MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pasteurella multocida subsp. multocida str. Pm70 chromosome

Total Repeats: 46127

< Previous12...3031323334353637383940...9293Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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17002	NC_002663	TAC	2	6	837397	837402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15602579
17003	NC_002663	CACT	2	8	837415	837422	25 %	25 %	0 %	50 %	15602579
17004	NC_002663	AGA	2	6	837530	837535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15602579
17005	NC_002663	CTG	2	6	837622	837627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15602579
17006	NC_002663	TTA	2	6	837723	837728	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15602579
17007	NC_002663	GCA	3	9	837924	837932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15602579
17008	NC_002663	CAT	2	6	837970	837975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15602579
17009	NC_002663	AAT	2	6	838024	838029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15602579
17010	NC_002663	TGT	2	6	838154	838159	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15602579
17011	NC_002663	TGG	2	6	838166	838171	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15602579
17012	NC_002663	T	6	6	838262	838267	0 %	100 %	0 %	0 %	15602579
17013	NC_002663	TGC	2	6	838283	838288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15602579
17014	NC_002663	GAC	2	6	838324	838329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15602579
17015	NC_002663	CTG	2	6	838345	838350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15602579
17016	NC_002663	TGA	2	6	838359	838364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15602579
17017	NC_002663	AAC	2	6	838373	838378	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15602579
17018	NC_002663	CTT	2	6	838414	838419	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15602579
17019	NC_002663	GCT	2	6	838587	838592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15602579
17020	NC_002663	CAG	2	6	838627	838632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15602579
17021	NC_002663	ATTT	2	8	838645	838652	25 %	75 %	0 %	0 %	15602579
17022	NC_002663	TTC	2	6	838688	838693	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15602579
17023	NC_002663	T	6	6	838698	838703	0 %	100 %	0 %	0 %	15602579
17024	NC_002663	CAA	2	6	838747	838752	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15602579
17025	NC_002663	ACCAAT	2	12	838772	838783	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	15602579
17026	NC_002663	CTT	2	6	838861	838866	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15602579
17027	NC_002663	CAATCG	2	12	838930	838941	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	15602579
17028	NC_002663	TGC	2	6	839066	839071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15602579
17029	NC_002663	AGCG	2	8	839075	839082	25 %	0 %	50 %	25 %	15602579
17030	NC_002663	ATT	2	6	839243	839248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15602579
17031	NC_002663	AAG	2	6	839383	839388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15602579
17032	NC_002663	CAT	2	6	839395	839400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15602579
17033	NC_002663	T	6	6	839486	839491	0 %	100 %	0 %	0 %	15602579
17034	NC_002663	CAT	2	6	839611	839616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15602579
17035	NC_002663	GTT	2	6	839658	839663	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15602579
17036	NC_002663	T	6	6	839736	839741	0 %	100 %	0 %	0 %	15602579
17037	NC_002663	T	6	6	839814	839819	0 %	100 %	0 %	0 %	15602579
17038	NC_002663	CTGA	2	8	839833	839840	25 %	25 %	25 %	25 %	15602579
17039	NC_002663	GCT	2	6	839841	839846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15602579
17040	NC_002663	T	6	6	839853	839858	0 %	100 %	0 %	0 %	15602579
17041	NC_002663	T	6	6	839892	839897	0 %	100 %	0 %	0 %	15602579
17042	NC_002663	GCT	2	6	839919	839924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15602579
17043	NC_002663	GTT	2	6	839940	839945	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15602579
17044	NC_002663	TGT	2	6	839948	839953	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15602579
17045	NC_002663	CAT	2	6	839956	839961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15602579
17046	NC_002663	T	6	6	839976	839981	0 %	100 %	0 %	0 %	15602579
17047	NC_002663	CCA	2	6	839982	839987	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15602579
17048	NC_002663	CTG	2	6	840016	840021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15602579
17049	NC_002663	TTA	2	6	840030	840035	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15602579
17050	NC_002663	TAT	2	6	840046	840051	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15602579
17051	NC_002663	GAA	2	6	840222	840227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15602579
17052	NC_002663	ACTTT	2	10	840241	840250	20 %	60 %	0 %	20 %	15602579
17053	NC_002663	ATA	2	6	840347	840352	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17054	NC_002663	TAAA	2	8	840386	840393	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17055	NC_002663	AACG	2	8	840398	840405	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
17056	NC_002663	ATTA	2	8	840421	840428	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17057	NC_002663	AAG	2	6	840510	840515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17058	NC_002663	TAA	2	6	840523	840528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17059	NC_002663	A	6	6	840546	840551	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17060	NC_002663	CTT	2	6	840574	840579	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17061	NC_002663	A	6	6	840595	840600	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17062	NC_002663	T	6	6	840623	840628	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17063	NC_002663	ATATT	2	10	840629	840638	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
17064	NC_002663	CTTT	2	8	840651	840658	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
17065	NC_002663	A	6	6	840689	840694	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17066	NC_002663	CAA	2	6	840705	840710	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17067	NC_002663	T	6	6	840734	840739	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17068	NC_002663	TTAT	2	8	840742	840749	25 %	75 %	0 %	0 %	15602580
17069	NC_002663	GCC	2	6	840781	840786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15602580
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17072	NC_002663	CTT	3	9	840912	840920	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15602580
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17081	NC_002663	AAAAC	2	10	841245	841254	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
17082	NC_002663	A	7	7	841288	841294	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17083	NC_002663	TAT	2	6	841340	841345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17084	NC_002663	A	7	7	841357	841363	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17085	NC_002663	TCT	2	6	841397	841402	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15602581
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17087	NC_002663	ACGA	2	8	841435	841442	50 %	0 %	25 %	25 %	15602581
17088	NC_002663	GTCA	2	8	841463	841470	25 %	25 %	25 %	25 %	15602581
17089	NC_002663	A	6	6	841566	841571	100 %	0 %	0 %	0 %	15602581
17090	NC_002663	CAATTT	2	12	841661	841672	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	15602581
17091	NC_002663	A	6	6	841702	841707	100 %	0 %	0 %	0 %	15602581
17092	NC_002663	A	7	7	841795	841801	100 %	0 %	0 %	0 %	15602581
17093	NC_002663	A	6	6	841812	841817	100 %	0 %	0 %	0 %	15602581
17094	NC_002663	GTG	2	6	841821	841826	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15602581
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17096	NC_002663	CTG	2	6	841917	841922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15602581
17097	NC_002663	ATA	2	6	841935	841940	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15602581
17098	NC_002663	ATA	2	6	842094	842099	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15602581
17099	NC_002663	AAAC	2	8	842134	842141	75 %	0 %	0 %	25 %	15602581
17100	NC_002663	ATT	2	6	842192	842197	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15602581
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17104	NC_002663	A	7	7	842315	842321	100 %	0 %	0 %	0 %	15602581
17105	NC_002663	TGA	2	6	842322	842327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15602581
17106	NC_002663	A	6	6	842327	842332	100 %	0 %	0 %	0 %	15602581
17107	NC_002663	AGCCA	2	10	842414	842423	40 %	0 %	20 %	40 %	15602581
17108	NC_002663	ATT	2	6	842471	842476	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15602581
17109	NC_002663	CT	3	6	842510	842515	0 %	50 %	0 %	50 %	15602581
17110	NC_002663	TTA	2	6	842525	842530	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15602581
17111	NC_002663	TC	3	6	842627	842632	0 %	50 %	0 %	50 %	15602581
17112	NC_002663	GT	3	6	842685	842690	0 %	50 %	50 %	0 %	15602581
17113	NC_002663	A	6	6	842717	842722	100 %	0 %	0 %	0 %	15602581
17114	NC_002663	TTA	2	6	842748	842753	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15602581
17115	NC_002663	CAAAA	2	10	842782	842791	80 %	0 %	0 %	20 %	15602581
17116	NC_002663	TAC	2	6	842872	842877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17117	NC_002663	TG	4	8	842891	842898	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
17118	NC_002663	AG	3	6	842907	842912	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17119	NC_002663	TA	3	6	842945	842950	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17120	NC_002663	A	6	6	842986	842991	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17121	NC_002663	TAA	2	6	843064	843069	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17122	NC_002663	TTAT	2	8	843099	843106	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17123	NC_002663	CAA	2	6	843125	843130	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17124	NC_002663	A	6	6	843138	843143	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17125	NC_002663	TAC	2	6	843146	843151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17126	NC_002663	CTA	2	6	843163	843168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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17129	NC_002663	GGC	2	6	843327	843332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15602582
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17246	NC_002663	T	6	6	848870	848875	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17247	NC_002663	CTTCT	2	10	848943	848952	0 %	60 %	0 %	40 %	15602585
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17498	NC_002663	ATGCG	2	10	861438	861447	20 %	20 %	40 %	20 %	15602597
17499	NC_002663	TCTT	2	8	861476	861483	0 %	75 %	0 %	25 %	15602597
17500	NC_002663	GT	3	6	861552	861557	0 %	50 %	50 %	0 %	15602597

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