MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pyrobaculum aerophilum str. IM2 chromosome

Total Repeats: 46766

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003364	CTGCCT	2	12	48	59	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	18311644
2	NC_003364	GTT	2	6	181	186	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	18311644
3	NC_003364	T	7	7	185	191	0 %	100 %	0 %	0 %	18311644
4	NC_003364	GGA	2	6	206	211	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	18311644
5	NC_003364	CCG	2	6	268	273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	18311644
6	NC_003364	AAT	2	6	282	287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18311644
7	NC_003364	TC	3	6	301	306	0 %	50 %	0 %	50 %	18311644
8	NC_003364	GAG	2	6	310	315	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	18311644
9	NC_003364	CA	3	6	316	321	50 %	0 %	0 %	50 %	18311644
10	NC_003364	G	6	6	323	328	0 %	0 %	100 %	0 %	18311644
11	NC_003364	CTT	2	6	436	441	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18311644
12	NC_003364	GGT	2	6	510	515	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	18311644
13	NC_003364	GAG	2	6	547	552	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	18311644
14	NC_003364	G	6	6	583	588	0 %	0 %	100 %	0 %	18311644
15	NC_003364	A	6	6	821	826	100 %	0 %	0 %	0 %	18311644
16	NC_003364	GAG	2	6	907	912	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	18311644
17	NC_003364	GCC	2	6	964	969	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	18311645
18	NC_003364	CCA	2	6	983	988	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	18311645
19	NC_003364	CCT	2	6	989	994	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	18311645
20	NC_003364	TC	3	6	1000	1005	0 %	50 %	0 %	50 %	18311645
21	NC_003364	CCA	2	6	1094	1099	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	18311645
22	NC_003364	CGA	2	6	1121	1126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	18311645
23	NC_003364	GCC	2	6	1129	1134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	18311645
24	NC_003364	CT	3	6	1183	1188	0 %	50 %	0 %	50 %	18311645
25	NC_003364	GCC	2	6	1228	1233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	18311645
26	NC_003364	CGC	2	6	1251	1256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	18311645
27	NC_003364	GCC	2	6	1264	1269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	18311645
28	NC_003364	GCG	2	6	1303	1308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	18311645
29	NC_003364	T	6	6	1324	1329	0 %	100 %	0 %	0 %	18311645
30	NC_003364	CTC	2	6	1335	1340	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	18311645
31	NC_003364	GA	3	6	1414	1419	50 %	0 %	50 %	0 %	18311645
32	NC_003364	GCCAC	2	10	1512	1521	20 %	0 %	20 %	60 %	18311646
33	NC_003364	TCC	3	9	1532	1540	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	18311646
34	NC_003364	CT	3	6	1552	1557	0 %	50 %	0 %	50 %	18311646
35	NC_003364	CCG	2	6	1587	1592	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	18311646
36	NC_003364	AGTC	2	8	1629	1636	25 %	25 %	25 %	25 %	18311646
37	NC_003364	CGC	2	6	1678	1683	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	18311646
38	NC_003364	CGC	2	6	1752	1757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	18311646
39	NC_003364	AAC	2	6	1766	1771	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	18311646
40	NC_003364	CGT	3	9	1782	1790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	18311646
41	NC_003364	TGGGG	2	10	1800	1809	0 %	20 %	80 %	0 %	18311646
42	NC_003364	ACC	2	6	1841	1846	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	18311646
43	NC_003364	CCA	3	9	1905	1913	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	18311646
44	NC_003364	CCT	2	6	1929	1934	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	18311646
45	NC_003364	CTA	2	6	1935	1940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18311646
46	NC_003364	CTC	2	6	1942	1947	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	18311646
47	NC_003364	TC	3	6	1970	1975	0 %	50 %	0 %	50 %	18311646
48	NC_003364	CCCCT	2	10	2135	2144	0 %	20 %	0 %	80 %	18311646
49	NC_003364	GTA	2	6	2179	2184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18311646
50	NC_003364	CT	3	6	2209	2214	0 %	50 %	0 %	50 %	18311646
51	NC_003364	CCG	2	6	2256	2261	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	18311646
52	NC_003364	CGGCG	2	10	2280	2289	0 %	0 %	60 %	40 %	18311646
53	NC_003364	G	6	6	2339	2344	0 %	0 %	100 %	0 %	18311646
54	NC_003364	AAG	2	6	2349	2354	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18311646
55	NC_003364	TAG	2	6	2363	2368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18311646
56	NC_003364	TGG	2	6	2378	2383	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	18311646
57	NC_003364	CAA	2	6	2388	2393	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	18311646
58	NC_003364	CCCCA	2	10	2444	2453	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
59	NC_003364	CGT	2	6	2487	2492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_003364	TTA	2	6	2498	2503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_003364	TAA	2	6	2520	2525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_003364	AAAC	2	8	2535	2542	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_003364	T	6	6	2559	2564	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_003364	TA	3	6	2618	2623	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_003364	TCTT	2	8	2645	2652	0 %	75 %	0 %	25 %	18311647
66	NC_003364	A	6	6	2831	2836	100 %	0 %	0 %	0 %	18311647
67	NC_003364	AGA	2	6	2866	2871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18311647
68	NC_003364	CGT	2	6	2882	2887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	18311647
69	NC_003364	AGG	2	6	2901	2906	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	18311647
70	NC_003364	TAC	2	6	2933	2938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18311647
71	NC_003364	AT	3	6	2999	3004	50 %	50 %	0 %	0 %	18311647
72	NC_003364	CGG	2	6	3059	3064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	18311647
73	NC_003364	AAC	2	6	3066	3071	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	18311647
74	NC_003364	CTAC	2	8	3089	3096	25 %	25 %	0 %	50 %	18311647
75	NC_003364	AGA	2	6	3182	3187	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18311647
76	NC_003364	TAG	2	6	3229	3234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18311647
77	NC_003364	TCC	2	6	3241	3246	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	18311647
78	NC_003364	GGA	2	6	3269	3274	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	18311647
79	NC_003364	GA	3	6	3330	3335	50 %	0 %	50 %	0 %	18311647
80	NC_003364	A	6	6	3444	3449	100 %	0 %	0 %	0 %	18311647
81	NC_003364	TTG	2	6	3516	3521	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	18311647
82	NC_003364	GGC	2	6	3530	3535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	18311647
83	NC_003364	G	6	6	3538	3543	0 %	0 %	100 %	0 %	18311647
84	NC_003364	AAC	2	6	3557	3562	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	18311647
85	NC_003364	GA	3	6	3678	3683	50 %	0 %	50 %	0 %	18311647
86	NC_003364	AAG	2	6	3697	3702	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18311647
87	NC_003364	GAC	2	6	3711	3716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	18311647
88	NC_003364	GAT	2	6	3793	3798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18311647
89	NC_003364	TAGA	2	8	3848	3855	50 %	25 %	25 %	0 %	18311648
90	NC_003364	A	6	6	3870	3875	100 %	0 %	0 %	0 %	18311648
91	NC_003364	GCG	2	6	3908	3913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	18311648
92	NC_003364	ATT	2	6	3916	3921	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18311648
93	NC_003364	ATA	2	6	3994	3999	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18311648
94	NC_003364	GCG	3	9	4007	4015	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	18311648
95	NC_003364	GC	3	6	4039	4044	0 %	0 %	50 %	50 %	18311648
96	NC_003364	AGT	2	6	4072	4077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18311648
97	NC_003364	AAT	2	6	4078	4083	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18311648
98	NC_003364	TA	3	6	4084	4089	50 %	50 %	0 %	0 %	18311648
99	NC_003364	ATT	2	6	4112	4117	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18311648
100	NC_003364	TA	3	6	4127	4132	50 %	50 %	0 %	0 %	18311648
101	NC_003364	AAT	2	6	4153	4158	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_003364	GA	3	6	4169	4174	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_003364	CTT	2	6	4185	4190	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_003364	CGA	2	6	4221	4226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_003364	AGT	2	6	4232	4237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_003364	GGA	2	6	4240	4245	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_003364	CT	3	6	4326	4331	0 %	50 %	0 %	50 %	18311649
108	NC_003364	ATT	2	6	4341	4346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18311649
109	NC_003364	CCT	2	6	4366	4371	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	18311649
110	NC_003364	CAG	2	6	4372	4377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	18311649
111	NC_003364	TC	3	6	4425	4430	0 %	50 %	0 %	50 %	18311649
112	NC_003364	C	6	6	4540	4545	0 %	0 %	0 %	100 %	18311650
113	NC_003364	CCT	2	6	4665	4670	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	18311650
114	NC_003364	CAT	2	6	4674	4679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18311650
115	NC_003364	GAC	2	6	4690	4695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	18311650
116	NC_003364	CGT	2	6	4779	4784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	18311650
117	NC_003364	CA	3	6	4792	4797	50 %	0 %	0 %	50 %	18311650
118	NC_003364	CGC	2	6	4827	4832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	18311650
119	NC_003364	CTC	2	6	4879	4884	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	18311650
120	NC_003364	CTC	2	6	4892	4897	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	18311650
121	NC_003364	CTC	2	6	4914	4919	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	18311650
122	NC_003364	TA	3	6	5030	5035	50 %	50 %	0 %	0 %	18311650
123	NC_003364	TCCCC	2	10	5091	5100	0 %	20 %	0 %	80 %	18311650
124	NC_003364	GA	3	6	5104	5109	50 %	0 %	50 %	0 %	18311650
125	NC_003364	C	6	6	5360	5365	0 %	0 %	0 %	100 %	18311651
126	NC_003364	AT	3	6	5396	5401	50 %	50 %	0 %	0 %	18311651
127	NC_003364	GAG	2	6	5480	5485	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	18311651
128	NC_003364	AGGC	2	8	5569	5576	25 %	0 %	50 %	25 %	18311651
129	NC_003364	CAC	2	6	5593	5598	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_003364	TTA	2	6	5607	5612	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_003364	AAG	2	6	5686	5691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_003364	A	6	6	5708	5713	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_003364	TA	3	6	5716	5721	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_003364	ACA	2	6	5770	5775	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	18311652
135	NC_003364	TC	4	8	5795	5802	0 %	50 %	0 %	50 %	18311652
136	NC_003364	TA	3	6	5846	5851	50 %	50 %	0 %	0 %	18311652
137	NC_003364	TAT	2	6	5876	5881	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18311652
138	NC_003364	CTC	2	6	5892	5897	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	18311652
139	NC_003364	GC	3	6	5899	5904	0 %	0 %	50 %	50 %	18311652
140	NC_003364	CTC	2	6	5946	5951	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	18311652
141	NC_003364	GTT	2	6	6013	6018	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	18311652
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275	NC_003364	CTC	2	6	12412	12417	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	18311662
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277	NC_003364	ATTT	2	8	12469	12476	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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