MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas aeruginosa PAO1 chromosome

Total Repeats: 161212

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_002516	CGA	2	6	40828	40833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1002	NC_002516	CTTT	2	8	40871	40878	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1003	NC_002516	TTG	2	6	40912	40917	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_002516	TCG	2	6	40922	40927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1005	NC_002516	TGCC	2	8	41146	41153	0 %	25 %	25 %	50 %	15595238
1006	NC_002516	GCC	2	6	41167	41172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15595238
1007	NC_002516	GCGACC	2	12	41189	41200	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	15595238
1008	NC_002516	CAG	2	6	41215	41220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15595238
1009	NC_002516	CTG	2	6	41224	41229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15595238
1010	NC_002516	GGA	2	6	41250	41255	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15595238
1011	NC_002516	CGC	2	6	41286	41291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15595238
1012	NC_002516	CGG	2	6	41304	41309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15595238
1013	NC_002516	CGA	2	6	41310	41315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15595238
1014	NC_002516	GCT	2	6	41318	41323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15595238
1015	NC_002516	CCG	2	6	41331	41336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15595238
1016	NC_002516	GC	3	6	41372	41377	0 %	0 %	50 %	50 %	15595238
1017	NC_002516	GCT	2	6	41436	41441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15595238
1018	NC_002516	CAC	2	6	41481	41486	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15595238
1019	NC_002516	CAG	2	6	41503	41508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15595238
1020	NC_002516	CAT	2	6	41532	41537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15595238
1021	NC_002516	CGT	2	6	41538	41543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15595238
1022	NC_002516	GCC	2	6	41549	41554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15595238
1023	NC_002516	CG	3	6	41588	41593	0 %	0 %	50 %	50 %	15595238
1024	NC_002516	GCC	2	6	41672	41677	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15595238
1025	NC_002516	CGG	2	6	41724	41729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15595238
1026	NC_002516	CAA	2	6	41787	41792	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15595238
1027	NC_002516	AGC	2	6	41816	41821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15595238
1028	NC_002516	TGGGCC	2	12	41825	41836	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	15595238
1029	NC_002516	GC	3	6	41880	41885	0 %	0 %	50 %	50 %	15595238
1030	NC_002516	GACC	2	8	41901	41908	25 %	0 %	25 %	50 %	15595238
1031	NC_002516	TGG	2	6	41959	41964	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15595238
1032	NC_002516	CCA	2	6	42054	42059	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15595238
1033	NC_002516	TGC	2	6	42077	42082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15595238
1034	NC_002516	CCA	2	6	42126	42131	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15595238
1035	NC_002516	CAA	2	6	42138	42143	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15595238
1036	NC_002516	CGG	2	6	42217	42222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15595238
1037	NC_002516	ACCTCG	2	12	42242	42253	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	15595238
1038	NC_002516	GCA	2	6	42258	42263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15595238
1039	NC_002516	GC	3	6	42281	42286	0 %	0 %	50 %	50 %	15595238
1040	NC_002516	GGCG	2	8	42306	42313	0 %	0 %	75 %	25 %	15595238
1041	NC_002516	GC	3	6	42322	42327	0 %	0 %	50 %	50 %	15595238
1042	NC_002516	CGG	2	6	42459	42464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15595238
1043	NC_002516	GCG	2	6	42512	42517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15595238
1044	NC_002516	GGC	2	6	42542	42547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15595238
1045	NC_002516	GC	3	6	42546	42551	0 %	0 %	50 %	50 %	15595238
1046	NC_002516	ACG	2	6	42608	42613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15595238
1047	NC_002516	ACG	2	6	42641	42646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15595238
1048	NC_002516	CGC	2	6	42705	42710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15595238
1049	NC_002516	CGCT	2	8	42727	42734	0 %	25 %	25 %	50 %	15595238
1050	NC_002516	GCG	2	6	42756	42761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15595238
1051	NC_002516	TTC	2	6	42793	42798	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15595238
1052	NC_002516	CCT	2	6	42813	42818	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1053	NC_002516	TCG	2	6	42984	42989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15595239
1054	NC_002516	CGG	3	9	42993	43001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15595239
1055	NC_002516	GCC	2	6	43019	43024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15595239
1056	NC_002516	GGC	2	6	43025	43030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15595239
1057	NC_002516	ACG	2	6	43089	43094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15595239
1058	NC_002516	AAC	2	6	43106	43111	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15595239
1059	NC_002516	CAA	2	6	43153	43158	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15595239
1060	NC_002516	CGG	2	6	43189	43194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15595239
1061	NC_002516	ATC	2	6	43196	43201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15595239
1062	NC_002516	GGC	2	6	43228	43233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15595239
1063	NC_002516	CGG	2	6	43258	43263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15595239
1064	NC_002516	GCA	2	6	43269	43274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15595239
1065	NC_002516	TCG	2	6	43320	43325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15595239
1066	NC_002516	TCA	2	6	43362	43367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15595239
1067	NC_002516	CGC	2	6	43371	43376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15595239
1068	NC_002516	GC	3	6	43375	43380	0 %	0 %	50 %	50 %	15595239
1069	NC_002516	CAC	2	6	43387	43392	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15595239
1070	NC_002516	CGG	2	6	43441	43446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15595239
1071	NC_002516	TCG	3	9	43452	43460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15595239
1072	NC_002516	GAA	2	6	43543	43548	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15595239
1073	NC_002516	ACG	2	6	43572	43577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15595239
1074	NC_002516	CGC	2	6	43602	43607	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15595239
1075	NC_002516	GC	3	6	43606	43611	0 %	0 %	50 %	50 %	15595239
1076	NC_002516	GCC	2	6	43736	43741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15595239
1077	NC_002516	GCG	3	9	43743	43751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15595239
1078	NC_002516	CCAG	2	8	43797	43804	25 %	0 %	25 %	50 %	15595239
1079	NC_002516	CGG	2	6	43858	43863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15595239
1080	NC_002516	GGA	2	6	43885	43890	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15595239
1081	NC_002516	GGC	2	6	43912	43917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15595239
1082	NC_002516	GC	3	6	43916	43921	0 %	0 %	50 %	50 %	15595239
1083	NC_002516	GGC	2	6	43939	43944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15595239
1084	NC_002516	CG	4	8	44002	44009	0 %	0 %	50 %	50 %	15595239
1085	NC_002516	TGG	2	6	44055	44060	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15595239
1086	NC_002516	CG	3	6	44066	44071	0 %	0 %	50 %	50 %	15595239
1087	NC_002516	GGC	2	6	44108	44113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15595239
1088	NC_002516	GGC	2	6	44165	44170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15595239
1089	NC_002516	GCT	2	6	44173	44178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15595239
1090	NC_002516	AGC	2	6	44207	44212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15595239
1091	NC_002516	GGC	2	6	44291	44296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15595239
1092	NC_002516	CGGCG	2	10	44326	44335	0 %	0 %	60 %	40 %	15595239
1093	NC_002516	CAGC	2	8	44368	44375	25 %	0 %	25 %	50 %	15595239
1094	NC_002516	G	6	6	44412	44417	0 %	0 %	100 %	0 %	15595239
1095	NC_002516	CGG	2	6	44473	44478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15595239
1096	NC_002516	CGA	2	6	44491	44496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15595239
1097	NC_002516	CTG	2	6	44498	44503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15595239
1098	NC_002516	GC	3	6	44573	44578	0 %	0 %	50 %	50 %	15595239
1099	NC_002516	ACA	2	6	44586	44591	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15595239
1100	NC_002516	AGC	2	6	44609	44614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15595239
1101	NC_002516	GGC	2	6	44618	44623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15595239
1102	NC_002516	CGG	2	6	44638	44643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15595239
1103	NC_002516	CTG	2	6	44645	44650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15595239
1104	NC_002516	GC	3	6	44685	44690	0 %	0 %	50 %	50 %	15595239
1105	NC_002516	CGG	2	6	44725	44730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15595239
1106	NC_002516	CTG	2	6	44732	44737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15595239
1107	NC_002516	GGC	2	6	44786	44791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15595239
1108	NC_002516	TGG	2	6	44796	44801	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15595239
1109	NC_002516	CGG	2	6	44848	44853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15595239
1110	NC_002516	GCT	2	6	44920	44925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15595239
1111	NC_002516	GCC	2	6	44934	44939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15595239
1112	NC_002516	CGC	2	6	44983	44988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15595239
1113	NC_002516	ACA	2	6	45084	45089	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15595239
1114	NC_002516	CGC	2	6	45106	45111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15595239
1115	NC_002516	GGC	2	6	45116	45121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15595239
1116	NC_002516	CGG	2	6	45217	45222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15595239
1117	NC_002516	CTG	2	6	45266	45271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15595239
1118	NC_002516	CGG	2	6	45319	45324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15595239
1119	NC_002516	ACGGCG	2	12	45336	45347	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	15595239
1120	NC_002516	CGG	2	6	45385	45390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15595239
1121	NC_002516	GCG	2	6	45408	45413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15595239
1122	NC_002516	GC	4	8	45440	45447	0 %	0 %	50 %	50 %	15595239
1123	NC_002516	CG	3	6	45448	45453	0 %	0 %	50 %	50 %	15595239
1124	NC_002516	GCGCTG	2	12	45491	45502	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	15595239
1125	NC_002516	CCAG	2	8	45504	45511	25 %	0 %	25 %	50 %	15595239
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1127	NC_002516	ACA	2	6	45582	45587	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15595239
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1253	NC_002516	CTGG	2	8	49811	49818	0 %	25 %	50 %	25 %	15595239
1254	NC_002516	GCA	2	6	49845	49850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15595239
1255	NC_002516	CGG	2	6	49855	49860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15595239
1256	NC_002516	ACGCC	2	10	49902	49911	20 %	0 %	20 %	60 %	15595239
1257	NC_002516	GCCA	2	8	49916	49923	25 %	0 %	25 %	50 %	15595239
1258	NC_002516	AAG	2	6	50024	50029	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15595239
1259	NC_002516	AGC	2	6	50052	50057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15595239
1260	NC_002516	GGT	2	6	50074	50079	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15595239
1261	NC_002516	GC	3	6	50081	50086	0 %	0 %	50 %	50 %	15595239
1262	NC_002516	AGC	2	6	50114	50119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15595239
1263	NC_002516	GGC	2	6	50215	50220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15595239
1264	NC_002516	CTGG	2	8	50239	50246	0 %	25 %	50 %	25 %	15595239
1265	NC_002516	GGT	2	6	50284	50289	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15595239
1266	NC_002516	GCG	3	9	50364	50372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15595239
1267	NC_002516	GC	4	8	50395	50402	0 %	0 %	50 %	50 %	15595239
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1269	NC_002516	CGTGA	2	10	50525	50534	20 %	20 %	40 %	20 %	15595239
1270	NC_002516	AACG	2	8	50564	50571	50 %	0 %	25 %	25 %	15595239
1271	NC_002516	GC	3	6	50592	50597	0 %	0 %	50 %	50 %	15595239
1272	NC_002516	CG	3	6	50638	50643	0 %	0 %	50 %	50 %	15595239
1273	NC_002516	GGC	2	6	50650	50655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15595239
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1279	NC_002516	CGG	2	6	50883	50888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15595239
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1285	NC_002516	GCCAG	2	10	51096	51105	20 %	0 %	40 %	40 %	15595239
1286	NC_002516	CGA	2	6	51112	51117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15595239
1287	NC_002516	TGG	2	6	51126	51131	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15595239
1288	NC_002516	CTG	2	6	51149	51154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15595239
1289	NC_002516	GCC	2	6	51155	51160	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15595239
1290	NC_002516	ACT	2	6	51171	51176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15595239
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1352	NC_002516	ATTT	2	8	54052	54059	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1353	NC_002516	AGG	2	6	54108	54113	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1369	NC_002516	AAAT	2	8	55028	55035	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1370	NC_002516	T	6	6	55044	55049	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1372	NC_002516	GGT	2	6	55141	55146	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1373	NC_002516	TGAT	2	8	55222	55229	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1374	NC_002516	AG	3	6	55274	55279	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1375	NC_002516	A	6	6	55298	55303	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1376	NC_002516	TGC	2	6	55331	55336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1377	NC_002516	GAT	2	6	55374	55379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1378	NC_002516	TTC	2	6	55447	55452	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1379	NC_002516	GTGA	2	8	55512	55519	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1380	NC_002516	GTT	2	6	55547	55552	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1381	NC_002516	GCG	2	6	55588	55593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1383	NC_002516	AG	3	6	55805	55810	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1499	NC_002516	CCTG	2	8	60247	60254	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1500	NC_002516	AACGA	2	10	60351	60360	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding

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