MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000 chromosome

Total Repeats: 125962

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
108001	NC_004578	TGC	2	6	5487034	5487039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28871960
108002	NC_004578	TTC	2	6	5487108	5487113	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28871960
108003	NC_004578	CG	3	6	5487124	5487129	0 %	0 %	50 %	50 %	28871960
108004	NC_004578	TGC	2	6	5487154	5487159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28871960
108005	NC_004578	CTG	2	6	5487168	5487173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28871960
108006	NC_004578	GCC	2	6	5487226	5487231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28871960
108007	NC_004578	CGA	2	6	5487233	5487238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28871960
108008	NC_004578	GAA	2	6	5487309	5487314	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28871960
108009	NC_004578	CCTG	2	8	5487395	5487402	0 %	25 %	25 %	50 %	28871960
108010	NC_004578	CTG	2	6	5487448	5487453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28871960
108011	NC_004578	GC	3	6	5487493	5487498	0 %	0 %	50 %	50 %	28871960
108012	NC_004578	GAA	2	6	5487594	5487599	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28871960
108013	NC_004578	AGCC	2	8	5487716	5487723	25 %	0 %	25 %	50 %	28871960
108014	NC_004578	GGCG	2	8	5487735	5487742	0 %	0 %	75 %	25 %	28871960
108015	NC_004578	CCG	2	6	5487752	5487757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28871960
108016	NC_004578	CCG	2	6	5487778	5487783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28871960
108017	NC_004578	GCA	2	6	5487814	5487819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28871960
108018	NC_004578	ACG	2	6	5487838	5487843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28871960
108019	NC_004578	CGGCC	2	10	5487881	5487890	0 %	0 %	40 %	60 %	28871960
108020	NC_004578	CAA	2	6	5487923	5487928	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28871960
108021	NC_004578	ACT	3	9	5487976	5487984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28871960
108022	NC_004578	ACT	2	6	5487988	5487993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28871960
108023	NC_004578	CAG	2	6	5488151	5488156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28871960
108024	NC_004578	ACA	2	6	5488189	5488194	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28871960
108025	NC_004578	CGG	2	6	5488199	5488204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28871960
108026	NC_004578	CTG	2	6	5488311	5488316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28871960
108027	NC_004578	TGG	2	6	5488341	5488346	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28871960
108028	NC_004578	TGCC	2	8	5488360	5488367	0 %	25 %	25 %	50 %	28871960
108029	NC_004578	GC	3	6	5488478	5488483	0 %	0 %	50 %	50 %	28871960
108030	NC_004578	TGC	2	6	5488492	5488497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28871960
108031	NC_004578	A	6	6	5488552	5488557	100 %	0 %	0 %	0 %	28871960
108032	NC_004578	CAAGTG	2	12	5488623	5488634	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	28871960
108033	NC_004578	CGG	2	6	5488642	5488647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28871960
108034	NC_004578	ACGCC	2	10	5488678	5488687	20 %	0 %	20 %	60 %	28871960
108035	NC_004578	GCAA	2	8	5488714	5488721	50 %	0 %	25 %	25 %	28871960
108036	NC_004578	CGG	2	6	5488796	5488801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28871960
108037	NC_004578	GGC	2	6	5488818	5488823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28871960
108038	NC_004578	CGA	2	6	5488961	5488966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28871960
108039	NC_004578	ATGGC	2	10	5488972	5488981	20 %	20 %	40 %	20 %	28871960
108040	NC_004578	GTG	2	6	5488995	5489000	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28871960
108041	NC_004578	ATC	2	6	5489010	5489015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28871960
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108044	NC_004578	GCACA	2	10	5489092	5489101	40 %	0 %	20 %	40 %	28871960
108045	NC_004578	CGG	2	6	5489147	5489152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28871960
108046	NC_004578	CAAG	2	8	5489177	5489184	50 %	0 %	25 %	25 %	28871960
108047	NC_004578	TGG	2	6	5489254	5489259	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28871960
108048	NC_004578	CTGTCG	2	12	5489436	5489447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28871960
108049	NC_004578	CCG	2	6	5489454	5489459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28871960
108050	NC_004578	CGCAAG	2	12	5489604	5489615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28871960
108051	NC_004578	CTG	2	6	5489637	5489642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28871960
108052	NC_004578	CGA	2	6	5489690	5489695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28871960
108053	NC_004578	CTG	2	6	5489730	5489735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28871960
108054	NC_004578	GAA	2	6	5489777	5489782	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28871960
108055	NC_004578	CTG	2	6	5489796	5489801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28871960
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108058	NC_004578	CG	3	6	5490019	5490024	0 %	0 %	50 %	50 %	28871960
108059	NC_004578	TGGC	2	8	5490072	5490079	0 %	25 %	50 %	25 %	28871960
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108066	NC_004578	CCTGAG	2	12	5490482	5490493	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	28871960
108067	NC_004578	GC	3	6	5490496	5490501	0 %	0 %	50 %	50 %	28871960
108068	NC_004578	GC	3	6	5490514	5490519	0 %	0 %	50 %	50 %	28871960
108069	NC_004578	ACTGGT	2	12	5490533	5490544	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	28871960
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108072	NC_004578	TGC	2	6	5490598	5490603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28871960
108073	NC_004578	GGC	2	6	5490746	5490751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28871960
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108077	NC_004578	TGGT	11	44	5490931	5490974	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
108078	NC_004578	AAGCG	2	10	5491110	5491119	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
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108081	NC_004578	GAT	2	6	5491206	5491211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28871961
108082	NC_004578	GAT	2	6	5491218	5491223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28871961
108083	NC_004578	GC	3	6	5491228	5491233	0 %	0 %	50 %	50 %	28871961
108084	NC_004578	GAT	2	6	5491272	5491277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28871961
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108089	NC_004578	A	6	6	5491434	5491439	100 %	0 %	0 %	0 %	28871961
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108095	NC_004578	GT	3	6	5491737	5491742	0 %	50 %	50 %	0 %	28871962
108096	NC_004578	CAG	2	6	5491763	5491768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28871962
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108099	NC_004578	CGCTGG	2	12	5491842	5491853	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	28871962
108100	NC_004578	GC	3	6	5491855	5491860	0 %	0 %	50 %	50 %	28871962
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108104	NC_004578	CG	3	6	5492042	5492047	0 %	0 %	50 %	50 %	28871962
108105	NC_004578	GGC	2	6	5492054	5492059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28871962
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108109	NC_004578	CGA	2	6	5492266	5492271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28871962
108110	NC_004578	TGGC	2	8	5492291	5492298	0 %	25 %	50 %	25 %	28871962
108111	NC_004578	CTG	2	6	5492327	5492332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28871962
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108113	NC_004578	ACCG	2	8	5492346	5492353	25 %	0 %	25 %	50 %	28871962
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108115	NC_004578	GC	3	6	5492494	5492499	0 %	0 %	50 %	50 %	28871962
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108348	NC_004578	AAC	2	6	5504016	5504021	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28871973
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108352	NC_004578	CTTG	2	8	5504264	5504271	0 %	50 %	25 %	25 %	28871973
108353	NC_004578	GCT	2	6	5504300	5504305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28871973
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108355	NC_004578	GTT	2	6	5504461	5504466	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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108394	NC_004578	GT	3	6	5506891	5506896	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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108456	NC_004578	GAT	2	6	5509573	5509578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108457	NC_004578	GGCG	2	8	5509662	5509669	0 %	0 %	75 %	25 %	28871979
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108460	NC_004578	GAT	2	6	5509842	5509847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28871979
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