MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000 chromosome

Total Repeats: 125962

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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112002	NC_004578	TCC	2	6	5688398	5688403	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	28872119
112003	NC_004578	GAT	2	6	5688445	5688450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28872119
112004	NC_004578	TCT	2	6	5688462	5688467	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28872119
112005	NC_004578	CCTGG	2	10	5688499	5688508	0 %	20 %	40 %	40 %	28872119
112006	NC_004578	CGG	2	6	5688544	5688549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28872119
112007	NC_004578	CCG	2	6	5688552	5688557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28872119
112008	NC_004578	TAC	2	6	5688562	5688567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28872119
112009	NC_004578	GCA	2	6	5688586	5688591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872119
112010	NC_004578	ATC	2	6	5688677	5688682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28872119
112011	NC_004578	GAA	2	6	5688707	5688712	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28872119
112012	NC_004578	CAG	2	6	5688713	5688718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872119
112013	NC_004578	CTA	2	6	5688727	5688732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28872119
112014	NC_004578	TGA	2	6	5688741	5688746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28872119
112015	NC_004578	CAGC	2	8	5688761	5688768	25 %	0 %	25 %	50 %	28872119
112016	NC_004578	GCCG	2	8	5688772	5688779	0 %	0 %	50 %	50 %	28872119
112017	NC_004578	GAA	2	6	5688818	5688823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28872119
112018	NC_004578	GCG	2	6	5688836	5688841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28872119
112019	NC_004578	CAC	2	6	5688842	5688847	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28872119
112020	NC_004578	GCG	2	6	5688893	5688898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28872119
112021	NC_004578	CGA	2	6	5688910	5688915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872119
112022	NC_004578	CAA	2	6	5688991	5688996	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28872119
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112025	NC_004578	GTGA	2	8	5689449	5689456	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
112026	NC_004578	GA	3	6	5689472	5689477	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
112027	NC_004578	AGTG	2	8	5689481	5689488	25 %	25 %	50 %	0 %	28872120
112028	NC_004578	ATTGA	2	10	5689533	5689542	40 %	40 %	20 %	0 %	28872120
112029	NC_004578	TCA	2	6	5689639	5689644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28872120
112030	NC_004578	CGA	2	6	5689685	5689690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872120
112031	NC_004578	TGGAAG	2	12	5689702	5689713	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	28872120
112032	NC_004578	CTG	2	6	5689738	5689743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872120
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112034	NC_004578	GCT	2	6	5689773	5689778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872120
112035	NC_004578	GCT	2	6	5689803	5689808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872120
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112038	NC_004578	CTGAAA	2	12	5690052	5690063	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	28872120
112039	NC_004578	CTG	3	9	5690080	5690088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872120
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112052	NC_004578	TGC	2	6	5690611	5690616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872120
112053	NC_004578	GCT	3	9	5690618	5690626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872120
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112062	NC_004578	CGCTGT	2	12	5691022	5691033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872120
112063	NC_004578	GCT	2	6	5691063	5691068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872120
112064	NC_004578	CTG	2	6	5691120	5691125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872120
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112068	NC_004578	CGGT	2	8	5691423	5691430	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
112069	NC_004578	CTGG	2	8	5691438	5691445	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
112070	NC_004578	TTTTG	2	10	5691468	5691477	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
112071	NC_004578	CGT	2	6	5691487	5691492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872121
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112087	NC_004578	AGC	2	6	5692245	5692250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872121
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112090	NC_004578	GC	3	6	5692546	5692551	0 %	0 %	50 %	50 %	28872121
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112098	NC_004578	TGGCGC	2	12	5693073	5693084	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	28872122
112099	NC_004578	GATC	2	8	5693139	5693146	25 %	25 %	25 %	25 %	28872122
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112102	NC_004578	GGCG	2	8	5693185	5693192	0 %	0 %	75 %	25 %	28872122
112103	NC_004578	GAA	2	6	5693331	5693336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28872122
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112108	NC_004578	GCT	2	6	5693595	5693600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872122
112109	NC_004578	CTG	2	6	5693812	5693817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872122
112110	NC_004578	ACG	2	6	5693825	5693830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872122
112111	NC_004578	CAA	2	6	5693848	5693853	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28872122
112112	NC_004578	AAG	2	6	5693908	5693913	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28872122
112113	NC_004578	GGT	2	6	5694015	5694020	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28872122
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112115	NC_004578	CCG	2	6	5694047	5694052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28872122
112116	NC_004578	GTC	2	6	5694087	5694092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872122
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112119	NC_004578	CGAT	2	8	5694324	5694331	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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112231	NC_004578	CAT	2	6	5700098	5700103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28872128
112232	NC_004578	CAC	2	6	5700273	5700278	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28872128
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112249	NC_004578	C	6	6	5701341	5701346	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
112250	NC_004578	A	7	7	5701355	5701361	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
112251	NC_004578	GATC	2	8	5701384	5701391	25 %	25 %	25 %	25 %	28872129
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112262	NC_004578	GC	3	6	5702189	5702194	0 %	0 %	50 %	50 %	28872130
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112348	NC_004578	TCGT	2	8	5705774	5705781	0 %	50 %	25 %	25 %	28872131
112349	NC_004578	TCG	2	6	5705820	5705825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872131
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112352	NC_004578	CTG	2	6	5705990	5705995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872131
112353	NC_004578	TGC	2	6	5706061	5706066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872131
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112357	NC_004578	CGC	2	6	5706199	5706204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28872131
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112359	NC_004578	CTG	2	6	5706260	5706265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872131
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112395	NC_004578	TGA	2	6	5708025	5708030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28872131
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112401	NC_004578	GCTG	2	8	5708384	5708391	0 %	25 %	50 %	25 %	28872132
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112424	NC_004578	TCA	2	6	5709683	5709688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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112428	NC_004578	CGA	2	6	5709933	5709938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872134
112429	NC_004578	GGCGA	2	10	5709961	5709970	20 %	0 %	60 %	20 %	28872134
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112438	NC_004578	ACG	3	9	5710463	5710471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872134
112439	NC_004578	ATG	2	6	5710490	5710495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28872134
112440	NC_004578	TGC	2	6	5710496	5710501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872134
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112442	NC_004578	GC	3	6	5710760	5710765	0 %	0 %	50 %	50 %	28872134
112443	NC_004578	GCG	2	6	5710794	5710799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28872134
112444	NC_004578	CGA	2	6	5710869	5710874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872134
112445	NC_004578	GCT	2	6	5710920	5710925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872134
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112447	NC_004578	CGG	2	6	5711004	5711009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28872134
112448	NC_004578	TAC	2	6	5711044	5711049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28872134
112449	NC_004578	CTG	2	6	5711155	5711160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872134
112450	NC_004578	GC	4	8	5711184	5711191	0 %	0 %	50 %	50 %	28872134
112451	NC_004578	GCT	2	6	5711268	5711273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872134
112452	NC_004578	GCTGGC	2	12	5711357	5711368	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	28872134
112453	NC_004578	CGG	2	6	5711414	5711419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28872134
112454	NC_004578	AGC	2	6	5711448	5711453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872134
112455	NC_004578	CAT	2	6	5711488	5711493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28872134
112456	NC_004578	TGA	2	6	5711554	5711559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28872134
112457	NC_004578	GTCA	2	8	5711597	5711604	25 %	25 %	25 %	25 %	28872135
112458	NC_004578	A	7	7	5711618	5711624	100 %	0 %	0 %	0 %	28872135
112459	NC_004578	CCT	2	6	5711737	5711742	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	28872135
112460	NC_004578	ATG	2	6	5711757	5711762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28872135
112461	NC_004578	CGC	2	6	5711773	5711778	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28872135
112462	NC_004578	AGC	2	6	5711809	5711814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872135
112463	NC_004578	CCT	2	6	5711836	5711841	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	28872135
112464	NC_004578	CTG	2	6	5711970	5711975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872135
112465	NC_004578	CAC	2	6	5712091	5712096	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28872135
112466	NC_004578	GCC	2	6	5712098	5712103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28872135
112467	NC_004578	CAT	2	6	5712118	5712123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28872135
112468	NC_004578	TGT	2	6	5712124	5712129	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28872135
112469	NC_004578	CAC	2	6	5712134	5712139	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28872135
112470	NC_004578	GTC	2	6	5712266	5712271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872135
112471	NC_004578	TGCCA	2	10	5712298	5712307	20 %	20 %	20 %	40 %	28872135
112472	NC_004578	TCG	2	6	5712324	5712329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872135
112473	NC_004578	TGA	2	6	5712338	5712343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28872135
112474	NC_004578	ATC	3	9	5712381	5712389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28872135
112475	NC_004578	CGG	2	6	5712505	5712510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28872135
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112478	NC_004578	TGC	2	6	5712613	5712618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872135
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112481	NC_004578	AGC	2	6	5712786	5712791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872135
112482	NC_004578	GC	3	6	5712826	5712831	0 %	0 %	50 %	50 %	28872135
112483	NC_004578	TGC	2	6	5712832	5712837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872135
112484	NC_004578	CAA	2	6	5712917	5712922	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28872135
112485	NC_004578	CAG	2	6	5712935	5712940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872135
112486	NC_004578	ATG	2	6	5712945	5712950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28872135
112487	NC_004578	TGA	2	6	5712952	5712957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28872135
112488	NC_004578	CGCC	2	8	5712970	5712977	0 %	0 %	25 %	75 %	28872135
112489	NC_004578	TGCGC	2	10	5712979	5712988	0 %	20 %	40 %	40 %	28872135
112490	NC_004578	CAG	2	6	5713160	5713165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872135
112491	NC_004578	CG	3	6	5713301	5713306	0 %	0 %	50 %	50 %	28872135
112492	NC_004578	A	6	6	5713307	5713312	100 %	0 %	0 %	0 %	28872135
112493	NC_004578	CAC	2	6	5713342	5713347	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28872135
112494	NC_004578	GCT	2	6	5713447	5713452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872135
112495	NC_004578	GAT	2	6	5713469	5713474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28872135
112496	NC_004578	GCG	2	6	5713485	5713490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28872135
112497	NC_004578	GCA	2	6	5713501	5713506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872135
112498	NC_004578	ATC	2	6	5713643	5713648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28872135
112499	NC_004578	GCAG	2	8	5713669	5713676	25 %	0 %	50 %	25 %	28872135
112500	NC_004578	GCA	2	6	5713813	5713818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872135

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