MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Oscillatoria acuminata PCC 6304 plasmid pOSCIL6304.02

Total Repeats: 942

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_019694	AAT	2	6	28707	28712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428216270
502	NC_019694	TCC	2	6	28794	28799	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428216270
503	NC_019694	TTG	2	6	28809	28814	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428216270
504	NC_019694	GAT	2	6	28821	28826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428216270
505	NC_019694	GGGA	2	8	28828	28835	25 %	0 %	75 %	0 %	428216270
506	NC_019694	TCA	2	6	28842	28847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428216270
507	NC_019694	ATG	2	6	28894	28899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428216270
508	NC_019694	TGG	2	6	28916	28921	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428216270
509	NC_019694	CAC	2	6	29009	29014	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428216270
510	NC_019694	GTAGAA	2	12	29118	29129	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	428216270
511	NC_019694	CG	3	6	29165	29170	0 %	0 %	50 %	50 %	428216270
512	NC_019694	CAC	2	6	29213	29218	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428216270
513	NC_019694	CAGT	2	8	29219	29226	25 %	25 %	25 %	25 %	428216270
514	NC_019694	GTC	2	6	29265	29270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428216270
515	NC_019694	GTT	2	6	29286	29291	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428216270
516	NC_019694	GCC	3	9	29370	29378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428216270
517	NC_019694	ACGGT	2	10	29422	29431	20 %	20 %	40 %	20 %	428216270
518	NC_019694	GGT	2	6	29534	29539	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428216270
519	NC_019694	GGA	2	6	29586	29591	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428216270
520	NC_019694	ATG	2	6	29644	29649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428216270
521	NC_019694	AACGG	2	10	29739	29748	40 %	0 %	40 %	20 %	428216270
522	NC_019694	GCA	3	9	29868	29876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428216270
523	NC_019694	TGA	2	6	29918	29923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428216270
524	NC_019694	ACAA	2	8	29930	29937	75 %	0 %	0 %	25 %	428216270
525	NC_019694	TCG	2	6	29942	29947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428216270
526	NC_019694	CGA	2	6	30020	30025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428216270
527	NC_019694	GGTT	2	8	30066	30073	0 %	50 %	50 %	0 %	428216270
528	NC_019694	ATG	2	6	30112	30117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428216270
529	NC_019694	GCA	2	6	30124	30129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428216270
530	NC_019694	AGA	2	6	30140	30145	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428216270
531	NC_019694	GAG	2	6	30156	30161	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428216270
532	NC_019694	G	6	6	30235	30240	0 %	0 %	100 %	0 %	428216270
533	NC_019694	TTCC	2	8	30284	30291	0 %	50 %	0 %	50 %	428216270
534	NC_019694	AAT	2	6	30321	30326	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428216270
535	NC_019694	ATCG	2	8	30450	30457	25 %	25 %	25 %	25 %	428216270
536	NC_019694	TGT	2	6	30476	30481	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428216270
537	NC_019694	C	7	7	30559	30565	0 %	0 %	0 %	100 %	428216270
538	NC_019694	TACA	2	8	30643	30650	50 %	25 %	0 %	25 %	428216270
539	NC_019694	GAT	2	6	30792	30797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428216270
540	NC_019694	CAC	2	6	30932	30937	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428216270
541	NC_019694	TGGC	2	8	31034	31041	0 %	25 %	50 %	25 %	428216270
542	NC_019694	GCA	2	6	31054	31059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428216270
543	NC_019694	AAT	2	6	31068	31073	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428216270
544	NC_019694	TAA	2	6	31094	31099	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428216270
545	NC_019694	ACA	2	6	31144	31149	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428216270
546	NC_019694	T	6	6	31157	31162	0 %	100 %	0 %	0 %	428216270
547	NC_019694	ATA	2	6	31192	31197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428216270
548	NC_019694	T	6	6	31203	31208	0 %	100 %	0 %	0 %	428216270
549	NC_019694	AAT	2	6	31218	31223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428216270
550	NC_019694	CCG	2	6	31225	31230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428216270
551	NC_019694	ATA	2	6	31246	31251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428216270
552	NC_019694	A	7	7	31336	31342	100 %	0 %	0 %	0 %	428216270
553	NC_019694	CAA	2	6	31404	31409	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428216270
554	NC_019694	AAG	2	6	31564	31569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428216270
555	NC_019694	A	6	6	31634	31639	100 %	0 %	0 %	0 %	428216270
556	NC_019694	AT	3	6	31770	31775	50 %	50 %	0 %	0 %	428216270
557	NC_019694	TAAT	2	8	31788	31795	50 %	50 %	0 %	0 %	428216270
558	NC_019694	A	6	6	31853	31858	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
559	NC_019694	TCC	2	6	31859	31864	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
560	NC_019694	A	6	6	31907	31912	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
561	NC_019694	TC	3	6	31922	31927	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
562	NC_019694	ACAAT	2	10	31942	31951	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
563	NC_019694	TAA	2	6	31991	31996	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428216271
564	NC_019694	TCG	2	6	31997	32002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428216271
565	NC_019694	CAA	2	6	32025	32030	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428216271
566	NC_019694	A	7	7	32062	32068	100 %	0 %	0 %	0 %	428216271
567	NC_019694	AAGT	2	8	32098	32105	50 %	25 %	25 %	0 %	428216271
568	NC_019694	CAT	2	6	32128	32133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428216271
569	NC_019694	GCT	2	6	32152	32157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428216271
570	NC_019694	CAC	2	6	32217	32222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428216271
571	NC_019694	AAT	2	6	32362	32367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428216271
572	NC_019694	TTTC	2	8	32378	32385	0 %	75 %	0 %	25 %	428216271
573	NC_019694	CGC	2	6	32399	32404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428216271
574	NC_019694	GA	3	6	32418	32423	50 %	0 %	50 %	0 %	428216271
575	NC_019694	TTC	2	6	32696	32701	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428216271
576	NC_019694	AAG	2	6	32703	32708	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428216271
577	NC_019694	AGTTGA	2	12	32757	32768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428216271
578	NC_019694	T	6	6	32845	32850	0 %	100 %	0 %	0 %	428216271
579	NC_019694	CAG	2	6	32851	32856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428216271
580	NC_019694	CATTT	2	10	32896	32905	20 %	60 %	0 %	20 %	428216271
581	NC_019694	TTC	2	6	32914	32919	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428216271
582	NC_019694	AAG	2	6	32930	32935	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428216271
583	NC_019694	ATTAA	2	10	32966	32975	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NC_019694	TGA	2	6	32980	32985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
585	NC_019694	CT	3	6	33047	33052	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
586	NC_019694	ATTT	2	8	33054	33061	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
587	NC_019694	ATA	2	6	33062	33067	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
588	NC_019694	GACTG	2	10	33209	33218	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
589	NC_019694	AAG	2	6	33228	33233	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
590	NC_019694	A	6	6	33298	33303	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
591	NC_019694	ACTT	2	8	33360	33367	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
592	NC_019694	A	6	6	33373	33378	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
593	NC_019694	ACA	2	6	33427	33432	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
594	NC_019694	AT	3	6	33434	33439	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
595	NC_019694	TTGC	2	8	33455	33462	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
596	NC_019694	A	7	7	33478	33484	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
597	NC_019694	A	6	6	33508	33513	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
598	NC_019694	A	7	7	33558	33564	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
599	NC_019694	TC	4	8	33572	33579	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
600	NC_019694	AGA	2	6	33588	33593	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
601	NC_019694	ACA	2	6	33594	33599	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
602	NC_019694	CAAC	2	8	33672	33679	50 %	0 %	0 %	50 %	428216272
603	NC_019694	AAGT	2	8	33708	33715	50 %	25 %	25 %	0 %	428216272
604	NC_019694	CAT	2	6	33738	33743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428216272
605	NC_019694	CTG	2	6	33763	33768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428216272
606	NC_019694	CAC	2	6	33827	33832	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428216272
607	NC_019694	AAT	2	6	33972	33977	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428216272
608	NC_019694	TTTC	2	8	33988	33995	0 %	75 %	0 %	25 %	428216272
609	NC_019694	CGC	2	6	34009	34014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428216272
610	NC_019694	GA	3	6	34028	34033	50 %	0 %	50 %	0 %	428216272
611	NC_019694	CAAG	2	8	34266	34273	50 %	0 %	25 %	25 %	428216272
612	NC_019694	AAG	2	6	34313	34318	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428216272
613	NC_019694	AGTC	2	8	34328	34335	25 %	25 %	25 %	25 %	428216272
614	NC_019694	CAG	2	6	34461	34466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428216272
615	NC_019694	CATTT	2	10	34506	34515	20 %	60 %	0 %	20 %	428216272
616	NC_019694	TTC	2	6	34524	34529	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428216272
617	NC_019694	ATT	2	6	34573	34578	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
618	NC_019694	TGA	2	6	34590	34595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
619	NC_019694	CT	4	8	34653	34660	0 %	50 %	0 %	50 %	428216273
620	NC_019694	AT	3	6	34662	34667	50 %	50 %	0 %	0 %	428216273
621	NC_019694	GTC	2	6	34693	34698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428216273
622	NC_019694	CAA	2	6	34711	34716	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428216273
623	NC_019694	GTT	2	6	34720	34725	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428216273
624	NC_019694	TGG	2	6	34788	34793	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428216273
625	NC_019694	GCC	3	9	34804	34812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428216273
626	NC_019694	ACGGT	2	10	34856	34865	20 %	20 %	40 %	20 %	428216273
627	NC_019694	ATG	2	6	34886	34891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428216273
628	NC_019694	GGT	2	6	34968	34973	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428216273
629	NC_019694	CG	3	6	35039	35044	0 %	0 %	50 %	50 %	428216273
630	NC_019694	CTT	2	6	35047	35052	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428216273
631	NC_019694	CGAT	2	8	35060	35067	25 %	25 %	25 %	25 %	428216273
632	NC_019694	GAT	2	6	35080	35085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428216273
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901	NC_019694	GAA	2	6	49226	49231	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428216282
902	NC_019694	GGC	2	6	49363	49368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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