MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000 chromosome

Total Repeats: 125962

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_004578	GCAGC	2	10	510527	510536	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
10002	NC_004578	CGT	2	6	510596	510601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10003	NC_004578	TCA	2	6	510653	510658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10004	NC_004578	AAG	2	6	510685	510690	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10005	NC_004578	GCCC	2	8	510692	510699	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
10006	NC_004578	GAG	2	6	510723	510728	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10007	NC_004578	TGA	2	6	510735	510740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28867695
10008	NC_004578	TCAA	2	8	510747	510754	50 %	25 %	0 %	25 %	28867695
10009	NC_004578	CG	3	6	510773	510778	0 %	0 %	50 %	50 %	28867695
10010	NC_004578	CTG	2	6	510797	510802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867695
10011	NC_004578	CGG	2	6	510834	510839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28867695
10012	NC_004578	CGC	2	6	510955	510960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28867695
10013	NC_004578	GGT	2	6	511001	511006	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28867695
10014	NC_004578	GTCGC	2	10	511069	511078	0 %	20 %	40 %	40 %	28867695
10015	NC_004578	TG	3	6	511087	511092	0 %	50 %	50 %	0 %	28867695
10016	NC_004578	GT	3	6	511191	511196	0 %	50 %	50 %	0 %	28867695
10017	NC_004578	GTT	2	6	511210	511215	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28867695
10018	NC_004578	CGC	2	6	511257	511262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28867695
10019	NC_004578	ATG	2	6	511268	511273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28867695
10020	NC_004578	CGG	2	6	511311	511316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28867695
10021	NC_004578	TGA	2	6	511465	511470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28867695
10022	NC_004578	TTA	2	6	511549	511554	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28867695
10023	NC_004578	ATC	2	6	511610	511615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28867695
10024	NC_004578	CGC	2	6	511689	511694	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28867695
10025	NC_004578	CGA	2	6	511696	511701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28867695
10026	NC_004578	ATG	2	6	511736	511741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28867695
10027	NC_004578	GCTG	2	8	512082	512089	0 %	25 %	50 %	25 %	28867696
10028	NC_004578	CTGGT	2	10	512092	512101	0 %	40 %	40 %	20 %	28867696
10029	NC_004578	GCG	2	6	512188	512193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28867696
10030	NC_004578	CGTT	2	8	512212	512219	0 %	50 %	25 %	25 %	28867696
10031	NC_004578	TGC	2	6	512348	512353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867696
10032	NC_004578	TGC	2	6	512383	512388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867696
10033	NC_004578	GC	3	6	512404	512409	0 %	0 %	50 %	50 %	28867696
10034	NC_004578	TCG	2	6	512413	512418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867696
10035	NC_004578	GGC	2	6	512469	512474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28867696
10036	NC_004578	CAG	2	6	512484	512489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28867696
10037	NC_004578	TGGTC	2	10	512492	512501	0 %	40 %	40 %	20 %	28867696
10038	NC_004578	TGA	2	6	512561	512566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28867696
10039	NC_004578	CGC	2	6	512658	512663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28867696
10040	NC_004578	CTT	2	6	512705	512710	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28867696
10041	NC_004578	GTT	2	6	512760	512765	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28867696
10042	NC_004578	CTG	2	6	512766	512771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867696
10043	NC_004578	TCG	2	6	512791	512796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867696
10044	NC_004578	GCC	2	6	512818	512823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28867696
10045	NC_004578	CAG	2	6	512898	512903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28867696
10046	NC_004578	TCG	2	6	512917	512922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867696
10047	NC_004578	CCG	2	6	512972	512977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28867696
10048	NC_004578	AGC	2	6	513043	513048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28867696
10049	NC_004578	AGC	2	6	513061	513066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28867696
10050	NC_004578	ACG	2	6	513163	513168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28867696
10051	NC_004578	GTT	2	6	513198	513203	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28867696
10052	NC_004578	TTG	2	6	513229	513234	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28867696
10053	NC_004578	CAG	2	6	513282	513287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28867696
10054	NC_004578	TCG	2	6	513316	513321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867696
10055	NC_004578	TTG	2	6	513370	513375	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28867696
10056	NC_004578	CAG	2	6	513384	513389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28867696
10057	NC_004578	TCT	2	6	513398	513403	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28867696
10058	NC_004578	CAG	2	6	513429	513434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28867696
10059	NC_004578	ACA	2	6	513443	513448	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28867696
10060	NC_004578	ATCG	2	8	513476	513483	25 %	25 %	25 %	25 %	28867696
10061	NC_004578	GAT	2	6	513591	513596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28867696
10062	NC_004578	GGTA	2	8	513661	513668	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
10063	NC_004578	TAG	2	6	513745	513750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10064	NC_004578	GAC	2	6	513763	513768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10065	NC_004578	TTA	2	6	513769	513774	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10066	NC_004578	CAG	2	6	513906	513911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28867697
10067	NC_004578	ATGTCA	2	12	513966	513977	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
10068	NC_004578	AAC	2	6	514096	514101	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28867698
10069	NC_004578	GCA	2	6	514118	514123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28867698
10070	NC_004578	ACGAGA	2	12	514183	514194	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	28867698
10071	NC_004578	GAA	2	6	514221	514226	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28867698
10072	NC_004578	GCA	2	6	514234	514239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28867698
10073	NC_004578	CCG	2	6	514240	514245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28867698
10074	NC_004578	CG	3	6	514244	514249	0 %	0 %	50 %	50 %	28867698
10075	NC_004578	CG	3	6	514269	514274	0 %	0 %	50 %	50 %	28867698
10076	NC_004578	GCC	2	6	514394	514399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28867699
10077	NC_004578	GCA	2	6	514495	514500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28867699
10078	NC_004578	GT	3	6	514642	514647	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10079	NC_004578	TGCGCC	2	12	514700	514711	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	28867700
10080	NC_004578	CTG	2	6	514752	514757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867700
10081	NC_004578	GCG	2	6	514758	514763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28867700
10082	NC_004578	TTC	2	6	514830	514835	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28867700
10083	NC_004578	A	6	6	514848	514853	100 %	0 %	0 %	0 %	28867700
10084	NC_004578	GTC	2	6	514863	514868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867700
10085	NC_004578	CGG	2	6	514919	514924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28867700
10086	NC_004578	TGC	2	6	514939	514944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867700
10087	NC_004578	CTTT	2	8	514960	514967	0 %	75 %	0 %	25 %	28867700
10088	NC_004578	CTG	2	6	515160	515165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867700
10089	NC_004578	CAC	2	6	515259	515264	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28867700
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10091	NC_004578	GGT	2	6	515470	515475	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28867701
10092	NC_004578	GT	3	6	515479	515484	0 %	50 %	50 %	0 %	28867701
10093	NC_004578	TGC	2	6	515538	515543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867701
10094	NC_004578	CTG	2	6	515552	515557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867701
10095	NC_004578	CCT	2	6	515572	515577	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	28867701
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10099	NC_004578	GC	3	6	515750	515755	0 %	0 %	50 %	50 %	28867701
10100	NC_004578	CGG	2	6	515783	515788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28867701
10101	NC_004578	CAT	2	6	515813	515818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28867701
10102	NC_004578	CGC	3	9	515875	515883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28867701
10103	NC_004578	CAG	2	6	515930	515935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28867701
10104	NC_004578	TGAT	2	8	516066	516073	25 %	50 %	25 %	0 %	28867701
10105	NC_004578	AGC	2	6	516090	516095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28867701
10106	NC_004578	TCTGC	2	10	516106	516115	0 %	40 %	20 %	40 %	28867701
10107	NC_004578	CAGC	2	8	516203	516210	25 %	0 %	25 %	50 %	28867701
10108	NC_004578	AC	3	6	516263	516268	50 %	0 %	0 %	50 %	28867701
10109	NC_004578	GC	3	6	516407	516412	0 %	0 %	50 %	50 %	28867701
10110	NC_004578	ACACC	2	10	516460	516469	40 %	0 %	0 %	60 %	28867701
10111	NC_004578	CA	3	6	516495	516500	50 %	0 %	0 %	50 %	28867701
10112	NC_004578	GC	3	6	516598	516603	0 %	0 %	50 %	50 %	28867701
10113	NC_004578	TGC	2	6	516672	516677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867701
10114	NC_004578	TCG	2	6	516678	516683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867701
10115	NC_004578	TGC	2	6	516694	516699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867701
10116	NC_004578	CTG	2	6	516704	516709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867701
10117	NC_004578	CGG	2	6	516826	516831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28867701
10118	NC_004578	GCT	2	6	516835	516840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867701
10119	NC_004578	CTG	2	6	516845	516850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867701
10120	NC_004578	GCT	2	6	516869	516874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867701
10121	NC_004578	TGA	2	6	516925	516930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28867701
10122	NC_004578	GCAG	2	8	516949	516956	25 %	0 %	50 %	25 %	28867701
10123	NC_004578	CGG	2	6	516967	516972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28867701
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10133	NC_004578	GCGA	2	8	517464	517471	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10134	NC_004578	CGA	2	6	517488	517493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10135	NC_004578	CTG	2	6	517518	517523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10150	NC_004578	CTG	2	6	518247	518252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10152	NC_004578	ATCT	2	8	518316	518323	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10153	NC_004578	TCG	2	6	518399	518404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10155	NC_004578	TTG	2	6	518458	518463	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10157	NC_004578	CCAGG	2	10	518628	518637	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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10162	NC_004578	CGTG	2	8	518817	518824	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10163	NC_004578	CCG	2	6	518912	518917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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10245	NC_004578	GCA	2	6	522953	522958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28867706
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10248	NC_004578	CCA	2	6	523147	523152	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28867706
10249	NC_004578	CAT	2	6	523204	523209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28867706
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10363	NC_004578	GC	3	6	529223	529228	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10364	NC_004578	A	6	6	529260	529265	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10365	NC_004578	CTT	2	6	529329	529334	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10366	NC_004578	G	6	6	529344	529349	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
10367	NC_004578	TG	3	6	529367	529372	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10368	NC_004578	T	6	6	529373	529378	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10369	NC_004578	GCG	2	6	529384	529389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28867713
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10493	NC_004578	GTC	2	6	536102	536107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867719
10494	NC_004578	T	6	6	536119	536124	0 %	100 %	0 %	0 %	28867719
10495	NC_004578	GC	3	6	536129	536134	0 %	0 %	50 %	50 %	28867719
10496	NC_004578	CGG	2	6	536157	536162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28867719
10497	NC_004578	CGC	2	6	536214	536219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28867719
10498	NC_004578	CAA	2	6	536242	536247	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28867719
10499	NC_004578	AG	3	6	536281	536286	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10500	NC_004578	CGC	2	6	536389	536394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28867720

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