MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000 chromosome

Total Repeats: 125962

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_004578	TCT	2	6	234294	234299	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28867441
4502	NC_004578	ATC	2	6	234314	234319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28867441
4503	NC_004578	TCA	2	6	234357	234362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28867441
4504	NC_004578	TGT	2	6	234391	234396	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28867441
4505	NC_004578	CAT	2	6	234430	234435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28867441
4506	NC_004578	CGA	2	6	234484	234489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28867441
4507	NC_004578	TCG	2	6	234570	234575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867441
4508	NC_004578	CG	3	6	234574	234579	0 %	0 %	50 %	50 %	28867441
4509	NC_004578	GCC	2	6	234668	234673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28867441
4510	NC_004578	CAA	2	6	234904	234909	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28867441
4511	NC_004578	TGC	2	6	234925	234930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867441
4512	NC_004578	CTG	2	6	234935	234940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867441
4513	NC_004578	TGCT	2	8	235053	235060	0 %	50 %	25 %	25 %	28867441
4514	NC_004578	CGC	2	6	235066	235071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28867441
4515	NC_004578	GC	3	6	235147	235152	0 %	0 %	50 %	50 %	28867441
4516	NC_004578	GCA	2	6	235162	235167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28867441
4517	NC_004578	TCGA	2	8	235170	235177	25 %	25 %	25 %	25 %	28867441
4518	NC_004578	GC	3	6	235302	235307	0 %	0 %	50 %	50 %	28867441
4519	NC_004578	CCG	2	6	235336	235341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28867441
4520	NC_004578	CGT	2	6	235453	235458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867441
4521	NC_004578	GCTG	2	8	235501	235508	0 %	25 %	50 %	25 %	28867441
4522	NC_004578	TGCC	2	8	235607	235614	0 %	25 %	25 %	50 %	28867442
4523	NC_004578	GCC	2	6	235695	235700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28867442
4524	NC_004578	AGCC	2	8	235738	235745	25 %	0 %	25 %	50 %	28867442
4525	NC_004578	CAAC	2	8	235759	235766	50 %	0 %	0 %	50 %	28867442
4526	NC_004578	ATG	2	6	235852	235857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28867442
4527	NC_004578	ACC	2	6	235945	235950	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28867442
4528	NC_004578	AGCA	2	8	235966	235973	50 %	0 %	25 %	25 %	28867442
4529	NC_004578	CCATC	2	10	235998	236007	20 %	20 %	0 %	60 %	28867442
4530	NC_004578	AGC	2	6	236041	236046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28867442
4531	NC_004578	CAGC	2	8	236079	236086	25 %	0 %	25 %	50 %	28867442
4532	NC_004578	ATC	2	6	236119	236124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28867442
4533	NC_004578	GCA	2	6	236168	236173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28867442
4534	NC_004578	ATC	2	6	236188	236193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28867442
4535	NC_004578	CAA	2	6	236205	236210	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28867442
4536	NC_004578	TGA	2	6	236226	236231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28867442
4537	NC_004578	GCG	2	6	236309	236314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28867442
4538	NC_004578	CGA	2	6	236345	236350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28867442
4539	NC_004578	GCC	2	6	236374	236379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28867442
4540	NC_004578	ATC	2	6	236398	236403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28867442
4541	NC_004578	CGA	2	6	236482	236487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28867443
4542	NC_004578	TGA	2	6	236494	236499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28867443
4543	NC_004578	TTG	2	6	236500	236505	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28867443
4544	NC_004578	CG	3	6	236507	236512	0 %	0 %	50 %	50 %	28867443
4545	NC_004578	CGAG	2	8	236602	236609	25 %	0 %	50 %	25 %	28867443
4546	NC_004578	AAC	2	6	236621	236626	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28867443
4547	NC_004578	TCA	2	6	236631	236636	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28867443
4548	NC_004578	GTC	2	6	236651	236656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867443
4549	NC_004578	CAG	2	6	236657	236662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28867443
4550	NC_004578	CGG	2	6	236674	236679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28867443
4551	NC_004578	TGA	2	6	236728	236733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28867443
4552	NC_004578	GCC	2	6	236741	236746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28867443
4553	NC_004578	GT	3	6	236919	236924	0 %	50 %	50 %	0 %	28867443
4554	NC_004578	GCAA	2	8	236928	236935	50 %	0 %	25 %	25 %	28867443
4555	NC_004578	T	6	6	236942	236947	0 %	100 %	0 %	0 %	28867443
4556	NC_004578	GCG	2	6	237022	237027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28867443
4557	NC_004578	GTGC	2	8	237032	237039	0 %	25 %	50 %	25 %	28867443
4558	NC_004578	CGC	2	6	237106	237111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28867443
4559	NC_004578	GCC	2	6	237116	237121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28867443
4560	NC_004578	GCT	2	6	237176	237181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867443
4561	NC_004578	GACG	2	8	237228	237235	25 %	0 %	50 %	25 %	28867443
4562	NC_004578	CCT	2	6	237328	237333	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	28867443
4563	NC_004578	GGCA	2	8	237347	237354	25 %	0 %	50 %	25 %	28867443
4564	NC_004578	CGG	2	6	237393	237398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28867443
4565	NC_004578	GAA	2	6	237451	237456	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28867443
4566	NC_004578	TGG	2	6	237478	237483	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28867443
4567	NC_004578	GTTGT	2	10	237528	237537	0 %	60 %	40 %	0 %	28867443
4568	NC_004578	CAG	2	6	237539	237544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28867443
4569	NC_004578	CAG	2	6	237558	237563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28867443
4570	NC_004578	ATG	2	6	237746	237751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4571	NC_004578	CATT	2	8	237795	237802	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4572	NC_004578	GCC	2	6	237906	237911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28867444
4573	NC_004578	GC	3	6	237954	237959	0 %	0 %	50 %	50 %	28867444
4574	NC_004578	CTCA	2	8	237969	237976	25 %	25 %	0 %	50 %	28867444
4575	NC_004578	GAG	2	6	238041	238046	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28867444
4576	NC_004578	CGG	2	6	238087	238092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28867444
4577	NC_004578	GCCT	2	8	238131	238138	0 %	25 %	25 %	50 %	28867444
4578	NC_004578	GTT	2	6	238157	238162	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28867444
4579	NC_004578	T	6	6	238182	238187	0 %	100 %	0 %	0 %	28867444
4580	NC_004578	CGC	2	6	238219	238224	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28867444
4581	NC_004578	GC	3	6	238294	238299	0 %	0 %	50 %	50 %	28867444
4582	NC_004578	GT	4	8	238341	238348	0 %	50 %	50 %	0 %	28867444
4583	NC_004578	TCA	2	6	238417	238422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28867444
4584	NC_004578	GCA	2	6	238448	238453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28867444
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4587	NC_004578	TCG	2	6	238723	238728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867444
4588	NC_004578	GGC	2	6	238739	238744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28867444
4589	NC_004578	G	8	8	238777	238784	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4590	NC_004578	GAA	2	6	238853	238858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4591	NC_004578	GCA	2	6	238894	238899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4592	NC_004578	GAT	2	6	238976	238981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4593	NC_004578	GTGC	2	8	239043	239050	0 %	25 %	50 %	25 %	28867445
4594	NC_004578	TGC	2	6	239136	239141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867445
4595	NC_004578	CTC	2	6	239165	239170	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	28867445
4596	NC_004578	CGTA	2	8	239220	239227	25 %	25 %	25 %	25 %	28867445
4597	NC_004578	TCCA	2	8	239339	239346	25 %	25 %	0 %	50 %	28867446
4598	NC_004578	CCG	2	6	239390	239395	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28867446
4599	NC_004578	CAGAGA	2	12	239558	239569	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	28867446
4600	NC_004578	GC	3	6	239573	239578	0 %	0 %	50 %	50 %	28867446
4601	NC_004578	AGCC	2	8	239670	239677	25 %	0 %	25 %	50 %	28867447
4602	NC_004578	ACCTT	2	10	239693	239702	20 %	40 %	0 %	40 %	28867447
4603	NC_004578	TTC	2	6	239779	239784	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28867447
4604	NC_004578	GCA	2	6	239820	239825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28867447
4605	NC_004578	ATG	2	6	239933	239938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28867447
4606	NC_004578	GCA	2	6	239958	239963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4607	NC_004578	GC	3	6	240018	240023	0 %	0 %	50 %	50 %	28867448
4608	NC_004578	GGGC	2	8	240026	240033	0 %	0 %	75 %	25 %	28867448
4609	NC_004578	TTG	2	6	240046	240051	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28867448
4610	NC_004578	TGA	2	6	240079	240084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28867448
4611	NC_004578	GGC	2	6	240260	240265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4612	NC_004578	GTTT	2	8	240309	240316	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4613	NC_004578	CCA	2	6	240330	240335	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4614	NC_004578	CAT	2	6	240371	240376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28867449
4615	NC_004578	GTC	2	6	240507	240512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867449
4616	NC_004578	CTTC	2	8	240515	240522	0 %	50 %	0 %	50 %	28867449
4617	NC_004578	GCC	2	6	240693	240698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4618	NC_004578	TGT	2	6	240762	240767	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28867450
4619	NC_004578	GGC	2	6	240793	240798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28867450
4620	NC_004578	GACCGC	2	12	240850	240861	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	28867450
4621	NC_004578	CGG	2	6	240904	240909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28867450
4622	NC_004578	A	6	6	240922	240927	100 %	0 %	0 %	0 %	28867450
4623	NC_004578	TGA	2	6	240939	240944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28867450
4624	NC_004578	CGT	2	6	241036	241041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867450
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4626	NC_004578	CTG	2	6	241116	241121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867450
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4654	NC_004578	T	6	6	242139	242144	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4655	NC_004578	CGCAG	2	10	242188	242197	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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