MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000 chromosome

Total Repeats: 125962

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
113501	NC_004578	AAGG	2	8	5761986	5761993	50 %	0 %	50 %	0 %	28872171
113502	NC_004578	CGGT	2	8	5762103	5762110	0 %	25 %	50 %	25 %	28872171
113503	NC_004578	CTT	2	6	5762132	5762137	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28872171
113504	NC_004578	ATG	2	6	5762184	5762189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28872171
113505	NC_004578	TTC	2	6	5762238	5762243	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28872171
113506	NC_004578	GTG	2	6	5762250	5762255	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28872171
113507	NC_004578	ACG	2	6	5762272	5762277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872171
113508	NC_004578	ACG	2	6	5762317	5762322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872171
113509	NC_004578	ACA	2	6	5762401	5762406	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28872171
113510	NC_004578	TGGT	2	8	5762431	5762438	0 %	50 %	50 %	0 %	28872171
113511	NC_004578	CGC	2	6	5762513	5762518	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28872171
113512	NC_004578	CAG	2	6	5762541	5762546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872171
113513	NC_004578	ATGT	2	8	5762646	5762653	25 %	50 %	25 %	0 %	28872171
113514	NC_004578	AAG	2	6	5762706	5762711	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28872171
113515	NC_004578	CGA	2	6	5762768	5762773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872171
113516	NC_004578	GCA	2	6	5762836	5762841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872171
113517	NC_004578	CGA	2	6	5762852	5762857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872171
113518	NC_004578	CTG	2	6	5762897	5762902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113519	NC_004578	GTGGCA	2	12	5762923	5762934	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
113520	NC_004578	TACT	2	8	5762977	5762984	25 %	50 %	0 %	25 %	28872172
113521	NC_004578	CG	3	6	5763010	5763015	0 %	0 %	50 %	50 %	28872172
113522	NC_004578	CGC	3	9	5763062	5763070	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28872172
113523	NC_004578	TGC	2	6	5763138	5763143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872172
113524	NC_004578	GCATCG	2	12	5763181	5763192	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	28872172
113525	NC_004578	GAA	2	6	5763221	5763226	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28872172
113526	NC_004578	GAAG	2	8	5763245	5763252	50 %	0 %	50 %	0 %	28872172
113527	NC_004578	CAA	2	6	5763308	5763313	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28872172
113528	NC_004578	GCC	2	6	5763340	5763345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28872172
113529	NC_004578	CCA	2	6	5763472	5763477	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28872172
113530	NC_004578	T	6	6	5763565	5763570	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
113531	NC_004578	TAAAAA	2	12	5763622	5763633	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113532	NC_004578	TGC	2	6	5763806	5763811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872173
113533	NC_004578	TGCC	2	8	5763885	5763892	0 %	25 %	25 %	50 %	28872173
113534	NC_004578	CAGC	2	8	5763899	5763906	25 %	0 %	25 %	50 %	28872173
113535	NC_004578	CTGC	2	8	5763914	5763921	0 %	25 %	25 %	50 %	28872173
113536	NC_004578	CTG	2	6	5764087	5764092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872173
113537	NC_004578	CGG	2	6	5764113	5764118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28872173
113538	NC_004578	ATG	2	6	5764150	5764155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28872173
113539	NC_004578	GGGCT	2	10	5764243	5764252	0 %	20 %	60 %	20 %	28872173
113540	NC_004578	ATC	2	6	5764264	5764269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28872173
113541	NC_004578	TGC	2	6	5764296	5764301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872173
113542	NC_004578	CGC	2	6	5764436	5764441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28872173
113543	NC_004578	CGCA	2	8	5764491	5764498	25 %	0 %	25 %	50 %	28872173
113544	NC_004578	GCA	3	9	5764496	5764504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872173
113545	NC_004578	GAC	2	6	5764579	5764584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872173
113546	NC_004578	CGG	2	6	5764586	5764591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28872173
113547	NC_004578	AAGCC	2	10	5764625	5764634	40 %	0 %	20 %	40 %	28872173
113548	NC_004578	GAG	2	6	5764646	5764651	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28872173
113549	NC_004578	TGA	2	6	5764656	5764661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113550	NC_004578	GCT	2	6	5764681	5764686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113551	NC_004578	CGAC	2	8	5764716	5764723	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
113552	NC_004578	GCG	2	6	5764743	5764748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28872174
113553	NC_004578	CAC	2	6	5764840	5764845	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28872174
113554	NC_004578	CGCTG	2	10	5764876	5764885	0 %	20 %	40 %	40 %	28872174
113555	NC_004578	TCT	2	6	5764917	5764922	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28872174
113556	NC_004578	TTCGA	2	10	5764940	5764949	20 %	40 %	20 %	20 %	28872174
113557	NC_004578	GCC	2	6	5764952	5764957	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28872174
113558	NC_004578	GGTCA	2	10	5764967	5764976	20 %	20 %	40 %	20 %	28872174
113559	NC_004578	CTG	2	6	5764985	5764990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872174
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113562	NC_004578	TGC	2	6	5765151	5765156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872174
113563	NC_004578	ACC	2	6	5765165	5765170	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28872174
113564	NC_004578	GC	3	6	5765245	5765250	0 %	0 %	50 %	50 %	28872174
113565	NC_004578	AC	3	6	5765301	5765306	50 %	0 %	0 %	50 %	28872174
113566	NC_004578	TGG	2	6	5765341	5765346	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28872174
113567	NC_004578	GCG	3	9	5765433	5765441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28872174
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113570	NC_004578	CCA	2	6	5765472	5765477	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28872174
113571	NC_004578	CTGG	2	8	5765494	5765501	0 %	25 %	50 %	25 %	28872174
113572	NC_004578	GCCCT	2	10	5765511	5765520	0 %	20 %	20 %	60 %	28872174
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113578	NC_004578	GATC	2	8	5765818	5765825	25 %	25 %	25 %	25 %	28872174
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113580	NC_004578	GC	3	6	5765853	5765858	0 %	0 %	50 %	50 %	28872174
113581	NC_004578	CTT	2	6	5765905	5765910	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28872174
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113583	NC_004578	TGA	2	6	5765952	5765957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28872175
113584	NC_004578	CGGC	2	8	5765988	5765995	0 %	0 %	50 %	50 %	28872175
113585	NC_004578	TGT	2	6	5765996	5766001	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28872175
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113588	NC_004578	CGAC	2	8	5766074	5766081	25 %	0 %	25 %	50 %	28872175
113589	NC_004578	GCCT	2	8	5766082	5766089	0 %	25 %	25 %	50 %	28872175
113590	NC_004578	GCA	2	6	5766149	5766154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872175
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113598	NC_004578	GAA	2	6	5766550	5766555	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28872175
113599	NC_004578	AC	3	6	5766589	5766594	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
113600	NC_004578	AAC	2	6	5766637	5766642	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113601	NC_004578	CGC	2	6	5766725	5766730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28872176
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113603	NC_004578	CGTT	2	8	5766803	5766810	0 %	50 %	25 %	25 %	28872176
113604	NC_004578	CAT	2	6	5766828	5766833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28872176
113605	NC_004578	TGG	2	6	5766869	5766874	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28872176
113606	NC_004578	GGC	2	6	5766886	5766891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28872176
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113609	NC_004578	CAT	2	6	5766951	5766956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28872176
113610	NC_004578	CGGG	2	8	5766965	5766972	0 %	0 %	75 %	25 %	28872176
113611	NC_004578	CGC	2	6	5767022	5767027	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28872176
113612	NC_004578	TGG	2	6	5767052	5767057	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28872176
113613	NC_004578	TTC	2	6	5767069	5767074	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28872176
113614	NC_004578	GCG	2	6	5767123	5767128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28872176
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