MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Oscillatoria acuminata PCC 6304 plasmid pOSCIL6304.02

Total Repeats: 710

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_019694	CGAT	2	8	35060	35067	25 %	25 %	25 %	25 %	428216273
502	NC_019694	GAT	2	6	35080	35085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428216273
503	NC_019694	AGT	2	6	35124	35129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428216273
504	NC_019694	AACGG	2	10	35173	35182	40 %	0 %	40 %	20 %	428216273
505	NC_019694	TGGC	2	8	35243	35250	0 %	25 %	50 %	25 %	428216273
506	NC_019694	ACAA	2	8	35340	35347	75 %	0 %	0 %	25 %	428216273
507	NC_019694	ATTCT	2	10	35477	35486	20 %	60 %	0 %	20 %	428216273
508	NC_019694	ATG	2	6	35513	35518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428216273
509	NC_019694	GAA	2	6	35526	35531	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428216273
510	NC_019694	AGCA	2	8	35533	35540	50 %	0 %	25 %	25 %	428216273
511	NC_019694	TGA	2	6	35556	35561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428216273
512	NC_019694	GTCGC	2	10	35571	35580	0 %	20 %	40 %	40 %	428216273
513	NC_019694	GAG	2	6	35698	35703	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428216273
514	NC_019694	CAA	2	6	35760	35765	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428216273
515	NC_019694	A	7	7	35774	35780	100 %	0 %	0 %	0 %	428216273
516	NC_019694	AGCG	2	8	35818	35825	25 %	0 %	50 %	25 %	428216273
517	NC_019694	GAG	2	6	35879	35884	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428216273
518	NC_019694	ACC	2	6	35893	35898	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428216273
519	NC_019694	G	6	6	35930	35935	0 %	0 %	100 %	0 %	428216273
520	NC_019694	CAA	2	6	35976	35981	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428216273
521	NC_019694	TCAG	2	8	36019	36026	25 %	25 %	25 %	25 %	428216273
522	NC_019694	CAAAA	2	10	36061	36070	80 %	0 %	0 %	20 %	428216273
523	NC_019694	AAT	2	6	36075	36080	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428216273
524	NC_019694	CTT	2	6	36107	36112	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428216273
525	NC_019694	CGA	2	6	36117	36122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428216273
526	NC_019694	T	6	6	36256	36261	0 %	100 %	0 %	0 %	428216273
527	NC_019694	AACTC	2	10	36308	36317	40 %	20 %	0 %	40 %	428216273
528	NC_019694	AAC	2	6	36328	36333	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428216273
529	NC_019694	TC	4	8	36358	36365	0 %	50 %	0 %	50 %	428216273
530	NC_019694	TCGGC	2	10	36425	36434	0 %	20 %	40 %	40 %	428216273
531	NC_019694	ACA	2	6	36476	36481	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428216273
532	NC_019694	GGGAT	2	10	36483	36492	20 %	20 %	60 %	0 %	428216273
533	NC_019694	GAC	2	6	36568	36573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428216273
534	NC_019694	ATC	2	6	36619	36624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428216273
535	NC_019694	CAGAAC	2	12	36660	36671	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	428216273
536	NC_019694	CTT	2	6	36693	36698	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428216273
537	NC_019694	CAA	3	9	36718	36726	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428216273
538	NC_019694	AAT	2	6	36730	36735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428216273
539	NC_019694	CCT	2	6	36787	36792	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428216273
540	NC_019694	GGA	2	6	36796	36801	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428216273
541	NC_019694	TA	3	6	36814	36819	50 %	50 %	0 %	0 %	428216273
542	NC_019694	ACA	2	6	36935	36940	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428216273
543	NC_019694	AAG	2	6	36993	36998	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428216273
544	NC_019694	CAA	2	6	37006	37011	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428216273
545	NC_019694	AGA	2	6	37026	37031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428216273
546	NC_019694	ATA	2	6	37055	37060	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428216273
547	NC_019694	TC	3	6	37267	37272	0 %	50 %	0 %	50 %	428216274
548	NC_019694	TCG	2	6	37378	37383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428216274
549	NC_019694	AATT	2	8	37403	37410	50 %	50 %	0 %	0 %	428216274
550	NC_019694	CAC	2	6	37616	37621	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428216274
551	NC_019694	T	6	6	37632	37637	0 %	100 %	0 %	0 %	428216274
552	NC_019694	GA	3	6	37681	37686	50 %	0 %	50 %	0 %	428216274
553	NC_019694	GTCAG	2	10	37741	37750	20 %	20 %	40 %	20 %	428216274
554	NC_019694	TCG	2	6	37879	37884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428216274
555	NC_019694	TCC	2	6	38061	38066	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428216274
556	NC_019694	CTC	2	6	38130	38135	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428216274
557	NC_019694	CAG	2	6	38140	38145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428216274
558	NC_019694	CTG	2	6	38161	38166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428216274
559	NC_019694	AGTTA	2	10	38328	38337	40 %	40 %	20 %	0 %	428216274
560	NC_019694	GATC	2	8	38348	38355	25 %	25 %	25 %	25 %	428216274
561	NC_019694	TTC	2	6	38562	38567	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428216274
562	NC_019694	TGG	2	6	39358	39363	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428216275
563	NC_019694	TAG	2	6	39389	39394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428216275
564	NC_019694	GAT	2	6	39478	39483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428216275
565	NC_019694	CAT	2	6	39486	39491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428216275
566	NC_019694	TCT	2	6	39544	39549	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428216275
567	NC_019694	GTT	2	6	39626	39631	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428216275
568	NC_019694	TC	3	6	39642	39647	0 %	50 %	0 %	50 %	428216275
569	NC_019694	ATC	2	6	39667	39672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428216275
570	NC_019694	CAT	2	6	39678	39683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428216275
571	NC_019694	CGG	2	6	39785	39790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428216275
572	NC_019694	CAAC	2	8	39857	39864	50 %	0 %	0 %	50 %	428216275
573	NC_019694	CAT	2	6	39911	39916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428216275
574	NC_019694	AAT	2	6	39918	39923	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428216275
575	NC_019694	TACTG	2	10	40038	40047	20 %	40 %	20 %	20 %	428216275
576	NC_019694	ACC	2	6	40346	40351	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428216276
577	NC_019694	AAC	2	6	40448	40453	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428216276
578	NC_019694	GGA	2	6	40468	40473	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428216276
579	NC_019694	A	6	6	40473	40478	100 %	0 %	0 %	0 %	428216276
580	NC_019694	GAA	3	9	40523	40531	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428216276
581	NC_019694	AACG	2	8	40532	40539	50 %	0 %	25 %	25 %	428216276
582	NC_019694	ATC	2	6	40817	40822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428216277
583	NC_019694	CTG	2	6	40866	40871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428216277
584	NC_019694	TGA	2	6	40880	40885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428216277
585	NC_019694	GGA	2	6	41039	41044	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428216277
586	NC_019694	GTA	2	6	41130	41135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428216277
587	NC_019694	ACGA	2	8	41137	41144	50 %	0 %	25 %	25 %	428216277
588	NC_019694	AGG	2	6	41170	41175	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428216277
589	NC_019694	TCGGTA	2	12	41181	41192	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	428216277
590	NC_019694	CCAG	2	8	41195	41202	25 %	0 %	25 %	50 %	428216277
591	NC_019694	TGA	2	6	41246	41251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428216277
592	NC_019694	GAT	2	6	41259	41264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428216277
593	NC_019694	GGA	2	6	41276	41281	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428216277
594	NC_019694	GAT	2	6	41385	41390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428216277
595	NC_019694	GGA	2	6	41402	41407	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428216277
596	NC_019694	CTT	2	6	41560	41565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428216277
597	NC_019694	A	6	6	41586	41591	100 %	0 %	0 %	0 %	428216277
598	NC_019694	A	6	6	41655	41660	100 %	0 %	0 %	0 %	428216277
599	NC_019694	TGA	2	6	41675	41680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428216277
600	NC_019694	CTT	2	6	42160	42165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428216278
601	NC_019694	T	6	6	42178	42183	0 %	100 %	0 %	0 %	428216278
602	NC_019694	CTG	2	6	42268	42273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428216278
603	NC_019694	GTCG	2	8	42299	42306	0 %	25 %	50 %	25 %	428216278
604	NC_019694	TGGG	2	8	42494	42501	0 %	25 %	75 %	0 %	428216278
605	NC_019694	TGC	2	6	42511	42516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428216278
606	NC_019694	TGA	2	6	42550	42555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428216278
607	NC_019694	GGGA	2	8	42608	42615	25 %	0 %	75 %	0 %	428216278
608	NC_019694	GGC	2	6	42657	42662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428216278
609	NC_019694	ATC	2	6	42701	42706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428216278
610	NC_019694	TCT	2	6	42728	42733	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428216278
611	NC_019694	TAAG	2	8	42805	42812	50 %	25 %	25 %	0 %	428216278
612	NC_019694	CTCA	2	8	42832	42839	25 %	25 %	0 %	50 %	428216278
613	NC_019694	TCC	2	6	42854	42859	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428216278
614	NC_019694	TGGG	2	8	42920	42927	0 %	25 %	75 %	0 %	428216278
615	NC_019694	TGC	2	6	42938	42943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428216278
616	NC_019694	GCCCA	2	10	43176	43185	20 %	0 %	20 %	60 %	428216278
617	NC_019694	TGAG	2	8	43240	43247	25 %	25 %	50 %	0 %	428216278
618	NC_019694	TGGG	2	8	43280	43287	0 %	25 %	75 %	0 %	428216278
619	NC_019694	ACA	2	6	43329	43334	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428216278
620	NC_019694	AGC	2	6	43502	43507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428216278
621	NC_019694	GCT	2	6	43554	43559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428216278
622	NC_019694	GCA	3	9	43601	43609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428216278
623	NC_019694	GTC	2	6	43689	43694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428216278
624	NC_019694	CGG	2	6	43773	43778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428216278
625	NC_019694	TTG	2	6	43810	43815	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428216278
626	NC_019694	GCG	2	6	43852	43857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428216278
627	NC_019694	TCAAA	2	10	43887	43896	60 %	20 %	0 %	20 %	428216278
628	NC_019694	GGC	2	6	43918	43923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428216278
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