MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Natrinema sp. J7-2 chromosome

Total Repeats: 10981

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9001	NC_018224	GAT	2	6	2991578	2991583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9002	NC_018224	GTC	2	6	2991645	2991650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9003	NC_018224	TGAC	2	8	2992585	2992592	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
9004	NC_018224	TCC	2	6	2992768	2992773	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9005	NC_018224	AC	3	6	2992790	2992795	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9006	NC_018224	GC	3	6	2992812	2992817	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9007	NC_018224	AGC	2	6	2992822	2992827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9008	NC_018224	GCG	2	6	2992901	2992906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9009	NC_018224	CCA	2	6	2993127	2993132	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9010	NC_018224	CACG	2	8	2994167	2994174	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
9011	NC_018224	ACT	2	6	2994232	2994237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9012	NC_018224	TGA	2	6	2994243	2994248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9013	NC_018224	CAT	2	6	2994262	2994267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9014	NC_018224	TGA	2	6	2994335	2994340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9015	NC_018224	TCC	2	6	2995427	2995432	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9016	NC_018224	CGGA	2	8	2995438	2995445	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
9017	NC_018224	CGG	2	6	2995623	2995628	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9018	NC_018224	ACC	2	6	2995655	2995660	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9019	NC_018224	TA	3	6	2995693	2995698	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9020	NC_018224	GCCG	2	8	2995752	2995759	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9021	NC_018224	TCC	2	6	2995822	2995827	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9022	NC_018224	ACC	2	6	2995846	2995851	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9023	NC_018224	GAAC	2	8	2995866	2995873	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
9024	NC_018224	CTC	2	6	2996038	2996043	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9025	NC_018224	TAG	2	6	2996079	2996084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9026	NC_018224	GAAA	2	8	2998104	2998111	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
9027	NC_018224	ACC	2	6	2998306	2998311	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9028	NC_018224	CTC	2	6	2998322	2998327	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9029	NC_018224	GTG	2	6	2998342	2998347	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9030	NC_018224	GC	3	6	2998378	2998383	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9031	NC_018224	TGAC	2	8	2998409	2998416	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
9032	NC_018224	CGT	2	6	2998568	2998573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9033	NC_018224	CGGGC	2	10	2998582	2998591	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
9034	NC_018224	GTCG	2	8	2998673	2998680	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
9035	NC_018224	GCC	2	6	2998703	2998708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9036	NC_018224	CCCTCG	2	12	2998733	2998744	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
9037	NC_018224	GTC	2	6	2998746	2998751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9038	NC_018224	GCG	2	6	3000648	3000653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9039	NC_018224	ACG	2	6	3000659	3000664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9040	NC_018224	CCG	2	6	3000665	3000670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9041	NC_018224	CTCG	2	8	3000672	3000679	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
9042	NC_018224	CCGGG	2	10	3000689	3000698	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
9043	NC_018224	CGGGA	2	10	3000712	3000721	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
9044	NC_018224	CGG	2	6	3004153	3004158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9045	NC_018224	TTA	2	6	3007069	3007074	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9046	NC_018224	TTA	2	6	3007090	3007095	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9047	NC_018224	AAC	2	6	3007124	3007129	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9048	NC_018224	TTA	2	6	3007153	3007158	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9049	NC_018224	GCG	2	6	3007177	3007182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9050	NC_018224	TCGG	2	8	3007184	3007191	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
9051	NC_018224	ACG	2	6	3007221	3007226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9052	NC_018224	GTC	2	6	3007246	3007251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9053	NC_018224	AC	3	6	3007698	3007703	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9054	NC_018224	CA	3	6	3007726	3007731	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9055	NC_018224	ACC	2	6	3007740	3007745	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9056	NC_018224	GTC	3	9	3008293	3008301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9057	NC_018224	GAC	2	6	3008338	3008343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9058	NC_018224	TAG	2	6	3008345	3008350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9059	NC_018224	GTC	2	6	3008360	3008365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9060	NC_018224	ACC	2	6	3008393	3008398	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9061	NC_018224	GTC	2	6	3008416	3008421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9062	NC_018224	CCG	2	6	3008446	3008451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9063	NC_018224	CG	3	6	3008873	3008878	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9064	NC_018224	TAG	2	6	3008895	3008900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9065	NC_018224	CCG	2	6	3008917	3008922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9066	NC_018224	TCG	2	6	3010238	3010243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9067	NC_018224	ACC	2	6	3012884	3012889	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9068	NC_018224	TCG	2	6	3012982	3012987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9069	NC_018224	GCG	2	6	3012990	3012995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9070	NC_018224	ACC	2	6	3013019	3013024	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9071	NC_018224	CCG	2	6	3013062	3013067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9072	NC_018224	TAC	2	6	3015133	3015138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9073	NC_018224	CTG	2	6	3016338	3016343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9074	NC_018224	CGCT	2	8	3016405	3016412	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
9075	NC_018224	CGA	2	6	3016434	3016439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9076	NC_018224	CGGG	2	8	3016446	3016453	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
9077	NC_018224	CCAA	2	8	3017263	3017270	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9078	NC_018224	CGC	2	6	3019761	3019766	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9079	NC_018224	CGTC	2	8	3019769	3019776	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
9080	NC_018224	GCG	3	9	3019790	3019798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9081	NC_018224	GA	3	6	3019900	3019905	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9082	NC_018224	TGC	2	6	3019938	3019943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9083	NC_018224	GT	3	6	3019983	3019988	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9084	NC_018224	CCGG	2	8	3020017	3020024	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9085	NC_018224	GA	3	6	3021929	3021934	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9086	NC_018224	GCGG	2	8	3022580	3022587	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
9087	NC_018224	CG	3	6	3022650	3022655	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9088	NC_018224	CGG	2	6	3022678	3022683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9089	NC_018224	GCCG	2	8	3022716	3022723	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9090	NC_018224	G	6	6	3022729	3022734	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
9091	NC_018224	GACGG	2	10	3022757	3022766	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
9092	NC_018224	C	6	6	3024102	3024107	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
9093	NC_018224	GTC	2	6	3024121	3024126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9094	NC_018224	TAA	2	6	3026352	3026357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9095	NC_018224	CAACTT	2	12	3026373	3026384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9096	NC_018224	GACGGC	2	12	3026442	3026453	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
9097	NC_018224	GCC	2	6	3026518	3026523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9098	NC_018224	CGGT	2	8	3026562	3026569	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
9099	NC_018224	AATAA	2	10	3026893	3026902	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
9100	NC_018224	GGC	2	6	3026911	3026916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9101	NC_018224	GAC	2	6	3026921	3026926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9102	NC_018224	GTCC	2	8	3026943	3026950	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
9103	NC_018224	GGC	2	6	3026963	3026968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9104	NC_018224	CTC	2	6	3028332	3028337	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9105	NC_018224	TGAC	2	8	3029897	3029904	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
9106	NC_018224	ACA	2	6	3029966	3029971	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9107	NC_018224	CGG	3	9	3029996	3030004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9108	NC_018224	CCG	2	6	3030133	3030138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9109	NC_018224	GAG	2	6	3030172	3030177	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9110	NC_018224	GACG	2	8	3030212	3030219	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
9111	NC_018224	CGG	2	6	3032271	3032276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9112	NC_018224	GCC	2	6	3032294	3032299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9113	NC_018224	ACG	2	6	3032322	3032327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9114	NC_018224	CGC	2	6	3035938	3035943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9115	NC_018224	GGCC	2	8	3035945	3035952	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9116	NC_018224	CACGC	2	10	3035995	3036004	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
9117	NC_018224	CGA	2	6	3037336	3037341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9118	NC_018224	GC	4	8	3037377	3037384	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9119	NC_018224	GCC	2	6	3037390	3037395	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9120	NC_018224	GCC	2	6	3037450	3037455	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9121	NC_018224	ACG	3	9	3037488	3037496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9122	NC_018224	CCG	2	6	3037591	3037596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9123	NC_018224	TCG	2	6	3037653	3037658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9124	NC_018224	GTC	3	9	3037914	3037922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9125	NC_018224	CGG	2	6	3037967	3037972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9126	NC_018224	A	6	6	3038827	3038832	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9127	NC_018224	GTC	2	6	3038844	3038849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9128	NC_018224	CGG	2	6	3038851	3038856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9129	NC_018224	GGC	2	6	3039419	3039424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9130	NC_018224	CG	3	6	3039452	3039457	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9131	NC_018224	CGG	2	6	3039488	3039493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9132	NC_018224	CCGT	2	8	3039533	3039540	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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9252	NC_018224	CAG	2	6	3116077	3116082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9253	NC_018224	CGAA	2	8	3116089	3116096	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
9254	NC_018224	AC	3	6	3116103	3116108	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9255	NC_018224	AGACG	2	10	3116839	3116848	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
9256	NC_018224	GAA	2	6	3116884	3116889	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9257	NC_018224	TC	3	6	3116894	3116899	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9258	NC_018224	AGG	2	6	3116970	3116975	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9259	NC_018224	CAC	2	6	3116991	3116996	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9260	NC_018224	AGTACG	2	12	3117137	3117148	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
9261	NC_018224	TC	3	6	3117172	3117177	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9262	NC_018224	AGT	2	6	3117373	3117378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9263	NC_018224	TGA	2	6	3117379	3117384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9264	NC_018224	CTC	2	6	3117401	3117406	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9265	NC_018224	CAT	2	6	3117481	3117486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9266	NC_018224	TC	3	6	3117631	3117636	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9267	NC_018224	CTG	2	6	3118618	3118623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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9269	NC_018224	CTG	2	6	3119322	3119327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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9273	NC_018224	CCG	2	6	3120163	3120168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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9283	NC_018224	GT	3	6	3122039	3122044	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9284	NC_018224	TCG	2	6	3122125	3122130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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9293	NC_018224	CGGT	2	8	3127249	3127256	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
9294	NC_018224	TGC	3	9	3127319	3127327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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9302	NC_018224	TCGA	2	8	3130524	3130531	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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9305	NC_018224	TCCGT	2	10	3131813	3131822	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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9359	NC_018224	TGAC	3	12	3151212	3151223	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
9360	NC_018224	GTA	2	6	3151224	3151229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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9362	NC_018224	GAC	2	6	3151507	3151512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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9372	NC_018224	CGGC	2	8	3154033	3154040	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9373	NC_018224	CGC	2	6	3154056	3154061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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9380	NC_018224	GC	3	6	3156269	3156274	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9381	NC_018224	GGA	2	6	3156283	3156288	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9382	NC_018224	CCG	2	6	3156653	3156658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9383	NC_018224	TCCGA	2	10	3156768	3156777	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
9384	NC_018224	CAGC	2	8	3156805	3156812	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
9385	NC_018224	GGC	2	6	3156813	3156818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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