MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pectobacterium atrosepticum SCRI1043 chromosome

Total Repeats: 102454

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_004547	AGG	2	6	77212	77217	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	50119023
1502	NC_004547	TGC	2	6	77266	77271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50119023
1503	NC_004547	CCG	2	6	77403	77408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50119023
1504	NC_004547	GGC	2	6	77417	77422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50119023
1505	NC_004547	TGG	2	6	77488	77493	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	50119023
1506	NC_004547	CGGT	2	8	77538	77545	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1507	NC_004547	TGA	2	6	77640	77645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50119024
1508	NC_004547	GGC	3	9	77672	77680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50119024
1509	NC_004547	GCG	2	6	77682	77687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50119024
1510	NC_004547	CG	3	6	77705	77710	0 %	0 %	50 %	50 %	50119024
1511	NC_004547	GGC	2	6	77756	77761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50119024
1512	NC_004547	TG	3	6	77780	77785	0 %	50 %	50 %	0 %	50119024
1513	NC_004547	GAA	2	6	77788	77793	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50119024
1514	NC_004547	ATCG	2	8	77915	77922	25 %	25 %	25 %	25 %	50119024
1515	NC_004547	CCA	2	6	77926	77931	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	50119024
1516	NC_004547	GTC	2	6	78063	78068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50119024
1517	NC_004547	CTT	2	6	78118	78123	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	50119024
1518	NC_004547	TCG	2	6	78156	78161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50119024
1519	NC_004547	GGCT	2	8	78163	78170	0 %	25 %	50 %	25 %	50119024
1520	NC_004547	GGGCT	2	10	78203	78212	0 %	20 %	60 %	20 %	50119024
1521	NC_004547	TGG	2	6	78282	78287	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	50119024
1522	NC_004547	TGA	2	6	78291	78296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50119024
1523	NC_004547	GAA	2	6	78346	78351	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50119024
1524	NC_004547	AACCTG	2	12	78446	78457	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	50119024
1525	NC_004547	ACC	2	6	78518	78523	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	50119024
1526	NC_004547	GCG	2	6	78587	78592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50119024
1527	NC_004547	CGT	2	6	78596	78601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50119024
1528	NC_004547	GTTT	2	8	78612	78619	0 %	75 %	25 %	0 %	50119024
1529	NC_004547	AAC	2	6	78620	78625	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	50119024
1530	NC_004547	CGT	2	6	78664	78669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50119024
1531	NC_004547	CCG	2	6	78680	78685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50119024
1532	NC_004547	CGA	2	6	78733	78738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50119024
1533	NC_004547	CCG	2	6	78780	78785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50119024
1534	NC_004547	GCA	2	6	78790	78795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50119024
1535	NC_004547	AGA	2	6	78835	78840	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50119024
1536	NC_004547	A	6	6	78840	78845	100 %	0 %	0 %	0 %	50119024
1537	NC_004547	TCG	2	6	78846	78851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50119024
1538	NC_004547	TGC	2	6	78885	78890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50119024
1539	NC_004547	A	6	6	78926	78931	100 %	0 %	0 %	0 %	50119024
1540	NC_004547	ACA	2	6	78939	78944	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	50119024
1541	NC_004547	T	7	7	79073	79079	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1542	NC_004547	GAT	2	6	79121	79126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50119025
1543	NC_004547	CGC	2	6	79130	79135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50119025
1544	NC_004547	CGT	2	6	79178	79183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50119025
1545	NC_004547	GCA	2	6	79284	79289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50119025
1546	NC_004547	T	7	7	79290	79296	0 %	100 %	0 %	0 %	50119025
1547	NC_004547	T	6	6	79422	79427	0 %	100 %	0 %	0 %	50119026
1548	NC_004547	GTC	2	6	79457	79462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50119026
1549	NC_004547	T	6	6	79477	79482	0 %	100 %	0 %	0 %	50119026
1550	NC_004547	AATAT	2	10	79617	79626	60 %	40 %	0 %	0 %	50119026
1551	NC_004547	T	6	6	79708	79713	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_004547	CTTC	2	8	79731	79738	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1553	NC_004547	TGA	2	6	79744	79749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_004547	GCT	2	6	79757	79762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1555	NC_004547	GTT	2	6	79927	79932	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	50119027
1556	NC_004547	AG	3	6	79945	79950	50 %	0 %	50 %	0 %	50119027
1557	NC_004547	GCT	2	6	79957	79962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50119027
1558	NC_004547	GC	3	6	79976	79981	0 %	0 %	50 %	50 %	50119027
1559	NC_004547	CTG	2	6	80045	80050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50119027
1560	NC_004547	GCG	2	6	80064	80069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50119027
1561	NC_004547	CAG	2	6	80183	80188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50119027
1562	NC_004547	CGAT	2	8	80193	80200	25 %	25 %	25 %	25 %	50119027
1563	NC_004547	TGC	2	6	80205	80210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50119027
1564	NC_004547	TCG	2	6	80274	80279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50119027
1565	NC_004547	ATG	2	6	80331	80336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50119027
1566	NC_004547	TGC	2	6	80349	80354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50119027
1567	NC_004547	CAG	2	6	80379	80384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50119027
1568	NC_004547	AAC	2	6	80400	80405	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	50119027
1569	NC_004547	CCG	2	6	80423	80428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50119027
1570	NC_004547	T	6	6	80441	80446	0 %	100 %	0 %	0 %	50119027
1571	NC_004547	GCG	2	6	80459	80464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50119027
1572	NC_004547	GCA	2	6	80529	80534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50119027
1573	NC_004547	CTG	2	6	80552	80557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50119027
1574	NC_004547	CAA	2	6	80567	80572	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	50119027
1575	NC_004547	TGA	2	6	80608	80613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50119027
1576	NC_004547	GC	3	6	80653	80658	0 %	0 %	50 %	50 %	50119027
1577	NC_004547	CCGT	2	8	80668	80675	0 %	25 %	25 %	50 %	50119027
1578	NC_004547	ATC	2	6	80698	80703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50119027
1579	NC_004547	CGC	2	6	80720	80725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50119027
1580	NC_004547	CGA	2	6	80734	80739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50119027
1581	NC_004547	AGG	2	6	80806	80811	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1582	NC_004547	CCT	2	6	80819	80824	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1583	NC_004547	CAT	2	6	80838	80843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50119028
1584	NC_004547	ACC	2	6	80875	80880	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	50119028
1585	NC_004547	TGGC	2	8	80915	80922	0 %	25 %	50 %	25 %	50119028
1586	NC_004547	CATC	2	8	80942	80949	25 %	25 %	0 %	50 %	50119028
1587	NC_004547	GGC	2	6	81066	81071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50119028
1588	NC_004547	CGC	2	6	81078	81083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50119028
1589	NC_004547	TGA	2	6	81107	81112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50119028
1590	NC_004547	CTG	2	6	81168	81173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50119028
1591	NC_004547	GAT	2	6	81216	81221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50119028
1592	NC_004547	CGG	2	6	81293	81298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50119028
1593	NC_004547	CTG	2	6	81312	81317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50119028
1594	NC_004547	GTT	2	6	81336	81341	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	50119028
1595	NC_004547	TCA	2	6	81349	81354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50119028
1596	NC_004547	AT	3	6	81358	81363	50 %	50 %	0 %	0 %	50119028
1597	NC_004547	CAGC	2	8	81429	81436	25 %	0 %	25 %	50 %	50119028
1598	NC_004547	TGCC	2	8	81612	81619	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1599	NC_004547	TAGCG	2	10	81623	81632	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1600	NC_004547	AG	3	6	81714	81719	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1601	NC_004547	ATG	2	6	81761	81766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1602	NC_004547	GCT	2	6	81849	81854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50119029
1603	NC_004547	TGG	2	6	81974	81979	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	50119029
1604	NC_004547	GTTTG	2	10	81981	81990	0 %	60 %	40 %	0 %	50119029
1605	NC_004547	GGTGC	2	10	82037	82046	0 %	20 %	60 %	20 %	50119029
1606	NC_004547	GCTG	2	8	82058	82065	0 %	25 %	50 %	25 %	50119029
1607	NC_004547	GGC	2	6	82107	82112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50119029
1608	NC_004547	ACCT	2	8	82249	82256	25 %	25 %	0 %	50 %	50119029
1609	NC_004547	GTC	2	6	82293	82298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50119029
1610	NC_004547	T	6	6	82332	82337	0 %	100 %	0 %	0 %	50119029
1611	NC_004547	GGT	2	6	82350	82355	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	50119029
1612	NC_004547	ATGG	2	8	82359	82366	25 %	25 %	50 %	0 %	50119029
1613	NC_004547	AAC	2	6	82371	82376	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	50119029
1614	NC_004547	CGC	2	6	82398	82403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50119029
1615	NC_004547	CGG	2	6	82420	82425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50119029
1616	NC_004547	CCCA	2	8	82467	82474	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
1617	NC_004547	GTG	2	6	82563	82568	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	50119030
1618	NC_004547	CAGC	2	8	82643	82650	25 %	0 %	25 %	50 %	50119030
1619	NC_004547	CGT	2	6	82694	82699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50119030
1620	NC_004547	GGC	2	6	82737	82742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50119030
1621	NC_004547	A	6	6	82810	82815	100 %	0 %	0 %	0 %	50119030
1622	NC_004547	TG	3	6	82828	82833	0 %	50 %	50 %	0 %	50119030
1623	NC_004547	TCA	2	6	82855	82860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50119030
1624	NC_004547	GCA	2	6	82951	82956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50119030
1625	NC_004547	TCAG	2	8	82959	82966	25 %	25 %	25 %	25 %	50119030
1626	NC_004547	ACC	2	6	83046	83051	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	50119030
1627	NC_004547	TGAG	2	8	83084	83091	25 %	25 %	50 %	0 %	50119030
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1629	NC_004547	CAG	2	6	83141	83146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50119030
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1631	NC_004547	GCA	2	6	83218	83223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50119030
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2000	NC_004547	ACCG	2	8	100456	100463	25 %	0 %	25 %	50 %	50119046

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