MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pyrococcus abyssi GE5 chromosome

Total Repeats: 32374

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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16125	NC_000868	TCT	2	6	879773	879778	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14521122
16126	NC_000868	TCG	2	6	879823	879828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14521122
16127	NC_000868	TTCC	2	8	879877	879884	0 %	50 %	0 %	50 %	14521122
16128	NC_000868	AG	3	6	879959	879964	50 %	0 %	50 %	0 %	14521122
16129	NC_000868	ATC	2	6	879982	879987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14521122
16130	NC_000868	CTTT	2	8	880097	880104	0 %	75 %	0 %	25 %	14521122
16131	NC_000868	AAT	2	6	880150	880155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14521122
16132	NC_000868	CCT	2	6	880215	880220	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14521122
16133	NC_000868	GTCCAT	2	12	880227	880238	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	14521122
16134	NC_000868	GTC	2	6	880242	880247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14521122
16135	NC_000868	CCA	2	6	880315	880320	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	14521122
16136	NC_000868	ACC	2	6	880365	880370	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	14521122
16137	NC_000868	GCT	2	6	880390	880395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14521122
16138	NC_000868	CAA	2	6	880537	880542	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	14521123
16139	NC_000868	CTC	2	6	880589	880594	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14521123
16140	NC_000868	TCT	2	6	880689	880694	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14521123
16141	NC_000868	TTGC	2	8	880695	880702	0 %	50 %	25 %	25 %	14521123
16142	NC_000868	ATC	2	6	880728	880733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14521123
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16145	NC_000868	TTGCT	2	10	881012	881021	0 %	60 %	20 %	20 %	14521123
16146	NC_000868	GCCT	2	8	881061	881068	0 %	25 %	25 %	50 %	14521123
16147	NC_000868	TGGC	2	8	881115	881122	0 %	25 %	50 %	25 %	14521123
16148	NC_000868	TGT	2	6	881126	881131	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	14521123
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16152	NC_000868	TC	4	8	881300	881307	0 %	50 %	0 %	50 %	14521123
16153	NC_000868	GAT	2	6	881314	881319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14521123
16154	NC_000868	TGT	2	6	881320	881325	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	14521123
16155	NC_000868	AAC	2	6	881348	881353	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	14521123
16156	NC_000868	GAC	2	6	881375	881380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	14521123
16157	NC_000868	AGA	2	6	881384	881389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14521123
16158	NC_000868	TCAC	2	8	881436	881443	25 %	25 %	0 %	50 %	14521123
16159	NC_000868	TAGT	2	8	881460	881467	25 %	50 %	25 %	0 %	14521123
16160	NC_000868	CTC	2	6	881498	881503	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14521123
16161	NC_000868	AGCT	2	8	881576	881583	25 %	25 %	25 %	25 %	14521123
16162	NC_000868	CGA	2	6	881632	881637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	14521123
16163	NC_000868	CTT	2	6	881639	881644	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14521123
16164	NC_000868	TCT	2	6	881704	881709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14521123
16165	NC_000868	TCC	2	6	881822	881827	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14521123
16166	NC_000868	TCC	2	6	881856	881861	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14521123
16167	NC_000868	GAAGCT	2	12	881892	881903	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
16168	NC_000868	TAAT	2	8	881937	881944	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16169	NC_000868	ATG	2	6	881958	881963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14521124
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16171	NC_000868	GGT	2	6	882069	882074	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	14521124
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16173	NC_000868	GA	3	6	882264	882269	50 %	0 %	50 %	0 %	14521124
16174	NC_000868	GAG	2	6	882372	882377	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14521124
16175	NC_000868	CGG	2	6	882404	882409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	14521124
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16178	NC_000868	ATTC	2	8	882616	882623	25 %	50 %	0 %	25 %	14521124
16179	NC_000868	GTTAG	2	10	882819	882828	20 %	40 %	40 %	0 %	14521124
16180	NC_000868	AG	3	6	882827	882832	50 %	0 %	50 %	0 %	14521124
16181	NC_000868	AAG	2	6	882901	882906	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14521125
16182	NC_000868	TAA	2	6	882914	882919	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14521125
16183	NC_000868	CAT	3	9	883010	883018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14521125
16184	NC_000868	CGA	2	6	883356	883361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	14521125
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16189	NC_000868	CTTTT	2	10	883567	883576	0 %	80 %	0 %	20 %	14521126
16190	NC_000868	CGA	2	6	883586	883591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	14521126
16191	NC_000868	CTTC	2	8	883736	883743	0 %	50 %	0 %	50 %	14521126
16192	NC_000868	GAA	2	6	883756	883761	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14521126
16193	NC_000868	TCC	2	6	883792	883797	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14521126
16194	NC_000868	TCGC	2	8	883798	883805	0 %	25 %	25 %	50 %	14521126
16195	NC_000868	TTC	2	6	883911	883916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14521126
16196	NC_000868	ACTT	2	8	883944	883951	25 %	50 %	0 %	25 %	14521126
16197	NC_000868	C	7	7	884023	884029	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
16198	NC_000868	TCAA	2	8	884066	884073	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
16199	NC_000868	G	6	6	884141	884146	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
16200	NC_000868	ATC	2	6	884155	884160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16201	NC_000868	AGA	2	6	884274	884279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14521127
16202	NC_000868	TAC	2	6	884353	884358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14521127
16203	NC_000868	GCG	2	6	884384	884389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	14521127
16204	NC_000868	ATA	2	6	884434	884439	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14521127
16205	NC_000868	GAA	2	6	884544	884549	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14521127
16206	NC_000868	AAG	2	6	884587	884592	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14521127
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16208	NC_000868	AAT	2	6	884622	884627	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14521127
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16210	NC_000868	TTC	2	6	884768	884773	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14521127
16211	NC_000868	AGGA	2	8	884836	884843	50 %	0 %	50 %	0 %	14521127
16212	NC_000868	CTA	2	6	884893	884898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14521127
16213	NC_000868	GATTAC	2	12	884956	884967	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	14521127
16214	NC_000868	AGA	2	6	884997	885002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14521127
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16216	NC_000868	AAGGG	2	10	885082	885091	40 %	0 %	60 %	0 %	14521127
16217	NC_000868	GAG	2	6	885250	885255	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14521127
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16219	NC_000868	GATAA	2	10	885511	885520	60 %	20 %	20 %	0 %	14521127
16220	NC_000868	ACG	2	6	885530	885535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	14521127
16221	NC_000868	GA	3	6	885690	885695	50 %	0 %	50 %	0 %	14521127
16222	NC_000868	GAG	2	6	885760	885765	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14521127
16223	NC_000868	GAG	2	6	885781	885786	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14521127
16224	NC_000868	ATA	2	6	885832	885837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14521127
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16228	NC_000868	TCG	3	9	886460	886468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14521127
16229	NC_000868	GGT	2	6	886481	886486	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	14521127
16230	NC_000868	TAA	2	6	886496	886501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14521127
16231	NC_000868	TAC	2	6	886549	886554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14521127
16232	NC_000868	ACT	2	6	886587	886592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14521127
16233	NC_000868	TA	3	6	886609	886614	50 %	50 %	0 %	0 %	14521127
16234	NC_000868	AGG	2	6	886741	886746	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14521127
16235	NC_000868	ATC	2	6	886816	886821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14521127
16236	NC_000868	AAG	2	6	886843	886848	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14521127
16237	NC_000868	ATA	2	6	886984	886989	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14521127
16238	NC_000868	ATA	2	6	887086	887091	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14521127
16239	NC_000868	CTT	2	6	887112	887117	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14521127
16240	NC_000868	GAGG	2	8	887134	887141	25 %	0 %	75 %	0 %	14521127
16241	NC_000868	GAG	2	6	887208	887213	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14521127
16242	NC_000868	ATA	2	6	887260	887265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14521127
16243	NC_000868	GA	3	6	887328	887333	50 %	0 %	50 %	0 %	14521127
16244	NC_000868	CTT	2	6	887440	887445	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16245	NC_000868	ATA	2	6	887517	887522	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14521128
16246	NC_000868	CCA	2	6	887538	887543	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	14521128
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16248	NC_000868	GA	3	6	887595	887600	50 %	0 %	50 %	0 %	14521128
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16497	NC_000868	TCC	2	6	902384	902389	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14521144
16498	NC_000868	TCCC	2	8	902490	902497	0 %	25 %	0 %	75 %	14521144
16499	NC_000868	ATA	2	6	902602	902607	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14521144
16500	NC_000868	TGAT	2	8	902885	902892	25 %	50 %	25 %	0 %	14521144

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