MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000 chromosome

Total Repeats: 125962

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
108501	NC_004578	GCA	2	6	5512088	5512093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28871981
108502	NC_004578	CTG	2	6	5512120	5512125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28871981
108503	NC_004578	GAGC	2	8	5512140	5512147	25 %	0 %	50 %	25 %	28871981
108504	NC_004578	CGG	2	6	5512179	5512184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28871981
108505	NC_004578	CTG	2	6	5512186	5512191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28871981
108506	NC_004578	CACC	2	8	5512253	5512260	25 %	0 %	0 %	75 %	28871981
108507	NC_004578	TCGGCG	2	12	5512352	5512363	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	28871981
108508	NC_004578	CGC	2	6	5512398	5512403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28871981
108509	NC_004578	TGCAGG	2	12	5512427	5512438	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	28871981
108510	NC_004578	TTC	2	6	5512462	5512467	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28871981
108511	NC_004578	CCAG	2	8	5512521	5512528	25 %	0 %	25 %	50 %	28871981
108512	NC_004578	TGC	2	6	5512557	5512562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28871981
108513	NC_004578	CTG	2	6	5512651	5512656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108514	NC_004578	AC	3	6	5512776	5512781	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
108515	NC_004578	AATG	2	8	5512818	5512825	50 %	25 %	25 %	0 %	28871982
108516	NC_004578	AAC	2	6	5513002	5513007	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28871982
108517	NC_004578	TCG	2	6	5513021	5513026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28871982
108518	NC_004578	GTTG	2	8	5513040	5513047	0 %	50 %	50 %	0 %	28871982
108519	NC_004578	CGT	2	6	5513052	5513057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28871982
108520	NC_004578	GC	3	6	5513152	5513157	0 %	0 %	50 %	50 %	28871982
108521	NC_004578	GC	3	6	5513231	5513236	0 %	0 %	50 %	50 %	28871982
108522	NC_004578	TCA	2	6	5513243	5513248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28871982
108523	NC_004578	TCG	2	6	5513282	5513287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28871982
108524	NC_004578	CCGAAG	2	12	5513300	5513311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28871982
108525	NC_004578	CG	3	6	5513360	5513365	0 %	0 %	50 %	50 %	28871982
108526	NC_004578	GAA	2	6	5513392	5513397	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28871982
108527	NC_004578	CCA	2	6	5513444	5513449	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28871982
108528	NC_004578	CGGCGA	2	12	5513469	5513480	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	28871982
108529	NC_004578	CGG	2	6	5513496	5513501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28871982
108530	NC_004578	CCG	2	6	5513534	5513539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28871982
108531	NC_004578	TCA	2	6	5513544	5513549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28871982
108532	NC_004578	TGA	2	6	5513636	5513641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28871982
108533	NC_004578	TGC	2	6	5513714	5513719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28871982
108534	NC_004578	GGC	2	6	5513823	5513828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28871982
108535	NC_004578	GGT	2	6	5513830	5513835	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28871982
108536	NC_004578	ATC	2	6	5513863	5513868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28871982
108537	NC_004578	CAC	2	6	5513919	5513924	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28871982
108538	NC_004578	TG	3	6	5513966	5513971	0 %	50 %	50 %	0 %	28871982
108539	NC_004578	GC	3	6	5513999	5514004	0 %	0 %	50 %	50 %	28871982
108540	NC_004578	GTT	2	6	5514047	5514052	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28871982
108541	NC_004578	TGT	2	6	5514132	5514137	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108542	NC_004578	CATT	2	8	5514177	5514184	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
108543	NC_004578	CTG	2	6	5514241	5514246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28871983
108544	NC_004578	CTG	2	6	5514250	5514255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28871983
108545	NC_004578	GCTG	2	8	5514286	5514293	0 %	25 %	50 %	25 %	28871983
108546	NC_004578	GCT	2	6	5514300	5514305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28871983
108547	NC_004578	CGA	2	6	5514306	5514311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28871983
108548	NC_004578	CGC	2	6	5514390	5514395	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28871983
108549	NC_004578	ATGG	2	8	5514505	5514512	25 %	25 %	50 %	0 %	28871983
108550	NC_004578	GATC	2	8	5514522	5514529	25 %	25 %	25 %	25 %	28871983
108551	NC_004578	AGA	2	6	5514558	5514563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28871983
108552	NC_004578	CTG	2	6	5514589	5514594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28871983
108553	NC_004578	CT	3	6	5514615	5514620	0 %	50 %	0 %	50 %	28871983
108554	NC_004578	CGA	2	6	5514699	5514704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28871983
108555	NC_004578	GCA	2	6	5514794	5514799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28871983
108556	NC_004578	TGGC	2	8	5514805	5514812	0 %	25 %	50 %	25 %	28871983
108557	NC_004578	CTG	3	9	5514844	5514852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28871983
108558	NC_004578	GC	3	6	5514902	5514907	0 %	0 %	50 %	50 %	28871983
108559	NC_004578	CGTTG	2	10	5514909	5514918	0 %	40 %	40 %	20 %	28871983
108560	NC_004578	CTG	2	6	5514919	5514924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28871983
108561	NC_004578	GCC	2	6	5514925	5514930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28871983
108562	NC_004578	TTC	2	6	5514958	5514963	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28871983
108563	NC_004578	CTG	2	6	5515033	5515038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28871983
108564	NC_004578	GTG	2	6	5515039	5515044	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28871983
108565	NC_004578	ACGCT	2	10	5515049	5515058	20 %	20 %	20 %	40 %	28871983
108566	NC_004578	GTTC	2	8	5515161	5515168	0 %	50 %	25 %	25 %	28871983
108567	NC_004578	TGG	2	6	5515199	5515204	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28871983
108568	NC_004578	CTG	2	6	5515216	5515221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28871983
108569	NC_004578	GCC	2	6	5515236	5515241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28871983
108570	NC_004578	GCT	2	6	5515260	5515265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28871983
108571	NC_004578	TCT	2	6	5515271	5515276	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28871983
108572	NC_004578	CTG	2	6	5515288	5515293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28871983
108573	NC_004578	GCA	2	6	5515322	5515327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28871983
108574	NC_004578	CTG	2	6	5515462	5515467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28871983
108575	NC_004578	AGC	2	6	5515490	5515495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28871983
108576	NC_004578	CTG	2	6	5515534	5515539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28871983
108577	NC_004578	GAC	2	6	5515597	5515602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28871983
108578	NC_004578	AGC	2	6	5515664	5515669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28871983
108579	NC_004578	GCG	2	6	5515721	5515726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28871983
108580	NC_004578	GCT	2	6	5515749	5515754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28871983
108581	NC_004578	CTG	2	6	5515759	5515764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28871983
108582	NC_004578	CGA	2	6	5515785	5515790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28871983
108583	NC_004578	GCG	2	6	5515868	5515873	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28871983
108584	NC_004578	CGA	2	6	5515884	5515889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28871983
108585	NC_004578	CGA	2	6	5515896	5515901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28871983
108586	NC_004578	GCT	2	6	5515902	5515907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28871983
108587	NC_004578	CAG	2	6	5515923	5515928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28871983
108588	NC_004578	CAG	3	9	5515941	5515949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28871983
108589	NC_004578	GGC	2	6	5515954	5515959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28871983
108590	NC_004578	CGCC	2	8	5515977	5515984	0 %	0 %	25 %	75 %	28871983
108591	NC_004578	GCT	2	6	5516076	5516081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28871983
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108599	NC_004578	CCCGG	2	10	5516527	5516536	0 %	0 %	40 %	60 %	28871983
108600	NC_004578	CCG	2	6	5516545	5516550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28871983
108601	NC_004578	TGG	2	6	5516579	5516584	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28871983
108602	NC_004578	ACA	2	6	5516591	5516596	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28871983
108603	NC_004578	GAA	2	6	5516668	5516673	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28871983
108604	NC_004578	GC	3	6	5516679	5516684	0 %	0 %	50 %	50 %	28871983
108605	NC_004578	AAC	2	6	5516759	5516764	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28871983
108606	NC_004578	ACGC	2	8	5516796	5516803	25 %	0 %	25 %	50 %	28871983
108607	NC_004578	CG	4	8	5516848	5516855	0 %	0 %	50 %	50 %	28871983
108608	NC_004578	CGG	2	6	5516960	5516965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28871983
108609	NC_004578	CTG	3	9	5517040	5517048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108610	NC_004578	GTT	2	6	5517072	5517077	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28871984
108611	NC_004578	TCA	2	6	5517134	5517139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28871984
108612	NC_004578	GCG	2	6	5517171	5517176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28871984
108613	NC_004578	CCTGG	2	10	5517177	5517186	0 %	20 %	40 %	40 %	28871984
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108615	NC_004578	CAG	2	6	5517361	5517366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28871984
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