MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas putida KT2440 chromosome

Total Repeats: 130078

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5002	NC_002947	GAA	2	6	244576	244581	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	26986938
5003	NC_002947	TC	3	6	244591	244596	0 %	50 %	0 %	50 %	26986938
5004	NC_002947	GCT	2	6	244750	244755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	26986938
5005	NC_002947	GCC	2	6	244795	244800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	26986938
5006	NC_002947	GAC	2	6	244827	244832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	26986938
5007	NC_002947	GCC	2	6	244837	244842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	26986938
5008	NC_002947	GCC	2	6	244879	244884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	26986938
5009	NC_002947	GCC	2	6	244921	244926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	26986938
5010	NC_002947	GCC	2	6	244963	244968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	26986938
5011	NC_002947	GCC	2	6	245005	245010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	26986938
5012	NC_002947	GGC	2	6	245079	245084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	26986938
5013	NC_002947	CTG	2	6	245126	245131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	26986938
5014	NC_002947	GCCG	2	8	245136	245143	0 %	0 %	50 %	50 %	26986938
5015	NC_002947	CCA	2	6	245156	245161	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	26986938
5016	NC_002947	GCAC	2	8	245170	245177	25 %	0 %	25 %	50 %	26986938
5017	NC_002947	GCC	2	6	245179	245184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	26986938
5018	NC_002947	CGC	2	6	245190	245195	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	26986938
5019	NC_002947	CTG	2	6	245201	245206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	26986938
5020	NC_002947	GCC	2	6	245227	245232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	26986938
5021	NC_002947	CAAC	2	8	245234	245241	50 %	0 %	0 %	50 %	26986938
5022	NC_002947	GCT	2	6	245254	245259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	26986938
5023	NC_002947	GCA	2	6	245260	245265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	26986938
5024	NC_002947	ATG	2	6	245352	245357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	26986939
5025	NC_002947	GCCA	2	8	245383	245390	25 %	0 %	25 %	50 %	26986939
5026	NC_002947	GTC	2	6	245391	245396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	26986939
5027	NC_002947	CAC	2	6	245636	245641	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	26986939
5028	NC_002947	CAG	3	9	245664	245672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	26986939
5029	NC_002947	AGGC	2	8	245704	245711	25 %	0 %	50 %	25 %	26986939
5030	NC_002947	CAGGGC	2	12	245736	245747	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	26986939
5031	NC_002947	CAT	2	6	245818	245823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	26986940
5032	NC_002947	GGCC	2	8	245908	245915	0 %	0 %	50 %	50 %	26986940
5033	NC_002947	TGC	2	6	245958	245963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	26986940
5034	NC_002947	ACG	2	6	246135	246140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	26986940
5035	NC_002947	GC	3	6	246152	246157	0 %	0 %	50 %	50 %	26986940
5036	NC_002947	CCG	2	6	246192	246197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	26986940
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5038	NC_002947	GCTG	2	8	246217	246224	0 %	25 %	50 %	25 %	26986940
5039	NC_002947	CCG	2	6	246253	246258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	26986940
5040	NC_002947	TGG	2	6	246274	246279	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	26986940
5041	NC_002947	TGC	2	6	246333	246338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	26986940
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5044	NC_002947	CCTCGA	2	12	246358	246369	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	26986940
5045	NC_002947	GTT	2	6	246415	246420	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	26986940
5046	NC_002947	TGC	2	6	246468	246473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	26986940
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5049	NC_002947	GCA	4	12	246550	246561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	26986940
5050	NC_002947	AGC	2	6	246573	246578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	26986940
5051	NC_002947	GC	4	8	246586	246593	0 %	0 %	50 %	50 %	26986940
5052	NC_002947	CCA	2	6	246630	246635	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	26986940
5053	NC_002947	GCC	2	6	246921	246926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	26986940
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5055	NC_002947	CTG	2	6	247004	247009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	26986940
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5057	NC_002947	CGA	2	6	247093	247098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	26986940
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5059	NC_002947	CTG	3	9	247172	247180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	26986940
5060	NC_002947	CGA	2	6	247183	247188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	26986940
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5062	NC_002947	GTG	4	12	247259	247270	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	26986940
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5065	NC_002947	CTG	2	6	247313	247318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	26986940
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5068	NC_002947	CAG	2	6	247478	247483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	26986940
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5072	NC_002947	CTG	2	6	247619	247624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	26986940
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5077	NC_002947	CTGG	2	8	247779	247786	0 %	25 %	50 %	25 %	26986941
5078	NC_002947	GCG	2	6	247813	247818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	26986941
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5084	NC_002947	GC	3	6	247934	247939	0 %	0 %	50 %	50 %	26986941
5085	NC_002947	GTAGCG	2	12	248005	248016	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	26986941
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5090	NC_002947	CTG	2	6	248185	248190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	26986941
5091	NC_002947	GCGG	2	8	248203	248210	0 %	0 %	75 %	25 %	26986941
5092	NC_002947	TTC	2	6	248239	248244	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	26986941
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5095	NC_002947	T	6	6	248361	248366	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5096	NC_002947	CAA	2	6	248393	248398	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5097	NC_002947	CGAG	2	8	248404	248411	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5098	NC_002947	GT	3	6	248412	248417	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5099	NC_002947	T	6	6	248443	248448	0 %	100 %	0 %	0 %	26986942
5100	NC_002947	GCC	2	6	248449	248454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	26986942
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5102	NC_002947	CGC	2	6	248589	248594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	26986942
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5105	NC_002947	GCT	2	6	248850	248855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	26986942
5106	NC_002947	CTG	2	6	248899	248904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	26986942
5107	NC_002947	TGC	2	6	248948	248953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	26986942
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5109	NC_002947	GTT	2	6	248997	249002	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	26986942
5110	NC_002947	CG	3	6	249037	249042	0 %	0 %	50 %	50 %	26986942
5111	NC_002947	CCA	2	6	249114	249119	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	26986943
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5113	NC_002947	CTCGGC	2	12	249313	249324	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	26986943
5114	NC_002947	GGCG	2	8	249327	249334	0 %	0 %	75 %	25 %	26986943
5115	NC_002947	CAG	2	6	249463	249468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	26986943
5116	NC_002947	CGCA	2	8	249496	249503	25 %	0 %	25 %	50 %	26986943
5117	NC_002947	GTC	2	6	249506	249511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	26986943
5118	NC_002947	GCTG	2	8	249519	249526	0 %	25 %	50 %	25 %	26986943
5119	NC_002947	CCA	2	6	249531	249536	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	26986943
5120	NC_002947	ACA	2	6	249588	249593	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	26986943
5121	NC_002947	TTGACC	2	12	249599	249610	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	26986943
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5123	NC_002947	GCG	3	9	249877	249885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	26986944
5124	NC_002947	GC	3	6	249909	249914	0 %	0 %	50 %	50 %	26986944
5125	NC_002947	GCG	2	6	249944	249949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	26986944
5126	NC_002947	GGTGAC	2	12	250023	250034	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	26986944
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5130	NC_002947	CAG	3	9	250347	250355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	26986944
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5132	NC_002947	AAC	2	6	250408	250413	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	26986944
5133	NC_002947	GATCAG	2	12	250434	250445	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	26986944
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5139	NC_002947	GGC	2	6	250725	250730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	26986944
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5142	NC_002947	TCG	2	6	250765	250770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	26986944
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5153	NC_002947	GGCCG	2	10	251082	251091	0 %	0 %	60 %	40 %	26986944
5154	NC_002947	CGT	2	6	251096	251101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	26986944
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5250	NC_002947	GGC	2	6	256376	256381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	26986949
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5253	NC_002947	CAT	2	6	256490	256495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	26986949
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5280	NC_002947	GGC	2	6	257807	257812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	26986949
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5370	NC_002947	CG	3	6	261700	261705	0 %	0 %	50 %	50 %	26986954
5371	NC_002947	GAA	2	6	261722	261727	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	26986954
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5488	NC_002947	CCTGA	2	10	266449	266458	20 %	20 %	20 %	40 %	26986958
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5499	NC_002947	GCC	2	6	266887	266892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	26986958
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