MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Odoribacter splanchnicus DSM 20712 chromosome

Total Repeats: 86630

< Previous12...3334353637383940414243...173174Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18501	NC_015160	CCG	2	6	938056	938061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325279505
18502	NC_015160	AGG	2	6	938116	938121	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325279505
18503	NC_015160	TTGC	2	8	938124	938131	0 %	50 %	25 %	25 %	325279505
18504	NC_015160	GTA	2	6	938136	938141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325279505
18505	NC_015160	TCAC	2	8	938199	938206	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
18506	NC_015160	GCA	2	6	938230	938235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18507	NC_015160	ACT	2	6	938299	938304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18508	NC_015160	TGCC	2	8	938326	938333	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
18509	NC_015160	ATC	2	6	938403	938408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325279506
18510	NC_015160	AAAT	2	8	938417	938424	75 %	25 %	0 %	0 %	325279506
18511	NC_015160	CCTC	2	8	938546	938553	0 %	25 %	0 %	75 %	325279506
18512	NC_015160	TCCG	2	8	938571	938578	0 %	25 %	25 %	50 %	325279506
18513	NC_015160	TCACC	2	10	938630	938639	20 %	20 %	0 %	60 %	325279506
18514	NC_015160	CTC	2	6	938667	938672	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325279506
18515	NC_015160	GCT	2	6	938675	938680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325279506
18516	NC_015160	AAT	2	6	938696	938701	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325279506
18517	NC_015160	T	7	7	938728	938734	0 %	100 %	0 %	0 %	325279506
18518	NC_015160	GTT	2	6	938820	938825	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325279507
18519	NC_015160	TAA	2	6	938826	938831	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325279507
18520	NC_015160	TAC	2	6	938857	938862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325279507
18521	NC_015160	TCA	2	6	939074	939079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325279507
18522	NC_015160	ACC	2	6	939106	939111	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325279507
18523	NC_015160	TGTT	2	8	939114	939121	0 %	75 %	25 %	0 %	325279507
18524	NC_015160	TAA	2	6	939154	939159	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325279507
18525	NC_015160	TGC	2	6	939176	939181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325279507
18526	NC_015160	TCA	2	6	939221	939226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325279507
18527	NC_015160	AAT	2	6	939297	939302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325279507
18528	NC_015160	TAAT	2	8	939326	939333	50 %	50 %	0 %	0 %	325279507
18529	NC_015160	CT	3	6	939341	939346	0 %	50 %	0 %	50 %	325279507
18530	NC_015160	ATT	2	6	939391	939396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325279507
18531	NC_015160	TCCA	2	8	939445	939452	25 %	25 %	0 %	50 %	325279507
18532	NC_015160	ATC	2	6	939463	939468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325279507
18533	NC_015160	TCT	2	6	939500	939505	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325279507
18534	NC_015160	ATGAT	2	10	939509	939518	40 %	40 %	20 %	0 %	325279507
18535	NC_015160	ATAA	2	8	939528	939535	75 %	25 %	0 %	0 %	325279507
18536	NC_015160	ATAA	2	8	939555	939562	75 %	25 %	0 %	0 %	325279507
18537	NC_015160	AAGCA	2	10	939607	939616	60 %	0 %	20 %	20 %	325279507
18538	NC_015160	AGC	2	6	939617	939622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325279507
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18540	NC_015160	CGG	2	6	939746	939751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325279507
18541	NC_015160	AG	3	6	939817	939822	50 %	0 %	50 %	0 %	325279507
18542	NC_015160	ATG	2	6	939914	939919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325279507
18543	NC_015160	CTTCG	2	10	940014	940023	0 %	40 %	20 %	40 %	325279507
18544	NC_015160	GCG	2	6	940040	940045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325279507
18545	NC_015160	CAAA	2	8	940089	940096	75 %	0 %	0 %	25 %	325279507
18546	NC_015160	CATTCG	2	12	940287	940298	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
18547	NC_015160	TTCGTA	2	12	940316	940327	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
18548	NC_015160	GTTAGC	2	12	940354	940365	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
18549	NC_015160	AAC	2	6	940408	940413	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18550	NC_015160	A	7	7	940476	940482	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18551	NC_015160	CCG	2	6	940521	940526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18552	NC_015160	CGTTTT	2	12	940584	940595	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	325279508
18553	NC_015160	ATACGA	2	12	940651	940662	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	325279508
18554	NC_015160	GAT	2	6	940751	940756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325279508
18555	NC_015160	TCGG	2	8	940811	940818	0 %	25 %	50 %	25 %	325279508
18556	NC_015160	AGT	2	6	940833	940838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325279508
18557	NC_015160	CCG	2	6	940859	940864	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325279508
18558	NC_015160	TCA	2	6	940910	940915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325279508
18559	NC_015160	TCA	2	6	940958	940963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325279508
18560	NC_015160	AT	3	6	940998	941003	50 %	50 %	0 %	0 %	325279508
18561	NC_015160	TCC	2	6	941066	941071	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325279508
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18568	NC_015160	TCAC	2	8	941450	941457	25 %	25 %	0 %	50 %	325279508
18569	NC_015160	CGTT	2	8	941475	941482	0 %	50 %	25 %	25 %	325279508
18570	NC_015160	CCA	2	6	941495	941500	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325279508
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18572	NC_015160	GAGAAA	2	12	941556	941567	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325279508
18573	NC_015160	ATA	2	6	941572	941577	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325279508
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18594	NC_015160	GCT	2	6	942603	942608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325279509
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18602	NC_015160	CCG	2	6	942981	942986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325279510
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18606	NC_015160	CAC	2	6	943102	943107	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325279510
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18608	NC_015160	TCA	2	6	943171	943176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325279510
18609	NC_015160	GCT	2	6	943177	943182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325279510
18610	NC_015160	CCT	2	6	943273	943278	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18611	NC_015160	TAT	2	6	943282	943287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325279511
18612	NC_015160	TTA	2	6	943294	943299	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325279511
18613	NC_015160	TCAT	2	8	943300	943307	25 %	50 %	0 %	25 %	325279511
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18616	NC_015160	ATT	2	6	943452	943457	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325279511
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18618	NC_015160	GGT	2	6	943566	943571	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325279511
18619	NC_015160	ACC	2	6	943696	943701	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325279511
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18621	NC_015160	T	6	6	943773	943778	0 %	100 %	0 %	0 %	325279511
18622	NC_015160	GTCATA	2	12	943779	943790	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	325279511
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18700	NC_015160	GTA	2	6	947646	947651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325279512
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18725	NC_015160	GA	3	6	949579	949584	50 %	0 %	50 %	0 %	325279513
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18735	NC_015160	GCT	2	6	950059	950064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325279513
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18741	NC_015160	CCG	2	6	950310	950315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325279513
18742	NC_015160	TTTC	2	8	950324	950331	0 %	75 %	0 %	25 %	325279513
18743	NC_015160	TCC	2	6	950346	950351	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325279513
18744	NC_015160	CCT	2	6	950365	950370	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325279513
18745	NC_015160	CGG	2	6	950395	950400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325279513
18746	NC_015160	CCT	2	6	950422	950427	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325279513
18747	NC_015160	TAT	2	6	950428	950433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325279513
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18750	NC_015160	CT	3	6	950829	950834	0 %	50 %	0 %	50 %	325279513
18751	NC_015160	CCG	2	6	950860	950865	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325279513
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18764	NC_015160	ATCT	2	8	951491	951498	25 %	50 %	0 %	25 %	325279513
18765	NC_015160	CGCA	2	8	951500	951507	25 %	0 %	25 %	50 %	325279513
18766	NC_015160	CTT	2	6	951548	951553	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325279513
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18769	NC_015160	GA	3	6	951688	951693	50 %	0 %	50 %	0 %	325279513
18770	NC_015160	TC	3	6	951699	951704	0 %	50 %	0 %	50 %	325279513
18771	NC_015160	CGGTT	2	10	951801	951810	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
18772	NC_015160	CAT	2	6	951850	951855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18773	NC_015160	CTTT	2	8	951978	951985	0 %	75 %	0 %	25 %	325279514
18774	NC_015160	T	6	6	951983	951988	0 %	100 %	0 %	0 %	325279514
18775	NC_015160	CT	4	8	951991	951998	0 %	50 %	0 %	50 %	325279514
18776	NC_015160	TGGAT	2	10	952008	952017	20 %	40 %	40 %	0 %	325279514
18777	NC_015160	ATA	2	6	952033	952038	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325279514
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18779	NC_015160	TTTC	2	8	952353	952360	0 %	75 %	0 %	25 %	325279514
18780	NC_015160	A	6	6	952381	952386	100 %	0 %	0 %	0 %	325279514
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18788	NC_015160	CATTTC	2	12	952761	952772	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	325279515
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18791	NC_015160	TCA	2	6	953101	953106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325279515
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18793	NC_015160	CAT	2	6	953154	953159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325279515
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18795	NC_015160	ATTCT	2	10	953215	953224	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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18798	NC_015160	TCA	2	6	953350	953355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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18805	NC_015160	CTG	2	6	953745	953750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325279516
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18813	NC_015160	ACT	2	6	953992	953997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325279516
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18817	NC_015160	CTTTG	2	10	954135	954144	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
18818	NC_015160	GAT	2	6	954226	954231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325279517
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18844	NC_015160	TAA	2	6	955547	955552	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18845	NC_015160	GGC	2	6	955610	955615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325279519
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18850	NC_015160	CGTC	2	8	955824	955831	0 %	25 %	25 %	50 %	325279519
18851	NC_015160	T	6	6	956045	956050	0 %	100 %	0 %	0 %	325279519
18852	NC_015160	TTA	2	6	956055	956060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325279519
18853	NC_015160	CT	4	8	956118	956125	0 %	50 %	0 %	50 %	325279519
18854	NC_015160	TCC	2	6	956250	956255	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325279519
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18856	NC_015160	AG	3	6	956406	956411	50 %	0 %	50 %	0 %	325279519
18857	NC_015160	ATC	2	6	956414	956419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325279519
18858	NC_015160	CTC	2	6	956453	956458	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325279519
18859	NC_015160	TCA	2	6	956508	956513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325279519
18860	NC_015160	A	6	6	956574	956579	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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18984	NC_015160	GCC	2	6	962629	962634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325279525
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19000	NC_015160	A	6	6	963105	963110	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

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