MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000 chromosome

Total Repeats: 125962

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_004578	CTG	2	6	27296	27301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867263
502	NC_004578	GC	3	6	27321	27326	0 %	0 %	50 %	50 %	28867263
503	NC_004578	GCG	2	6	27353	27358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28867263
504	NC_004578	AGG	2	6	27426	27431	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28867263
505	NC_004578	GAG	2	6	27485	27490	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28867263
506	NC_004578	TGC	2	6	27499	27504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867263
507	NC_004578	TTGC	2	8	27506	27513	0 %	50 %	25 %	25 %	28867263
508	NC_004578	TTGA	2	8	27516	27523	25 %	50 %	25 %	0 %	28867263
509	NC_004578	T	6	6	27545	27550	0 %	100 %	0 %	0 %	28867263
510	NC_004578	T	6	6	27603	27608	0 %	100 %	0 %	0 %	28867263
511	NC_004578	GAG	2	6	27620	27625	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28867263
512	NC_004578	TGC	2	6	27642	27647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867263
513	NC_004578	GAC	2	6	27808	27813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
514	NC_004578	GA	3	6	27850	27855	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
515	NC_004578	GTC	2	6	27883	27888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
516	NC_004578	GACC	2	8	27903	27910	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
517	NC_004578	TTC	2	6	27947	27952	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
518	NC_004578	ATG	2	6	28123	28128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
519	NC_004578	TGC	2	6	28139	28144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
520	NC_004578	GCAA	2	8	28145	28152	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
521	NC_004578	GGC	2	6	28234	28239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
522	NC_004578	GCT	2	6	28348	28353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
523	NC_004578	TGG	2	6	28392	28397	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
524	NC_004578	TGG	2	6	28419	28424	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
525	NC_004578	AAG	2	6	28433	28438	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
526	NC_004578	ACC	2	6	28451	28456	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
527	NC_004578	T	6	6	28513	28518	0 %	100 %	0 %	0 %	28867264
528	NC_004578	CG	3	6	28570	28575	0 %	0 %	50 %	50 %	28867264
529	NC_004578	ATTGGG	2	12	28609	28620	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	28867264
530	NC_004578	AGC	2	6	28707	28712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28867264
531	NC_004578	GGA	2	6	28864	28869	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28867264
532	NC_004578	CTG	2	6	28895	28900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867264
533	NC_004578	GGC	2	6	28936	28941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28867264
534	NC_004578	CAG	2	6	28979	28984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28867264
535	NC_004578	CAG	2	6	29024	29029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28867264
536	NC_004578	GCG	2	6	29042	29047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28867264
537	NC_004578	CGC	2	6	29112	29117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28867264
538	NC_004578	TTC	2	6	29204	29209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28867264
539	NC_004578	ACGGG	2	10	29238	29247	20 %	0 %	60 %	20 %	28867264
540	NC_004578	CGT	2	6	29250	29255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867264
541	NC_004578	CG	3	6	29314	29319	0 %	0 %	50 %	50 %	28867264
542	NC_004578	GCG	2	6	29326	29331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28867265
543	NC_004578	GGGTT	2	10	29399	29408	0 %	40 %	60 %	0 %	28867265
544	NC_004578	GTG	2	6	29468	29473	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28867265
545	NC_004578	CGA	2	6	29553	29558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28867265
546	NC_004578	TCC	2	6	29650	29655	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	28867265
547	NC_004578	ATGG	2	8	29920	29927	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
548	NC_004578	ACG	2	6	30117	30122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
549	NC_004578	AGA	2	6	30251	30256	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
550	NC_004578	CCT	2	6	30558	30563	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
551	NC_004578	GAG	2	6	30577	30582	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
552	NC_004578	CTT	2	6	30671	30676	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
553	NC_004578	GCCAA	2	10	30731	30740	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
554	NC_004578	GTCG	2	8	30748	30755	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
555	NC_004578	CGG	2	6	30768	30773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
556	NC_004578	CG	3	6	30779	30784	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
557	NC_004578	GCCAAG	2	12	30874	30885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28867266
558	NC_004578	ACCAAG	4	24	30886	30909	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	28867266
559	NC_004578	CG	3	6	30924	30929	0 %	0 %	50 %	50 %	28867266
560	NC_004578	TTC	2	6	30948	30953	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28867266
561	NC_004578	GGGT	2	8	31024	31031	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
562	NC_004578	TC	3	6	31062	31067	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
563	NC_004578	AGCA	2	8	31073	31080	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
564	NC_004578	TGG	2	6	31193	31198	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
565	NC_004578	TGT	2	6	31200	31205	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
566	NC_004578	CGT	2	6	31215	31220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
567	NC_004578	AGC	2	6	31279	31284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
568	NC_004578	GGAG	2	8	31322	31329	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
569	NC_004578	CG	3	6	31397	31402	0 %	0 %	50 %	50 %	28867267
570	NC_004578	CCAT	2	8	31403	31410	25 %	25 %	0 %	50 %	28867267
571	NC_004578	GCG	2	6	31445	31450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28867267
572	NC_004578	GAT	2	6	31461	31466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28867267
573	NC_004578	CGG	2	6	31758	31763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28867267
574	NC_004578	CTGA	2	8	31779	31786	25 %	25 %	25 %	25 %	28867267
575	NC_004578	GAT	2	6	31814	31819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28867267
576	NC_004578	GCA	2	6	31992	31997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
577	NC_004578	AGC	2	6	32040	32045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28867268
578	NC_004578	TCG	2	6	32135	32140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867268
579	NC_004578	ATGC	2	8	32179	32186	25 %	25 %	25 %	25 %	28867268
580	NC_004578	TGC	2	6	32189	32194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867268
581	NC_004578	GATCA	2	10	32217	32226	40 %	20 %	20 %	20 %	28867268
582	NC_004578	TGC	2	6	32258	32263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867268
583	NC_004578	TAG	2	6	32351	32356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28867268
584	NC_004578	CCACC	2	10	32362	32371	20 %	0 %	0 %	80 %	28867268
585	NC_004578	GCACT	2	10	32399	32408	20 %	20 %	20 %	40 %	28867268
586	NC_004578	TG	3	6	32442	32447	0 %	50 %	50 %	0 %	28867268
587	NC_004578	TGA	2	6	32558	32563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28867268
588	NC_004578	CAGGA	2	10	32570	32579	40 %	0 %	40 %	20 %	28867268
589	NC_004578	CGA	2	6	32740	32745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28867268
590	NC_004578	CTT	2	6	32750	32755	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28867268
591	NC_004578	GAT	2	6	32960	32965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28867268
592	NC_004578	GGT	2	6	33045	33050	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28867268
593	NC_004578	TTTG	2	8	33080	33087	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
594	NC_004578	GGCC	2	8	33110	33117	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
595	NC_004578	TGC	2	6	33396	33401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867269
596	NC_004578	TTA	2	6	33477	33482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28867269
597	NC_004578	AAGA	2	8	33500	33507	75 %	0 %	25 %	0 %	28867269
598	NC_004578	CTG	2	6	33531	33536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867269
599	NC_004578	GCAA	2	8	33654	33661	50 %	0 %	25 %	25 %	28867269
600	NC_004578	GAG	2	6	33677	33682	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28867269
601	NC_004578	TC	3	6	33687	33692	0 %	50 %	0 %	50 %	28867269
602	NC_004578	CG	3	6	33752	33757	0 %	0 %	50 %	50 %	28867269
603	NC_004578	A	6	6	33790	33795	100 %	0 %	0 %	0 %	28867269
604	NC_004578	T	8	8	33855	33862	0 %	100 %	0 %	0 %	28867269
605	NC_004578	GCG	2	6	33932	33937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28867269
606	NC_004578	ATC	2	6	33951	33956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28867269
607	NC_004578	TCA	2	6	34000	34005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28867270
608	NC_004578	TCGT	2	8	34052	34059	0 %	50 %	25 %	25 %	28867270
609	NC_004578	AGT	2	6	34094	34099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28867270
610	NC_004578	GAC	2	6	34140	34145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28867270
611	NC_004578	AGA	2	6	34211	34216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28867270
612	NC_004578	AGC	2	6	34294	34299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28867270
613	NC_004578	AAG	2	6	34376	34381	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28867270
614	NC_004578	TCA	2	6	34463	34468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28867270
615	NC_004578	GCAGTA	2	12	34531	34542	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	28867270
616	NC_004578	GT	3	6	34624	34629	0 %	50 %	50 %	0 %	28867270
617	NC_004578	CAA	2	6	34858	34863	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28867270
618	NC_004578	TTG	2	6	34870	34875	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28867270
619	NC_004578	TCACC	2	10	34880	34889	20 %	20 %	0 %	60 %	28867270
620	NC_004578	GCA	2	6	34896	34901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28867270
621	NC_004578	GCCC	2	8	34991	34998	0 %	0 %	25 %	75 %	28867270
622	NC_004578	ATG	2	6	35082	35087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28867270
623	NC_004578	T	7	7	35138	35144	0 %	100 %	0 %	0 %	28867270
624	NC_004578	TCA	2	6	35272	35277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28867270
625	NC_004578	TCATA	2	10	35295	35304	40 %	40 %	0 %	20 %	28867270
626	NC_004578	AAG	2	6	35307	35312	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28867270
627	NC_004578	CAG	2	6	35379	35384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28867270
628	NC_004578	GAA	2	6	35412	35417	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28867270
629	NC_004578	GTC	2	6	35431	35436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867270
630	NC_004578	AAAC	2	8	35527	35534	75 %	0 %	0 %	25 %	28867270
631	NC_004578	TG	3	6	35552	35557	0 %	50 %	50 %	0 %	28867270
632	NC_004578	CGGT	2	8	35577	35584	0 %	25 %	50 %	25 %	28867270
633	NC_004578	TCA	2	6	35728	35733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28867270
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741	NC_004578	T	7	7	42076	42082	0 %	100 %	0 %	0 %	28867275
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