MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pyrococcus abyssi GE5 chromosome

Total Repeats: 32374

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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24002	NC_000868	ATC	2	6	1313175	1313180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14521554
24003	NC_000868	TAG	2	6	1313187	1313192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14521554
24004	NC_000868	GAA	2	6	1313195	1313200	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14521554
24005	NC_000868	GAA	2	6	1313205	1313210	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14521554
24006	NC_000868	GA	3	6	1313348	1313353	50 %	0 %	50 %	0 %	14521554
24007	NC_000868	AAG	2	6	1313420	1313425	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14521554
24008	NC_000868	AAG	2	6	1313501	1313506	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14521554
24009	NC_000868	AGG	2	6	1313525	1313530	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14521554
24010	NC_000868	CTA	2	6	1313563	1313568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14521554
24011	NC_000868	AAT	2	6	1313620	1313625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14521554
24012	NC_000868	AGG	2	6	1313663	1313668	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14521554
24013	NC_000868	ACT	2	6	1313745	1313750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14521554
24014	NC_000868	GTA	2	6	1313769	1313774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14521554
24015	NC_000868	GAA	2	6	1313787	1313792	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14521554
24016	NC_000868	ACTC	2	8	1314051	1314058	25 %	25 %	0 %	50 %	14521555
24017	NC_000868	TGC	2	6	1314139	1314144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14521555
24018	NC_000868	AT	3	6	1314164	1314169	50 %	50 %	0 %	0 %	14521555
24019	NC_000868	AGA	2	6	1314279	1314284	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14521555
24020	NC_000868	GAT	2	6	1314297	1314302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14521555
24021	NC_000868	GAA	2	6	1314311	1314316	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14521556
24022	NC_000868	TTTA	2	8	1314347	1314354	25 %	75 %	0 %	0 %	14521556
24023	NC_000868	TAA	2	6	1314461	1314466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14521556
24024	NC_000868	AAGA	2	8	1314494	1314501	75 %	0 %	25 %	0 %	14521556
24025	NC_000868	ATC	2	6	1314548	1314553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14521556
24026	NC_000868	TGA	2	6	1314573	1314578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14521556
24027	NC_000868	TAAA	2	8	1314630	1314637	75 %	25 %	0 %	0 %	14521556
24028	NC_000868	TAA	2	6	1314713	1314718	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24029	NC_000868	GA	3	6	1314723	1314728	50 %	0 %	50 %	0 %	14521557
24030	NC_000868	ACT	2	6	1314738	1314743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14521557
24031	NC_000868	GGA	2	6	1314759	1314764	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14521557
24032	NC_000868	CTG	2	6	1314773	1314778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14521557
24033	NC_000868	GCT	2	6	1314832	1314837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14521557
24034	NC_000868	TA	3	6	1314857	1314862	50 %	50 %	0 %	0 %	14521557
24035	NC_000868	AG	4	8	1314872	1314879	50 %	0 %	50 %	0 %	14521557
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24039	NC_000868	CTTGA	2	10	1314958	1314967	20 %	40 %	20 %	20 %	14521557
24040	NC_000868	TGC	2	6	1314999	1315004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14521557
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24042	NC_000868	CAGA	2	8	1315086	1315093	50 %	0 %	25 %	25 %	14521557
24043	NC_000868	A	7	7	1315124	1315130	100 %	0 %	0 %	0 %	14521558
24044	NC_000868	T	6	6	1315155	1315160	0 %	100 %	0 %	0 %	14521558
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24048	NC_000868	AGGG	2	8	1315377	1315384	25 %	0 %	75 %	0 %	14521558
24049	NC_000868	ATT	2	6	1315386	1315391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14521558
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24051	NC_000868	A	6	6	1315471	1315476	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24052	NC_000868	GCC	2	6	1315560	1315565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
24053	NC_000868	CCA	2	6	1315605	1315610	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24054	NC_000868	GGGC	2	8	1315619	1315626	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
24055	NC_000868	CCA	2	6	1315695	1315700	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24056	NC_000868	CTTT	2	8	1315744	1315751	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
24057	NC_000868	ATT	2	6	1315783	1315788	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24058	NC_000868	T	6	6	1315977	1315982	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24059	NC_000868	GCATT	2	10	1316062	1316071	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
24060	NC_000868	T	6	6	1316080	1316085	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24061	NC_000868	ATTG	2	8	1316096	1316103	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
24062	NC_000868	TAC	2	6	1316161	1316166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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24064	NC_000868	AGTAA	2	10	1316206	1316215	60 %	20 %	20 %	0 %	14521559
24065	NC_000868	TTCCC	2	10	1316221	1316230	0 %	40 %	0 %	60 %	14521559
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24086	NC_000868	TAGC	2	8	1316928	1316935	25 %	25 %	25 %	25 %	14521559
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24093	NC_000868	CCTT	2	8	1317230	1317237	0 %	50 %	0 %	50 %	14521559
24094	NC_000868	CTT	2	6	1317245	1317250	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14521559
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24121	NC_000868	GTAA	2	8	1318090	1318097	50 %	25 %	25 %	0 %	14521559
24122	NC_000868	TCC	2	6	1318112	1318117	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14521559
24123	NC_000868	GAA	2	6	1318240	1318245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14521559
24124	NC_000868	TAT	2	6	1318312	1318317	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14521559
24125	NC_000868	AAC	2	6	1318327	1318332	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	14521559
24126	NC_000868	GTT	2	6	1318348	1318353	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	14521559
24127	NC_000868	ACT	2	6	1318409	1318414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14521559
24128	NC_000868	TTC	2	6	1318478	1318483	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14521559
24129	NC_000868	CCAT	2	8	1318493	1318500	25 %	25 %	0 %	50 %	14521559
24130	NC_000868	TCG	2	6	1318523	1318528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14521559
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24132	NC_000868	TTCT	2	8	1318560	1318567	0 %	75 %	0 %	25 %	14521559
24133	NC_000868	ATC	2	6	1318604	1318609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14521559
24134	NC_000868	ATC	2	6	1318718	1318723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14521559
24135	NC_000868	TCCT	2	8	1318734	1318741	0 %	50 %	0 %	50 %	14521560
24136	NC_000868	CCT	2	6	1318759	1318764	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14521560
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24138	NC_000868	GAT	2	6	1318806	1318811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14521560
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24140	NC_000868	CT	3	6	1318898	1318903	0 %	50 %	0 %	50 %	14521560
24141	NC_000868	CT	3	6	1318922	1318927	0 %	50 %	0 %	50 %	14521560
24142	NC_000868	CTA	2	6	1318948	1318953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14521560
24143	NC_000868	GTT	2	6	1318995	1319000	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	14521560
24144	NC_000868	TAT	3	9	1319015	1319023	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14521560
24145	NC_000868	ATCTTT	2	12	1319097	1319108	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	14521560
24146	NC_000868	TTG	2	6	1319319	1319324	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	14521560
24147	NC_000868	AACTT	2	10	1319328	1319337	40 %	40 %	0 %	20 %	14521560
24148	NC_000868	ACT	2	6	1319364	1319369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14521560
24149	NC_000868	TAA	2	6	1319451	1319456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14521560
24150	NC_000868	CAT	2	6	1319489	1319494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14521560
24151	NC_000868	AGA	2	6	1319498	1319503	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24152	NC_000868	CTC	2	6	1319528	1319533	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14521561
24153	NC_000868	TTC	2	6	1319657	1319662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14521561
24154	NC_000868	CTT	2	6	1319669	1319674	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14521561
24155	NC_000868	CCTT	2	8	1319700	1319707	0 %	50 %	0 %	50 %	14521561
24156	NC_000868	CTC	3	9	1319719	1319727	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14521561
24157	NC_000868	AG	3	6	1319776	1319781	50 %	0 %	50 %	0 %	14521561
24158	NC_000868	TCC	2	6	1319839	1319844	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14521561
24159	NC_000868	CTT	2	6	1319903	1319908	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14521561
24160	NC_000868	CTT	2	6	1319912	1319917	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14521561
24161	NC_000868	CTT	2	6	1319996	1320001	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14521561
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24184	NC_000868	TG	4	8	1321194	1321201	0 %	50 %	50 %	0 %	14521562
24185	NC_000868	TCC	2	6	1321252	1321257	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14521562
24186	NC_000868	GCTC	2	8	1321509	1321516	0 %	25 %	25 %	50 %	14521562
24187	NC_000868	GCTC	2	8	1321541	1321548	0 %	25 %	25 %	50 %	14521562
24188	NC_000868	CAC	2	6	1321723	1321728	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24189	NC_000868	CT	3	6	1321739	1321744	0 %	50 %	0 %	50 %	14521563
24190	NC_000868	GTTG	2	8	1321760	1321767	0 %	50 %	50 %	0 %	14521563
24191	NC_000868	ATAGTC	2	12	1321802	1321813	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	14521563
24192	NC_000868	CTT	2	6	1321898	1321903	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14521563
24193	NC_000868	T	6	6	1321987	1321992	0 %	100 %	0 %	0 %	14521563
24194	NC_000868	CAC	2	6	1322052	1322057	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24195	NC_000868	TAAT	2	8	1322065	1322072	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24196	NC_000868	CTT	2	6	1322097	1322102	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14521564
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24199	NC_000868	CTT	2	6	1322214	1322219	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14521564
24200	NC_000868	TTGTC	2	10	1322309	1322318	0 %	60 %	20 %	20 %	14521564
24201	NC_000868	TCCA	2	8	1322330	1322337	25 %	25 %	0 %	50 %	14521564
24202	NC_000868	CTT	2	6	1322391	1322396	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14521564
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24204	NC_000868	TGC	2	6	1322439	1322444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14521564
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24214	NC_000868	CAC	2	6	1322921	1322926	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	14521564
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24218	NC_000868	CAT	2	6	1323009	1323014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14521564
24219	NC_000868	GGT	2	6	1323028	1323033	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	14521565
24220	NC_000868	CTT	2	6	1323074	1323079	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14521565
24221	NC_000868	TCAC	2	8	1323105	1323112	25 %	25 %	0 %	50 %	14521565
24222	NC_000868	TTC	2	6	1323147	1323152	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14521565
24223	NC_000868	GTT	2	6	1323170	1323175	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	14521565
24224	NC_000868	CCT	2	6	1323211	1323216	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14521565
24225	NC_000868	TCC	2	6	1323282	1323287	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14521565
24226	NC_000868	ACCT	2	8	1323323	1323330	25 %	25 %	0 %	50 %	14521565
24227	NC_000868	CCT	2	6	1323361	1323366	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14521565
24228	NC_000868	CCCATG	2	12	1323387	1323398	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	14521565
24229	NC_000868	TCG	2	6	1323414	1323419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14521565
24230	NC_000868	CTT	2	6	1323497	1323502	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14521565
24231	NC_000868	GTA	2	6	1323542	1323547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14521565
24232	NC_000868	GTT	2	6	1323773	1323778	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	14521565
24233	NC_000868	TCT	2	6	1324075	1324080	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14521565
24234	NC_000868	GGA	2	6	1324138	1324143	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14521565
24235	NC_000868	GCA	2	6	1324155	1324160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	14521565
24236	NC_000868	CTTT	2	8	1324177	1324184	0 %	75 %	0 %	25 %	14521565
24237	NC_000868	CCA	2	6	1324198	1324203	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	14521565
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24239	NC_000868	TTGG	2	8	1324237	1324244	0 %	50 %	50 %	0 %	14521566
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24358	NC_000868	GAG	2	6	1331539	1331544	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14521576
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24429	NC_000868	GGC	2	6	1335793	1335798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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24478	NC_000868	AGG	2	6	1338565	1338570	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14521584
24479	NC_000868	AAG	2	6	1338579	1338584	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14521584
24480	NC_000868	GAA	2	6	1338597	1338602	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14521584
24481	NC_000868	GAG	2	6	1338702	1338707	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14521584
24482	NC_000868	AAACGA	2	12	1338763	1338774	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	14521584
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24484	NC_000868	AGA	2	6	1338884	1338889	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14521584
24485	NC_000868	AAG	2	6	1338946	1338951	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14521584
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24487	NC_000868	A	6	6	1339164	1339169	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24488	NC_000868	A	6	6	1339203	1339208	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24489	NC_000868	T	6	6	1339266	1339271	0 %	100 %	0 %	0 %	14521585
24490	NC_000868	CTA	2	6	1339355	1339360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14521585
24491	NC_000868	TCA	2	6	1339391	1339396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14521585
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