MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000 chromosome

Total Repeats: 125962

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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113002	NC_004578	CAG	2	6	5737484	5737489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872149
113003	NC_004578	GC	3	6	5737577	5737582	0 %	0 %	50 %	50 %	28872149
113004	NC_004578	GGCG	2	8	5737622	5737629	0 %	0 %	75 %	25 %	28872149
113005	NC_004578	CTG	2	6	5737706	5737711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872149
113006	NC_004578	TCG	2	6	5737713	5737718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872149
113007	NC_004578	GATG	2	8	5737822	5737829	25 %	25 %	50 %	0 %	28872149
113008	NC_004578	GAA	2	6	5737837	5737842	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28872149
113009	NC_004578	GC	3	6	5737850	5737855	0 %	0 %	50 %	50 %	28872149
113010	NC_004578	ACG	2	6	5737961	5737966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113011	NC_004578	GCC	2	6	5737970	5737975	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
113012	NC_004578	ACACG	2	10	5738066	5738075	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
113013	NC_004578	TGA	2	6	5738112	5738117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113014	NC_004578	ATG	2	6	5738195	5738200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28872150
113015	NC_004578	CGCTG	2	10	5738203	5738212	0 %	20 %	40 %	40 %	28872150
113016	NC_004578	GAA	2	6	5738309	5738314	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28872150
113017	NC_004578	CAA	2	6	5738351	5738356	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28872150
113018	NC_004578	ACC	2	6	5738393	5738398	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28872150
113019	NC_004578	CGC	2	6	5738439	5738444	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28872150
113020	NC_004578	GGT	2	6	5738461	5738466	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28872150
113021	NC_004578	CGA	2	6	5738536	5738541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872150
113022	NC_004578	CAG	2	6	5738639	5738644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872150
113023	NC_004578	CGC	2	6	5738680	5738685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28872150
113024	NC_004578	GAC	2	6	5738720	5738725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872150
113025	NC_004578	AAG	2	6	5738732	5738737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28872150
113026	NC_004578	CGAG	2	8	5738740	5738747	25 %	0 %	50 %	25 %	28872150
113027	NC_004578	CGC	2	6	5738777	5738782	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28872150
113028	NC_004578	CTT	2	6	5738807	5738812	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28872150
113029	NC_004578	GTGCTG	2	12	5738846	5738857	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	28872150
113030	NC_004578	ATC	2	6	5738860	5738865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28872150
113031	NC_004578	TGC	2	6	5738911	5738916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872150
113032	NC_004578	ATC	2	6	5738966	5738971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28872150
113033	NC_004578	ACG	2	6	5739072	5739077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113034	NC_004578	A	6	6	5739095	5739100	100 %	0 %	0 %	0 %	28872151
113035	NC_004578	TC	3	6	5739102	5739107	0 %	50 %	0 %	50 %	28872151
113036	NC_004578	ACG	2	6	5739153	5739158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872151
113037	NC_004578	CGT	2	6	5739184	5739189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872151
113038	NC_004578	CTGC	2	8	5739281	5739288	0 %	25 %	25 %	50 %	28872151
113039	NC_004578	CCAT	2	8	5739312	5739319	25 %	25 %	0 %	50 %	28872151
113040	NC_004578	GGC	2	6	5739323	5739328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28872151
113041	NC_004578	GACC	2	8	5739337	5739344	25 %	0 %	25 %	50 %	28872151
113042	NC_004578	CGG	2	6	5739400	5739405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28872151
113043	NC_004578	GCT	2	6	5739667	5739672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872152
113044	NC_004578	TGC	2	6	5739680	5739685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872152
113045	NC_004578	ACG	2	6	5739950	5739955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872152
113046	NC_004578	GAC	2	6	5739963	5739968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872152
113047	NC_004578	CGG	2	6	5739999	5740004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28872152
113048	NC_004578	CGCTG	2	10	5740047	5740056	0 %	20 %	40 %	40 %	28872152
113049	NC_004578	CTG	3	9	5740054	5740062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872152
113050	NC_004578	GGCT	2	8	5740066	5740073	0 %	25 %	50 %	25 %	28872152
113051	NC_004578	CGA	2	6	5740074	5740079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872152
113052	NC_004578	TG	3	6	5740098	5740103	0 %	50 %	50 %	0 %	28872152
113053	NC_004578	AGT	2	6	5740293	5740298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113054	NC_004578	CCG	2	6	5740363	5740368	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28872153
113055	NC_004578	GT	3	6	5740459	5740464	0 %	50 %	50 %	0 %	28872153
113056	NC_004578	GCT	2	6	5740478	5740483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872153
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113058	NC_004578	CGC	2	6	5740504	5740509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28872153
113059	NC_004578	GAT	2	6	5740539	5740544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28872153
113060	NC_004578	CGA	2	6	5740625	5740630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872153
113061	NC_004578	TGA	2	6	5740636	5740641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28872153
113062	NC_004578	GCC	2	6	5740687	5740692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28872153
113063	NC_004578	CTGC	2	8	5740712	5740719	0 %	25 %	25 %	50 %	28872153
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113073	NC_004578	ATC	2	6	5741292	5741297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28872154
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113087	NC_004578	GCA	2	6	5742090	5742095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872155
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113098	NC_004578	CGCGG	2	10	5742584	5742593	0 %	0 %	60 %	40 %	28872155
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113110	NC_004578	GC	3	6	5742987	5742992	0 %	0 %	50 %	50 %	28872155
113111	NC_004578	CTGC	2	8	5743084	5743091	0 %	25 %	25 %	50 %	28872155
113112	NC_004578	AC	3	6	5743107	5743112	50 %	0 %	0 %	50 %	28872155
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113114	NC_004578	GCG	2	6	5743285	5743290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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113233	NC_004578	TTC	2	6	5748626	5748631	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28872163
113234	NC_004578	GTC	2	6	5748632	5748637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872163
113235	NC_004578	CAA	2	6	5748643	5748648	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28872163
113236	NC_004578	GGC	2	6	5748653	5748658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28872163
113237	NC_004578	AGC	2	6	5748680	5748685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872163
113238	NC_004578	GGCT	2	8	5748765	5748772	0 %	25 %	50 %	25 %	28872163
113239	NC_004578	GCG	2	6	5748797	5748802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28872163
113240	NC_004578	GGC	2	6	5748809	5748814	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28872163
113241	NC_004578	GGC	2	6	5748821	5748826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28872163
113242	NC_004578	GC	3	6	5748935	5748940	0 %	0 %	50 %	50 %	28872163
113243	NC_004578	CGG	2	6	5748970	5748975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28872163
113244	NC_004578	GCG	2	6	5748990	5748995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28872163
113245	NC_004578	ACCT	2	8	5749043	5749050	25 %	25 %	0 %	50 %	28872163
113246	NC_004578	GAC	2	6	5749055	5749060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872163
113247	NC_004578	TACC	2	8	5749192	5749199	25 %	25 %	0 %	50 %	28872163
113248	NC_004578	TGA	2	6	5749203	5749208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28872163
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113250	NC_004578	CAC	2	6	5749306	5749311	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28872163
113251	NC_004578	TGG	2	6	5749347	5749352	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28872163
113252	NC_004578	CGCA	2	8	5749366	5749373	25 %	0 %	25 %	50 %	28872163
113253	NC_004578	ACG	2	6	5749413	5749418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872163
113254	NC_004578	ATC	2	6	5749512	5749517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28872164
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113257	NC_004578	ACG	2	6	5749627	5749632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872164
113258	NC_004578	GTG	2	6	5749728	5749733	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28872164
113259	NC_004578	CGA	2	6	5749781	5749786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872164
113260	NC_004578	TGC	2	6	5749789	5749794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872164
113261	NC_004578	CAT	2	6	5749811	5749816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28872164
113262	NC_004578	ACA	2	6	5749909	5749914	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28872164
113263	NC_004578	GAA	2	6	5749950	5749955	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28872164
113264	NC_004578	CAG	2	6	5750004	5750009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872164
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113266	NC_004578	CAC	2	6	5750130	5750135	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
113267	NC_004578	ATG	2	6	5750145	5750150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28872165
113268	NC_004578	GCCA	2	8	5750172	5750179	25 %	0 %	25 %	50 %	28872165
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113270	NC_004578	CGG	2	6	5750216	5750221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28872165
113271	NC_004578	TGG	2	6	5750257	5750262	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28872165
113272	NC_004578	TCGT	2	8	5750283	5750290	0 %	50 %	25 %	25 %	28872165
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113274	NC_004578	CGG	2	6	5750381	5750386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28872165
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113279	NC_004578	CGA	2	6	5750531	5750536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872165
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113295	NC_004578	GAC	2	6	5751452	5751457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872166
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113297	NC_004578	ACT	2	6	5751570	5751575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28872166
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113300	NC_004578	TGA	2	6	5751753	5751758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28872166
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113302	NC_004578	CTG	2	6	5751866	5751871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872166
113303	NC_004578	TGC	2	6	5751930	5751935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872166
113304	NC_004578	GCA	2	6	5752008	5752013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872167
113305	NC_004578	TGG	2	6	5752038	5752043	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28872167
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113307	NC_004578	GGCT	2	8	5752079	5752086	0 %	25 %	50 %	25 %	28872167
113308	NC_004578	GCG	2	6	5752158	5752163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28872167
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113310	NC_004578	CAA	2	6	5752213	5752218	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28872167
113311	NC_004578	AC	3	6	5752286	5752291	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
113312	NC_004578	TAAA	2	8	5752310	5752317	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
113313	NC_004578	CGTT	2	8	5752355	5752362	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
113314	NC_004578	TCA	2	6	5752404	5752409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113315	NC_004578	TCT	2	6	5752413	5752418	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113316	NC_004578	T	6	6	5752447	5752452	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
113317	NC_004578	ATA	2	6	5752496	5752501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113318	NC_004578	CTG	2	6	5752526	5752531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113319	NC_004578	A	7	7	5752546	5752552	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
113320	NC_004578	TA	3	6	5752600	5752605	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113321	NC_004578	CGA	2	6	5752622	5752627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113322	NC_004578	CGA	2	6	5752658	5752663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113323	NC_004578	CAGT	2	8	5752664	5752671	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
113324	NC_004578	C	6	6	5752672	5752677	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
113325	NC_004578	TA	3	6	5752708	5752713	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113326	NC_004578	T	6	6	5752847	5752852	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
113327	NC_004578	CG	3	6	5752879	5752884	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
113328	NC_004578	CAC	2	6	5752922	5752927	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28872168
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113331	NC_004578	CGC	2	6	5753024	5753029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28872168
113332	NC_004578	CTT	2	6	5753120	5753125	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28872168
113333	NC_004578	GGCCGT	2	12	5753144	5753155	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	28872168
113334	NC_004578	GTGCA	2	10	5753169	5753178	20 %	20 %	40 %	20 %	28872168
113335	NC_004578	GTT	2	6	5753205	5753210	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28872168
113336	NC_004578	CGGCG	2	10	5753376	5753385	0 %	0 %	60 %	40 %	28872168
113337	NC_004578	TGC	2	6	5753404	5753409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872168
113338	NC_004578	CGT	2	6	5753585	5753590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872168
113339	NC_004578	TCA	2	6	5753656	5753661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28872168
113340	NC_004578	CAA	2	6	5753709	5753714	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28872168
113341	NC_004578	CAAT	2	8	5753819	5753826	50 %	25 %	0 %	25 %	28872168
113342	NC_004578	TCA	2	6	5753848	5753853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28872168
113343	NC_004578	A	6	6	5753853	5753858	100 %	0 %	0 %	0 %	28872168
113344	NC_004578	TG	3	6	5753890	5753895	0 %	50 %	50 %	0 %	28872168
113345	NC_004578	AG	3	6	5753921	5753926	50 %	0 %	50 %	0 %	28872168
113346	NC_004578	GCA	2	6	5753971	5753976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872168
113347	NC_004578	TGGG	2	8	5753996	5754003	0 %	25 %	75 %	0 %	28872168
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113349	NC_004578	CAT	2	6	5754113	5754118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28872168
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