MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000 chromosome

Total Repeats: 125962

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
111501	NC_004578	GCCA	2	8	5663839	5663846	25 %	0 %	25 %	50 %	28872103
111502	NC_004578	CCAC	2	8	5663852	5663859	25 %	0 %	0 %	75 %	28872103
111503	NC_004578	CAA	2	6	5663892	5663897	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28872103
111504	NC_004578	TTG	2	6	5663908	5663913	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28872103
111505	NC_004578	TTGC	2	8	5663937	5663944	0 %	50 %	25 %	25 %	28872103
111506	NC_004578	GCG	2	6	5664154	5664159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28872104
111507	NC_004578	CGT	2	6	5664196	5664201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872104
111508	NC_004578	ACC	2	6	5664210	5664215	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28872104
111509	NC_004578	GCA	2	6	5664235	5664240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872104
111510	NC_004578	GCG	2	6	5664290	5664295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28872104
111511	NC_004578	GCT	2	6	5664332	5664337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872104
111512	NC_004578	CCGC	2	8	5664363	5664370	0 %	0 %	25 %	75 %	28872104
111513	NC_004578	CTT	2	6	5664413	5664418	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28872104
111514	NC_004578	GC	3	6	5664437	5664442	0 %	0 %	50 %	50 %	28872104
111515	NC_004578	AGCG	2	8	5664630	5664637	25 %	0 %	50 %	25 %	28872104
111516	NC_004578	CGC	2	6	5664653	5664658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28872104
111517	NC_004578	ACC	2	6	5664729	5664734	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28872104
111518	NC_004578	GCCAG	2	10	5664769	5664778	20 %	0 %	40 %	40 %	28872104
111519	NC_004578	GCC	2	6	5664786	5664791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28872104
111520	NC_004578	AGA	2	6	5664885	5664890	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28872105
111521	NC_004578	GCA	3	9	5664930	5664938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872105
111522	NC_004578	GCT	2	6	5664960	5664965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872105
111523	NC_004578	CAG	2	6	5665030	5665035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872105
111524	NC_004578	CCA	2	6	5665047	5665052	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28872105
111525	NC_004578	CTTC	2	8	5665053	5665060	0 %	50 %	0 %	50 %	28872105
111526	NC_004578	GCC	2	6	5665063	5665068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28872105
111527	NC_004578	CCA	2	6	5665098	5665103	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28872105
111528	NC_004578	CAG	2	6	5665111	5665116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872105
111529	NC_004578	CGG	2	6	5665178	5665183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28872105
111530	NC_004578	GCGA	2	8	5665238	5665245	25 %	0 %	50 %	25 %	28872105
111531	NC_004578	GAC	2	6	5665365	5665370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872105
111532	NC_004578	ACTG	2	8	5665437	5665444	25 %	25 %	25 %	25 %	28872105
111533	NC_004578	CGGC	2	8	5665494	5665501	0 %	0 %	50 %	50 %	28872105
111534	NC_004578	GCT	2	6	5665513	5665518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872105
111535	NC_004578	CAG	2	6	5665657	5665662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872105
111536	NC_004578	GGC	2	6	5665717	5665722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28872105
111537	NC_004578	CGG	2	6	5665833	5665838	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28872105
111538	NC_004578	CGT	2	6	5665855	5665860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872105
111539	NC_004578	GCA	2	6	5665944	5665949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872105
111540	NC_004578	ACC	2	6	5665995	5666000	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28872106
111541	NC_004578	A	6	6	5666039	5666044	100 %	0 %	0 %	0 %	28872106
111542	NC_004578	TCGG	2	8	5666058	5666065	0 %	25 %	50 %	25 %	28872106
111543	NC_004578	ATC	2	6	5666073	5666078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28872106
111544	NC_004578	CGG	2	6	5666088	5666093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28872106
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111546	NC_004578	TCA	2	6	5666146	5666151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28872106
111547	NC_004578	GTA	2	6	5666156	5666161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28872106
111548	NC_004578	GAC	2	6	5666216	5666221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872106
111549	NC_004578	GATC	2	8	5666287	5666294	25 %	25 %	25 %	25 %	28872106
111550	NC_004578	ATC	2	6	5666298	5666303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28872106
111551	NC_004578	GCG	2	6	5666305	5666310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28872106
111552	NC_004578	TTGAT	2	10	5666361	5666370	20 %	60 %	20 %	0 %	28872106
111553	NC_004578	GAT	2	6	5666411	5666416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28872106
111554	NC_004578	GC	4	8	5666431	5666438	0 %	0 %	50 %	50 %	28872106
111555	NC_004578	GCG	2	6	5666509	5666514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28872106
111556	NC_004578	TGT	2	6	5666515	5666520	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28872106
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111560	NC_004578	TGCCG	2	10	5666666	5666675	0 %	20 %	40 %	40 %	28872106
111561	NC_004578	GAT	2	6	5666726	5666731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28872106
111562	NC_004578	CAT	2	6	5666819	5666824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28872106
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111564	NC_004578	TGA	2	6	5667004	5667009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28872106
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111569	NC_004578	GGT	2	6	5667310	5667315	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28872106
111570	NC_004578	T	7	7	5667337	5667343	0 %	100 %	0 %	0 %	28872106
111571	NC_004578	TTG	2	6	5667381	5667386	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28872106
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111575	NC_004578	TGCC	2	8	5667541	5667548	0 %	25 %	25 %	50 %	28872106
111576	NC_004578	CAGA	2	8	5667554	5667561	50 %	0 %	25 %	25 %	28872106
111577	NC_004578	ACGA	2	8	5667605	5667612	50 %	0 %	25 %	25 %	28872106
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111581	NC_004578	GCC	2	6	5667921	5667926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
111582	NC_004578	TCG	2	6	5667953	5667958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872107
111583	NC_004578	GTC	2	6	5667970	5667975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872107
111584	NC_004578	GC	3	6	5667997	5668002	0 %	0 %	50 %	50 %	28872107
111585	NC_004578	GCC	2	6	5668093	5668098	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28872107
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111588	NC_004578	CGA	2	6	5668242	5668247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872107
111589	NC_004578	GCC	2	6	5668280	5668285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28872107
111590	NC_004578	TGCC	2	8	5668298	5668305	0 %	25 %	25 %	50 %	28872107
111591	NC_004578	TGA	2	6	5668323	5668328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28872107
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111599	NC_004578	CAC	2	6	5668722	5668727	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28872107
111600	NC_004578	CATG	2	8	5668737	5668744	25 %	25 %	25 %	25 %	28872107
111601	NC_004578	CTG	2	6	5668756	5668761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872107
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111604	NC_004578	ACG	2	6	5669000	5669005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872107
111605	NC_004578	GCC	2	6	5669014	5669019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28872107
111606	NC_004578	GCAGC	2	10	5669036	5669045	20 %	0 %	40 %	40 %	28872107
111607	NC_004578	CGC	2	6	5669140	5669145	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28872107
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111609	NC_004578	CGCT	2	8	5669182	5669189	0 %	25 %	25 %	50 %	28872107
111610	NC_004578	GAC	2	6	5669221	5669226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872107
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111613	NC_004578	C	6	6	5669300	5669305	0 %	0 %	0 %	100 %	28872107
111614	NC_004578	GCGG	2	8	5669349	5669356	0 %	0 %	75 %	25 %	28872107
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111733	NC_004578	GAC	2	6	5675253	5675258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872110
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111959	NC_004578	TCAG	2	8	5686221	5686228	25 %	25 %	25 %	25 %	28872118
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