MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000 chromosome

Total Repeats: 125962

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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6502	NC_004578	CGG	2	6	336041	336046	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28867539
6503	NC_004578	GAA	2	6	336134	336139	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28867539
6504	NC_004578	AAGG	2	8	336186	336193	50 %	0 %	50 %	0 %	28867539
6505	NC_004578	TGC	2	6	336203	336208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867539
6506	NC_004578	A	6	6	336209	336214	100 %	0 %	0 %	0 %	28867539
6507	NC_004578	GGC	2	6	336303	336308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28867539
6508	NC_004578	ATG	2	6	336337	336342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28867539
6509	NC_004578	GCG	2	6	336343	336348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28867539
6510	NC_004578	CG	3	6	336393	336398	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6511	NC_004578	AGC	2	6	336421	336426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6512	NC_004578	CGT	2	6	336478	336483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867540
6513	NC_004578	CTA	2	6	336553	336558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28867540
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6515	NC_004578	CAT	2	6	336615	336620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28867540
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6517	NC_004578	ATC	2	6	336751	336756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28867540
6518	NC_004578	GAT	2	6	336762	336767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28867540
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6521	NC_004578	GTG	2	6	336931	336936	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28867540
6522	NC_004578	GAA	2	6	336979	336984	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28867540
6523	NC_004578	GCC	3	9	336985	336993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28867540
6524	NC_004578	TGC	2	6	337046	337051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867540
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6529	NC_004578	CTG	2	6	337261	337266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867540
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6533	NC_004578	CGT	2	6	337352	337357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867541
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6535	NC_004578	GTG	2	6	337439	337444	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28867541
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6542	NC_004578	GCT	2	6	337861	337866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867541
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6545	NC_004578	CTG	2	6	338114	338119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867541
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6554	NC_004578	AGCG	2	8	338494	338501	25 %	0 %	50 %	25 %	28867542
6555	NC_004578	CGAA	2	8	338504	338511	50 %	0 %	25 %	25 %	28867542
6556	NC_004578	GCT	2	6	338538	338543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867542
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6559	NC_004578	CAGCGT	2	12	338602	338613	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	28867542
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6561	NC_004578	GCTG	2	8	338711	338718	0 %	25 %	50 %	25 %	28867542
6562	NC_004578	GC	3	6	338719	338724	0 %	0 %	50 %	50 %	28867542
6563	NC_004578	CGA	2	6	338919	338924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28867542
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6585	NC_004578	CGA	2	6	339965	339970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6595	NC_004578	CGCTG	2	10	340420	340429	0 %	20 %	40 %	40 %	28867544
6596	NC_004578	GTT	2	6	340477	340482	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28867544
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6601	NC_004578	CCAGGG	2	12	340716	340727	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	28867544
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6603	NC_004578	TCT	2	6	340874	340879	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28867545
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6995	NC_004578	GTG	2	6	360846	360851	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28867560
6996	NC_004578	GGGC	2	8	360871	360878	0 %	0 %	75 %	25 %	28867560
6997	NC_004578	TCCG	2	8	360884	360891	0 %	25 %	25 %	50 %	28867560
6998	NC_004578	CGCA	2	8	360932	360939	25 %	0 %	25 %	50 %	28867560
6999	NC_004578	CGG	2	6	360995	361000	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28867560
7000	NC_004578	GCG	2	6	361027	361032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28867560

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