MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000 chromosome

Total Repeats: 125962

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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115502	NC_004578	CAA	2	6	5857652	5857657	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28872257
115503	NC_004578	CTG	2	6	5857662	5857667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872257
115504	NC_004578	CGC	3	9	5857675	5857683	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28872257
115505	NC_004578	AAC	2	6	5857704	5857709	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28872257
115506	NC_004578	CGC	2	6	5857727	5857732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28872257
115507	NC_004578	CTG	2	6	5857746	5857751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872257
115508	NC_004578	CTT	2	6	5857754	5857759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28872257
115509	NC_004578	ATCAC	2	10	5857864	5857873	40 %	20 %	0 %	40 %	28872257
115510	NC_004578	CTG	3	9	5857902	5857910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872257
115511	NC_004578	GGC	2	6	5857911	5857916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28872257
115512	NC_004578	AGC	2	6	5858013	5858018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872257
115513	NC_004578	TAC	2	6	5858034	5858039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28872257
115514	NC_004578	GCA	2	6	5858045	5858050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872257
115515	NC_004578	ACG	2	6	5858053	5858058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872257
115516	NC_004578	TGG	2	6	5858064	5858069	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28872257
115517	NC_004578	GGAG	2	8	5858122	5858129	25 %	0 %	75 %	0 %	28872257
115518	NC_004578	CCG	2	6	5858148	5858153	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28872257
115519	NC_004578	ATGTGC	2	12	5858176	5858187	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	28872257
115520	NC_004578	AAG	2	6	5858229	5858234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115521	NC_004578	GC	3	6	5858268	5858273	0 %	0 %	50 %	50 %	28872258
115522	NC_004578	CAG	2	6	5858288	5858293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872258
115523	NC_004578	CAGA	2	8	5858411	5858418	50 %	0 %	25 %	25 %	28872258
115524	NC_004578	GCT	2	6	5858428	5858433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872258
115525	NC_004578	ACT	2	6	5858469	5858474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28872258
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115528	NC_004578	CTG	2	6	5858702	5858707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872258
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115530	NC_004578	ATG	2	6	5858774	5858779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28872258
115531	NC_004578	AG	3	6	5858810	5858815	50 %	0 %	50 %	0 %	28872258
115532	NC_004578	TGGG	2	8	5858844	5858851	0 %	25 %	75 %	0 %	28872258
115533	NC_004578	CGCGC	2	10	5858890	5858899	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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115535	NC_004578	TGGCA	2	10	5859140	5859149	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
115536	NC_004578	A	6	6	5859165	5859170	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
115537	NC_004578	CTGG	2	8	5859222	5859229	0 %	25 %	50 %	25 %	28872259
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115550	NC_004578	CAT	2	6	5860116	5860121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28872260
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115552	NC_004578	TCGAT	2	10	5860239	5860248	20 %	40 %	20 %	20 %	28872260
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115558	NC_004578	GCG	2	6	5860885	5860890	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
115559	NC_004578	TA	3	6	5860895	5860900	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115560	NC_004578	CCCG	2	8	5860903	5860910	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
115561	NC_004578	TGA	2	6	5860929	5860934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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115566	NC_004578	TGC	2	6	5861481	5861486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872262
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115616	NC_004578	CTG	2	6	5863599	5863604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872264
115617	NC_004578	GTC	2	6	5863636	5863641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872264
115618	NC_004578	CTG	2	6	5863725	5863730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872264
115619	NC_004578	CTG	2	6	5863788	5863793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872264
115620	NC_004578	CCCG	2	8	5863804	5863811	0 %	0 %	25 %	75 %	28872264
115621	NC_004578	TGG	2	6	5863888	5863893	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28872264
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115629	NC_004578	TGA	2	6	5864162	5864167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28872265
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115652	NC_004578	GC	3	6	5865351	5865356	0 %	0 %	50 %	50 %	28872268
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115722	NC_004578	GCGCA	2	10	5868720	5868729	20 %	0 %	40 %	40 %	28872271
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115964	NC_004578	ACG	2	6	5880531	5880536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115965	NC_004578	GTCC	2	8	5880648	5880655	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
115966	NC_004578	TA	3	6	5880661	5880666	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115967	NC_004578	CA	3	6	5880685	5880690	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
115968	NC_004578	GTC	2	6	5880702	5880707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115969	NC_004578	GC	3	6	5880792	5880797	0 %	0 %	50 %	50 %	28872278
115970	NC_004578	TGGGC	2	10	5880801	5880810	0 %	20 %	60 %	20 %	28872278
115971	NC_004578	GGCA	2	8	5880817	5880824	25 %	0 %	50 %	25 %	28872278
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115978	NC_004578	GCT	2	6	5881159	5881164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872278
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115983	NC_004578	TGC	2	6	5881353	5881358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872278
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115992	NC_004578	CTG	2	6	5881847	5881852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872278
115993	NC_004578	CTG	2	6	5881892	5881897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872278
115994	NC_004578	TCG	2	6	5881911	5881916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872278
115995	NC_004578	GC	3	6	5881971	5881976	0 %	0 %	50 %	50 %	28872278
115996	NC_004578	GCTG	2	8	5882010	5882017	0 %	25 %	50 %	25 %	28872278
115997	NC_004578	TTG	2	6	5882045	5882050	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28872278
115998	NC_004578	CCTG	2	8	5882058	5882065	0 %	25 %	25 %	50 %	28872278
115999	NC_004578	GTG	2	6	5882075	5882080	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28872278
116000	NC_004578	GAC	2	6	5882122	5882127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872278

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