MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas putida KT2440 chromosome

Total Repeats: 130078

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_002947	ACCGA	2	10	527481	527490	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
11002	NC_002947	AC	3	6	527694	527699	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11003	NC_002947	CGTC	2	8	527712	527719	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11004	NC_002947	AAC	2	6	527731	527736	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11005	NC_002947	AGG	2	6	527805	527810	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11006	NC_002947	AGC	2	6	527821	527826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11007	NC_002947	AAAG	2	8	527835	527842	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
11008	NC_002947	AGTCG	2	10	527857	527866	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
11009	NC_002947	ATC	2	6	527918	527923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11010	NC_002947	GAT	2	6	527928	527933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11011	NC_002947	GTTG	2	8	528202	528209	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11012	NC_002947	GGT	2	6	528221	528226	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11013	NC_002947	TGA	2	6	528270	528275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11014	NC_002947	CGA	2	6	528291	528296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11015	NC_002947	GGT	2	6	528371	528376	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11016	NC_002947	GA	3	6	528401	528406	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11017	NC_002947	TTA	2	6	528527	528532	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11018	NC_002947	CGG	2	6	528651	528656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11019	NC_002947	GGC	2	6	528732	528737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11020	NC_002947	TGAAAT	2	12	528760	528771	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11021	NC_002947	ACC	2	6	528922	528927	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11022	NC_002947	TGG	2	6	528982	528987	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11023	NC_002947	TCC	2	6	529008	529013	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11024	NC_002947	GGA	2	6	529025	529030	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11025	NC_002947	GC	3	6	529086	529091	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11026	NC_002947	GGT	2	6	529145	529150	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11027	NC_002947	CGG	2	6	529232	529237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11028	NC_002947	TCA	2	6	529260	529265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11029	NC_002947	CGT	2	6	529340	529345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11030	NC_002947	GCT	2	6	529394	529399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11031	NC_002947	ACG	2	6	529575	529580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11032	NC_002947	GT	3	6	529593	529598	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11033	NC_002947	TGG	2	6	529685	529690	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11034	NC_002947	GAC	2	6	529787	529792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11035	NC_002947	ACC	2	6	529807	529812	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11036	NC_002947	ATCCC	2	10	529815	529824	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
11037	NC_002947	AGT	2	6	529831	529836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11039	NC_002947	TGCC	2	8	530056	530063	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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11041	NC_002947	CGGT	2	8	530114	530121	0 %	25 %	50 %	25 %	26987178
11042	NC_002947	CGCAG	2	10	530163	530172	20 %	0 %	40 %	40 %	26987178
11043	NC_002947	GCA	2	6	530186	530191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	26987178
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11048	NC_002947	GAAC	2	8	530717	530724	50 %	0 %	25 %	25 %	26987178
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11052	NC_002947	CAG	2	6	530805	530810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	26987178
11053	NC_002947	CGC	2	6	530835	530840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	26987178
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11061	NC_002947	TCG	2	6	531119	531124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	26987179
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11066	NC_002947	GC	3	6	531540	531545	0 %	0 %	50 %	50 %	26987179
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11083	NC_002947	A	6	6	532318	532323	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11084	NC_002947	GGAC	2	8	532394	532401	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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11086	NC_002947	TGA	2	6	532516	532521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11109	NC_002947	GAC	2	6	533595	533600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	26987181
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11119	NC_002947	TCT	2	6	534080	534085	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11120	NC_002947	TCC	2	6	534093	534098	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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11126	NC_002947	ACC	2	6	534363	534368	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	26987182
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11128	NC_002947	TGT	2	6	534497	534502	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	26987183
11129	NC_002947	GCTG	2	8	534560	534567	0 %	25 %	50 %	25 %	26987183
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11131	NC_002947	GTC	2	6	534612	534617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	26987183
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11134	NC_002947	CTG	2	6	534754	534759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	26987183
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11138	NC_002947	GTC	2	6	535062	535067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11486	NC_002947	GGC	2	6	551642	551647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161378147
11487	NC_002947	CGG	2	6	551806	551811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	26987196
11488	NC_002947	AGC	2	6	551826	551831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	26987196
11489	NC_002947	AGA	2	6	551832	551837	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	26987196
11490	NC_002947	TGG	2	6	551854	551859	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	26987196
11491	NC_002947	CGTGCT	2	12	551894	551905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	26987196
11492	NC_002947	TGGCG	2	10	551927	551936	0 %	20 %	60 %	20 %	26987196
11493	NC_002947	GTG	2	6	551937	551942	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	26987196
11494	NC_002947	CAA	2	6	551983	551988	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	26987196
11495	NC_002947	CTG	2	6	552095	552100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	26987196
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11497	NC_002947	ACGT	2	8	552198	552205	25 %	25 %	25 %	25 %	26987196
11498	NC_002947	GAA	2	6	552274	552279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	26987196
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11500	NC_002947	CTG	2	6	552290	552295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	26987196

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