MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000 chromosome

Total Repeats: 125962

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
111001	NC_004578	A	7	7	5637071	5637077	100 %	0 %	0 %	0 %	28872084
111002	NC_004578	CT	3	6	5637101	5637106	0 %	50 %	0 %	50 %	28872084
111003	NC_004578	GC	3	6	5637117	5637122	0 %	0 %	50 %	50 %	28872084
111004	NC_004578	TCA	2	6	5637125	5637130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28872084
111005	NC_004578	A	7	7	5637234	5637240	100 %	0 %	0 %	0 %	28872084
111006	NC_004578	AGG	2	6	5637318	5637323	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28872084
111007	NC_004578	ATT	2	6	5637474	5637479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28872084
111008	NC_004578	CCT	2	6	5637494	5637499	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	28872084
111009	NC_004578	TAT	2	6	5637521	5637526	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28872084
111010	NC_004578	CGA	2	6	5637553	5637558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872084
111011	NC_004578	TAT	2	6	5637566	5637571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28872084
111012	NC_004578	ATC	2	6	5637633	5637638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28872084
111013	NC_004578	AGA	2	6	5637649	5637654	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28872084
111014	NC_004578	TCA	2	6	5637684	5637689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28872084
111015	NC_004578	CGAC	2	8	5637750	5637757	25 %	0 %	25 %	50 %	28872084
111016	NC_004578	AGAA	2	8	5637784	5637791	75 %	0 %	25 %	0 %	28872084
111017	NC_004578	ACA	3	9	5637816	5637824	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28872084
111018	NC_004578	CCAGG	2	10	5638060	5638069	20 %	0 %	40 %	40 %	28872084
111019	NC_004578	TCAA	2	8	5638080	5638087	50 %	25 %	0 %	25 %	28872084
111020	NC_004578	GTT	2	6	5638115	5638120	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28872084
111021	NC_004578	TGC	2	6	5638152	5638157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872084
111022	NC_004578	ATTG	2	8	5638186	5638193	25 %	50 %	25 %	0 %	28872084
111023	NC_004578	CTGG	2	8	5638276	5638283	0 %	25 %	50 %	25 %	28872084
111024	NC_004578	GAC	2	6	5638322	5638327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872084
111025	NC_004578	TC	3	6	5638392	5638397	0 %	50 %	0 %	50 %	28872084
111026	NC_004578	ACC	2	6	5638493	5638498	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28872084
111027	NC_004578	GACT	2	8	5638534	5638541	25 %	25 %	25 %	25 %	28872084
111028	NC_004578	CCG	2	6	5638551	5638556	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28872084
111029	NC_004578	ACGC	2	8	5638597	5638604	25 %	0 %	25 %	50 %	28872084
111030	NC_004578	TG	3	6	5638673	5638678	0 %	50 %	50 %	0 %	28872084
111031	NC_004578	CCA	2	6	5638710	5638715	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28872084
111032	NC_004578	CGG	2	6	5638741	5638746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28872084
111033	NC_004578	CGC	2	6	5638751	5638756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28872084
111034	NC_004578	GGC	2	6	5638777	5638782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28872084
111035	NC_004578	GCG	2	6	5638872	5638877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28872084
111036	NC_004578	CGGA	2	8	5638900	5638907	25 %	0 %	50 %	25 %	28872084
111037	NC_004578	ACCG	2	8	5638973	5638980	25 %	0 %	25 %	50 %	28872084
111038	NC_004578	CGA	2	6	5638999	5639004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872084
111039	NC_004578	ATC	2	6	5639087	5639092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28872084
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111041	NC_004578	CA	3	6	5639146	5639151	50 %	0 %	0 %	50 %	28872084
111042	NC_004578	A	6	6	5639184	5639189	100 %	0 %	0 %	0 %	28872084
111043	NC_004578	CCG	3	9	5639193	5639201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28872084
111044	NC_004578	CGGG	2	8	5639241	5639248	0 %	0 %	75 %	25 %	28872084
111045	NC_004578	GTC	2	6	5639261	5639266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872084
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111048	NC_004578	CAA	2	6	5639332	5639337	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28872084
111049	NC_004578	TC	3	6	5639361	5639366	0 %	50 %	0 %	50 %	28872084
111050	NC_004578	ACTG	2	8	5639377	5639384	25 %	25 %	25 %	25 %	28872084
111051	NC_004578	CACTAT	2	12	5639621	5639632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28872084
111052	NC_004578	GGT	2	6	5639668	5639673	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28872084
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111054	NC_004578	GCA	2	6	5640015	5640020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872084
111055	NC_004578	CTGT	2	8	5640071	5640078	0 %	50 %	25 %	25 %	28872084
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111058	NC_004578	ACG	2	6	5640138	5640143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872084
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111060	NC_004578	ACG	2	6	5640225	5640230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872084
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111062	NC_004578	GCT	2	6	5640313	5640318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872084
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111065	NC_004578	ATG	2	6	5640489	5640494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28872084
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111076	NC_004578	AAAGCT	2	12	5641183	5641194	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	28872084
111077	NC_004578	GTC	2	6	5641231	5641236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872084
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111080	NC_004578	GAC	2	6	5641370	5641375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872084
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111083	NC_004578	T	6	6	5641457	5641462	0 %	100 %	0 %	0 %	28872084
111084	NC_004578	A	7	7	5641477	5641483	100 %	0 %	0 %	0 %	28872084
111085	NC_004578	AATA	2	8	5641493	5641500	75 %	25 %	0 %	0 %	28872084
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111088	NC_004578	CGC	2	6	5641555	5641560	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28872084
111089	NC_004578	A	7	7	5641723	5641729	100 %	0 %	0 %	0 %	28872084
111090	NC_004578	AAGG	2	8	5641757	5641764	50 %	0 %	50 %	0 %	28872084
111091	NC_004578	A	7	7	5641810	5641816	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
111092	NC_004578	CAG	2	6	5641928	5641933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872085
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111094	NC_004578	GGGC	2	8	5642154	5642161	0 %	0 %	75 %	25 %	28872085
111095	NC_004578	ATC	2	6	5642175	5642180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28872085
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111100	NC_004578	ATGA	2	8	5642444	5642451	50 %	25 %	25 %	0 %	28872085
111101	NC_004578	TCG	2	6	5642452	5642457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872085
111102	NC_004578	ACC	2	6	5642463	5642468	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28872085
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111106	NC_004578	AACCA	2	10	5642671	5642680	60 %	0 %	0 %	40 %	28872085
111107	NC_004578	GCA	2	6	5642701	5642706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872085
111108	NC_004578	CGG	2	6	5642823	5642828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28872085
111109	NC_004578	TCA	2	6	5642878	5642883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28872085
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111111	NC_004578	AG	3	6	5643161	5643166	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
111112	NC_004578	GC	3	6	5643352	5643357	0 %	0 %	50 %	50 %	28872086
111113	NC_004578	GCACCG	2	12	5643381	5643392	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	28872086
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111115	NC_004578	AGC	2	6	5643452	5643457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872086
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111117	NC_004578	GC	3	6	5643556	5643561	0 %	0 %	50 %	50 %	28872086
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111233	NC_004578	GCA	2	6	5649834	5649839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872091
111234	NC_004578	GCG	2	6	5649870	5649875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28872091
111235	NC_004578	AGC	2	6	5649927	5649932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872091
111236	NC_004578	GGT	2	6	5649955	5649960	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28872091
111237	NC_004578	GC	3	6	5650016	5650021	0 %	0 %	50 %	50 %	28872091
111238	NC_004578	ATC	2	6	5650031	5650036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28872091
111239	NC_004578	TCG	2	6	5650095	5650100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872091
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111241	NC_004578	GCAG	2	8	5650192	5650199	25 %	0 %	50 %	25 %	28872091
111242	NC_004578	GCC	2	6	5650279	5650284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28872091
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111245	NC_004578	TCC	2	6	5650446	5650451	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	28872092
111246	NC_004578	TCA	2	6	5650522	5650527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28872092
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111249	NC_004578	CAG	2	6	5650718	5650723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872092
111250	NC_004578	CCG	2	6	5650731	5650736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28872092
111251	NC_004578	GCC	2	6	5650751	5650756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28872092
111252	NC_004578	CTG	3	9	5650877	5650885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872092
111253	NC_004578	TGGC	2	8	5650953	5650960	0 %	25 %	50 %	25 %	28872092
111254	NC_004578	GC	3	6	5651070	5651075	0 %	0 %	50 %	50 %	28872092
111255	NC_004578	CAG	2	6	5651078	5651083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872092
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111260	NC_004578	CAC	2	6	5651285	5651290	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28872092
111261	NC_004578	TGA	2	6	5651313	5651318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28872092
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111263	NC_004578	CGG	2	6	5651389	5651394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28872092
111264	NC_004578	CAG	2	6	5651522	5651527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872092
111265	NC_004578	ATC	2	6	5651535	5651540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28872092
111266	NC_004578	GCG	2	6	5651547	5651552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28872092
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111268	NC_004578	GC	5	10	5651660	5651669	0 %	0 %	50 %	50 %	28872092
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111271	NC_004578	CGGT	2	8	5651969	5651976	0 %	25 %	50 %	25 %	28872093
111272	NC_004578	TTTA	2	8	5652034	5652041	25 %	75 %	0 %	0 %	28872093
111273	NC_004578	GAT	2	6	5652081	5652086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28872093
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111284	NC_004578	CTG	2	6	5652812	5652817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872094
111285	NC_004578	CTG	2	6	5652820	5652825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872094
111286	NC_004578	GCC	2	6	5652860	5652865	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28872094
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111288	NC_004578	GAC	2	6	5652954	5652959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872094
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111295	NC_004578	TGG	2	6	5653304	5653309	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28872094
111296	NC_004578	CTG	2	6	5653351	5653356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872094
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111300	NC_004578	CAG	2	6	5653500	5653505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872095
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111302	NC_004578	TGC	2	6	5653600	5653605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872095
111303	NC_004578	GAA	2	6	5653647	5653652	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28872095
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111306	NC_004578	CGGCTT	2	12	5653847	5653858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872095
111307	NC_004578	GGC	2	6	5653878	5653883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28872095
111308	NC_004578	CTG	2	6	5653884	5653889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872095
111309	NC_004578	CGA	2	6	5653931	5653936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872095
111310	NC_004578	TGCC	2	8	5654018	5654025	0 %	25 %	25 %	50 %	28872095
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111312	NC_004578	GGC	2	6	5654179	5654184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
111313	NC_004578	AAG	2	6	5654197	5654202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111314	NC_004578	GAA	2	6	5654231	5654236	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28872096
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111317	NC_004578	GTG	2	6	5654484	5654489	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28872096
111318	NC_004578	CGCTGC	2	12	5654530	5654541	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	28872096
111319	NC_004578	GCC	2	6	5654640	5654645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28872096
111320	NC_004578	AGG	2	6	5654812	5654817	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28872096
111321	NC_004578	GTTT	2	8	5654830	5654837	0 %	75 %	25 %	0 %	28872096
111322	NC_004578	TGA	2	6	5654843	5654848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28872096
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111332	NC_004578	ACC	2	6	5655347	5655352	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28872097
111333	NC_004578	AGG	2	6	5655407	5655412	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28872097
111334	NC_004578	GGC	2	6	5655504	5655509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28872097
111335	NC_004578	GC	5	10	5655573	5655582	0 %	0 %	50 %	50 %	28872097
111336	NC_004578	AGGT	2	8	5655590	5655597	25 %	25 %	50 %	0 %	28872097
111337	NC_004578	GGA	2	6	5655612	5655617	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28872097
111338	NC_004578	AGC	2	6	5655624	5655629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872097
111339	NC_004578	T	6	6	5655645	5655650	0 %	100 %	0 %	0 %	28872097
111340	NC_004578	CG	3	6	5655662	5655667	0 %	0 %	50 %	50 %	28872097
111341	NC_004578	CAG	2	6	5655679	5655684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872097
111342	NC_004578	CGC	2	6	5655705	5655710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28872097
111343	NC_004578	CTT	2	6	5655720	5655725	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28872097
111344	NC_004578	TGCC	2	8	5655792	5655799	0 %	25 %	25 %	50 %	28872097
111345	NC_004578	CGCC	2	8	5655837	5655844	0 %	0 %	25 %	75 %	28872097
111346	NC_004578	GCC	3	9	5655851	5655859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28872097
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111491	NC_004578	GC	3	6	5663415	5663420	0 %	0 %	50 %	50 %	28872103
111492	NC_004578	GCG	2	6	5663447	5663452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28872103
111493	NC_004578	TCAGGT	2	12	5663522	5663533	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	28872103
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111497	NC_004578	ACGC	2	8	5663715	5663722	25 %	0 %	25 %	50 %	28872103
111498	NC_004578	CGG	2	6	5663738	5663743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28872103
111499	NC_004578	GTC	2	6	5663760	5663765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872103
111500	NC_004578	CAAGC	2	10	5663792	5663801	40 %	0 %	20 %	40 %	28872103

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