MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000 chromosome

Total Repeats: 125962

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_004578	GC	3	6	361041	361046	0 %	0 %	50 %	50 %	28867560
7002	NC_004578	TGC	2	6	361069	361074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867560
7003	NC_004578	ATC	2	6	361131	361136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7004	NC_004578	GC	3	6	361272	361277	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7005	NC_004578	GCC	2	6	361306	361311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7006	NC_004578	CAAC	2	8	361472	361479	50 %	0 %	0 %	50 %	28867561
7007	NC_004578	TGC	2	6	361606	361611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867561
7008	NC_004578	CTTC	2	8	361655	361662	0 %	50 %	0 %	50 %	28867561
7009	NC_004578	GAC	2	6	361665	361670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28867561
7010	NC_004578	CAT	2	6	361733	361738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28867561
7011	NC_004578	GCC	2	6	361761	361766	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28867561
7012	NC_004578	GGC	2	6	361776	361781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28867561
7013	NC_004578	ACG	2	6	361823	361828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28867562
7014	NC_004578	GAA	3	9	361832	361840	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28867562
7015	NC_004578	ACG	2	6	361866	361871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28867562
7016	NC_004578	GAT	2	6	361943	361948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28867562
7017	NC_004578	TGC	2	6	362013	362018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7018	NC_004578	T	6	6	362020	362025	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7019	NC_004578	A	6	6	362037	362042	100 %	0 %	0 %	0 %	28867563
7020	NC_004578	TGC	2	6	362051	362056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867563
7021	NC_004578	TGC	2	6	362151	362156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867563
7022	NC_004578	CTG	2	6	362218	362223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867563
7023	NC_004578	GAG	2	6	362251	362256	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28867563
7024	NC_004578	GCTG	2	8	362310	362317	0 %	25 %	50 %	25 %	28867563
7025	NC_004578	CAAT	2	8	362350	362357	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7026	NC_004578	TTG	2	6	362382	362387	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7027	NC_004578	T	6	6	362429	362434	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7028	NC_004578	GC	3	6	362564	362569	0 %	0 %	50 %	50 %	28867564
7029	NC_004578	CG	3	6	362619	362624	0 %	0 %	50 %	50 %	28867564
7030	NC_004578	GAC	2	6	362678	362683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28867564
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7033	NC_004578	GGC	2	6	362816	362821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28867564
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7040	NC_004578	GCAG	2	8	363303	363310	25 %	0 %	50 %	25 %	28867564
7041	NC_004578	GCA	2	6	363351	363356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28867564
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7045	NC_004578	AG	3	6	363486	363491	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7046	NC_004578	GCAT	2	8	363495	363502	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7047	NC_004578	AATC	2	8	363510	363517	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7048	NC_004578	GAT	2	6	363541	363546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7055	NC_004578	AGC	2	6	363953	363958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28867565
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7057	NC_004578	ATG	2	6	364048	364053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28867565
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7059	NC_004578	AAG	2	6	364174	364179	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28867565
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7095	NC_004578	GTC	2	6	365865	365870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867566
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7116	NC_004578	GCT	3	9	366721	366729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867566
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7122	NC_004578	AGTG	2	8	367031	367038	25 %	25 %	50 %	0 %	28867567
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7126	NC_004578	TGC	2	6	367163	367168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867568
7127	NC_004578	TCA	2	6	367244	367249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28867568
7128	NC_004578	TGA	2	6	367287	367292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28867568
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7132	NC_004578	TTCC	2	8	367381	367388	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7133	NC_004578	CA	3	6	367474	367479	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7134	NC_004578	CTG	2	6	367494	367499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7500	NC_004578	GCG	2	6	385156	385161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28867582

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