MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas putida KT2440 chromosome

Total Repeats: 130078

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
130001	NC_002947	GAT	2	6	6177907	6177912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	26992090
130002	NC_002947	CAC	2	6	6177927	6177932	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	26992090
130003	NC_002947	GAAC	2	8	6178041	6178048	50 %	0 %	25 %	25 %	26992090
130004	NC_002947	GAT	2	6	6178075	6178080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	26992090
130005	NC_002947	CG	3	6	6178155	6178160	0 %	0 %	50 %	50 %	26992090
130006	NC_002947	CAG	2	6	6178171	6178176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	26992090
130007	NC_002947	TGG	2	6	6178222	6178227	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	26992090
130008	NC_002947	GCA	3	9	6178233	6178241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	26992090
130009	NC_002947	GAA	2	6	6178318	6178323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	26992090
130010	NC_002947	GCG	2	6	6178367	6178372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	26992090
130011	NC_002947	CAA	2	6	6178389	6178394	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	26992090
130012	NC_002947	TTC	2	6	6178423	6178428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	26992090
130013	NC_002947	TGA	2	6	6178512	6178517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	26992090
130014	NC_002947	ACG	2	6	6178742	6178747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	26992090
130015	NC_002947	CAG	2	6	6178753	6178758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	26992090
130016	NC_002947	ACG	2	6	6178970	6178975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	26992090
130017	NC_002947	TGA	2	6	6179028	6179033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	26992090
130018	NC_002947	TGC	2	6	6179060	6179065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	26992090
130019	NC_002947	CTG	2	6	6179072	6179077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130020	NC_002947	GAC	2	6	6179167	6179172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	26992091
130021	NC_002947	GCC	2	6	6179173	6179178	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	26992091
130022	NC_002947	TCC	2	6	6179192	6179197	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	26992091
130023	NC_002947	TCCACG	2	12	6179294	6179305	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	26992091
130024	NC_002947	ATGA	2	8	6179389	6179396	50 %	25 %	25 %	0 %	26992091
130025	NC_002947	CTGTGC	2	12	6179401	6179412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	26992091
130026	NC_002947	GGC	2	6	6179446	6179451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	26992091
130027	NC_002947	GTC	2	6	6179500	6179505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	26992091
130028	NC_002947	GCA	2	6	6179516	6179521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	26992091
130029	NC_002947	CAC	2	6	6179715	6179720	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	26992092
130030	NC_002947	TCG	2	6	6179843	6179848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	26992092
130031	NC_002947	AGC	2	6	6179857	6179862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	26992092
130032	NC_002947	TTGCT	2	10	6179870	6179879	0 %	60 %	20 %	20 %	26992092
130033	NC_002947	GAT	2	6	6179881	6179886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	26992092
130034	NC_002947	GCT	2	6	6179891	6179896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	26992092
130035	NC_002947	TCT	2	6	6179991	6179996	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	26992092
130036	NC_002947	TGA	2	6	6180018	6180023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	26992092
130037	NC_002947	CATA	2	8	6180032	6180039	50 %	25 %	0 %	25 %	26992092
130038	NC_002947	AGA	2	6	6180048	6180053	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	26992092
130039	NC_002947	CTCG	2	8	6180117	6180124	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
130040	NC_002947	GTG	2	6	6180151	6180156	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
130041	NC_002947	AACG	2	8	6180183	6180190	50 %	0 %	25 %	25 %	26992093
130042	NC_002947	GAA	2	6	6180204	6180209	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	26992093
130043	NC_002947	GCA	2	6	6180278	6180283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	26992093
130044	NC_002947	AGC	2	6	6180306	6180311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	26992093
130045	NC_002947	CAG	2	6	6180333	6180338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	26992093
130046	NC_002947	CAG	2	6	6180378	6180383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	26992093
130047	NC_002947	TCC	2	6	6180426	6180431	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
130048	NC_002947	CGT	2	6	6180441	6180446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130049	NC_002947	C	6	6	6180523	6180528	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
130050	NC_002947	CAGG	2	8	6180532	6180539	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
130051	NC_002947	CAT	2	6	6180612	6180617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	26992094
130052	NC_002947	TGA	2	6	6180638	6180643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	26992094
130053	NC_002947	GCA	2	6	6180674	6180679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	26992094
130054	NC_002947	CAG	2	6	6180702	6180707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	26992094
130055	NC_002947	CAG	2	6	6180819	6180824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	26992094
130056	NC_002947	CAG	2	6	6180840	6180845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	26992094
130057	NC_002947	TGC	2	6	6180866	6180871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	26992094
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130059	NC_002947	CCTTGA	2	12	6180914	6180925	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	26992094
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130061	NC_002947	GGT	2	6	6180987	6180992	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	26992094
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130065	NC_002947	CTT	2	6	6181230	6181235	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	26992094
130066	NC_002947	GCC	2	6	6181237	6181242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	26992094
130067	NC_002947	GTG	2	6	6181398	6181403	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	26992094
130068	NC_002947	CTG	2	6	6181427	6181432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	26992094
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130076	NC_002947	CAG	2	6	6181798	6181803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	26992095
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130078	NC_002947	GCGT	2	8	6181845	6181852	0 %	25 %	50 %	25 %	26992095

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.