MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pyrococcus abyssi GE5 chromosome

Total Repeats: 32374

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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21502	NC_000868	CTA	2	6	1175837	1175842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14521424
21503	NC_000868	AACT	2	8	1175872	1175879	50 %	25 %	0 %	25 %	14521424
21504	NC_000868	GAT	2	6	1175883	1175888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14521424
21505	NC_000868	TCA	2	6	1176031	1176036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14521424
21506	NC_000868	AAAG	2	8	1176095	1176102	75 %	0 %	25 %	0 %	14521424
21507	NC_000868	GTTGAC	2	12	1176174	1176185	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	14521424
21508	NC_000868	ATA	2	6	1176234	1176239	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14521424
21509	NC_000868	AGAGG	2	10	1176242	1176251	40 %	0 %	60 %	0 %	14521424
21510	NC_000868	TTC	2	6	1176285	1176290	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14521424
21511	NC_000868	AGCG	2	8	1176320	1176327	25 %	0 %	50 %	25 %	14521424
21512	NC_000868	AGGA	2	8	1176379	1176386	50 %	0 %	50 %	0 %	14521424
21513	NC_000868	AAG	2	6	1176423	1176428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14521424
21514	NC_000868	TAT	2	6	1176455	1176460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14521424
21515	NC_000868	AGG	2	6	1176494	1176499	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14521425
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21517	NC_000868	GCTC	2	8	1176593	1176600	0 %	25 %	25 %	50 %	14521425
21518	NC_000868	AAG	2	6	1176634	1176639	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14521425
21519	NC_000868	CTGAGG	2	12	1176640	1176651	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	14521425
21520	NC_000868	AAG	2	6	1176658	1176663	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14521425
21521	NC_000868	AGG	2	6	1176673	1176678	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14521425
21522	NC_000868	AGG	2	6	1176681	1176686	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14521425
21523	NC_000868	GGA	2	6	1176691	1176696	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14521425
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21525	NC_000868	GTAC	2	8	1176735	1176742	25 %	25 %	25 %	25 %	14521425
21526	NC_000868	GCAT	2	8	1176804	1176811	25 %	25 %	25 %	25 %	14521425
21527	NC_000868	GT	3	6	1176830	1176835	0 %	50 %	50 %	0 %	14521425
21528	NC_000868	AG	3	6	1176846	1176851	50 %	0 %	50 %	0 %	14521425
21529	NC_000868	TCC	2	6	1176854	1176859	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14521425
21530	NC_000868	TCT	2	6	1176869	1176874	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14521425
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21533	NC_000868	GAG	2	6	1177069	1177074	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14521425
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21535	NC_000868	G	6	6	1177154	1177159	0 %	0 %	100 %	0 %	14521425
21536	NC_000868	AG	3	6	1177174	1177179	50 %	0 %	50 %	0 %	14521425
21537	NC_000868	GAA	2	6	1177254	1177259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14521425
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21539	NC_000868	GAG	2	6	1177300	1177305	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14521425
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21541	NC_000868	GAA	2	6	1177330	1177335	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14521425
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21545	NC_000868	AGGA	2	8	1177487	1177494	50 %	0 %	50 %	0 %	14521425
21546	NC_000868	GAAAA	2	10	1177495	1177504	80 %	0 %	20 %	0 %	14521425
21547	NC_000868	CGTA	2	8	1177571	1177578	25 %	25 %	25 %	25 %	14521425
21548	NC_000868	GAG	2	6	1177579	1177584	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14521425
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21552	NC_000868	AGA	2	6	1177779	1177784	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14521425
21553	NC_000868	AAGG	2	8	1177788	1177795	50 %	0 %	50 %	0 %	14521425
21554	NC_000868	GA	3	6	1177821	1177826	50 %	0 %	50 %	0 %	14521425
21555	NC_000868	AAG	2	6	1177843	1177848	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14521425
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21558	NC_000868	GCAGA	2	10	1177990	1177999	40 %	0 %	40 %	20 %	14521425
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21560	NC_000868	GAG	2	6	1178080	1178085	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14521425
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21571	NC_000868	AGAA	2	8	1178665	1178672	75 %	0 %	25 %	0 %	14521425
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21601	NC_000868	ACC	2	6	1180706	1180711	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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21603	NC_000868	TCT	2	6	1180762	1180767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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21605	NC_000868	GGA	2	6	1180801	1180806	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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21608	NC_000868	TA	3	6	1180850	1180855	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21609	NC_000868	TG	3	6	1180912	1180917	0 %	50 %	50 %	0 %	14521427
21610	NC_000868	AT	3	6	1180935	1180940	50 %	50 %	0 %	0 %	14521427
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21615	NC_000868	TAT	2	6	1181226	1181231	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21616	NC_000868	GCAT	2	8	1181244	1181251	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
21617	NC_000868	CTTG	2	8	1181332	1181339	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
21618	NC_000868	AGT	2	6	1181349	1181354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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21620	NC_000868	TTA	2	6	1181384	1181389	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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21622	NC_000868	ACC	2	6	1181423	1181428	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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21624	NC_000868	TCA	2	6	1181626	1181631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14521428
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21643	NC_000868	AATA	2	8	1182352	1182359	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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21985	NC_000868	AACCTT	2	12	1201685	1201696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14521445
21986	NC_000868	CTT	2	6	1201817	1201822	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14521445
21987	NC_000868	ACCA	2	8	1201862	1201869	50 %	0 %	0 %	50 %	14521445
21988	NC_000868	TGA	2	6	1202058	1202063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14521446
21989	NC_000868	CTCGGG	2	12	1202089	1202100	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	14521446
21990	NC_000868	TCT	2	6	1202249	1202254	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14521446
21991	NC_000868	CT	3	6	1202279	1202284	0 %	50 %	0 %	50 %	14521446
21992	NC_000868	GAAG	2	8	1202316	1202323	50 %	0 %	50 %	0 %	14521446
21993	NC_000868	CCTC	2	8	1202328	1202335	0 %	25 %	0 %	75 %	14521446
21994	NC_000868	ACG	3	9	1202357	1202365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	14521446
21995	NC_000868	ATTA	2	8	1202383	1202390	50 %	50 %	0 %	0 %	14521446
21996	NC_000868	TCC	2	6	1202503	1202508	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14521446
21997	NC_000868	ACG	2	6	1202540	1202545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	14521446
21998	NC_000868	TGC	2	6	1202567	1202572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14521446
21999	NC_000868	TCC	2	6	1202592	1202597	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14521446
22000	NC_000868	CGG	2	6	1202622	1202627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	14521446

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