MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas putida KT2440 chromosome

Total Repeats: 130078

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_002947	ACG	2	6	51042	51047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	26986790
1002	NC_002947	CTAC	2	8	51148	51155	25 %	25 %	0 %	50 %	26986790
1003	NC_002947	CGAG	2	8	51197	51204	25 %	0 %	50 %	25 %	26986790
1004	NC_002947	CAC	2	6	51225	51230	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	26986790
1005	NC_002947	CTG	2	6	51245	51250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	26986790
1006	NC_002947	CAG	2	6	51267	51272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	26986790
1007	NC_002947	GAGC	2	8	51356	51363	25 %	0 %	50 %	25 %	26986790
1008	NC_002947	GAC	2	6	51457	51462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	26986790
1009	NC_002947	CGA	2	6	51485	51490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	26986790
1010	NC_002947	TCAG	2	8	51505	51512	25 %	25 %	25 %	25 %	26986790
1011	NC_002947	GA	3	6	51516	51521	50 %	0 %	50 %	0 %	26986790
1012	NC_002947	GAC	2	6	51576	51581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	26986790
1013	NC_002947	GCG	2	6	51625	51630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	26986790
1014	NC_002947	C	6	6	51662	51667	0 %	0 %	0 %	100 %	26986790
1015	NC_002947	GA	4	8	51696	51703	50 %	0 %	50 %	0 %	26986790
1016	NC_002947	GTC	2	6	51706	51711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	26986790
1017	NC_002947	ACG	2	6	51723	51728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	26986790
1018	NC_002947	AACCC	2	10	52160	52169	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
1019	NC_002947	GAT	2	6	52175	52180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_002947	AATTGT	2	12	52247	52258	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_002947	CGCTA	2	10	52302	52311	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1022	NC_002947	GC	3	6	52313	52318	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1023	NC_002947	AAC	2	6	52330	52335	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1024	NC_002947	ATA	2	6	52359	52364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_002947	GGC	2	6	52420	52425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	26986791
1026	NC_002947	GCTAT	2	10	52446	52455	20 %	40 %	20 %	20 %	26986791
1027	NC_002947	GCA	2	6	52497	52502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	26986791
1028	NC_002947	ACA	2	6	52569	52574	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	26986791
1029	NC_002947	ATC	2	6	52622	52627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	26986791
1030	NC_002947	CGG	2	6	52726	52731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	26986791
1031	NC_002947	TGC	2	6	52749	52754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	26986791
1032	NC_002947	CGA	2	6	52780	52785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	26986791
1033	NC_002947	CGG	2	6	52798	52803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	26986791
1034	NC_002947	GTC	2	6	52868	52873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	26986791
1035	NC_002947	CTG	2	6	52892	52897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	26986791
1036	NC_002947	AG	3	6	52900	52905	50 %	0 %	50 %	0 %	26986791
1037	NC_002947	GTC	2	6	52962	52967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	26986791
1038	NC_002947	AGCC	2	8	52979	52986	25 %	0 %	25 %	50 %	26986791
1039	NC_002947	CGG	2	6	53026	53031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	26986791
1040	NC_002947	ACT	2	6	53070	53075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	26986791
1041	NC_002947	GCCA	2	8	53108	53115	25 %	0 %	25 %	50 %	26986791
1042	NC_002947	TAC	2	6	53138	53143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	26986791
1043	NC_002947	CGA	2	6	53173	53178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	26986791
1044	NC_002947	ACT	2	6	53202	53207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	26986791
1045	NC_002947	AAG	2	6	53228	53233	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	26986791
1046	NC_002947	ACA	3	9	53250	53258	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	26986791
1047	NC_002947	CAA	2	6	53320	53325	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	26986791
1048	NC_002947	CGA	3	9	53329	53337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	26986791
1049	NC_002947	TCG	2	6	53370	53375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	26986791
1050	NC_002947	TCCA	2	8	53381	53388	25 %	25 %	0 %	50 %	26986791
1051	NC_002947	TGC	2	6	53427	53432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	26986791
1052	NC_002947	CGA	2	6	53545	53550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	26986791
1053	NC_002947	ATC	2	6	53708	53713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	26986791
1054	NC_002947	T	8	8	53861	53868	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_002947	CGCAT	2	10	53899	53908	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1056	NC_002947	AGA	2	6	53996	54001	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_002947	CTG	2	6	54034	54039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1058	NC_002947	GA	3	6	54040	54045	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_002947	CAAACC	2	12	54060	54071	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1060	NC_002947	AAT	2	6	54171	54176	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_002947	GC	3	6	54181	54186	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1062	NC_002947	ATT	2	6	54334	54339	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	26986792
1063	NC_002947	AGC	2	6	54348	54353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	26986792
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1065	NC_002947	CGT	2	6	54425	54430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	26986792
1066	NC_002947	ATG	2	6	54452	54457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	26986792
1067	NC_002947	GCT	2	6	54547	54552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	26986792
1068	NC_002947	TGACC	2	10	54673	54682	20 %	20 %	20 %	40 %	26986792
1069	NC_002947	GTG	2	6	54728	54733	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	26986792
1070	NC_002947	ATT	2	6	54749	54754	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	26986792
1071	NC_002947	AGAT	2	8	54828	54835	50 %	25 %	25 %	0 %	26986792
1072	NC_002947	ATAC	2	8	54857	54864	50 %	25 %	0 %	25 %	26986792
1073	NC_002947	CT	3	6	54910	54915	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1074	NC_002947	CTCA	2	8	54991	54998	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1075	NC_002947	CAG	2	6	55040	55045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	26986793
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1081	NC_002947	CAG	2	6	55390	55395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1082	NC_002947	AGCG	2	8	55396	55403	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1083	NC_002947	CTG	2	6	55455	55460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1084	NC_002947	T	6	6	55485	55490	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_002947	GCA	2	6	55503	55508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1086	NC_002947	ATA	2	6	55613	55618	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_002947	GTACA	2	10	55625	55634	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1088	NC_002947	A	6	6	55658	55663	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_002947	CGA	2	6	55768	55773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1090	NC_002947	GAT	2	6	55843	55848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_002947	AAT	2	6	55855	55860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_002947	CAT	2	6	55912	55917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1093	NC_002947	TTC	2	6	55974	55979	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1094	NC_002947	TGT	2	6	56001	56006	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_002947	AG	3	6	56038	56043	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1097	NC_002947	CGC	2	6	56153	56158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1098	NC_002947	GGA	2	6	56171	56176	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	26986794
1099	NC_002947	GCT	2	6	56180	56185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	26986794
1100	NC_002947	AAAG	2	8	56263	56270	75 %	0 %	25 %	0 %	26986794
1101	NC_002947	TC	3	6	56297	56302	0 %	50 %	0 %	50 %	26986794
1102	NC_002947	CAG	2	6	56376	56381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	26986794
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1104	NC_002947	TGA	2	6	56724	56729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	26986794
1105	NC_002947	G	6	6	56906	56911	0 %	0 %	100 %	0 %	26986794
1106	NC_002947	TCTG	2	8	57124	57131	0 %	50 %	25 %	25 %	26986794
1107	NC_002947	CGG	2	6	57179	57184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	26986794
1108	NC_002947	CGT	3	9	57251	57259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	26986794
1109	NC_002947	GTG	2	6	57338	57343	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	26986794
1110	NC_002947	GAG	2	6	57358	57363	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	26986794
1111	NC_002947	ACG	2	6	57382	57387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	26986794
1112	NC_002947	GCA	2	6	57542	57547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	26986794
1113	NC_002947	TTTC	2	8	57549	57556	0 %	75 %	0 %	25 %	26986794
1114	NC_002947	GTC	2	6	57574	57579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	26986794
1115	NC_002947	CCG	2	6	57612	57617	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	26986794
1116	NC_002947	GAA	2	6	57645	57650	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_002947	CCA	2	6	57663	57668	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1118	NC_002947	TCC	2	6	57809	57814	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1119	NC_002947	CCA	2	6	57815	57820	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1120	NC_002947	T	6	6	57821	57826	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_002947	GAT	2	6	57841	57846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_002947	GGGA	2	8	57857	57864	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_002947	CTTCT	2	10	57877	57886	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
1124	NC_002947	GAT	2	6	57927	57932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_002947	CTC	2	6	57940	57945	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1126	NC_002947	TAGG	2	8	57969	57976	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_002947	CAG	2	6	58021	58026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1128	NC_002947	GGA	2	6	58042	58047	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_002947	ACC	2	6	58099	58104	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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