MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pasteurella multocida subsp. multocida str. Pm70 chromosome

Total Repeats: 46127

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_002663	TGC	2	6	639000	639005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15602420
13002	NC_002663	ATG	2	6	639018	639023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15602420
13003	NC_002663	GTAT	2	8	639099	639106	25 %	50 %	25 %	0 %	15602420
13004	NC_002663	GGT	2	6	639170	639175	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15602420
13005	NC_002663	ATT	2	6	639185	639190	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15602420
13006	NC_002663	GGT	2	6	639239	639244	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15602420
13007	NC_002663	CTGAGT	2	12	639330	639341	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	15602420
13008	NC_002663	AATC	2	8	639349	639356	50 %	25 %	0 %	25 %	15602420
13009	NC_002663	TTC	2	6	639385	639390	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15602420
13010	NC_002663	GGT	2	6	639398	639403	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15602420
13011	NC_002663	CGG	2	6	639426	639431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15602420
13012	NC_002663	GCA	2	6	639487	639492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15602420
13013	NC_002663	CGT	2	6	639581	639586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15602420
13014	NC_002663	TTAAC	2	10	639666	639675	40 %	40 %	0 %	20 %	15602420
13015	NC_002663	TGA	2	6	639696	639701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15602420
13016	NC_002663	TGA	2	6	639712	639717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15602420
13017	NC_002663	ATT	2	6	639731	639736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15602420
13018	NC_002663	GTAA	2	8	639805	639812	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13019	NC_002663	AAT	2	6	639839	639844	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15602421
13020	NC_002663	TGA	2	6	639883	639888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15602421
13021	NC_002663	T	6	6	639908	639913	0 %	100 %	0 %	0 %	15602421
13022	NC_002663	TTA	2	6	639939	639944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15602421
13023	NC_002663	CAG	2	6	640017	640022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15602421
13024	NC_002663	CGT	2	6	640041	640046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15602421
13025	NC_002663	GTCATT	2	12	640094	640105	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	15602421
13026	NC_002663	AC	3	6	640118	640123	50 %	0 %	0 %	50 %	15602421
13027	NC_002663	AAC	2	6	640180	640185	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15602421
13028	NC_002663	GT	3	6	640402	640407	0 %	50 %	50 %	0 %	15602421
13029	NC_002663	TTTGA	2	10	640437	640446	20 %	60 %	20 %	0 %	15602421
13030	NC_002663	C	6	6	640457	640462	0 %	0 %	0 %	100 %	15602421
13031	NC_002663	ATT	2	6	640566	640571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15602421
13032	NC_002663	TTA	2	6	640608	640613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15602421
13033	NC_002663	TGGC	2	8	640622	640629	0 %	25 %	50 %	25 %	15602421
13034	NC_002663	A	7	7	640660	640666	100 %	0 %	0 %	0 %	15602421
13035	NC_002663	GTT	2	6	640726	640731	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15602421
13036	NC_002663	A	6	6	640757	640762	100 %	0 %	0 %	0 %	15602422
13037	NC_002663	ATG	2	6	640770	640775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15602422
13038	NC_002663	ACA	2	6	640796	640801	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15602422
13039	NC_002663	AAGAA	2	10	640867	640876	80 %	0 %	20 %	0 %	15602422
13040	NC_002663	TCT	2	6	640912	640917	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15602422
13041	NC_002663	T	6	6	640969	640974	0 %	100 %	0 %	0 %	15602422
13042	NC_002663	ATG	2	6	640995	641000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15602422
13043	NC_002663	TA	3	6	641049	641054	50 %	50 %	0 %	0 %	15602422
13044	NC_002663	CCCAA	2	10	641095	641104	40 %	0 %	0 %	60 %	15602422
13045	NC_002663	TTA	2	6	641142	641147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15602422
13046	NC_002663	ATGGG	2	10	641152	641161	20 %	20 %	60 %	0 %	15602422
13047	NC_002663	AT	3	6	641164	641169	50 %	50 %	0 %	0 %	15602422
13048	NC_002663	TTA	2	6	641180	641185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15602422
13049	NC_002663	GAA	2	6	641309	641314	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15602422
13050	NC_002663	A	7	7	641313	641319	100 %	0 %	0 %	0 %	15602422
13051	NC_002663	TGA	2	6	641320	641325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15602422
13052	NC_002663	GCT	2	6	641415	641420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15602422
13053	NC_002663	AGA	2	6	641503	641508	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15602422
13054	NC_002663	AAG	2	6	641538	641543	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15602422
13055	NC_002663	ATG	2	6	641550	641555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15602423
13056	NC_002663	TTTGT	2	10	641607	641616	0 %	80 %	20 %	0 %	15602423
13057	NC_002663	CTT	2	6	641719	641724	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15602423
13058	NC_002663	GTT	2	6	641874	641879	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15602423
13059	NC_002663	T	6	6	641900	641905	0 %	100 %	0 %	0 %	15602423
13060	NC_002663	ATT	2	6	641952	641957	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15602423
13061	NC_002663	A	6	6	641964	641969	100 %	0 %	0 %	0 %	15602423
13062	NC_002663	GAA	2	6	642018	642023	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15602423
13063	NC_002663	A	6	6	642114	642119	100 %	0 %	0 %	0 %	15602423
13064	NC_002663	CGT	2	6	642201	642206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15602423
13065	NC_002663	GC	4	8	642225	642232	0 %	0 %	50 %	50 %	15602423
13066	NC_002663	ATCCGA	2	12	642274	642285	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	15602423
13067	NC_002663	TGA	2	6	642362	642367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15602423
13068	NC_002663	AATT	2	8	642402	642409	50 %	50 %	0 %	0 %	15602423
13069	NC_002663	TG	3	6	642410	642415	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13070	NC_002663	T	6	6	642450	642455	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13071	NC_002663	TAT	2	6	642465	642470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13072	NC_002663	TAT	2	6	642510	642515	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13073	NC_002663	AAATT	2	10	642541	642550	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
13074	NC_002663	AAT	2	6	642586	642591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15602424
13075	NC_002663	CAA	2	6	642770	642775	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15602424
13076	NC_002663	AAATTA	2	12	642782	642793	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15602424
13077	NC_002663	AAT	2	6	642818	642823	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15602424
13078	NC_002663	TGG	2	6	642831	642836	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15602424
13079	NC_002663	AT	3	6	642917	642922	50 %	50 %	0 %	0 %	15602424
13080	NC_002663	TAT	2	6	642937	642942	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15602424
13081	NC_002663	ACATT	2	10	643193	643202	40 %	40 %	0 %	20 %	15602424
13082	NC_002663	CA	3	6	643219	643224	50 %	0 %	0 %	50 %	15602424
13083	NC_002663	ATCA	2	8	643232	643239	50 %	25 %	0 %	25 %	15602424
13084	NC_002663	TGA	2	6	643254	643259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15602424
13085	NC_002663	A	6	6	643259	643264	100 %	0 %	0 %	0 %	15602424
13086	NC_002663	TAAT	2	8	643275	643282	50 %	50 %	0 %	0 %	15602424
13087	NC_002663	TGG	2	6	643345	643350	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15602424
13088	NC_002663	A	7	7	643386	643392	100 %	0 %	0 %	0 %	15602424
13089	NC_002663	TAATT	2	10	643426	643435	40 %	60 %	0 %	0 %	15602424
13090	NC_002663	ACC	2	6	643475	643480	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15602424
13091	NC_002663	AAACA	2	10	643496	643505	80 %	0 %	0 %	20 %	15602424
13092	NC_002663	A	6	6	643519	643524	100 %	0 %	0 %	0 %	15602424
13093	NC_002663	TAAAT	2	10	643542	643551	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
13094	NC_002663	TGT	3	9	643559	643567	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13095	NC_002663	TGT	2	6	643569	643574	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13096	NC_002663	AAT	2	6	643581	643586	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13097	NC_002663	T	6	6	643596	643601	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13098	NC_002663	CATTG	2	10	643645	643654	20 %	40 %	20 %	20 %	15602425
13099	NC_002663	GTATTG	2	12	643713	643724	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	15602425
13100	NC_002663	TGT	2	6	643752	643757	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15602425
13101	NC_002663	TGA	2	6	643761	643766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15602425
13102	NC_002663	AAC	2	6	643776	643781	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15602425
13103	NC_002663	AAG	2	6	643787	643792	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15602425
13104	NC_002663	CATTA	2	10	643843	643852	40 %	40 %	0 %	20 %	15602425
13105	NC_002663	ATCA	2	8	643901	643908	50 %	25 %	0 %	25 %	15602425
13106	NC_002663	ACA	2	6	643966	643971	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15602425
13107	NC_002663	TGA	2	6	643978	643983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15602425
13108	NC_002663	TTA	2	6	643988	643993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15602425
13109	NC_002663	ACC	2	6	644029	644034	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15602425
13110	NC_002663	TGA	3	9	644109	644117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15602425
13111	NC_002663	TAT	2	6	644186	644191	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15602425
13112	NC_002663	CAA	2	6	644369	644374	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15602425
13113	NC_002663	A	7	7	644406	644412	100 %	0 %	0 %	0 %	15602425
13114	NC_002663	ATG	2	6	644414	644419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15602425
13115	NC_002663	ATT	2	6	644438	644443	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15602425
13116	NC_002663	TAA	2	6	644533	644538	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15602425
13117	NC_002663	TTTA	2	8	644558	644565	25 %	75 %	0 %	0 %	15602425
13118	NC_002663	GTT	2	6	644571	644576	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15602425
13119	NC_002663	TTG	2	6	644586	644591	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15602425
13120	NC_002663	GGTT	2	8	644651	644658	0 %	50 %	50 %	0 %	15602425
13121	NC_002663	ATTT	2	8	644672	644679	25 %	75 %	0 %	0 %	15602425
13122	NC_002663	ATT	2	6	644711	644716	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15602425
13123	NC_002663	T	7	7	644720	644726	0 %	100 %	0 %	0 %	15602425
13124	NC_002663	TTA	3	9	644729	644737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15602425
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13234	NC_002663	TG	3	6	650360	650365	0 %	50 %	50 %	0 %	15602430
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13238	NC_002663	TATTC	2	10	650625	650634	20 %	60 %	0 %	20 %	15602430
13239	NC_002663	ATT	2	6	650646	650651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15602430
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13243	NC_002663	TGG	2	6	650889	650894	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15602431
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13245	NC_002663	TGA	2	6	650967	650972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15602431
13246	NC_002663	GCA	2	6	650975	650980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15602431
13247	NC_002663	CTT	2	6	650997	651002	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15602431
13248	NC_002663	CTT	2	6	651036	651041	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15602431
13249	NC_002663	CTAACC	2	12	651048	651059	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	15602431
13250	NC_002663	TAA	2	6	651126	651131	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15602431
13251	NC_002663	GAA	2	6	651154	651159	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15602431
13252	NC_002663	CTT	2	6	651174	651179	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15602431
13253	NC_002663	GT	4	8	651188	651195	0 %	50 %	50 %	0 %	15602431
13254	NC_002663	TAAA	2	8	651205	651212	75 %	25 %	0 %	0 %	15602431
13255	NC_002663	CTT	2	6	651240	651245	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15602431
13256	NC_002663	TGC	2	6	651262	651267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15602431
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13258	NC_002663	TGC	2	6	651286	651291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15602431
13259	NC_002663	TGCGG	2	10	651302	651311	0 %	20 %	60 %	20 %	15602431
13260	NC_002663	GCA	2	6	651379	651384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15602431
13261	NC_002663	AT	3	6	651398	651403	50 %	50 %	0 %	0 %	15602431
13262	NC_002663	TTG	2	6	651667	651672	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15602431
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13264	NC_002663	TTC	2	6	651878	651883	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13265	NC_002663	A	7	7	651906	651912	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13266	NC_002663	GATTAA	2	12	651913	651924	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13267	NC_002663	A	6	6	651927	651932	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13268	NC_002663	A	7	7	651999	652005	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13269	NC_002663	AAAT	2	8	652044	652051	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13270	NC_002663	ACA	2	6	652120	652125	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13271	NC_002663	GC	3	6	652180	652185	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13272	NC_002663	AG	3	6	652202	652207	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13273	NC_002663	T	7	7	652221	652227	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13274	NC_002663	GAA	2	6	652254	652259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13275	NC_002663	TAT	2	6	652268	652273	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13276	NC_002663	GAA	2	6	652295	652300	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13277	NC_002663	GCT	2	6	652351	652356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15602432
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13284	NC_002663	ATCG	2	8	652472	652479	25 %	25 %	25 %	25 %	15602432
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13289	NC_002663	GAA	2	6	652786	652791	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15602432
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13305	NC_002663	CAT	2	6	653622	653627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15602433
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13320	NC_002663	GATG	2	8	654284	654291	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
13321	NC_002663	AAC	2	6	654292	654297	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13322	NC_002663	AC	3	6	654296	654301	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13323	NC_002663	T	7	7	654322	654328	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13324	NC_002663	T	6	6	654331	654336	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13325	NC_002663	TATT	2	8	654362	654369	25 %	75 %	0 %	0 %	15602434
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13330	NC_002663	ATGCC	2	10	654876	654885	20 %	20 %	20 %	40 %	15602434
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13333	NC_002663	TG	3	6	655076	655081	0 %	50 %	50 %	0 %	15602434
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13351	NC_002663	CGG	2	6	655941	655946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15602435
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13354	NC_002663	ATC	2	6	656043	656048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15602435
13355	NC_002663	TAA	2	6	656064	656069	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15602435
13356	NC_002663	AATTA	2	10	656073	656082	60 %	40 %	0 %	0 %	15602435
13357	NC_002663	TTG	2	6	656227	656232	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13358	NC_002663	ATA	2	6	656234	656239	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13359	NC_002663	GAA	2	6	656333	656338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13360	NC_002663	AGC	2	6	656339	656344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13361	NC_002663	TG	3	6	656360	656365	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13362	NC_002663	TCAA	2	8	656424	656431	50 %	25 %	0 %	25 %	15602436
13363	NC_002663	TCA	2	6	656499	656504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15602436
13364	NC_002663	CAAAT	2	10	656516	656525	60 %	20 %	0 %	20 %	15602436
13365	NC_002663	TAA	2	6	656645	656650	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15602436
13366	NC_002663	TAA	2	6	656669	656674	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15602436
13367	NC_002663	ACG	2	6	656693	656698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15602436
13368	NC_002663	CCA	2	6	656706	656711	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15602436
13369	NC_002663	GAC	2	6	656719	656724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15602436
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13371	NC_002663	TCG	2	6	656814	656819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15602436
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