MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000 chromosome

Total Repeats: 125962

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_004578	CCG	2	6	310723	310728	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28867517
6002	NC_004578	CCTG	2	8	310751	310758	0 %	25 %	25 %	50 %	28867517
6003	NC_004578	TACA	2	8	310777	310784	50 %	25 %	0 %	25 %	28867517
6004	NC_004578	TGC	2	6	310834	310839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6005	NC_004578	GT	4	8	310884	310891	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6006	NC_004578	TGC	2	6	310975	310980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6007	NC_004578	ATC	2	6	311025	311030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6008	NC_004578	TCG	2	6	311089	311094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6009	NC_004578	CAT	2	6	311126	311131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6010	NC_004578	CTG	2	6	311180	311185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6011	NC_004578	GT	3	6	311264	311269	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6012	NC_004578	CTAT	2	8	311383	311390	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6013	NC_004578	CGT	2	6	311415	311420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6014	NC_004578	CAC	2	6	311510	311515	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6015	NC_004578	CGG	2	6	311551	311556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6016	NC_004578	CGC	2	6	311573	311578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6017	NC_004578	TCC	2	6	311656	311661	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6018	NC_004578	TCG	2	6	311671	311676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6019	NC_004578	ACG	2	6	311720	311725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6020	NC_004578	GGTC	2	8	311903	311910	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6021	NC_004578	AATG	2	8	312009	312016	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6022	NC_004578	TGC	2	6	312046	312051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6023	NC_004578	TGC	2	6	312084	312089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6024	NC_004578	ATC	2	6	312114	312119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6025	NC_004578	TTC	2	6	312150	312155	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6026	NC_004578	GCA	2	6	312265	312270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6027	NC_004578	CTCCG	2	10	312348	312357	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
6028	NC_004578	TGG	2	6	312430	312435	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6029	NC_004578	CAC	2	6	312443	312448	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6030	NC_004578	GCA	2	6	312494	312499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6031	NC_004578	CTTC	2	8	312599	312606	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6032	NC_004578	TCC	2	6	312690	312695	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6033	NC_004578	GA	3	6	312697	312702	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6034	NC_004578	GCA	2	6	312703	312708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6035	NC_004578	CCG	2	6	312724	312729	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6036	NC_004578	GCA	2	6	312764	312769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6037	NC_004578	A	6	6	312828	312833	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6038	NC_004578	CGA	2	6	312981	312986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6039	NC_004578	GAG	2	6	313020	313025	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6040	NC_004578	GATT	2	8	313039	313046	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6041	NC_004578	GTTC	2	8	313152	313159	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6042	NC_004578	TGCA	2	8	313180	313187	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6043	NC_004578	TCA	2	6	313197	313202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6044	NC_004578	ACTG	2	8	313211	313218	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6045	NC_004578	TTG	2	6	313276	313281	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6046	NC_004578	GCA	2	6	313377	313382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6047	NC_004578	GTG	2	6	313398	313403	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6048	NC_004578	GCT	2	6	313427	313432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6049	NC_004578	CTG	2	6	313443	313448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6050	NC_004578	CTTCT	2	10	313512	313521	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
6051	NC_004578	GCG	2	6	313744	313749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6052	NC_004578	GA	3	6	313777	313782	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6053	NC_004578	GCG	2	6	313783	313788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6054	NC_004578	GCG	2	6	313811	313816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6055	NC_004578	TAC	2	6	313831	313836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6056	NC_004578	TAT	3	9	313837	313845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6057	NC_004578	CAC	2	6	313928	313933	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6058	NC_004578	CCA	2	6	313955	313960	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6059	NC_004578	CTA	2	6	313972	313977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6060	NC_004578	ACT	2	6	313987	313992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6061	NC_004578	GTC	2	6	314114	314119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6062	NC_004578	T	6	6	314153	314158	0 %	100 %	0 %	0 %	28867518
6063	NC_004578	CTG	2	6	314168	314173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867518
6064	NC_004578	GGC	2	6	314336	314341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28867518
6065	NC_004578	GGAC	2	8	314383	314390	25 %	0 %	50 %	25 %	28867518
6066	NC_004578	GCT	2	6	314460	314465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867518
6067	NC_004578	CAC	2	6	314520	314525	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28867518
6068	NC_004578	GCT	2	6	314573	314578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867518
6069	NC_004578	CG	3	6	314703	314708	0 %	0 %	50 %	50 %	28867518
6070	NC_004578	CGA	2	6	314762	314767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28867518
6071	NC_004578	GAA	2	6	314799	314804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28867518
6072	NC_004578	GCA	2	6	314833	314838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28867518
6073	NC_004578	GC	3	6	314912	314917	0 %	0 %	50 %	50 %	28867518
6074	NC_004578	TGG	2	6	314947	314952	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28867518
6075	NC_004578	GAA	2	6	315020	315025	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28867518
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6078	NC_004578	AAG	2	6	315186	315191	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28867518
6079	NC_004578	GCT	2	6	315308	315313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867518
6080	NC_004578	CGG	2	6	315376	315381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28867518
6081	NC_004578	ATC	2	6	315407	315412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6082	NC_004578	GCCT	2	8	315530	315537	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6083	NC_004578	A	7	7	315550	315556	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6084	NC_004578	AAGCA	2	10	315621	315630	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
6085	NC_004578	TCG	2	6	315648	315653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6086	NC_004578	AACG	2	8	315774	315781	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6087	NC_004578	AATTT	2	10	315813	315822	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
6088	NC_004578	GTG	2	6	315852	315857	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6089	NC_004578	ACC	2	6	315902	315907	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6090	NC_004578	CGGC	2	8	315912	315919	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6091	NC_004578	GCTT	2	8	315940	315947	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6092	NC_004578	GATT	2	8	315982	315989	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6093	NC_004578	TTGC	2	8	315996	316003	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6094	NC_004578	TGG	2	6	316129	316134	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28867519
6095	NC_004578	TGA	2	6	316216	316221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28867519
6096	NC_004578	GC	3	6	316244	316249	0 %	0 %	50 %	50 %	28867519
6097	NC_004578	GCT	2	6	316274	316279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867520
6098	NC_004578	ATG	2	6	316311	316316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28867520
6099	NC_004578	AG	3	6	316321	316326	50 %	0 %	50 %	0 %	28867520
6100	NC_004578	GATC	2	8	316366	316373	25 %	25 %	25 %	25 %	28867520
6101	NC_004578	TGC	2	6	316380	316385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867520
6102	NC_004578	GC	3	6	316402	316407	0 %	0 %	50 %	50 %	28867520
6103	NC_004578	GGT	2	6	316411	316416	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28867520
6104	NC_004578	GGAG	2	8	316439	316446	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
6105	NC_004578	A	6	6	316507	316512	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6106	NC_004578	GCC	2	6	316650	316655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28867521
6107	NC_004578	GGCA	2	8	316712	316719	25 %	0 %	50 %	25 %	28867521
6108	NC_004578	GGCC	2	8	316729	316736	0 %	0 %	50 %	50 %	28867521
6109	NC_004578	CCT	2	6	316775	316780	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	28867521
6110	NC_004578	CTGC	2	8	316816	316823	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6111	NC_004578	A	7	7	316843	316849	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6112	NC_004578	GCC	2	6	316850	316855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6113	NC_004578	AGG	2	6	316868	316873	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6114	NC_004578	G	7	7	316872	316878	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6115	NC_004578	C	6	6	316990	316995	0 %	0 %	0 %	100 %	28867522
6116	NC_004578	ATG	2	6	317100	317105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28867522
6117	NC_004578	ATC	2	6	317142	317147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28867522
6118	NC_004578	ACA	2	6	317224	317229	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28867522
6119	NC_004578	GAA	2	6	317232	317237	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28867522
6120	NC_004578	TCA	2	6	317248	317253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28867522
6121	NC_004578	CAA	2	6	317289	317294	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28867522
6122	NC_004578	CAC	2	6	317307	317312	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28867522
6123	NC_004578	GCA	2	6	317363	317368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28867522
6124	NC_004578	GCC	2	6	317377	317382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28867522
6125	NC_004578	CAA	2	6	317495	317500	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28867522
6126	NC_004578	TGC	2	6	317508	317513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867522
6127	NC_004578	CAG	2	6	317604	317609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28867522
6128	NC_004578	CAGC	2	8	317648	317655	25 %	0 %	25 %	50 %	28867522
6129	NC_004578	CGC	2	6	317687	317692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28867522
6130	NC_004578	TGC	2	6	317694	317699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867522
6131	NC_004578	TTG	2	6	317700	317705	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28867522
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6383	NC_004578	TGG	2	6	329751	329756	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28867534
6384	NC_004578	TGAA	2	8	329762	329769	50 %	25 %	25 %	0 %	28867534
6385	NC_004578	CTGCG	2	10	329816	329825	0 %	20 %	40 %	40 %	28867534
6386	NC_004578	ACA	2	6	329882	329887	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28867534
6387	NC_004578	AG	3	6	329955	329960	50 %	0 %	50 %	0 %	28867534
6388	NC_004578	CTG	2	6	330064	330069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867534
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6411	NC_004578	CA	3	6	331468	331473	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6412	NC_004578	TGA	2	6	331498	331503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6417	NC_004578	TGC	2	6	331694	331699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867536
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6441	NC_004578	GCT	2	6	332957	332962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867537
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6471	NC_004578	GC	3	6	334295	334300	0 %	0 %	50 %	50 %	28867537
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6480	NC_004578	TAT	2	6	334957	334962	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6481	NC_004578	AGC	2	6	335070	335075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28867538
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6485	NC_004578	A	7	7	335271	335277	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6486	NC_004578	CGT	2	6	335284	335289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6488	NC_004578	GAA	3	9	335312	335320	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6489	NC_004578	A	6	6	335324	335329	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6490	NC_004578	AC	3	6	335334	335339	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6491	NC_004578	GAC	2	6	335526	335531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28867539
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6493	NC_004578	CCTG	2	8	335663	335670	0 %	25 %	25 %	50 %	28867539
6494	NC_004578	AAGA	2	8	335781	335788	75 %	0 %	25 %	0 %	28867539
6495	NC_004578	CGG	2	6	335822	335827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28867539
6496	NC_004578	GC	3	6	335829	335834	0 %	0 %	50 %	50 %	28867539
6497	NC_004578	GGC	2	6	335846	335851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28867539
6498	NC_004578	GCGG	2	8	335871	335878	0 %	0 %	75 %	25 %	28867539
6499	NC_004578	AAGCCA	2	12	335887	335898	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	28867539
6500	NC_004578	GTT	2	6	335915	335920	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28867539

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