MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000 chromosome

Total Repeats: 125962

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
110501	NC_004578	TGATCG	2	12	5611408	5611419	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	28872065
110502	NC_004578	CGC	2	6	5611472	5611477	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28872065
110503	NC_004578	GCT	4	12	5611499	5611510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872065
110504	NC_004578	CAA	2	6	5611511	5611516	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28872065
110505	NC_004578	CGA	2	6	5611529	5611534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872065
110506	NC_004578	GT	3	6	5611663	5611668	0 %	50 %	50 %	0 %	28872065
110507	NC_004578	TCG	2	6	5611669	5611674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872065
110508	NC_004578	GCAC	2	8	5611768	5611775	25 %	0 %	25 %	50 %	28872065
110509	NC_004578	ACC	4	12	5611776	5611787	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28872065
110510	NC_004578	CGG	2	6	5611811	5611816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28872065
110511	NC_004578	CAG	2	6	5611998	5612003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872065
110512	NC_004578	ATC	2	6	5612025	5612030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28872065
110513	NC_004578	CA	3	6	5612069	5612074	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
110514	NC_004578	CGC	2	6	5612079	5612084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
110515	NC_004578	GAT	2	6	5612085	5612090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110516	NC_004578	TG	3	6	5612102	5612107	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
110517	NC_004578	GT	3	6	5612109	5612114	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
110518	NC_004578	ACC	2	6	5612250	5612255	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28872066
110519	NC_004578	CAC	2	6	5612288	5612293	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28872066
110520	NC_004578	CAC	2	6	5612340	5612345	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28872066
110521	NC_004578	GCG	2	6	5612355	5612360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28872066
110522	NC_004578	CGA	2	6	5612400	5612405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872066
110523	NC_004578	GC	3	6	5612466	5612471	0 %	0 %	50 %	50 %	28872066
110524	NC_004578	GTT	2	6	5612514	5612519	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28872066
110525	NC_004578	CAGC	2	8	5612588	5612595	25 %	0 %	25 %	50 %	28872066
110526	NC_004578	CAG	2	6	5612598	5612603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28872066
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110531	NC_004578	AGAA	2	8	5613028	5613035	75 %	0 %	25 %	0 %	28872066
110532	NC_004578	CAT	2	6	5613039	5613044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28872066
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110554	NC_004578	CTT	2	6	5613822	5613827	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28872067
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110561	NC_004578	TCT	3	9	5614057	5614065	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110562	NC_004578	CAT	2	6	5614229	5614234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28872068
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110617	NC_004578	ATC	2	6	5616576	5616581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28872069
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110719	NC_004578	GC	4	8	5622253	5622260	0 %	0 %	50 %	50 %	28872072
110720	NC_004578	TGCAAC	2	12	5622306	5622317	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	28872072
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110724	NC_004578	GC	3	6	5622469	5622474	0 %	0 %	50 %	50 %	28872072
110725	NC_004578	CTG	2	6	5622508	5622513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28872072
110726	NC_004578	TG	3	6	5622512	5622517	0 %	50 %	50 %	0 %	28872072
110727	NC_004578	CAA	2	6	5622580	5622585	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28872072
110728	NC_004578	CATCA	2	10	5622610	5622619	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
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110730	NC_004578	G	6	6	5622747	5622752	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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110968	NC_004578	TGA	2	6	5635225	5635230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28872083
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110999	NC_004578	GA	3	6	5636972	5636977	50 %	0 %	50 %	0 %	28872084
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