MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000 chromosome

Total Repeats: 125962

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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117002	NC_004578	TCA	2	6	5931215	5931220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28872322
117003	NC_004578	GCT	2	6	5931275	5931280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872322
117004	NC_004578	T	6	6	5931334	5931339	0 %	100 %	0 %	0 %	28872322
117005	NC_004578	CATT	2	8	5931506	5931513	25 %	50 %	0 %	25 %	28872322
117006	NC_004578	GCC	3	9	5931663	5931671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28872322
117007	NC_004578	GTT	2	6	5931681	5931686	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28872322
117008	NC_004578	T	6	6	5931735	5931740	0 %	100 %	0 %	0 %	28872322
117009	NC_004578	GGC	2	6	5931824	5931829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28872322
117010	NC_004578	TA	3	6	5931942	5931947	50 %	50 %	0 %	0 %	28872322
117011	NC_004578	TCAG	2	8	5931964	5931971	25 %	25 %	25 %	25 %	28872322
117012	NC_004578	TGC	2	6	5931992	5931997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872322
117013	NC_004578	A	8	8	5932005	5932012	100 %	0 %	0 %	0 %	28872322
117014	NC_004578	AAAT	2	8	5932033	5932040	75 %	25 %	0 %	0 %	28872323
117015	NC_004578	GTTTTA	2	12	5932050	5932061	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	28872323
117016	NC_004578	AAG	2	6	5932117	5932122	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28872323
117017	NC_004578	A	7	7	5932144	5932150	100 %	0 %	0 %	0 %	28872323
117018	NC_004578	A	6	6	5932182	5932187	100 %	0 %	0 %	0 %	28872323
117019	NC_004578	GC	3	6	5932268	5932273	0 %	0 %	50 %	50 %	28872323
117020	NC_004578	GCT	2	6	5932335	5932340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872323
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117026	NC_004578	GGCG	2	8	5932693	5932700	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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117033	NC_004578	GTT	2	6	5933088	5933093	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28872324
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117035	NC_004578	CCAG	2	8	5933210	5933217	25 %	0 %	25 %	50 %	28872324
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117345	NC_004578	GGC	2	6	5949760	5949765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28872339
117346	NC_004578	GC	3	6	5949793	5949798	0 %	0 %	50 %	50 %	28872339
117347	NC_004578	GCT	2	6	5949822	5949827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872339
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117349	NC_004578	TGCC	2	8	5949990	5949997	0 %	25 %	25 %	50 %	28872340
117350	NC_004578	TTGCTG	2	12	5950007	5950018	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	28872340
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117353	NC_004578	CAAA	2	8	5950093	5950100	75 %	0 %	0 %	25 %	28872340
117354	NC_004578	CCT	2	6	5950146	5950151	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
117355	NC_004578	GCA	2	6	5950196	5950201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117356	NC_004578	TCA	2	6	5950281	5950286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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117374	NC_004578	CAGG	2	8	5951250	5951257	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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117469	NC_004578	CAT	2	6	5956032	5956037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28872348
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117500	NC_004578	TTCGCC	2	12	5957470	5957481	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	28872350

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