MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas putida KT2440 chromosome

Total Repeats: 130078

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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13002	NC_002947	ATA	2	6	623316	623321	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	26987274
13003	NC_002947	TGA	2	6	623327	623332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	26987274
13004	NC_002947	TGG	2	6	623506	623511	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	26987274
13005	NC_002947	ACA	2	6	623552	623557	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	26987274
13006	NC_002947	ATG	2	6	623640	623645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	26987274
13007	NC_002947	TCA	2	6	623688	623693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13008	NC_002947	TAA	2	6	623725	623730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13009	NC_002947	TAT	2	6	623778	623783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13010	NC_002947	A	7	7	623811	623817	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13011	NC_002947	CGA	2	6	623863	623868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13012	NC_002947	GAA	2	6	623869	623874	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13013	NC_002947	G	8	8	623916	623923	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
13014	NC_002947	TG	3	6	624048	624053	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13015	NC_002947	GCG	2	6	624145	624150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13016	NC_002947	GGGC	2	8	624161	624168	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
13017	NC_002947	A	6	6	624183	624188	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13018	NC_002947	GCT	2	6	624214	624219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	26987275
13019	NC_002947	AGC	2	6	624281	624286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	26987275
13020	NC_002947	GTT	2	6	624362	624367	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	26987275
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13022	NC_002947	ACC	2	6	624414	624419	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	26987275
13023	NC_002947	TGCT	2	8	624558	624565	0 %	50 %	25 %	25 %	26987275
13024	NC_002947	GTA	2	6	624599	624604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	26987275
13025	NC_002947	GGCG	2	8	624656	624663	0 %	0 %	75 %	25 %	26987275
13026	NC_002947	CA	3	6	624740	624745	50 %	0 %	0 %	50 %	26987275
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13029	NC_002947	CGCTG	2	10	624823	624832	0 %	20 %	40 %	40 %	26987275
13030	NC_002947	GGC	2	6	624833	624838	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	26987275
13031	NC_002947	GGC	2	6	624905	624910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	26987275
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13045	NC_002947	CACGC	2	10	625676	625685	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
13046	NC_002947	GC	3	6	625758	625763	0 %	0 %	50 %	50 %	26987277
13047	NC_002947	TGG	2	6	625795	625800	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	26987277
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13052	NC_002947	CTG	2	6	625959	625964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	26987277
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13056	NC_002947	CGC	2	6	626147	626152	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	26987277
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13058	NC_002947	GTC	2	6	626217	626222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	26987277
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13065	NC_002947	CAGC	2	8	626391	626398	25 %	0 %	25 %	50 %	26987277
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13092	NC_002947	GCGG	2	8	627394	627401	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
13093	NC_002947	CTTCG	2	10	627552	627561	0 %	40 %	20 %	40 %	26987279
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13241	NC_002947	GGA	2	6	633806	633811	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	26987284
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13340	NC_002947	CAG	2	6	638328	638333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	26987288
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13349	NC_002947	GGAA	2	8	638608	638615	50 %	0 %	50 %	0 %	26987288
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13354	NC_002947	AGTG	2	8	638816	638823	25 %	25 %	50 %	0 %	26987289
13355	NC_002947	TGCT	2	8	638839	638846	0 %	50 %	25 %	25 %	26987289
13356	NC_002947	TG	3	6	638857	638862	0 %	50 %	50 %	0 %	26987289
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13363	NC_002947	GAGCG	2	10	639150	639159	20 %	0 %	60 %	20 %	26987289
13364	NC_002947	GATGAC	2	12	639186	639197	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	26987289
13365	NC_002947	GCG	2	6	639215	639220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	26987289
13366	NC_002947	TGG	2	6	639289	639294	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	26987289
13367	NC_002947	GGC	2	6	639363	639368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	26987289
13368	NC_002947	GGT	2	6	639422	639427	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	26987289
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13370	NC_002947	CAG	2	6	639591	639596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	26987289
13371	NC_002947	GCA	2	6	639635	639640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	26987289
13372	NC_002947	CGCGCA	2	12	639656	639667	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	26987289
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13375	NC_002947	TGC	2	6	639764	639769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	26987289
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13378	NC_002947	CGT	2	6	640142	640147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	26987289
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13488	NC_002947	GCC	2	6	644715	644720	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	26987293
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13490	NC_002947	CAT	2	6	644763	644768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	26987293
13491	NC_002947	CGG	2	6	644861	644866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	26987293
13492	NC_002947	CTT	2	6	644873	644878	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	26987293
13493	NC_002947	TTC	2	6	644940	644945	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	26987293
13494	NC_002947	GCA	2	6	644981	644986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	26987293
13495	NC_002947	GTT	2	6	644987	644992	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	26987293
13496	NC_002947	TTG	2	6	645016	645021	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13497	NC_002947	CG	3	6	645069	645074	0 %	0 %	50 %	50 %	26987294
13498	NC_002947	CAG	2	6	645082	645087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	26987294
13499	NC_002947	GTG	2	6	645088	645093	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	26987294
13500	NC_002947	GCGG	2	8	645094	645101	0 %	0 %	75 %	25 %	26987294

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