MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pasteurella multocida subsp. multocida str. Pm70 chromosome

Total Repeats: 46127

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
45001	NC_002663	TTG	2	6	2201974	2201979	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15603827
45002	NC_002663	T	6	6	2202028	2202033	0 %	100 %	0 %	0 %	15603827
45003	NC_002663	GCA	2	6	2202122	2202127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15603827
45004	NC_002663	CG	3	6	2202137	2202142	0 %	0 %	50 %	50 %	15603827
45005	NC_002663	T	6	6	2202160	2202165	0 %	100 %	0 %	0 %	15603827
45006	NC_002663	TACCA	2	10	2202214	2202223	40 %	20 %	0 %	40 %	15603827
45007	NC_002663	TGG	2	6	2202227	2202232	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15603827
45008	NC_002663	GAA	2	6	2202239	2202244	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15603827
45009	NC_002663	TG	3	6	2202338	2202343	0 %	50 %	50 %	0 %	15603827
45010	NC_002663	ACT	2	6	2202398	2202403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15603827
45011	NC_002663	TCT	2	6	2202404	2202409	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15603827
45012	NC_002663	AAT	2	6	2202535	2202540	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15603827
45013	NC_002663	TCA	2	6	2202567	2202572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15603827
45014	NC_002663	AAT	2	6	2202580	2202585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15603827
45015	NC_002663	CAT	2	6	2202726	2202731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15603827
45016	NC_002663	CG	3	6	2202745	2202750	0 %	0 %	50 %	50 %	15603827
45017	NC_002663	ACG	2	6	2202793	2202798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15603827
45018	NC_002663	CTG	2	6	2202876	2202881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15603827
45019	NC_002663	CAG	2	6	2202975	2202980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15603827
45020	NC_002663	AAT	2	6	2203111	2203116	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15603827
45021	NC_002663	TTG	2	6	2203145	2203150	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45022	NC_002663	GTC	2	6	2203184	2203189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45023	NC_002663	T	6	6	2203190	2203195	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45024	NC_002663	A	7	7	2203205	2203211	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45025	NC_002663	T	6	6	2203256	2203261	0 %	100 %	0 %	0 %	15603828
45026	NC_002663	TG	3	6	2203287	2203292	0 %	50 %	50 %	0 %	15603828
45027	NC_002663	GA	3	6	2203304	2203309	50 %	0 %	50 %	0 %	15603828
45028	NC_002663	A	7	7	2203335	2203341	100 %	0 %	0 %	0 %	15603828
45029	NC_002663	GGA	2	6	2203428	2203433	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15603828
45030	NC_002663	AGGTAT	2	12	2203443	2203454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15603828
45031	NC_002663	TTA	2	6	2203497	2203502	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15603828
45032	NC_002663	CA	3	6	2203609	2203614	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
45033	NC_002663	AGCTA	2	10	2203633	2203642	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
45034	NC_002663	ATC	2	6	2203708	2203713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15603829
45035	NC_002663	T	6	6	2203731	2203736	0 %	100 %	0 %	0 %	15603829
45036	NC_002663	T	7	7	2203800	2203806	0 %	100 %	0 %	0 %	15603829
45037	NC_002663	GGC	2	6	2203807	2203812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15603829
45038	NC_002663	CGT	2	6	2203852	2203857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15603829
45039	NC_002663	TCAAGA	2	12	2203868	2203879	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	15603829
45040	NC_002663	AATA	2	8	2203891	2203898	75 %	25 %	0 %	0 %	15603829
45041	NC_002663	ACG	2	6	2203950	2203955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15603829
45042	NC_002663	TAA	2	6	2203987	2203992	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15603829
45043	NC_002663	TAC	2	6	2204100	2204105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15603829
45044	NC_002663	ATA	2	6	2204117	2204122	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15603829
45045	NC_002663	TGA	2	6	2204136	2204141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15603829
45046	NC_002663	GGC	2	6	2204146	2204151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15603829
45047	NC_002663	T	7	7	2204152	2204158	0 %	100 %	0 %	0 %	15603829
45048	NC_002663	GTT	2	6	2204166	2204171	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15603829
45049	NC_002663	ACG	2	6	2204237	2204242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15603829
45050	NC_002663	TTG	2	6	2204304	2204309	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15603829
45051	NC_002663	AAT	2	6	2204370	2204375	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15603829
45052	NC_002663	TGC	2	6	2204384	2204389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15603829
45053	NC_002663	AGCA	2	8	2204428	2204435	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
45054	NC_002663	T	6	6	2204469	2204474	0 %	100 %	0 %	0 %	15603830
45055	NC_002663	TGC	2	6	2204565	2204570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15603830
45056	NC_002663	GCA	2	6	2204575	2204580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15603830
45057	NC_002663	ACA	2	6	2204590	2204595	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15603830
45058	NC_002663	TCA	2	6	2204686	2204691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15603830
45059	NC_002663	GTA	2	6	2204705	2204710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15603830
45060	NC_002663	TAATTT	2	12	2204724	2204735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15603830
45061	NC_002663	ATT	2	6	2204752	2204757	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15603830
45062	NC_002663	CTT	2	6	2204846	2204851	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45063	NC_002663	TG	3	6	2204899	2204904	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
45064	NC_002663	ATTT	2	8	2205100	2205107	25 %	75 %	0 %	0 %	15603831
45065	NC_002663	TAT	2	6	2205116	2205121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45066	NC_002663	GAAA	2	8	2205152	2205159	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
45067	NC_002663	A	6	6	2205157	2205162	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45068	NC_002663	TA	3	6	2205188	2205193	50 %	50 %	0 %	0 %	15603832
45069	NC_002663	T	6	6	2205228	2205233	0 %	100 %	0 %	0 %	15603832
45070	NC_002663	CG	3	6	2205453	2205458	0 %	0 %	50 %	50 %	15603832
45071	NC_002663	TTG	2	6	2205474	2205479	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15603832
45072	NC_002663	TTG	2	6	2205533	2205538	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15603832
45073	NC_002663	TCC	2	6	2205552	2205557	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
45074	NC_002663	AAG	2	6	2205605	2205610	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45075	NC_002663	CCA	2	6	2205675	2205680	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15603833
45076	NC_002663	TGAC	2	8	2205692	2205699	25 %	25 %	25 %	25 %	15603833
45077	NC_002663	CTT	2	6	2205715	2205720	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15603833
45078	NC_002663	CTT	3	9	2205808	2205816	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15603833
45079	NC_002663	TTC	2	6	2205831	2205836	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15603833
45080	NC_002663	AATG	2	8	2205894	2205901	50 %	25 %	25 %	0 %	15603833
45081	NC_002663	ACC	2	6	2205956	2205961	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15603833
45082	NC_002663	TAC	2	6	2205994	2205999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15603833
45083	NC_002663	AAT	2	6	2206028	2206033	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15603833
45084	NC_002663	TTG	2	6	2206289	2206294	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15603833
45085	NC_002663	ACA	2	6	2206350	2206355	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15603833
45086	NC_002663	AAG	2	6	2206386	2206391	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15603833
45087	NC_002663	TCC	2	6	2206406	2206411	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15603833
45088	NC_002663	T	6	6	2206441	2206446	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45089	NC_002663	CTT	2	6	2206448	2206453	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45090	NC_002663	ATT	2	6	2206468	2206473	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15603834
45091	NC_002663	TCA	2	6	2206476	2206481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15603834
45092	NC_002663	ATTG	2	8	2206502	2206509	25 %	50 %	25 %	0 %	15603834
45093	NC_002663	GGA	2	6	2206524	2206529	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15603834
45094	NC_002663	GTAAT	2	10	2206638	2206647	40 %	40 %	20 %	0 %	15603834
45095	NC_002663	TTC	2	6	2206652	2206657	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15603834
45096	NC_002663	TCC	2	6	2206737	2206742	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15603834
45097	NC_002663	CTG	2	6	2206789	2206794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15603834
45098	NC_002663	GATA	2	8	2206924	2206931	50 %	25 %	25 %	0 %	15603835
45099	NC_002663	CTTG	2	8	2207023	2207030	0 %	50 %	25 %	25 %	15603835
45100	NC_002663	AAT	2	6	2207091	2207096	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15603835
45101	NC_002663	GTG	2	6	2207113	2207118	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15603835
45102	NC_002663	GAG	2	6	2207201	2207206	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15603835
45103	NC_002663	TGA	2	6	2207233	2207238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15603835
45104	NC_002663	ATA	2	6	2207307	2207312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15603835
45105	NC_002663	A	7	7	2207391	2207397	100 %	0 %	0 %	0 %	15603835
45106	NC_002663	CAA	2	6	2207401	2207406	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15603835
45107	NC_002663	T	7	7	2207461	2207467	0 %	100 %	0 %	0 %	15603835
45108	NC_002663	CAT	2	6	2207473	2207478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15603835
45109	NC_002663	TTG	2	6	2207489	2207494	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15603835
45110	NC_002663	TGT	2	6	2207559	2207564	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15603835
45111	NC_002663	AT	3	6	2207598	2207603	50 %	50 %	0 %	0 %	15603835
45112	NC_002663	GCG	2	6	2207604	2207609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15603835
45113	NC_002663	TTG	2	6	2207644	2207649	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15603835
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45115	NC_002663	CAA	2	6	2207698	2207703	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15603835
45116	NC_002663	TCT	2	6	2207718	2207723	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15603835
45117	NC_002663	CAA	2	6	2207788	2207793	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15603835
45118	NC_002663	T	6	6	2207829	2207834	0 %	100 %	0 %	0 %	15603835
45119	NC_002663	ACC	2	6	2207870	2207875	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15603835
45120	NC_002663	TAAT	2	8	2207936	2207943	50 %	50 %	0 %	0 %	15603836
45121	NC_002663	TCTA	2	8	2207960	2207967	25 %	50 %	0 %	25 %	15603836
45122	NC_002663	T	6	6	2207983	2207988	0 %	100 %	0 %	0 %	15603836
45123	NC_002663	AGTT	2	8	2208031	2208038	25 %	50 %	25 %	0 %	15603836
45124	NC_002663	TG	3	6	2208145	2208150	0 %	50 %	50 %	0 %	15603836
45125	NC_002663	CATT	2	8	2208160	2208167	25 %	50 %	0 %	25 %	15603836
45126	NC_002663	AGC	3	9	2208185	2208193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15603836
45127	NC_002663	A	6	6	2208256	2208261	100 %	0 %	0 %	0 %	15603836
45128	NC_002663	GA	3	6	2208295	2208300	50 %	0 %	50 %	0 %	15603836
45129	NC_002663	ATTA	2	8	2208356	2208363	50 %	50 %	0 %	0 %	15603836
45130	NC_002663	AG	3	6	2208382	2208387	50 %	0 %	50 %	0 %	15603836
45131	NC_002663	TAA	2	6	2208392	2208397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15603836
45132	NC_002663	GTA	2	6	2208400	2208405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15603836
45133	NC_002663	TCA	2	6	2208412	2208417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15603836
45134	NC_002663	CCCT	2	8	2208434	2208441	0 %	25 %	0 %	75 %	15603836
45135	NC_002663	CCT	2	6	2208498	2208503	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
45136	NC_002663	A	6	6	2208572	2208577	100 %	0 %	0 %	0 %	15603837
45137	NC_002663	AAAT	2	8	2208599	2208606	75 %	25 %	0 %	0 %	15603837
45138	NC_002663	T	6	6	2208641	2208646	0 %	100 %	0 %	0 %	15603837
45139	NC_002663	AGAA	2	8	2208733	2208740	75 %	0 %	25 %	0 %	15603837
45140	NC_002663	AAGG	2	8	2208747	2208754	50 %	0 %	50 %	0 %	15603837
45141	NC_002663	A	6	6	2208765	2208770	100 %	0 %	0 %	0 %	15603837
45142	NC_002663	A	6	6	2208810	2208815	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45143	NC_002663	CGC	2	6	2208844	2208849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15603838
45144	NC_002663	ATC	2	6	2208947	2208952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15603838
45145	NC_002663	TTGT	2	8	2209099	2209106	0 %	75 %	25 %	0 %	15603838
45146	NC_002663	AAG	2	6	2209139	2209144	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15603838
45147	NC_002663	ATG	2	6	2209154	2209159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15603838
45148	NC_002663	TGC	2	6	2209190	2209195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15603838
45149	NC_002663	GTT	2	6	2209360	2209365	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15603838
45150	NC_002663	AAT	2	6	2209378	2209383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15603838
45151	NC_002663	ACT	2	6	2209413	2209418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15603838
45152	NC_002663	TTC	3	9	2209442	2209450	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15603838
45153	NC_002663	TTG	2	6	2209469	2209474	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15603838
45154	NC_002663	ATG	2	6	2209545	2209550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15603838
45155	NC_002663	ACC	2	6	2209583	2209588	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15603838
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45157	NC_002663	TCT	2	6	2209605	2209610	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15603838
45158	NC_002663	ATA	2	6	2209644	2209649	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15603838
45159	NC_002663	TTG	2	6	2209659	2209664	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45160	NC_002663	TCA	2	6	2209665	2209670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45161	NC_002663	T	6	6	2209792	2209797	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45162	NC_002663	TAT	2	6	2209813	2209818	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15603839
45163	NC_002663	T	6	6	2209857	2209862	0 %	100 %	0 %	0 %	15603839
45164	NC_002663	AAG	2	6	2209869	2209874	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15603839
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45169	NC_002663	ATTTT	2	10	2210270	2210279	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
45170	NC_002663	AGCT	2	8	2210296	2210303	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
45171	NC_002663	T	6	6	2210307	2210312	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45172	NC_002663	A	6	6	2210322	2210327	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45173	NC_002663	TCG	2	6	2210389	2210394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45174	NC_002663	GTGC	2	8	2210430	2210437	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
45175	NC_002663	AAC	2	6	2210490	2210495	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15603840
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45203	NC_002663	GAT	2	6	2211908	2211913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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45205	NC_002663	GTT	2	6	2211954	2211959	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15603841
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45229	NC_002663	CCA	2	6	2213187	2213192	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15603842
45230	NC_002663	CAA	2	6	2213214	2213219	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15603842
45231	NC_002663	TGG	2	6	2213261	2213266	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15603842
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45233	NC_002663	GAT	2	6	2213397	2213402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15603842
45234	NC_002663	CAC	2	6	2213455	2213460	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15603842
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45236	NC_002663	GTTA	2	8	2213483	2213490	25 %	50 %	25 %	0 %	15603842
45237	NC_002663	A	6	6	2213507	2213512	100 %	0 %	0 %	0 %	15603842
45238	NC_002663	TTTAG	2	10	2213541	2213550	20 %	60 %	20 %	0 %	15603842
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45240	NC_002663	TATG	2	8	2213669	2213676	25 %	50 %	25 %	0 %	15603842
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45299	NC_002663	TTATT	2	10	2216349	2216358	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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45352	NC_002663	GAGT	2	8	2218612	2218619	25 %	25 %	50 %	0 %	15603845
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45361	NC_002663	AG	3	6	2219124	2219129	50 %	0 %	50 %	0 %	15603845
45362	NC_002663	TAA	2	6	2219237	2219242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15603845
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45364	NC_002663	T	6	6	2219252	2219257	0 %	100 %	0 %	0 %	15603845
45365	NC_002663	TAA	2	6	2219277	2219282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15603845
45366	NC_002663	GCA	2	6	2219313	2219318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15603845
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45389	NC_002663	CTA	2	6	2220550	2220555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15603846
45390	NC_002663	GTT	2	6	2220571	2220576	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15603846
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45394	NC_002663	ATC	2	6	2220807	2220812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15603846
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45398	NC_002663	TAAA	2	8	2220957	2220964	75 %	25 %	0 %	0 %	15603847
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45443	NC_002663	CACGA	2	10	2223630	2223639	40 %	0 %	20 %	40 %	15603847
45444	NC_002663	CTCC	2	8	2223652	2223659	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
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45464	NC_002663	A	6	6	2224699	2224704	100 %	0 %	0 %	0 %	15603848
45465	NC_002663	CA	4	8	2224798	2224805	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
45466	NC_002663	ATT	2	6	2224883	2224888	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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45469	NC_002663	AAC	2	6	2225075	2225080	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161723302
45470	NC_002663	AGC	3	9	2225131	2225139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161723302
45471	NC_002663	CAA	2	6	2225150	2225155	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161723302
45472	NC_002663	TAT	2	6	2225156	2225161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161723302
45473	NC_002663	GGT	2	6	2225180	2225185	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161723302
45474	NC_002663	TCAA	2	8	2225212	2225219	50 %	25 %	0 %	25 %	161723302
45475	NC_002663	A	6	6	2225279	2225284	100 %	0 %	0 %	0 %	161723302
45476	NC_002663	TGG	2	6	2225332	2225337	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161723302
45477	NC_002663	AAG	2	6	2225409	2225414	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161723302
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45479	NC_002663	CAG	3	9	2225532	2225540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161723302
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45481	NC_002663	GTC	2	6	2225559	2225564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161723302
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