785	5999790	0 %	100 %	0 %	0 %	28872387
118339	NC_004578	TGT	2	6	5999819	5999824	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28872387
118340	NC_004578	TGC	2	6	5999913	5999918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118341	NC_004578	CCGC	2	8	6000014	6000021	0 %	0 %	25 %	75 %	28872388
118342	NC_004578	GTT	2	6	6000063	6000068	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28872388
118343	NC_004578	CTCGGC	2	12	6000075	6000086	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	28872388
118344	NC_004578	CGG	2	6	6000129	6000134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28872388
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118346	NC_004578	GC	3	6	6000156	6000161	0 %	0 %	50 %	50 %	28872388
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