MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000 chromosome

Total Repeats: 125962

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_004578	CAG	2	6	560145	560150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28867741
11002	NC_004578	GCC	2	6	560223	560228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28867741
11003	NC_004578	GT	3	6	560234	560239	0 %	50 %	50 %	0 %	28867741
11004	NC_004578	CAG	2	6	560247	560252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28867741
11005	NC_004578	GCG	2	6	560288	560293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28867741
11006	NC_004578	GCC	2	6	560397	560402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28867741
11007	NC_004578	GGT	2	6	560514	560519	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28867741
11008	NC_004578	CGCC	2	8	560574	560581	0 %	0 %	25 %	75 %	28867741
11009	NC_004578	GC	3	6	560612	560617	0 %	0 %	50 %	50 %	28867741
11010	NC_004578	CGT	2	6	560657	560662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867741
11011	NC_004578	GAC	2	6	560677	560682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28867741
11012	NC_004578	GCAGTT	2	12	560736	560747	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	28867741
11013	NC_004578	CCGC	2	8	560764	560771	0 %	0 %	25 %	75 %	28867741
11014	NC_004578	CA	3	6	560812	560817	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11015	NC_004578	A	7	7	560854	560860	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11016	NC_004578	ACCGTT	2	12	561102	561113	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	28867743
11017	NC_004578	GGCT	2	8	561150	561157	0 %	25 %	50 %	25 %	28867743
11018	NC_004578	AGCC	2	8	561164	561171	25 %	0 %	25 %	50 %	28867743
11019	NC_004578	GTTG	2	8	561189	561196	0 %	50 %	50 %	0 %	28867743
11020	NC_004578	AGC	2	6	561206	561211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28867743
11021	NC_004578	GT	3	6	561214	561219	0 %	50 %	50 %	0 %	28867743
11022	NC_004578	GC	3	6	561236	561241	0 %	0 %	50 %	50 %	28867743
11023	NC_004578	ATG	2	6	561256	561261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28867743
11024	NC_004578	CAG	2	6	561466	561471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28867743
11025	NC_004578	TCC	2	6	561477	561482	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	28867743
11026	NC_004578	GCA	2	6	561561	561566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28867743
11027	NC_004578	AGC	2	6	561575	561580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28867743
11028	NC_004578	GGC	2	6	561586	561591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28867743
11029	NC_004578	GGACGA	2	12	561646	561657	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	28867743
11030	NC_004578	GCT	2	6	561664	561669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867743
11031	NC_004578	CAACTG	2	12	561751	561762	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	28867743
11032	NC_004578	GGC	2	6	561766	561771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28867743
11033	NC_004578	GT	3	6	561925	561930	0 %	50 %	50 %	0 %	28867743
11034	NC_004578	GCG	2	6	561944	561949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28867743
11035	NC_004578	CCA	2	6	561984	561989	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28867743
11036	NC_004578	AGT	2	6	562023	562028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28867743
11037	NC_004578	GCCGA	2	10	562253	562262	20 %	0 %	40 %	40 %	28867743
11038	NC_004578	GTT	2	6	562281	562286	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28867743
11039	NC_004578	CAG	2	6	562288	562293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28867743
11040	NC_004578	GCAG	2	8	562331	562338	25 %	0 %	50 %	25 %	28867743
11041	NC_004578	GGC	2	6	562386	562391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28867743
11042	NC_004578	GAA	2	6	562441	562446	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28867743
11043	NC_004578	AGC	2	6	562463	562468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28867743
11044	NC_004578	CAG	3	9	562516	562524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28867743
11045	NC_004578	GCG	2	6	562545	562550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28867743
11046	NC_004578	GCCC	2	8	562599	562606	0 %	0 %	25 %	75 %	28867743
11047	NC_004578	CAG	2	6	562684	562689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28867743
11048	NC_004578	TCG	2	6	562700	562705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867743
11049	NC_004578	TCA	2	6	562731	562736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28867743
11050	NC_004578	GCG	2	6	562737	562742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28867743
11051	NC_004578	CAGC	2	8	562977	562984	25 %	0 %	25 %	50 %	28867743
11052	NC_004578	CG	4	8	562998	563005	0 %	0 %	50 %	50 %	28867743
11053	NC_004578	CGCCA	2	10	563013	563022	20 %	0 %	20 %	60 %	28867743
11054	NC_004578	TTCGCG	2	12	563047	563058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867743
11055	NC_004578	GAA	3	9	563146	563154	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28867743
11056	NC_004578	GGT	2	6	563158	563163	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28867743
11057	NC_004578	CCG	2	6	563192	563197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28867743
11058	NC_004578	TCA	2	6	563214	563219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28867743
11059	NC_004578	GCG	2	6	563298	563303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28867743
11060	NC_004578	CTGC	2	8	563312	563319	0 %	25 %	25 %	50 %	28867743
11061	NC_004578	ATG	2	6	563331	563336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28867743
11062	NC_004578	GGCA	2	8	563425	563432	25 %	0 %	50 %	25 %	28867743
11063	NC_004578	TG	3	6	563593	563598	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11064	NC_004578	AAG	2	6	563620	563625	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11065	NC_004578	CGT	2	6	563692	563697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867744
11066	NC_004578	CCAG	2	8	563739	563746	25 %	0 %	25 %	50 %	28867744
11067	NC_004578	TCGA	2	8	563750	563757	25 %	25 %	25 %	25 %	28867744
11068	NC_004578	CA	3	6	563804	563809	50 %	0 %	0 %	50 %	28867744
11069	NC_004578	CAG	2	6	563951	563956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28867744
11070	NC_004578	AGA	2	6	563993	563998	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28867744
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11072	NC_004578	CGA	3	9	564046	564054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28867744
11073	NC_004578	AGA	2	6	564060	564065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28867744
11074	NC_004578	A	6	6	564121	564126	100 %	0 %	0 %	0 %	28867744
11075	NC_004578	AGC	2	6	564144	564149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28867744
11076	NC_004578	ACG	2	6	564151	564156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28867744
11077	NC_004578	GAG	2	6	564189	564194	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11078	NC_004578	GC	3	6	564235	564240	0 %	0 %	50 %	50 %	28867745
11079	NC_004578	CTA	2	6	564249	564254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28867745
11080	NC_004578	TCAGGT	2	12	564255	564266	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	28867745
11081	NC_004578	TGC	2	6	564288	564293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867745
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11083	NC_004578	GAG	2	6	564325	564330	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28867745
11084	NC_004578	AG	3	6	564329	564334	50 %	0 %	50 %	0 %	28867745
11085	NC_004578	CAA	2	6	564390	564395	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28867745
11086	NC_004578	GA	3	6	564406	564411	50 %	0 %	50 %	0 %	28867745
11087	NC_004578	GTT	2	6	564439	564444	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28867745
11088	NC_004578	A	7	7	564450	564456	100 %	0 %	0 %	0 %	28867745
11089	NC_004578	TC	3	6	564588	564593	0 %	50 %	0 %	50 %	28867745
11090	NC_004578	GCA	2	6	564690	564695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28867745
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11092	NC_004578	AAGCA	2	10	564790	564799	60 %	0 %	20 %	20 %	28867745
11093	NC_004578	T	6	6	564844	564849	0 %	100 %	0 %	0 %	28867745
11094	NC_004578	AGA	2	6	564897	564902	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28867745
11095	NC_004578	GGA	2	6	564918	564923	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28867745
11096	NC_004578	CTA	2	6	564933	564938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28867745
11097	NC_004578	GGC	2	6	564967	564972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28867745
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11099	NC_004578	G	6	6	565027	565032	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
11100	NC_004578	GCG	2	6	565059	565064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11101	NC_004578	CGA	2	6	565148	565153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28867746
11102	NC_004578	CAA	2	6	565155	565160	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28867746
11103	NC_004578	AGT	2	6	565161	565166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28867746
11104	NC_004578	CAG	2	6	565189	565194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28867746
11105	NC_004578	CCA	2	6	565212	565217	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28867746
11106	NC_004578	CAG	2	6	565240	565245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28867746
11107	NC_004578	GGC	2	6	565248	565253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28867746
11108	NC_004578	CGCCCG	2	12	565351	565362	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28867746
11109	NC_004578	GTCAC	2	10	565367	565376	20 %	20 %	20 %	40 %	28867746
11110	NC_004578	GCCAGC	2	12	565433	565444	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	28867746
11111	NC_004578	CGT	2	6	565470	565475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867746
11112	NC_004578	TTCAA	2	10	565505	565514	40 %	40 %	0 %	20 %	28867746
11113	NC_004578	TCG	2	6	565610	565615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867746
11114	NC_004578	CTG	2	6	565639	565644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867746
11115	NC_004578	CGT	2	6	565728	565733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867746
11116	NC_004578	TGT	2	6	565770	565775	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28867746
11117	NC_004578	GCG	3	9	565823	565831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28867746
11118	NC_004578	GTCA	2	8	565931	565938	25 %	25 %	25 %	25 %	28867747
11119	NC_004578	GCC	2	6	566004	566009	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28867747
11120	NC_004578	ATG	2	6	566020	566025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28867747
11121	NC_004578	CTG	2	6	566133	566138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867747
11122	NC_004578	GATCG	2	10	566238	566247	20 %	20 %	40 %	20 %	28867747
11123	NC_004578	GAT	2	6	566250	566255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28867747
11124	NC_004578	GC	3	6	566256	566261	0 %	0 %	50 %	50 %	28867747
11125	NC_004578	GCA	2	6	566336	566341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28867747
11126	NC_004578	GTC	2	6	566394	566399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867747
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11134	NC_004578	TGC	2	6	566815	566820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867747
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11152	NC_004578	CTT	2	6	567576	567581	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11158	NC_004578	GTT	2	6	567728	567733	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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