MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pectobacterium atrosepticum SCRI1043 chromosome

Total Repeats: 102454

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004547	TTC	2	6	65	70	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	50118966
2	NC_004547	TCT	2	6	78	83	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	50118966
3	NC_004547	TGC	2	6	93	98	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50118966
4	NC_004547	TAG	2	6	149	154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50118966
5	NC_004547	GT	3	6	305	310	0 %	50 %	50 %	0 %	50118966
6	NC_004547	ACC	2	6	318	323	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	50118966
7	NC_004547	CTGG	2	8	519	526	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8	NC_004547	ATA	2	6	540	545	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_004547	A	6	6	556	561	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_004547	TCA	2	6	629	634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50118967
11	NC_004547	TTG	2	6	647	652	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	50118967
12	NC_004547	TCGA	2	8	674	681	25 %	25 %	25 %	25 %	50118967
13	NC_004547	TAA	2	6	696	701	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	50118967
14	NC_004547	GTG	2	6	719	724	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	50118967
15	NC_004547	TAG	2	6	725	730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50118967
16	NC_004547	CTT	2	6	741	746	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	50118967
17	NC_004547	ATG	2	6	800	805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50118967
18	NC_004547	AGC	2	6	813	818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50118967
19	NC_004547	ATG	2	6	869	874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50118967
20	NC_004547	T	6	6	888	893	0 %	100 %	0 %	0 %	50118967
21	NC_004547	GC	3	6	958	963	0 %	0 %	50 %	50 %	50118967
22	NC_004547	CCT	2	6	1033	1038	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_004547	AAT	2	6	1048	1053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_004547	ATT	2	6	1111	1116	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_004547	AAC	2	6	1146	1151	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_004547	TCTT	2	8	1227	1234	0 %	75 %	0 %	25 %	50118968
27	NC_004547	AGC	2	6	1249	1254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50118968
28	NC_004547	GATT	2	8	1261	1268	25 %	50 %	25 %	0 %	50118968
29	NC_004547	CA	3	6	1307	1312	50 %	0 %	0 %	50 %	50118968
30	NC_004547	GTG	2	6	1383	1388	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	50118968
31	NC_004547	CACT	2	8	1389	1396	25 %	25 %	0 %	50 %	50118968
32	NC_004547	GGA	2	6	1547	1552	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	50118968
33	NC_004547	GAGC	2	8	1734	1741	25 %	0 %	50 %	25 %	50118968
34	NC_004547	GATTGG	2	12	1772	1783	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	50118968
35	NC_004547	ATG	2	6	1831	1836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50118968
36	NC_004547	GAC	2	6	1841	1846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50118968
37	NC_004547	TCG	2	6	1885	1890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50118968
38	NC_004547	GCT	2	6	2021	2026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50118968
39	NC_004547	CTG	2	6	2088	2093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50118968
40	NC_004547	TAA	2	6	2169	2174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	50118968
41	NC_004547	TGC	2	6	2184	2189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50118969
42	NC_004547	GCG	2	6	2192	2197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50118969
43	NC_004547	ATG	2	6	2253	2258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50118969
44	NC_004547	GCT	2	6	2308	2313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50118969
45	NC_004547	CAC	2	6	2336	2341	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	50118969
46	NC_004547	CAC	2	6	2378	2383	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	50118969
47	NC_004547	GGCATC	2	12	2384	2395	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	50118969
48	NC_004547	CAA	2	6	2423	2428	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	50118969
49	NC_004547	GACA	2	8	2433	2440	50 %	0 %	25 %	25 %	50118969
50	NC_004547	CAC	2	6	2528	2533	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	50118969
51	NC_004547	ATG	2	6	2550	2555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50118969
52	NC_004547	CGG	2	6	2562	2567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50118969
53	NC_004547	AGCG	2	8	2573	2580	25 %	0 %	50 %	25 %	50118969
54	NC_004547	CAGA	2	8	2597	2604	50 %	0 %	25 %	25 %	50118969
55	NC_004547	TTG	2	6	2693	2698	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	50118969
56	NC_004547	CAG	2	6	2774	2779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50118969
57	NC_004547	CGA	2	6	2781	2786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50118969
58	NC_004547	TCG	2	6	2853	2858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50118969
59	NC_004547	CGC	2	6	2869	2874	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50118969
60	NC_004547	CTT	2	6	2923	2928	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	50118969
61	NC_004547	GCG	2	6	3066	3071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50118969
62	NC_004547	TGT	2	6	3150	3155	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	50118969
63	NC_004547	CAG	2	6	3164	3169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50118969
64	NC_004547	TCA	2	6	3187	3192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50118969
65	NC_004547	GCC	2	6	3232	3237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50118969
66	NC_004547	GAA	2	6	3244	3249	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50118969
67	NC_004547	TC	3	6	3290	3295	0 %	50 %	0 %	50 %	50118969
68	NC_004547	GTT	2	6	3344	3349	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	50118969
69	NC_004547	GCAG	2	8	3366	3373	25 %	0 %	50 %	25 %	50118969
70	NC_004547	TCGA	2	8	3396	3403	25 %	25 %	25 %	25 %	50118969
71	NC_004547	AGC	2	6	3418	3423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50118969
72	NC_004547	GTG	2	6	3456	3461	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	50118969
73	NC_004547	GCT	2	6	3469	3474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50118969
74	NC_004547	TTTC	2	8	3481	3488	0 %	75 %	0 %	25 %	50118969
75	NC_004547	AGA	2	6	3541	3546	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50118969
76	NC_004547	GCG	2	6	3556	3561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50118969
77	NC_004547	GAC	2	6	3575	3580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50118969
78	NC_004547	CAG	2	6	3590	3595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50118969
79	NC_004547	CAG	2	6	3614	3619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50118969
80	NC_004547	ATC	2	6	3642	3647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50118969
81	NC_004547	GGCT	2	8	3699	3706	0 %	25 %	50 %	25 %	50118970
82	NC_004547	AGCC	2	8	3715	3722	25 %	0 %	25 %	50 %	50118970
83	NC_004547	GCTG	2	8	3753	3760	0 %	25 %	50 %	25 %	50118970
84	NC_004547	AGAA	2	8	3853	3860	75 %	0 %	25 %	0 %	50118970
85	NC_004547	CCA	2	6	3909	3914	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	50118970
86	NC_004547	CAGC	2	8	3979	3986	25 %	0 %	25 %	50 %	50118970
87	NC_004547	TTC	2	6	3998	4003	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	50118970
88	NC_004547	GCA	2	6	4053	4058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50118970
89	NC_004547	GCG	2	6	4076	4081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50118970
90	NC_004547	TTG	2	6	4177	4182	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	50118970
91	NC_004547	CTG	2	6	4198	4203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50118970
92	NC_004547	CAG	2	6	4213	4218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50118970
93	NC_004547	T	6	6	4221	4226	0 %	100 %	0 %	0 %	50118970
94	NC_004547	CAG	2	6	4249	4254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50118970
95	NC_004547	AAT	2	6	4318	4323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	50118970
96	NC_004547	T	6	6	4387	4392	0 %	100 %	0 %	0 %	50118970
97	NC_004547	GCA	2	6	4446	4451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50118970
98	NC_004547	AGC	2	6	4583	4588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50118970
99	NC_004547	CAG	2	6	4702	4707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50118970
100	NC_004547	CGT	2	6	4748	4753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50118970
101	NC_004547	CAG	2	6	4768	4773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50118970
102	NC_004547	TCA	2	6	4932	4937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50118970
103	NC_004547	TGG	2	6	5008	5013	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	50118970
104	NC_004547	CAG	2	6	5017	5022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50118970
105	NC_004547	CAG	2	6	5050	5055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50118970
106	NC_004547	TAAT	2	8	5151	5158	50 %	50 %	0 %	0 %	50118970
107	NC_004547	ATG	2	6	5170	5175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_004547	TAA	3	9	5263	5271	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_004547	TTA	2	6	5290	5295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_004547	ATT	2	6	5310	5315	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_004547	GTAA	2	8	5329	5336	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_004547	GT	3	6	5395	5400	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_004547	TGT	2	6	5457	5462	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_004547	AACGTT	2	12	5467	5478	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_004547	ACA	2	6	5486	5491	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_004547	ATT	2	6	5495	5500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_004547	AGA	2	6	5509	5514	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_004547	TAA	2	6	5609	5614	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_004547	AGA	2	6	5616	5621	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_004547	GGC	2	6	5670	5675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50118971
121	NC_004547	GGT	2	6	5682	5687	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	50118971
122	NC_004547	CTTT	2	8	5781	5788	0 %	75 %	0 %	25 %	50118971
123	NC_004547	GTT	2	6	5815	5820	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	50118971
124	NC_004547	ACCTA	2	10	5831	5840	40 %	20 %	0 %	40 %	50118971
125	NC_004547	GCTG	2	8	5892	5899	0 %	25 %	50 %	25 %	50118971
126	NC_004547	CGG	2	6	5952	5957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50118971
127	NC_004547	CTT	2	6	5961	5966	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	50118971
128	NC_004547	TCA	2	6	5981	5986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50118971
129	NC_004547	CGC	2	6	6030	6035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50118971
130	NC_004547	CTT	2	6	6243	6248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	50118971
131	NC_004547	GTG	2	6	6289	6294	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	50118971
132	NC_004547	GGT	2	6	6375	6380	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	50118971
133	NC_004547	CTG	2	6	6421	6426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50118971
134	NC_004547	GAA	2	6	6429	6434	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50118971
135	NC_004547	TTC	2	6	6457	6462	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	50118971
136	NC_004547	CTG	2	6	6463	6468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50118971
137	NC_004547	GCAG	2	8	6531	6538	25 %	0 %	50 %	25 %	50118971
138	NC_004547	GCC	2	6	6591	6596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50118971
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143	NC_004547	CTG	2	6	6838	6843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50118971
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159	NC_004547	ATG	2	6	7405	7410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50118971
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163	NC_004547	AGC	2	6	7604	7609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
164	NC_004547	TGC	2	6	7614	7619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
165	NC_004547	ATA	2	6	7660	7665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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259	NC_004547	GGTG	2	8	12778	12785	0 %	25 %	75 %	0 %	50118977
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404	NC_004547	AAAG	2	8	19969	19976	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
405	NC_004547	GTT	2	6	20064	20069	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
406	NC_004547	G	6	6	20306	20311	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
407	NC_004547	TGA	2	6	20408	20413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
408	NC_004547	TGA	2	6	20427	20432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
409	NC_004547	GGT	2	6	20507	20512	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
410	NC_004547	GA	3	6	20537	20542	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
411	NC_004547	CGGA	2	8	20618	20625	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
412	NC_004547	GCTG	2	8	20649	20656	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
413	NC_004547	TAA	2	6	20665	20670	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
414	NC_004547	CGG	2	6	20790	20795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
415	NC_004547	ATG	2	6	20866	20871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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422	NC_004547	GGT	2	6	21284	21289	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
423	NC_004547	CGG	2	6	21371	21376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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428	NC_004547	ACG	2	6	21714	21719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
429	NC_004547	GT	3	6	21732	21737	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
430	NC_004547	ACA	2	6	21793	21798	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
431	NC_004547	GGC	2	6	21924	21929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
432	NC_004547	GGT	2	6	21938	21943	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
433	NC_004547	GCA	2	6	22148	22153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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452	NC_004547	AGA	2	6	23340	23345	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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490	NC_004547	GTG	2	6	25419	25424	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	50118985
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492	NC_004547	TAT	2	6	25609	25614	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
493	NC_004547	A	6	6	25638	25643	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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