MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas putida KT2440 chromosome

Total Repeats: 130078

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002947	CTC	2	6	6	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_002947	CAA	2	6	22	27	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_002947	GC	3	6	65	70	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_002947	ACA	2	6	132	137	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_002947	GAGC	2	8	158	165	25 %	0 %	50 %	25 %	26986746
6	NC_002947	TTG	2	6	220	225	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	26986746
7	NC_002947	ACA	2	6	385	390	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	26986746
8	NC_002947	CTC	2	6	402	407	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	26986746
9	NC_002947	TGA	2	6	500	505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	26986746
10	NC_002947	GCA	2	6	509	514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	26986746
11	NC_002947	CTG	3	9	558	566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	26986746
12	NC_002947	ATGGCG	2	12	658	669	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	26986746
13	NC_002947	TCG	2	6	673	678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	26986746
14	NC_002947	GGCC	2	8	713	720	0 %	0 %	50 %	50 %	26986746
15	NC_002947	GC	3	6	730	735	0 %	0 %	50 %	50 %	26986746
16	NC_002947	GAT	2	6	753	758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	26986746
17	NC_002947	TTCT	2	8	915	922	0 %	75 %	0 %	25 %	26986746
18	NC_002947	GC	3	6	950	955	0 %	0 %	50 %	50 %	26986746
19	NC_002947	GTT	2	6	1033	1038	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	26986747
20	NC_002947	GCCAGG	2	12	1084	1095	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	26986747
21	NC_002947	GC	3	6	1103	1108	0 %	0 %	50 %	50 %	26986747
22	NC_002947	GTT	2	6	1239	1244	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	26986747
23	NC_002947	GCA	2	6	1274	1279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	26986747
24	NC_002947	GCG	2	6	1312	1317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	26986747
25	NC_002947	GTA	2	6	1362	1367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	26986747
26	NC_002947	CGG	2	6	1437	1442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	26986747
27	NC_002947	CAG	2	6	1524	1529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	26986747
28	NC_002947	CAC	2	6	1530	1535	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	26986747
29	NC_002947	GCG	2	6	1540	1545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	26986747
30	NC_002947	GCA	2	6	1565	1570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	26986747
31	NC_002947	AGT	2	6	1592	1597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	26986747
32	NC_002947	TGG	2	6	1682	1687	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	26986747
33	NC_002947	CAG	2	6	1713	1718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	26986747
34	NC_002947	ACG	2	6	1722	1727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	26986747
35	NC_002947	CAGC	2	8	1736	1743	25 %	0 %	25 %	50 %	26986747
36	NC_002947	GGC	2	6	1746	1751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	26986747
37	NC_002947	GGT	2	6	1764	1769	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	26986747
38	NC_002947	CAC	2	6	1781	1786	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	26986747
39	NC_002947	TTG	2	6	1820	1825	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	26986747
40	NC_002947	GCG	2	6	1848	1853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	26986748
41	NC_002947	CAG	2	6	1860	1865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	26986748
42	NC_002947	TGC	2	6	2030	2035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	26986748
43	NC_002947	GAT	2	6	2049	2054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	26986748
44	NC_002947	TCT	2	6	2156	2161	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	26986748
45	NC_002947	TG	3	6	2192	2197	0 %	50 %	50 %	0 %	26986748
46	NC_002947	CCG	2	6	2233	2238	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	26986748
47	NC_002947	CCAG	2	8	2249	2256	25 %	0 %	25 %	50 %	26986748
48	NC_002947	CAG	2	6	2339	2344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	26986748
49	NC_002947	AGC	2	6	2392	2397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	26986748
50	NC_002947	TGC	2	6	2404	2409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	26986748
51	NC_002947	GC	3	6	2436	2441	0 %	0 %	50 %	50 %	26986748
52	NC_002947	T	6	6	2522	2527	0 %	100 %	0 %	0 %	26986749
53	NC_002947	CGC	2	6	2552	2557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	26986749
54	NC_002947	TCG	2	6	2650	2655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	26986749
55	NC_002947	CAGG	2	8	2671	2678	25 %	0 %	50 %	25 %	26986749
56	NC_002947	GT	3	6	2680	2685	0 %	50 %	50 %	0 %	26986749
57	NC_002947	GC	3	6	2694	2699	0 %	0 %	50 %	50 %	26986749
58	NC_002947	CTG	2	6	2717	2722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	26986749
59	NC_002947	GATC	2	8	2779	2786	25 %	25 %	25 %	25 %	26986749
60	NC_002947	GC	3	6	2834	2839	0 %	0 %	50 %	50 %	26986749
61	NC_002947	CAG	2	6	2840	2845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	26986749
62	NC_002947	TGGCC	2	10	2896	2905	0 %	20 %	40 %	40 %	26986749
63	NC_002947	GTC	2	6	3131	3136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	26986749
64	NC_002947	TCG	2	6	3159	3164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	26986749
65	NC_002947	GCG	2	6	3204	3209	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	26986749
66	NC_002947	CAG	2	6	3221	3226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	26986749
67	NC_002947	CTT	2	6	3241	3246	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	26986749
68	NC_002947	GGT	2	6	3254	3259	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	26986749
69	NC_002947	GAA	2	6	3278	3283	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	26986749
70	NC_002947	GCC	2	6	3287	3292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	26986749
71	NC_002947	AGT	2	6	3337	3342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	26986749
72	NC_002947	TGG	2	6	3498	3503	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	26986749
73	NC_002947	GC	3	6	3629	3634	0 %	0 %	50 %	50 %	26986749
74	NC_002947	CAG	2	6	3651	3656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	26986749
75	NC_002947	GGC	2	6	3790	3795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	26986749
76	NC_002947	ACC	2	6	3860	3865	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	26986749
77	NC_002947	GCC	2	6	3896	3901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	26986749
78	NC_002947	CAC	2	6	3923	3928	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	26986749
79	NC_002947	CAC	2	6	3962	3967	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	26986749
80	NC_002947	CGA	2	6	3988	3993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	26986749
81	NC_002947	GTC	2	6	3998	4003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	26986749
82	NC_002947	CTG	2	6	4010	4015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	26986749
83	NC_002947	GTT	2	6	4121	4126	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	26986749
84	NC_002947	GCC	2	6	4175	4180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	26986749
85	NC_002947	CCG	2	6	4221	4226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	26986749
86	NC_002947	CAG	3	9	4274	4282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	26986749
87	NC_002947	GCC	3	9	4334	4342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	26986749
88	NC_002947	GGGAA	2	10	4363	4372	40 %	0 %	60 %	0 %	26986749
89	NC_002947	CCA	2	6	4375	4380	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	26986749
90	NC_002947	C	7	7	4438	4444	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
91	NC_002947	ACA	2	6	4496	4501	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_002947	AG	3	6	4508	4513	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_002947	AAT	2	6	4588	4593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_002947	AG	3	6	4604	4609	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_002947	A	7	7	4709	4715	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_002947	GGC	2	6	4803	4808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_002947	TCA	2	6	4886	4891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_002947	TCT	2	6	4939	4944	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_002947	A	8	8	4961	4968	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_002947	GCG	2	6	4984	4989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_002947	CGCC	2	8	5134	5141	0 %	0 %	25 %	75 %	26986750
102	NC_002947	CTGGC	2	10	5178	5187	0 %	20 %	40 %	40 %	26986750
103	NC_002947	CGG	2	6	5208	5213	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	26986750
104	NC_002947	CT	3	6	5226	5231	0 %	50 %	0 %	50 %	26986750
105	NC_002947	GTC	2	6	5291	5296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	26986750
106	NC_002947	CAC	2	6	5359	5364	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	26986750
107	NC_002947	TTG	2	6	5376	5381	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	26986750
108	NC_002947	CAG	2	6	5480	5485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	26986750
109	NC_002947	CCAG	2	8	5670	5677	25 %	0 %	25 %	50 %	26986750
110	NC_002947	CGGC	3	12	5708	5719	0 %	0 %	50 %	50 %	26986750
111	NC_002947	GCA	2	6	5743	5748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	26986750
112	NC_002947	TCT	2	6	5844	5849	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	26986750
113	NC_002947	ATCG	2	8	5858	5865	25 %	25 %	25 %	25 %	26986750
114	NC_002947	AGCG	2	8	5940	5947	25 %	0 %	50 %	25 %	26986750
115	NC_002947	GC	3	6	5957	5962	0 %	0 %	50 %	50 %	26986750
116	NC_002947	CTGG	2	8	5966	5973	0 %	25 %	50 %	25 %	26986750
117	NC_002947	GC	3	6	6039	6044	0 %	0 %	50 %	50 %	26986750
118	NC_002947	CGGG	2	8	6059	6066	0 %	0 %	75 %	25 %	26986750
119	NC_002947	GAC	2	6	6070	6075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	26986750
120	NC_002947	GCA	3	9	6097	6105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	26986750
121	NC_002947	TCG	2	6	6219	6224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	26986750
122	NC_002947	GGCC	2	8	6280	6287	0 %	0 %	50 %	50 %	26986750
123	NC_002947	GGC	2	6	6353	6358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	26986750
124	NC_002947	T	6	6	6440	6445	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_002947	AGC	3	9	6474	6482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	26986751
126	NC_002947	T	6	6	6483	6488	0 %	100 %	0 %	0 %	26986751
127	NC_002947	GCT	2	6	6493	6498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	26986751
128	NC_002947	CTG	2	6	6522	6527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	26986751
129	NC_002947	GTT	2	6	6543	6548	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	26986751
130	NC_002947	GAA	3	9	6588	6596	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	26986751
131	NC_002947	GAT	2	6	6603	6608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	26986751
132	NC_002947	CAT	2	6	6612	6617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	26986751
133	NC_002947	TCA	2	6	6620	6625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	26986751
134	NC_002947	CGG	2	6	6645	6650	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	26986751
135	NC_002947	GCT	2	6	6665	6670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	26986751
136	NC_002947	TGG	2	6	6680	6685	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	26986751
137	NC_002947	ATG	2	6	6691	6696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	26986751
138	NC_002947	GAA	2	6	6708	6713	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	26986751
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400	NC_002947	ACA	2	6	18547	18552	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	26986759
401	NC_002947	TCA	2	6	18595	18600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	26986759
402	NC_002947	TTC	2	6	18813	18818	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	26986759
403	NC_002947	AGC	2	6	18907	18912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	26986759
404	NC_002947	CCG	2	6	18971	18976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	26986759
405	NC_002947	ACG	2	6	18995	19000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	26986759
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414	NC_002947	GCA	2	6	19463	19468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	26986760
415	NC_002947	AGT	2	6	19540	19545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	26986760
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428	NC_002947	GAC	2	6	20428	20433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	26986761
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431	NC_002947	ACG	2	6	20510	20515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	26986761
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433	NC_002947	GGC	2	6	20731	20736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	26986761
434	NC_002947	CGG	2	6	20865	20870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	26986761
435	NC_002947	CTG	2	6	20909	20914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	26986761
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441	NC_002947	GA	3	6	21113	21118	50 %	0 %	50 %	0 %	26986761
442	NC_002947	CTG	3	9	21141	21149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	26986761
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449	NC_002947	ATTG	2	8	21439	21446	25 %	50 %	25 %	0 %	26986761
450	NC_002947	ACT	2	6	21492	21497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	26986761
451	NC_002947	G	6	6	21520	21525	0 %	0 %	100 %	0 %	26986761
452	NC_002947	CAA	2	6	21647	21652	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	26986761
453	NC_002947	GCT	2	6	21704	21709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	26986761
454	NC_002947	CGTT	2	8	21744	21751	0 %	50 %	25 %	25 %	26986761
455	NC_002947	CTG	2	6	21774	21779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	26986761
456	NC_002947	CCAT	2	8	21941	21948	25 %	25 %	0 %	50 %	26986761
457	NC_002947	AAG	2	6	21982	21987	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	26986761
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461	NC_002947	ATC	2	6	22144	22149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
462	NC_002947	AAC	2	6	22202	22207	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	26986762
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467	NC_002947	ATTG	2	8	22526	22533	25 %	50 %	25 %	0 %	26986762
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469	NC_002947	GTG	2	6	22566	22571	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
470	NC_002947	GTG	3	9	22621	22629	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
471	NC_002947	AC	3	6	22630	22635	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
472	NC_002947	A	6	6	22667	22672	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
473	NC_002947	CCT	2	6	22730	22735	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
474	NC_002947	ACC	2	6	22875	22880	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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499	NC_002947	TGGC	2	8	24613	24620	0 %	25 %	50 %	25 %	26986764
500	NC_002947	GCA	2	6	24626	24631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	26986764

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