MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000 chromosome

Total Repeats: 125962

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
114001	NC_004578	ACC	3	9	5784946	5784954	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28872193
114002	NC_004578	C	6	6	5784968	5784973	0 %	0 %	0 %	100 %	28872193
114003	NC_004578	GCC	2	6	5785008	5785013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28872193
114004	NC_004578	TCCA	2	8	5785021	5785028	25 %	25 %	0 %	50 %	28872193
114005	NC_004578	CAG	2	6	5785092	5785097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872193
114006	NC_004578	AGT	2	6	5785147	5785152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28872193
114007	NC_004578	TTG	2	6	5785172	5785177	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28872193
114008	NC_004578	GTT	3	9	5785203	5785211	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114009	NC_004578	AGC	2	6	5785224	5785229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114010	NC_004578	CGG	2	6	5785234	5785239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
114011	NC_004578	GCG	2	6	5785251	5785256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28872194
114012	NC_004578	CTC	2	6	5785260	5785265	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	28872194
114013	NC_004578	GC	3	6	5785338	5785343	0 %	0 %	50 %	50 %	28872194
114014	NC_004578	GGT	2	6	5785366	5785371	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28872194
114015	NC_004578	TGC	2	6	5785418	5785423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872194
114016	NC_004578	GTC	2	6	5785458	5785463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872194
114017	NC_004578	GC	3	6	5785491	5785496	0 %	0 %	50 %	50 %	28872194
114018	NC_004578	TGC	2	6	5785499	5785504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872194
114019	NC_004578	TGC	2	6	5785564	5785569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872194
114020	NC_004578	GCA	2	6	5785580	5785585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872194
114021	NC_004578	GGC	2	6	5785626	5785631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28872194
114022	NC_004578	TGC	2	6	5785679	5785684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872194
114023	NC_004578	CGC	2	6	5785841	5785846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28872194
114024	NC_004578	TCG	2	6	5785870	5785875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872194
114025	NC_004578	CA	3	6	5785944	5785949	50 %	0 %	0 %	50 %	28872194
114026	NC_004578	CG	3	6	5785952	5785957	0 %	0 %	50 %	50 %	28872194
114027	NC_004578	CAG	2	6	5785992	5785997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872194
114028	NC_004578	GCA	2	6	5786123	5786128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872194
114029	NC_004578	CTG	2	6	5786136	5786141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872194
114030	NC_004578	GCT	2	6	5786169	5786174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872194
114031	NC_004578	TCAC	2	8	5786205	5786212	25 %	25 %	0 %	50 %	28872195
114032	NC_004578	TGC	2	6	5786327	5786332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872195
114033	NC_004578	CGG	2	6	5786350	5786355	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28872195
114034	NC_004578	GCG	2	6	5786360	5786365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28872195
114035	NC_004578	GCC	2	6	5786456	5786461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28872195
114036	NC_004578	CATC	2	8	5786485	5786492	25 %	25 %	0 %	50 %	28872195
114037	NC_004578	GCTC	2	8	5786542	5786549	0 %	25 %	25 %	50 %	28872195
114038	NC_004578	GCT	2	6	5786620	5786625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872195
114039	NC_004578	GGC	2	6	5786677	5786682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28872195
114040	NC_004578	ACC	2	6	5786688	5786693	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28872195
114041	NC_004578	CAG	2	6	5786705	5786710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872195
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114043	NC_004578	GCA	2	6	5786782	5786787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872195
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114046	NC_004578	GAC	2	6	5786868	5786873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872196
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114048	NC_004578	GTC	2	6	5786944	5786949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872196
114049	NC_004578	CAG	2	6	5786992	5786997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872196
114050	NC_004578	GGC	2	6	5787046	5787051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28872196
114051	NC_004578	GGC	2	6	5787091	5787096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28872196
114052	NC_004578	CGCAA	2	10	5787137	5787146	40 %	0 %	20 %	40 %	28872196
114053	NC_004578	CCAA	2	8	5787200	5787207	50 %	0 %	0 %	50 %	28872196
114054	NC_004578	CCGCGC	2	12	5787235	5787246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28872196
114055	NC_004578	GATG	2	8	5787276	5787283	25 %	25 %	50 %	0 %	28872196
114056	NC_004578	GC	3	6	5787356	5787361	0 %	0 %	50 %	50 %	28872196
114057	NC_004578	CAA	2	6	5787415	5787420	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28872196
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114059	NC_004578	GCT	2	6	5787492	5787497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872196
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114062	NC_004578	AGCC	2	8	5787736	5787743	25 %	0 %	25 %	50 %	28872197
114063	NC_004578	CTG	2	6	5787750	5787755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872197
114064	NC_004578	TCG	2	6	5787772	5787777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872197
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114067	NC_004578	AATA	2	8	5787934	5787941	75 %	25 %	0 %	0 %	28872197
114068	NC_004578	CGG	2	6	5787953	5787958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28872197
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114082	NC_004578	GCGG	2	8	5788538	5788545	0 %	0 %	75 %	25 %	28872198
114083	NC_004578	CAGCG	2	10	5788583	5788592	20 %	0 %	40 %	40 %	28872198
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114089	NC_004578	CTC	2	6	5788755	5788760	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	28872199
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114091	NC_004578	AGGCG	2	10	5788832	5788841	20 %	0 %	60 %	20 %	28872199
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114099	NC_004578	ACG	2	6	5789141	5789146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872199
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114101	NC_004578	GC	3	6	5789214	5789219	0 %	0 %	50 %	50 %	28872199
114102	NC_004578	GCG	3	9	5789259	5789267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28872199
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114115	NC_004578	CGCC	2	8	5789820	5789827	0 %	0 %	25 %	75 %	28872200
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114458	NC_004578	GCAGC	2	10	5805389	5805398	20 %	0 %	40 %	40 %	28872217
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114462	NC_004578	TGC	2	6	5805580	5805585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872217
114463	NC_004578	AGA	2	6	5805685	5805690	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28872217
114464	NC_004578	CATC	2	8	5805701	5805708	25 %	25 %	0 %	50 %	28872217
114465	NC_004578	GCA	2	6	5805710	5805715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872217
114466	NC_004578	GCT	2	6	5805757	5805762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872217
114467	NC_004578	CGT	2	6	5805770	5805775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872217
114468	NC_004578	CGA	2	6	5805806	5805811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872217
114469	NC_004578	GCCT	2	8	5805819	5805826	0 %	25 %	25 %	50 %	28872217
114470	NC_004578	GC	3	6	5805827	5805832	0 %	0 %	50 %	50 %	28872217
114471	NC_004578	CGC	2	6	5805847	5805852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28872217
114472	NC_004578	GCT	2	6	5805953	5805958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872217
114473	NC_004578	GCG	2	6	5805966	5805971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28872217
114474	NC_004578	GCC	2	6	5806032	5806037	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28872217
114475	NC_004578	CGC	2	6	5806272	5806277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28872217
114476	NC_004578	CGG	2	6	5806307	5806312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28872217
114477	NC_004578	GTC	2	6	5806320	5806325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114478	NC_004578	GGGCA	2	10	5806487	5806496	20 %	0 %	60 %	20 %	28872218
114479	NC_004578	TCA	2	6	5806690	5806695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28872218
114480	NC_004578	GGC	2	6	5806748	5806753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28872218
114481	NC_004578	CTG	2	6	5806757	5806762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872218
114482	NC_004578	GCTG	2	8	5806806	5806813	0 %	25 %	50 %	25 %	28872218
114483	NC_004578	AGA	2	6	5806836	5806841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28872218
114484	NC_004578	GCC	2	6	5806844	5806849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28872218
114485	NC_004578	GAT	2	6	5806861	5806866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28872218
114486	NC_004578	TGG	2	6	5806919	5806924	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28872218
114487	NC_004578	GAA	2	6	5806994	5806999	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28872218
114488	NC_004578	CTG	2	6	5807074	5807079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872219
114489	NC_004578	CGG	2	6	5807082	5807087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28872219
114490	NC_004578	CTGCG	2	10	5807088	5807097	0 %	20 %	40 %	40 %	28872219
114491	NC_004578	GAT	2	6	5807229	5807234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28872219
114492	NC_004578	CTG	2	6	5807299	5807304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872219
114493	NC_004578	GCG	2	6	5807335	5807340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28872219
114494	NC_004578	CGC	2	6	5807413	5807418	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28872219
114495	NC_004578	GAT	2	6	5807422	5807427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28872219
114496	NC_004578	GCTG	2	8	5807429	5807436	0 %	25 %	50 %	25 %	28872219
114497	NC_004578	ACG	2	6	5807510	5807515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872219
114498	NC_004578	GC	4	8	5807517	5807524	0 %	0 %	50 %	50 %	28872219
114499	NC_004578	GC	3	6	5807560	5807565	0 %	0 %	50 %	50 %	28872220
114500	NC_004578	GAA	2	6	5807580	5807585	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28872220

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